Analyse de 10 annĂ©es de se suivi STOC EPS â Avril 2013 â 0032-ÂâFA2013
faune-Ââaquitaine.org
Suivi Temporel des Oiseaux Communs
Bilan Régional de 10 années de suivi
2002 -Ââ2013
Le contenu de lâespace tĂ©lĂ©chargeable est le fruit de la collaboration de lâensemble des contributeurs au projet de base de donnĂ©es naturalistes
Analyse de 10 annĂ©es de se suivi STOC EPS â LPO Aquitaine â Avril 2013 â 0032-ÂâFA2013
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Suivi Temporel des Oiseaux Communs
Bilan Régional de 10 années de suivi
2002 -Ââ2013
RĂ©daction :
Ondine Filippi-ÂâCodaccioni (LPO Aquitaine)
Karine Ancrenaz (LPO Aquitaine)
Analyse de 10 annĂ©es de se suivi STOC EPS â LPO Aquitaine â Avril 2013 â 0032-ÂâFA2013
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Table des matiĂšres Table des matiĂšres ......................................................................................................................................................... 3
1. Introduction ............................................................................................................................................................ 5
MĂ©thodologie du STOC-ÂâEPS ................................................................................................................................... 5
2. RĂ©sultats .................................................................................................................................................................... 7
Etat du réseau en Aquitaine .................................................................................................................................. 7
RĂ©partition des espĂšces ....................................................................................................................................... 10
Analyse des tendances des espĂšces ................................................................................................................ 12
RĂ©sultats ..................................................................................................................................................................... 13
Indicateurs par habitat selon la liste nationale dâespĂšces .................................................................... 16
Indicateurs par habitat selon la liste dâespĂšces aquitaines .................................................................. 19
3. Analyses supplémentaires ............................................................................................................................. 21
Réponses des communautés aux changements globaux ....................................................................... 21
RĂ©ponses des espĂšces aux changements globaux .................................................................................... 22
Cartes dâabondances relatives ........................................................................................................................... 24
4. Conclusion ............................................................................................................................................................. 25
5. Bibliographie ........................................................................................................................................................ 26
Perdrix rouge. Photo : A. Laborde
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Remerciements
58 observateurs ont participĂ© au programme STOC-ÂâEPS depuis son lancement en Aquitaine, en
2002. Nous tenons à remercier tous ceux et toutes celles qui permettent chaque année au
MNHN-ÂâCRBPO de dĂ©velopper des tendances nationales et qui nous ont permis de rĂ©aliser ce
travail :
ALEIXANDRE Pascal, AMOROS Virgil, BAKKER Mark, BELLOCQ Jean-ÂâAndrĂ©, BERNARD Yannig, BERNE
Patrick, BONNET Jean-ÂâClaude, BONZOUMET Aline, BOS Nathalie, CAMBON Yann, CANEVET Marie-Ââ
Françoise, CAZABAN Frédéric, CHARRON Claude, COUANON Virginie , DUMAS Yann , ENGEL GeneviÚve,
ETCHEBARNE Jean-ÂâBernard, FAGETTE Serge, FEIGNE Claude, FILIPPI-ÂâCODACCIONI Ondine, FOUERT-Ââ
POURET JĂ©rĂŽme, GANS Jean-ÂâPierre , GARBAY Alain, GENOUD David, GERMAIN Philippe, GERNIGON Julien,
GIRARDOT Philippe, GUELIN Robert, HOARE Michel, JOUANDOUDET Frank, JOURDAIN Bruno,
KOBIERZYCKI Erick, LAGARDE Marie, LAMOTHE Bertrand et RAYMOND Christina, LAPORTE Bernard, LE
GALL Olivier, LECONTE Michel, LEGAY Philippe, LUBET Ludovic, LUCIAT-ÂâLABRY Yves, LURDOS Pierre,
NEZAN Julien, PAIN Cédric, PRINCE Gilles, RAPETTI Alessandra, REVERS Frédéric, SIMPSON David,
THEILLOUT Amandine, THIBERVILLE Isabelle, TOUZOT Olivier, URCUN Jean-ÂâPaul, VAN DORSSELAER
Philippe et CAUTE Isabelle, VERRIER Jean-ÂâLouis, VIDAL Olivier, VIRY Benjamin, WATIER Jean-ÂâMarie.
