9
I Quantitative analysis of UV-A shock and short term stress using iTRAQ, pseudo selective reaction monitoring (pSRM) and GC-MS based metabolite analysis of the cyanobacterium Nostoc punctiforme ATCC 29133 Se realizó un proteómica y la metabolómica análisis cuantitativo utilizando iTRAQ, HPLC y GC-MS en la cianobacteria filamentosa Nostoc punctiforme ATCC 29133 para entender el efecto de corto y largo plazo de la exposición UV-A. Los cambios en el proteoma se midieron para el estrés a corto plazo (4-24 h) utilizando iTRAQ. Los cambios en los pigmentos fotosintéticos y metabolitos intracelulares se observaron a exposiciones de hasta 7 día (pigmentos) y hasta 11 días (metabolitos intracelulares). Para evaluar la calidad de la medición iTRAQ, se utilizó seudo seleccionado monitoreo de reacción (PSRM), con esta subestimación de confirmar los niveles de abundancia de proteínas por iTRAQ. Nuestros resultados sugieren que la radiación UV-A corto plazo la radiación reduce la abundancia de proteínas PS-I y PS-II. También se observó un aumento en la abundancia de proteínas homeostasis redox intracelular y plastocianina. Además, se observó cambios estadísticamente significativos en escitonemina, clorofila A, astaxantina, zeaxantina y β- caroteno. Evaluación de los metabolitos intracelulares mostró cambios significativos en varios, lo que sugiere su posible papel en la estrategia de mitigación del estrés de la Nostoc. Las cianobacterias bajo radiación UV-A han reducido el crecimiento debido al daño intensivo a las funciones esenciales, pero el organismo muestra una respuesta de defensa por la remodelación de la bioenergética vía, la inducción de la escitonemina compuesto de protección UV y aumento de los niveles de prolina y tirosina como respuesta mitigación. El efecto de la radiación UV-A en el proteoma y metabolitos intracelulares de N. punctiforme ATCC 29.133, incluidos los pigmentos fotosintéticos se ha descrito. También verificamos la expresión de 13 iTRAQ cuantificados proteína utilizando LC-PSRM. En general se observó que la radiación UV-A tiene un efecto drástico en la maquinaria fotosintética, pigmentos fotosintéticos y aminoácidos intracelulares. Como una estrategia de mitigación contra la radiación UV-A, prolina, glicina y tirosina se acumularon. II A heteroglycan from the cyanobacterium Nostoc commune modulates LPS-induced inflammator y cytokine secretion by THP-1 monocytes through phosphorylation of ERK1/2 and Akt A heteroglycan de la cianobacteria Nostoc commune modula LPS-inducida la secreción de citoquinas inflamatorias por monocitos THP-1 a través de la fosforilación de ERK1 / 2 y Akt Las cianobacterias (algas verde-azules) se han consumido como alimento y se utiliza en la medicina popular desde tiempos antiguos para aliviar una variedad de enfermedades. Las cianobacterias del género Nostoc se ha demostrado que producen exopolisacáridos complejos con actividad antioxidante y antiviral. Además, Nostoc sp. son comunes en simbiosis cyanolichen y polisacáridos líquenes se sabe que tienen efectos inmunomoduladores. Nc-5-s es un heteroglycan aislado de colonias de vida libre de Nostoc commune y su estructura se ha caracterizado en detalle. El objetivo de este estudio fue determinar los efectos de Nc-5-s en la respuesta inflamatoria de lipopolisacárido (LPS) estimulada humanos THP-1 monocitos y cómo están mediadas a los efectos. THP-1 monocitos cebados con interferón-γ y estimuladas con LPS en presencia de Nc-5-s secretada menos de la interleuquina citoquina pro-inflamatoria (IL) -6, y más de la citoquina

Tesis nostoc1

Embed Size (px)

DESCRIPTION

TESIS CUSHURO

Citation preview

Page 1: Tesis nostoc1

I

Quantitative analysis of UV-A shock and short term stress using iTRAQ, pseudo selective reaction monitoring (pSRM) and GC-MS based metabolite analysis of the cyanobacterium Nostoc punctiforme

ATCC 29133

Se realizó un proteómica y la metabolómica análisis cuantitativo util izando iTRAQ, HPLC y GC-MS en la

cianobacteria fi lamentosa Nostoc punctiforme ATCC 29133 para entender el efecto de corto y largo plazo de

la exposición UV-A. Los cambios en el proteoma se midieron para el estrés a corto plazo (4-24 h) util izando

iTRAQ. Los cambios en los pigmentos fotosintéticos y metabolitos intracelulares se observaron a

exposiciones de hasta 7 día (pigmentos) y hasta 11 días (metabolitos intracelulares). Para evaluar la calidad

de la medición iTRAQ, se util izó seudo seleccionado monitoreo de reacción (PSRM), con esta subestimación

de confirmar los niveles de abundancia de proteínas por iTRAQ. Nuestros resultados sugieren que la

radiación UV-A corto plazo la radiación reduce la abundancia de proteínas PS-I y PS-II. También se observó

un aumento en la abundancia de proteínas homeostasis redox intracelular y plastocianina. Además, se

observó cambios estadísticamente significativos en escitonemina, clorofila A, astaxantina, zeaxantina y β-

caroteno. Evaluación de los metabolitos intracelulares mostró cambios significativos en varios, lo que

sugiere su posible papel en la estrategia de mitigación del estrés de la Nostoc. Las cianobacterias bajo

radiación UV-A han reducido el crecimiento debido al daño intensivo a las funciones esenciales, pero el

organismo muestra una respuesta de defensa por la remodelación de la bioenergética vía, la inducción de la

escitonemina compuesto de protección UV y aumento de los niveles de prolina y tirosina como respuesta

mitigación.

El efecto de la radiación UV-A en el proteoma y metabolitos intracelulares de N. punctiforme ATCC 29.133,

incluidos los pigmentos fotosintéticos se ha descrito. También verificamos la expresión de 13 iTRAQ

cuantificados proteína util izando LC-PSRM. En general se observó que la radiación UV-A tiene un efecto

drástico en la maquinaria fotosintética, pigmentos fotosintéticos y aminoácidos intracelulares. Como una

estrategia de mitigación contra la radiación UV-A, prolina, glicina y tirosina se acumularon.

II

A heteroglycan from the cyanobacterium Nostoc commune modulates LPS-induced inflammatory

cytokine secretion by THP-1 monocytes through phosphorylation of ERK1/2 and Akt

A heteroglycan de la cianobacteria Nostoc commune modula LPS-inducida la secreción de citoquinas inflamatorias por monocitos THP-1 a través de la fosforilación de ERK1 / 2 y Akt

Las cianobacterias (algas verde-azules) se han consumido como alimento y se utiliza en la medicina popular

desde tiempos antiguos para aliviar una variedad de enfermedades. Las cianobacterias del género Nostoc se

ha demostrado que producen exopolisacáridos complejos con actividad antioxidante y antiviral. Además,

Nostoc sp. son comunes en simbiosis cyanolichen y polisacáridos líquenes se sabe que tienen efectos

inmunomoduladores. Nc-5-s es un heteroglycan aislado de colonias de vida libre de Nostoc commune y su

estructura se ha caracterizado en detalle. El objetivo de este estudio fue determinar los efectos de Nc-5-s en la

respuesta inflamatoria de lipopolisacárido (LPS) estimulada humanos THP-1 monocitos y cómo están

mediadas a los efectos. THP-1 monocitos cebados con interferón-γ y estimuladas con LPS en presencia de

Nc-5-s secretada menos de la interleuquina citoquina pro-inflamatoria (IL) -6, y más de la citoquina

Page 2: Tesis nostoc1

antiinflamatoria IL-10 de THP 1 monocitos estimulados sin Nc-5-s. En contraste, Nc-5-s aumento LPS

inducido la secreción de la pro-inflamatoria del factor de necrosis tumoral citoquinas (TNF) -α e IL-8. Nc-5-s

disminuyó LPS inducido por la fosforilación de la quinasa regulada extracelular (ERK) 1/2 y Akt quinasa,

pero no afectó la fosforilación de la quinasa p38, la activación del factor nuclear kappa B vía, ni la unión al

ADN de c-fos. Estos resultados muestran que Nc-5-s tiene efectos anti-inflamatorios de IL-6 e IL-10 por la

secreción de monocitos THP-1, pero sus efectos son pro-inflamatoria cuando se trata de TNF-α e IL-8.