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1. Introduction Le Suivi Temporel des Oiseaux Communs est coordonnĂ© par le Centre de Recherches par le Baguage des Populations dâOiseaux (C.R.B.P.O.), au sein du MusĂ©um national dâHistoire naturelle. Le programme STOC se compose de deux protocoles complĂ©mentaires :
âą lâun a pour objectif dâĂ©tudier les variations des deux principaux paramĂštres dĂ©mographiques, survie des adultes et succĂšs de la reproduction, il sâagit du STOC-ÂâCapture ;
âą lâautre est conçu pour Ă©valuer les variations spatiales et temporelles de lâabondance des populations nicheuses dâoiseaux communs. Il est basĂ© sur des points dâĂ©coute : le STOC-ÂâEPS, Echantillonnages Ponctuels Simples ;
Lâanalyse proposĂ©e dans ce rapport prĂ©sente les rĂ©sultats du suivi STOC-ÂâEPS en Aquitaine qui permet dâestimer les variations dâeffectifs des oiseaux nicheurs communs. En outre, des indicateurs plurispĂ©cifiques dans le but dâĂ©valuer lâĂ©volution des communautĂ©s seront dĂ©veloppĂ©s Ă©galement.
Figure 1 : CarrĂ©s STOC-ÂâEPS suivis en 2011 au niveau national (980 carrĂ©s). Source : CRBPO-Ââ
MNHN
En 2011, Le nombre de carrĂ©s suivis au niveau national sâapprochait de 980 (Figure 1).
AprĂšs dix ans de compilation de donnĂ©es, il est maintenant temps de sortir un bilan afin dâĂ©valuer comment se portent nos populations dâoiseaux nicheurs.
MĂ©thodologie du STOC-ÂâEPS
CompĂ©tences requises Ce programme est ouvert Ă tous les naturalistes volontaires, aptes Ă reconnaĂźtre les oiseaux communs tant au niveau visuel (plumage, vol, âŠ) quâauditif (chants, cris).
Distribution spatiale de lâĂ©chantillonnage Un tirage alĂ©atoire par le CRBPO depuis une grille nationale attribue Ă lâobservateur un carrĂ© de 2x2 km dans un rayon de 10 km autour de son domicile (un second lui est proposĂ© dans le cas oĂč le premier serait pour partie inaccessible). Dans chaque carrĂ© lâobservateur positionne 10 points dâĂ©coute rĂ©partis de façon homogĂšne spatialement et proportionnellement aux habitats prĂ©sents. Les points doivent ĂȘtre suffisamment Ă©loignĂ©s les uns des autres (> 300m) afin dâĂ©viter des doubles comptages dâespĂšces dĂ©tectables de loin (chant du Coucou gris par exemple).
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Le caractĂšre alĂ©atoire du tirage des carrĂ©s implique que les observateurs ne connaissent pas Ă priori les endroits oĂč le suivi aura lieu, et ne savent donc pas, en rĂšgle gĂ©nĂ©rale, quelles espĂšces prĂ©cises ils observeront. Il permet donc dâĂ©chantillonner tous types dâhabitats, mĂȘme ceux qui, Ă priori, seraient non-Ââattractifs pour lâobservateur (milieu urbain).
DĂ©roulement des campagnes de recensement Lâobservateur effectue des relevĂ©s de 5 minutes exactement sur chaque point. Il note alors tous les oiseaux entendus ou vus, posĂ©s ou en vol, en Ă©valuant leur distance. Les habitats sont dĂ©crits sur chacun des points dâĂ©coute, selon une nomenclature bien prĂ©cise (Annexe 1). La distance de contact est notĂ©e en 3 catĂ©gories : moins de 25 mĂštres, entre 25 et 100 mĂštres et plus de 100 mĂštres. Les oiseaux en vol direct sont Ă©galement comptabilisĂ©s et leur trajectoire est reportĂ©e sur la fiche de relevĂ©.
Chaque annĂ©e, deux passages sont rĂ©alisĂ©s par la mĂȘme personne sur les mĂȘmes points, en pĂ©riode de reproduction afin dâĂ©chantillonner les nicheurs prĂ©coces et tardifs. Le premier passage a lieu en dĂ©but de saison de reproduction (du 1er avril au 8 mai), le second du 8 mai au 15 juin. Lâintervalle entre les 2 passages doit ĂȘtre de 4 semaines minimum. Depuis quelques annĂ©es, il est possible dâeffectuer un troisiĂšme passage plus prĂ©coce destinĂ© Ă dĂ©tecter lâavancement de la saison de reproduction en rĂ©ponse au changement climatique.