Además, muestran que los efectos de Nc-5-s pueden ser mediados a través de la ERK1 / 2 vía y / o la

phosphoinositide 3-quinasa / Akt y sus efectores aguas abajo. La capacidad de Nc-5-s para disminuir la

secreción de IL-6, IL-10 aumenta la secreción y la activación moderada ERK1 / 2 indica un potencial para su

desarrollo como un agente anti-inflamatorio.

III

Stereospecific production of 9R-hydroxy-10E,12Z-octadecadienoic acid from linoleic acid by recombinant Escherichia coli cells expressing 9R-lipoxygenase from Nostoc sp. SAG 25.82

Producción estereoespecífica de 9R-hidroxi-10E, 12Z-ácido octadecadienoico a partir del ácido linoleico por

células de Escherichia coli recombinantes que expresan 9R-lipoxigenasa de Nostoc sp. SAG 25.82

Una de las propiedades más importantes de la l ipoxigenasa (LOX) como un biocatalizador es su oxigenación

estéreo-selectiva. En este estudio, la producción específica de estéreo-9R-hidroxi-10E, 12Z-ácido octadecadienoico (9R-HODE) a partir de ácido linoleico se logró util izando células de Escherichia coli

recombinantes que expresan enteros LOX de Nostoc sp. SAG 25.82. Las condiciones óptimas para la producción de 9R-HODE fueron pH 7.5, 25 ° C, 40 gl-1 células, 15 gl-1 de ácido linoleico, 2% (v / v) de metanol, 1 volumen de trabajo / volumen de oxígeno / min (vvm ) tasa de oxigenación, y 250 rpm la velocidad de agitación en matraz de 500 ml deflectores que contiene un volumen de trabajo de 50 ml. Bajo

estas condiciones optimizadas, las células recombinantes que expresan la proteína enteros 9R-LOX produjeron 14,3 gl-1-9R HODE de 1 h, con un rendimiento de conversión de 95% (w / w) y una productividad de 14,3 gl-1 h-1. El método de suministro de oxígeno significativamente influenciada estereoscópico y regio-selectividad de la oxigenación de ácido linoleico. Entre los métodos de suministro de oxígeno a prueba, la

oxigenación (1 vvm) con agitación (250 rpm) resultó en la relación 9R / 13S-HODE más alto de los productos en 96: 4. Esta es la primera aplicación usando células recombinantes que albergan enteros LOX-R específicas para la producción estereoselectiva de un ácido graso hidroxilado-R específica.

IV

Effects of light wavelengths on extracellular and capsular polysaccharide production by Nostoc

flagelliforme

Efectos de las longitudes de onda de luz sobre la producción extracelular y polisacárido capsular de Nostoc flagelliforme

Resumen Las influencias de diferentes longitudes de onda de la luz (rojo 660 nm, 590 nm amarillo, verde, azul 520 nm

460 nm, 400 nm) púrpura y luz blanca en polisacáridos extracelulares (EPS) y polisacárido capsular (CPS) de producción por Nostoc flagelliforme en cultivo líquido se demostró en este estudio. Los resultados mostraron que, en comparación con la luz blanca, roja y luz azul aumentado significativamente EPS y la

producción de CPS mientras que la luz amarilla reduce su producción; luces púrpuras y verdes estimulan la producción de EPS pero inhibieron la formación de CPS. Se detectaron nueve monosacáridos constituyentes

Page 3: Tesis nostoc1

y un ácido urónico en EPS y CPS, y sus relaciones mostraron diferencias significativas entre el tratamiento

con diferentes longitudes de onda de luz. Sin embargo, la estructura avanzada de la EPS y CPS de diversas condiciones de luz no presentó diferencia evidente a través de la transformada de Fourier espectroscopia de infrarrojos y de rayos X caracterización de difracción. Estos hallazgos establecen una base para el desarrollo del proceso de alto rendimiento de producción de polisacárido y la comprensión de su regulación.

V

Reduced scytonemin isolated from Nostoc commune induces autophagic cell death in human T-

lymphoid cell line Jurkat cells

Escitonemina reducido aislada de Nostoc commune induce la muerte celular por autofagia en la línea de células-T linfoide humana células Jurkat

Nostoc commune es un alga azul-verde bentónica terrestres que a menudo forma una capa

mucilaginosa extendida en el suelo, se acumula en las piedras y barro en los ambientes acuáticos.