Chaque relevĂ© dĂ©bute entre 1 et 4 heures aprĂšs le lever du soleil (soit entre 6 et 10h du matin). La date, lâheure et lâintervalle entre les 2 passages doivent ĂȘtre similaire dâune annĂ©e sur lâautre, dans la limite des conditions mĂ©tĂ©orologiques favorables.
Il est possible de renseigner et de saisir la prĂ©sence de mammifĂšres sur chaque point dâĂ©coute.
Saisie et analyse des donnĂ©es Les donnĂ©es issues des suivis ont Ă©tĂ© saisies numĂ©riquement Ă lâaide du logiciel FEPS (FenĂȘtres sur le STOC-ÂâEPS), dĂ©veloppĂ© par la sociĂ©tĂ© SAXRUB InformatiqueÂź (disponible gratuitement pour tous les participants sur le site http://www.saxrub.fr/index_download.php). Cette application facilite et standardise la saisie, limite les erreurs et les oublis.
Chaque annĂ©e, les observateurs transmettent leurs donnĂ©es au coordinateur rĂ©gional avant le 1er septembre qui les centralise et transmet au CRBPO avant le 1er octobre. Les donnĂ©es sont analysĂ©es au niveau national par les logiciels FNAT et TRIM. Le CRBPO met Ă disposition des dĂ©lĂ©gations rĂ©gionales un document explicatif sur les analyses rĂ©alisables avec TRIM dans le cadre du STOC-ÂâEPS (Annexe 2). Dans notre cas, les donnĂ©es ont Ă©tĂ© mises en forme et analysĂ©es Ă lâaide des logiciels R et TRIM Ă partir dâun export depuis FEPS. Quelques analyses simples ont Ă©tĂ© rĂ©alisĂ©es Ă lâaide dâun tableur Microsoft Excel 2010.
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2. RĂ©sultats Les cartes rĂ©sultant des analyses des donnĂ©es STOC-ÂâEPS dont nous disposons sont prĂ©sentĂ©es en annexes.
Etat du réseau en Aquitaine
Figure 2 : Personnes inscrites pour le STOC-ÂâEPS (en rouge, les nouveaux carrĂ©s demandĂ©s en 2012).
126 demandes de carrĂ© STOC-ÂâEPS ont Ă©tĂ© faites depuis 2002 par 95 observateurs, dont 24 dĂšs 2002 et 14 en 2012.
La figure 2 reprĂ©sente les centroĂŻdes des communes pour lesquelles ont eu lieu les demandes de suivi de carrĂ© STOC. A lâheure actuelle, nous ne disposons des donnĂ©es que de 69 carrĂ©s (Carte 1, Annexe 5), soit 57 observateurs (1 observateur et 2 carrĂ©s rapportĂ©s aprĂšs les analyses). Il est possible que toutes les personnes inscrites nâaient pas encore transmis leurs donnĂ©es au coordinateur rĂ©gional ou alors nâaient pas rĂ©alisĂ© leur comptage. Il est donc possible que dans les rapports des annĂ©es Ă venir les analyses des donnĂ©es anciennes soient complĂ©tĂ©es par des rĂ©tro-Ââsaisies avec une possible incidence sur les rĂ©sultats des analyses de ce document.
Evolution dans le temps Au total, depuis 2002, 69 carrés ont été suivis par 57 observateurs. Lors de la premiÚre
annĂ©e, seuls 3 carrĂ©s ont Ă©tĂ© Ă©chantillonnĂ©s, et 2 dâentre eux continuent de lâĂȘtre en 2012. La majeure partie des analyses dĂ©crites dans ce qui suit (sauf mention contraire) concernera la pĂ©riode comprise entre 2002 et 2011. On observe un bond important la seconde annĂ©e ainsi quâen 2004 (passant Ă 21 carrĂ©s, puis Ă 34). Depuis 2006, une baisse de lâimplication des observateurs sâamorce pour atteindre seulement 20 carrĂ©s suivis en 2012 (Figure 3). Lâengouement des premiĂšres annĂ©es, sâest rapidement essoufflĂ© et 40 carrĂ©s sur les 69 suivis ont Ă©tĂ© abandonnĂ©s Ă ce jour.