Reducido escitonemina (R-scy), aislado de N. comuna Vaucher, se ha demostrado para suprimir el T-

linfoide crecimiento celular Jurkat humana. Para revelar los mecanismos subyacentes a la inhibición

mediada-R-scy de crecimiento de las células Jurkat, se examinó la morfología celular, la fragmentación

del ADN, y la luz proteína de cadena 3 (LC3) la modificación asociada a los microtúbulos en estas

células. Hemos observado múltiples vacuolas, así como la conversión de LC3-I a LC3-II en las células

R-Scy-tratada. Estos resultados sugieren que la inhibición del crecimiento celular inducida por Jurkat

R-scy es atribuible a la inducción de tipo II de la muerte celular programada (PCD II; autofagia la

muerte celular o la autofagia). Además, examinó los mecanismos subyacentes PCDIY inducida R-scy-.

Las células tratadas con R-scy producen grandes cantidades de especies reactivas de oxígeno (ROS),

que conduce a la inducción de la disfunción mitocondrial. Sin embargo, la eliminación de la R-scy ROS

inducida por el tratamiento con N-acetil-L-cisteína (NAC) marcadamente opuesto PCDII inducida R-

scy-. Basándose en estos resultados, se concluye que la formación de ROS juega un papel crítico en

PCDII inducida R-scy-.

VI

Ultrastructural, physiological and proteomic analysis of Nostoc flagelliforme in response to dehydration

and rehydration

Ultraestructural, análisis fisiológico y proteómico de Nostoc flagelliforme en respuesta a la deshidratación y la rehidratación

Flagelliforme Nostoc debe someterse a un ciclo de deshidratación / rehidratación durante sus etapas de

crecimiento; se examinan los mecanismos que subyacen a esta restricción. Los nuevos conocimientos

sobre N. respuesta flagelliforme a la desecación y la rehidratación en ultraestructural, se ofrecieron los

niveles fisiológicos y proteómicos. La estructura de las colonias y las células se mantuvo sin cambios en

respuesta a los tratamientos de deshidratación y rehidratación, excepto que la funda apareció encogido,

y tanto la cantidad y el volumen de vacuolas se redujeron cuando se deshidrata en comparación con la

rehidratación. Se observó un aumento significativo en la fotosíntesis, la respiración, la actividad total

de la Rubisco, nivel de anión superóxido, SOD, CAT, POD, nitrogenasa y la glutamina sintetasa (GS)

las actividades en respuesta a la rehidratación, mientras H2O2, amonio, prolina y el contenido de

glutamato todas registraron una disminución . 32 proteínas expresadas diferencialmente entre colonias

deshidratadas y rehidratadas fueron clasificados de acuerdo a sus funciones previstas en la secreción, la

señalización, la transcripción y la traducción, procesos antioxidantes, el metabolismo del nitrógeno, el

metabolismo de la energía, el metabolismo lipídico y chaperonina. La deshidratación es un estado de

reposo en el que es el regulado metabolismo, tras la rehidratación, un cambio metabólico se produce a

Page 4: Tesis nostoc1

partir de reposo al activo. El metabólica específica y mecanismos regulados para acomodar el ciclo de

deshidratación / rehidratación en N. flagelliforme se informó aquí.

VII

Structural characterisation of a complex heteroglycan from the cyanobacterium Nostoc commune

Un álcali-extraíble O-metilados que contiene ribofuranosa-heteroglycan, Nc-5-s, fue aislado de las

colonias de campo de cultivo salvaje de la cianobacteria Nostoc commune recogido en Islandia,

mediante fraccionamiento con etanol y cromatografía de intercambio de aniones. El peso molecular

medio se estimó en 1500 kDa. Caracterización estructural de la heteroglycan se realizó por alto campo

espectroscopia RMN (protón 1D, 2D COSY, 1H 2D-NOESY, TOCSY 2D-, 13C-HSQC, HMBC, H2BC

y HSQC-NOES Y) así como el análisis de monosacáridos después de metanólisis por GC y apoyado por análisis de ligamiento por GC-MS.

VIII

Cyanobacteria (Nostoc commune) used as a dietary item in the Peruvian highlands produce the

neurotoxic amino acid BMAA

Las cianobacterias (Nostoc commune), utilizado como un elemento de la dieta en la sierra peruana

producir el BMAA aminoácido neurotóxico

En las montañas de Perú, colonias globulares de Nostoc commune (Nostocales) se recogen en los lagos

de altura por los pueblos indígenas, que ellos llaman Llullucha. Se consumen localmente, negocian para

el maíz, o vendidos, con el tiempo de entrar en los mercados populares de Cusco y otras ciudades

vecinas. A lo largo de las tierras altas Perú, Nostoc commune es altamente relevante como un elemento

de la dieta de temporada, se come solo o en picante - un guiso locales - y se dice que es muy nutritivo.

Nostoc commune se ha sabido para producir aminoácidos inusuales, incluyendo los del grupo

micosporina, que posiblemente funcionan para prevenir el daño UV. Se analizaron 21 Nostoc colonias

esféricas comunas diferentes de 7 colecciones diferentes del mercado en el área de Cusco por la

presencia de β-N-metilamino-l-alanina (BMAA), un aminoácido neurotóxico producido por diversos

taxones de cianobacterias, usando cuatro técnicas analíticas diferentes (HPLC-FD, UPLC-UV, UPLC /

MS, LC / MS / MS). Encontramos usando las cuatro técnicas que BMAA estaba presente en las

muestras compradas en los mercados de Perú. Desde BMAA ha sido supuestamente vinculado a una

enfermedad neurodegenerativa, que sería de interés conocer si la incidencia de la ELA, enfermedad de Alzheimer o la enfermedad de Parkinson es mayor entre las personas que consumen Llullucha en Perú.

IX

CRISPR in the extended hyp-operon of the cyanobacterium Nostoc sp. strain PCC 7120, characteristics and

putative function(s)

Page 5: Tesis nostoc1

CRISPR en el HYP-operón de la cianobacteria Nostoc sp extendida. cepa PCC 7120, las características

y la función putativa (s)

Una cianobacteria Nostoc-como, cepa SAG 2306, se aisló de una muestra de suelo de arcilla en la región

de Assiut (Egipto). Morfología y análisis de 16S rDNA identificaron como un miembro de la

cianobacteria heterocísticas (Nostocales). Inesperadamente, clorofila y el peso seco fueron más altos en

manganeso privados (Mn) o en células privadas (Mn--) que en repleta (Mn +) dobles de manganeso. La

última fase de Mn-- diluyó el contenido celular en células hijas a un valor mínimo crítico de

aproximadamente 1,5% en relación con el original 100% en Mn +. Al igual que el crecimiento, Nostoc

sp. exhibió un efecto bifásico dependiente de la edad significativo sobre la actividad hidrogenasas. Las

células más viejas de 120 h de edad muestran mayores tasas de evolución de hidrógeno que los más

jóvenes. Los resultados sugieren efectos inhibitorios de los 12 M de manganeso contenidos en medio

BG11 (Mn +) no sólo en el crecimiento, sino también en la producción de hidrógeno durante las primeras 72 h de crecimiento.

X

High growth rate, photosynthesis rate and increased hydrogen(ases) in manganese deprived cells of a newly isolated Nostoc-like cyanobacterium (SAG 2306)

Alta tasa de crecimiento, tasa de fotosíntesis y el aumento de hidrógeno (ASES) en manganeso privados

células de un Nostoc como recién aislado cianobacteria (SAG 2306)

A Nostoc-like cyanobacterium, strain SAG 2306, was isolated from a clay soil sample at Assiut region

(Egypt). Morphology and analysis of 16S rDNA identified it as a member of the heterocyteous cyanobacteria (Nostocales). Unexpectedly, chlorophyll a and dry weight were higher in manganese

deprived (Mn-) or in manganese double deprived (Mn--) than in replete (Mn+) cells. The latter phase of

Mn-- diluted the cellular content in daughter cells to a critical minimal value of about 1.5% relative to the original 100% in Mn+. Similar to growth, Nostoc sp. exhibited a significant age-dependent biphasic

impact on hydrogenases activity. Older cells of 120 h age displayed higher hydrogen evolution rates

than younger ones. The results suggest inhibitory effects of the 12 μM manganese contained in BG11 medium (Mn+) not only on growth but also on hydrogen production during the first 72 h of growth.