La moyenne du nombre de carrĂ©s suivis par annĂ©e entre 2003 et 2012 est de 29,7 (± 6,77), et le nombre mĂ©dian1 de carrĂ©s suivis est de 32,5 sur cette mĂȘme pĂ©riode. Il nous est apparu important de tenter de remobiliser le rĂ©seau naturaliste pour faire en sorte que la moyenne de 30 carrĂ©s suivis par an soit au moins maintenue.
1La valeur mĂ©diane d'une sĂ©rie statistique sĂ©pare les valeurs en deux groupes de mĂȘme effectif. Câest la valeur
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Figure 3 : Nombre de carrés suivis par année entre 2002 et 2012
Figure 4 : Evolution du nombre de carrés suivis entre 2002 et 2012 (* Il est impossible de différencier les
carrĂ©s abandonnĂ©s et les carrĂ©s non-ÂâprospectĂ©s en 2012).
42 % des sites ont Ă©tĂ© suivis 5 annĂ©es ou plus, la moyenne du nombre dâannĂ©es de suivi dâun carrĂ© Ă©tant de 4,3 (± 3,1) et la valeur mĂ©diane du nombre dâannĂ©es de suivi dâun carrĂ© de 4.
Il est Ă noter quâen 2012, la derniĂšre annĂ©e, il nâest pas possible de diffĂ©rencier les carrĂ©s non prospectĂ©s (dont une annĂ©e dâinventaire a Ă©tĂ© « sautĂ©e ») de ceux qui ont Ă©tĂ© dĂ©finitivement abandonnĂ©s. En dĂ©but dâannĂ©e, 14 observateurs avaient fait une demande de nouveaux carrĂ©s STOC-ÂâEPS (Figure 2). Nous nâavons disposĂ© que des donnĂ©es de 5 carrĂ©s. Il est possible que certains carrĂ©s nâaient pas Ă©tĂ© prospectĂ©s Ă cause de la combinaison disponibilitĂ© de lâobservateur-Ââconditions mĂ©tĂ©orologiques, ou que tout simplement les observateurs nâaient pas transmis leurs donnĂ©es Ă temps Ă notre coordinateur rĂ©gional.
2002 2004 2006 2008 2010 2012
3
21
34 38 37
33 34 32
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0
5
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20
25
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40
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6 3 5 4 4 5
2 5
3
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34 28 30 28
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1
2 1
3 1 0
3
0 8*
1 5 7 5
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7
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Nouveaux carrés Carrés reconduits Carrés non prospectés Carrés abandonnés
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Figure 5 : RĂ©partition des carrĂ©s STOC-ÂâEPS en fonction du nombre d'annĂ©es suivies
RĂ©partition gĂ©ographique des carrĂ©s STOC-ÂâEPS (carte n° 1) La grande majoritĂ© des carrĂ©s suivis est localisĂ©e en Gironde (43 %) et plus particuliĂšrement Ă proximitĂ© de la CUB et autour du bassin dâArcachon, vient ensuite les Landes (22 %). Concernant les PyrĂ©nĂ©es-ÂâAtlantiques et la Dordogne (13 et 12 %), on remarque que les carrĂ©s sont assez localisĂ©s en 2 ou 3 taches concentrĂ©es. En dernier, le Lot-Ââet-ÂâGaronne atteint les 10 % depuis 2012 avec seulement 7 carrĂ©s prospectĂ©s mais en majoritĂ© sur du long terme et relativement bien rĂ©partis sur le dĂ©partement.
ReprĂ©sentativitĂ© des habitats Sur chaque point d'Ă©coute, lâhabitat principal et 2 habitats secondaires sont dĂ©crits chaque annĂ©e pour suivre leurs Ă©volutions, mettre en exergue les modifications de milieux et apporter des explications aux variations dâeffectifs de chaque espĂšce dâoiseaux.
Sachant quâune bonne partie des 69 carrĂ©s STOC-ÂâEPS nâont pas Ă©tĂ© dĂ©crits sur la totalitĂ© de la pĂ©riode 2002-Ââ2012, il a Ă©tĂ© choisi de dresser un portrait des milieux reprĂ©sentĂ©s sur lâensemble des carrĂ©s Ă partir de la description de lâhabitat principal rĂ©alisĂ©e la derniĂšre annĂ©e de suivi de chaque carrĂ© (Figure 6).
Figure 6 : Milieux principaux des 690 points d'Ă©coute en Aquitaine.