XI

Isolation and purification of an axenic diazotrophic drought-tolerant cyanobacteria, Nostoc commune,

from natural cyanobacterial crusts and its utilization for field research on soils polluted with radioisotopes

El aislamiento y la purificación de una cianobacteria axénico diazotróficas tolerante a la sequía, Nostoc

commune, desde costras de cianobacterias natural y su utilización para la investigación de campo en

suelos contaminados con radioisótopos

El aislamiento y la purificación de una fijación de nitrógeno cyanobac y tolerancia a la sequía tolerante

a la sequía diazotróficas axénico confieren la capacidad de crecer en tierra firme, y algunos exhiben

cianobacterias terrestres estas propiedades. Estas cianobacterias fueron aislados en forma de racimos

axénico Nostoc commune y otras fuentes modificando el método usado para aislar la fijación de

nitrógeno y la cianobacteria tolerante a la sequía Nostoc sp. HK-01. De estas cianobacterias, N.

comuna, que es difícil de aislar y purificar, utiliza polisacáridos para mantener el agua, los fertilizantes

de nitrógeno para la fijación de nitrógeno, y puede vivir en ambientes extremos, debido a tolerancia a

la desecación. En este estudio, hemos examinado el uso de N. comuna como BioSoil para la agricultura

espacial y la posible absorción de radioisótopos (134Cs, 137Cs). Este artículo forma parte de una

edición especial titulada: La fotosíntesis de Investigación para la Sostenibilidad: de Natural a

Page 6: Tesis nostoc1

Artificial.bacteria, Nostoc commune, desde costras de cianobacterias natural y su utilización para la

investigación de campo en suelos contaminados con radioisótopos

XII

Changes in fatty acid profile and antioxidant systems in a Nostoc muscorum strain exposed to the

herbicide bentazon

Cambios en el perfil de ácidos grasos y sistemas antioxidantes en una cepa de Nostoc muscorum expuestas al herbicida bentazona

Un uso racional de cianobacterias nativo para diversos fines biotecnológicos requiere el estudio de los

factores abióticos locales que podrían potencialmente afectar su crecimiento normal. El presente

estudio con el bentazon herbicida (0.75, 1.5 y 2 mM) inducida por los cambios en el perfil lipídico y los

parámetros del sistema de defensa antioxidantes relacionados con el estrés oxidativo en el arroz cepa de

campo cianobacteria Nostoc UTAD_N213 muscorum crecido bajo condiciones de laboratorio durante

72 h. Los resultados indican que el 72-h de exposición de la cepa al aumento de las concentraciones de

bentazon causado: (1) una disminución de los ácidos grasos poliinsaturados (FAS); (2) un aumento de

la FAS saturadas; y (3) una disminución del índice de insaturación. Las actividades de todas las

enzimas antioxidantes, excepto para la glutatión reductasa mostraron un aumento significativo tras la

exposición bentazon de una manera tiempo y dependiente de la concentración. Cuando se compara con

los controles no tratados, el contenido de glutatión oxidado aumentó en un 42, 79 y 119% con 0,75, 1,5 y

2 mM bentazona, respectivamente, mientras que la reducida relación de glutatión oxidado a reducido

en un 32, 50 y 61% , respectivamente. La acumulación de prolina en las células después de la exposición

a herbicidas podría prevenir bentazon inducida por la producción de especies reactivas de oxígeno y funciones como un agente protector contra el daño oxidativo.

XIII

Carbon dioxide regulation of autotrophy and diazotrophs in the nitrogen-fixing cyanobacteria Nostoc muscorum

Regulación de dióxido de carbono de autotrofia y diazótrofos en la cianobacteria Nostoc muscorum

fijadoras de nitrógeno

Carbon Para entender cómo el carbono y el metabolismo del nitrógeno se regulan en diazotrophically y

culturas no diazotrophically cultivadas de la cianobacteria Nostoc muscorum, se investigó el papel de

bicarbonato (HCO3) en la regulación de diazotrophy y autotrofia. Los resultados mostraron que la

concentración de HCO3 hasta 12 mol m-3 mejorado de crecimiento, tasa de crecimiento específico,

pigmentos fotosintéticos, la evolución O2 fotosintética y actividad nitrogenasa en condiciones de

crecimiento diazotróficas. La coexistencia de diferentes fuentes de nitrógeno en el medio de crecimiento

a acelerar aún más los parámetros examinados en el orden de NO3- <NO2- <NH4 + <prolina. Además,

se analizó el Ca ++ - ATPasa dependiente y la actividad citocromo c oxidasa en presencia de la

concentración gradual de HCO3- en culturas diazotrophically cultivadas y no cultivadas

diazotrophically. La actividad de estos enzimas fue mayor en las células cultivadas bajo HCO3-

concentración elevada. El Ca ++ - actividad ATPasa dependiente fue mayor que la de la citocromo c

oxidasa, cuando NAPH se suministró como el donador de electrones. Este hallazgo sugiere que la

generación fotosintética de ATP utiliza NADPH como una actividad donante de electrones y citocromo

c oxidasa es independiente de la regulación de NADPH.dioxide autotrofia y diazótrofos en la cianobacteria Nostoc muscorum fijadoras de nitrógeno

Page 7: Tesis nostoc1

XIII

Antioxidant and moisture-retention activities of the

polysaccharide from Nostoc commune

Actividades antioxidantes y de retención de humedad del polisacárido de Nostoc commune

La principal matriz de soporte comestible de la colonia Nostoc commune es polisacárido, que desempeña un papel importante en la protección de la propia cianobacterias de la

desecación extrema y alta radiación. Para explorar el potencial biomédico de la naturaleza inherente del polisacárido, que investigó las capacidades antioxidantes y de retención de

humedad del polímero. Presentamos aquí que el polisacárido es capaz de barrido tanto anión superóxido y radicales hidroxilo in vitro. Usando el modelo animal Caenorhabditis elegans, una vez más demuestran que el polisacárido puede aumentar la actividad de la

enzima antioxidante, disminuir el nivel de peroxidación lipídica, y reducir el daño oxidativo inducido por paraquat. También revelan que el polisacárido tiene capacidades in vitro de

absorción de humedad y -retention fuertes en comparación con quitosano y urea, y es capaz de mejorar la retención de agua en el estrato córneo de ratón bajo condiciones secas. En conjunto, estos datos demuestran la potente in vitro así como in vivo en actividades

antioxidantes y fuerte capacidad de retención de humedad del polisacárido de N. comuna.

XIV

Analysis of Anabaena vaginicola and Nostoc calcicola

from Northern Iran, as rich sources of major carotenoids

Análisis de Anabaena y Nostoc vaginicola calcicola desde el norte de Irán, como fuentes ricas en carotenoides principales

Cuatro principales carotenoides de gran importancia nutricional, incluyendo β-caroteno, el

licopeno, la luteína y la zeaxantina se determinaron en tres cepas de cianobacterias heterocísticas,

pertenecientes a los géneros Anabaena y Nostoc, aislado de los ecosistemas terrestres y acuáticos

iraníes, por primera vez. Los carotenoides extraídos por ultrasonidos fueron identificados y

cuantificados por un método de HPLC isocrática rápido y sensible y la identificación se confirmó

adicionalmente mediante clavar patrones auténticos y el patrón de la UV-Vis espectros obtenidos

de detector de matriz de fotodiodos. Los resultados mostraron que estas cepas contienen grandes

cantidades de carotenoides cuatro principales, especialmente de licopeno (hasta 24.570 g / g de

peso seco, DW), que parece ser la cantidad más alto reportado hasta la actualidad; y β-caroteno

(hasta 8133 mg / g DW), que es comparable con las mejores fuentes naturales de β-caroteno.

Page 8: Tesis nostoc1

Mientras tanto, ellos son ricos en los isómeros cis de licopeno y β-caroteno, que es importante en

sus beneficios de biodisponibilidad y de salud.

XV

Metro Cyclophanes A and B, antiproliferative cyclophanes from the cultured terrestrial Cyanobacterium

Nostoc sp

Metro ciclofanos A y B, ciclofanos antiproliferativos de la cultivaron Cianobacterium terrestre Nostoc sp

Metro ciclofanos A y B, ciclofanos antiproliferativos de la cultura del extracto celular de un Nostoc

sp terrestre cultivadas. (UIC 10062), obtenida a partir de una muestra recogida en el Grand Mere

State Park en Michigan, muestra actividad antiproliferativa contra el colon humano línea celular de

cáncer HT-29. La bioactividad de fraccionamiento guiado del extracto celular, combinado con el

análisis LC-MS, condujo al aislamiento de dos ciclofanos, llamado ciclofanos mero A y B (1 y 2). Sus

estructuras se determinaron mediante diversas técnicas espectroscópicas incluyendo HRESIMS, y

1D y análisis de RMN 2D. La configuración estéreo fue asignado sobre la base de cristalográfico de

rayos X y análisis de CD. Las estructuras de ciclofanos mero A y B (1 y 2) establecieron un hasta

ahora desconocido esqueleto [7,7] paraciclofano en la naturaleza, como se caracteriza por

metilos-α ramificado en C-1/14. Mero ciclofanos A y B (1 y 2) que se muestra la actividad

antiproliferativa contra la línea celular de cáncer de colon humano HT-29 con valores de IC50 de 3,3 y 1,7 M, Cianobacterium terrestre respectively.d Nostoc sp

XVI

Modeling Photosystem I with the alternative reaction center protein PsaB2 in the nitrogen fixing

cyanobacterium Nostoc punctiforme

Modelado Fotosistema I con la proteína centro de reacción PsaB2 alternativa en la cianobacteria

Nostoc fijación de nitrógeno punctiforme

Modelado La presencia de pequeños RNAs (sRNA) y sus funciones en la regulación transcripcional

se ha convertido últimamente en un tema candente. Desde las cianobacterias a menudo se

enfrentan a cambios en el entorno, tienen que tener un sistema que funciona bien para la

respuesta al estrés. Adaptación rápida es necesaria, y un sistema regulador basado en el ARN es

por lo tanto útil. Un ejemplo de estos miRNAs es CRISPRs. En este trabajo se reporta la existencia

de un CRISPR dentro del hip-operón (HYP genes codifican las proteínas responsables de la

maduración de hidrogenasas) de la cianobacteria filamentosa Nostoc sp. colar PCC 7120. Se

presentan los datos relativos a sus características y función putativa (s) y elevar la cuestión relativa

a la importancia de esta matriz CRISPR y otros sistemas de CRISPR en general. Además, se discute

el uso del sistema CRISPR como un potencial mecanismo de defensa genética bacteriana para

lograr, culturas cianobacterias robustas en gran escala, units.photosystem producción comercial

que con la proteína PB2 centro de reacción alternativa en la cianobacteria Nostoc fijación de

nitrógeno punctiforme

XVII

Page 9: Tesis nostoc1

Quantitative analysis of UV-A shock and short term stress using

iTRAQ, pseudo selective reaction monitoring (pSRM) and GC-MS

based metabolite analysis of the cyanobacterium Nostoc

punctiforme ATCC 29133

El análisis cuantitativo de los rayos UV-A choque y la tensión a corto plazo utilizando iTRAQ,

reacción selectiva seudo monitoreo (PSRM) y GC-MS basado el análisis de metabolitos de la

cianobacteria Nostoc punctiforme ATCC 29133

Se realizó un proteómica y la metabolómica análisis cuantitativo utilizando iTRAQ, HPLC y GC-MS en la cianobacteria filamentosa Nostoc punctiforme ATCC 29133 para entender

el efecto de corto y largo plazo de la exposición UV-A. Los cambios en el proteoma se midieron para el estrés a corto plazo (4-24 h) utilizando iTRAQ. Los cambios en los pigmentos fotosintéticos y metabolitos intracelulares se observaron a exposiciones de hasta

7 día (pigmentos) y hasta 11 días (metabolitos intracelulares). Para evaluar la calidad de la medición iTRAQ, se utilizó seudo seleccionado monitoreo de reacción (PSRM), con esta

subestimación de confirmar los niveles de abundancia de proteínas por iTRAQ. Nuestros resultados sugieren que la radiación UV-A corto plazo la radiación reduce la abundancia de proteínas PS-I y PS-II. También se observó un aumento en la abundancia de proteínas

homeostasis redox intracelular y plastocianina. Además, se observó cambios estadísticamente significativos en escitonemina, clorofila A, astaxantina, zeaxantina y β-

caroteno. Evaluación de los metabolitos intracelulares mostró cambios significativos en varios, lo que sugiere su posible papel en la estrategia de mitigación del estrés de la Nostoc. Las cianobacterias bajo radiación UV-A han reducido el crecimiento debido al daño

intensivo a las funciones esenciales, pero el organismo muestra una respuesta de defensa por la remodelación de la bioenergética vía, la inducción de la escitonemina compuesto de

protección UV y aumento de los niveles de prolina y tirosina como respuesta mitigación.