0 2 4 6 8 10 12 14 16 18
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11
Nom
bre de
carrés S
TOC-ÂâEP
S
Nombres d'années suivies
30%
8% 7%
32%
19%
3% ForĂȘt (arbres > 5m de hauteur) Buissons (ou jeune forĂȘt < 5m de hauteur) Pelouses, marais et landes Milieux agricoles
Milieux bù_s ou urbanisés Milieux aquatiques
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Dans la figure 6, les milieux forestiers et agricoles reprĂ©sentent Ă eux deux plus de 60 % des habitats alors que les milieux aquatiques ne reprĂ©sente que 3% des points dĂ©crits au niveau rĂ©gional. Ces mĂȘmes analyses ont Ă©tĂ© rĂ©alisĂ©es au niveau dĂ©partemental, les graphes sont prĂ©sentĂ©s en annexe 2.
Figure 7 : Variation des habitats par carrĂ© STOC-ÂâEPS suivant la nomenclature du MNHN : (A) ForĂȘt ;(B) Buissons ; (C) Pelouses ; (D) Agricoles ; (E) BĂąti ; (F) Milieux aquatiques.2
L'analyse de la rĂ©partition Ă l'intĂ©rieur des carrĂ©s montre que certains sont caractĂ©risĂ©s par un seul habitat : les habitats agricoles, forestiers et mĂȘme les pelouses peuvent occuper les 10 points de relevĂ© sur certains carrĂ©s.
RĂ©partition des espĂšces Au total, 182 espĂšces dâoiseaux ont Ă©tĂ© recensĂ©es au cours des prospections STOC-ÂâEPS, dont 142 sont Ă©ligibles pour le STOC. Les abondances maximales et la richesse spĂ©cifique maximale ont Ă©tĂ© observĂ©es en 2005, annĂ©e qui correspond au maximum de carrĂ©s suivis (Figure 8).
2 Les boites sont dĂ©limitĂ©es par les quartiles (25 % et 75 % des effectifs). Le trait gras reprĂ©sente la mĂ©diane (50% des effectifs), lâĂ©tendue des valeurs est reprĂ©sentĂ©e par les pointillĂ©s. Les points reprĂ©sentent les valeurs extrĂȘmes. Lâhabitat G (Rochers terrestres ou cĂŽtiers) nâa Ă©tĂ© relevĂ© quâune fois et ne fait pas partie des annĂ©es Ă©tudiĂ©es.
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Figure 8 : Nombre d'espÚces par année.
Parmi celles suivies, 32 espĂšces nâont Ă©tĂ© vues quâune seule fois, dont certaines occupant des carrĂ©s suivis pendant les 11 annĂ©es. Le nombre moyen dâespĂšces par carrĂ© est de 53. Celui-Ââci se distribue de 24 Ă 90 espĂšces au maximum.
Figure 9 : RĂ©partition du nombre dâespĂšces par nombres de carrĂ©s (lire : il y a 24 espĂšces sur 1 carrĂ©, 76 espĂšces sur 4 carrĂ©s, par exemple)
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Nom
bre d'espĂš
ces
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2
3
4
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Nom
bre de
carrés
Nombre d'espĂšces
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La liste des espĂšces recensĂ©es durant ces 11 annĂ©es de STOC-ÂâEPS prĂ©sente la frĂ©quence3 par annĂ©e et lâabondance totale4 de chaque espĂšce. Cette liste est classĂ©e par ordre dĂ©croissant des frĂ©quences pour lâannĂ©e de maximum dâobservations (2005 ; Annexe 4). Les espĂšces les plus frĂ©quentes sont logiquement les espĂšces les plus gĂ©nĂ©ralistes. On
pourrait sâattendre Ă voir Ă©merger les espĂšces des milieux les plus Ă©chantillonnĂ©s en Aquitaine (agricoles et forestiers, dâaprĂšs la figure 6). Cependant, on ne les y retrouve pas vraiment ce qui pourrait ĂȘtre un reflet frappant de la fragmentation des milieux et du peu de points dâĂ©coutes vĂ©ritables faits dans une matrice dâhabitat homogĂšne. En 2012, les espĂšces les plus reprĂ©sentĂ©es sont le Merle noir, la Corneille noire, la MĂ©sange charbonniĂšre et le Pigeon ramier (espĂšces gĂ©nĂ©ralistes).
Lâabondance moyenne et la richesse spĂ©cifique par carrĂ© diminuent significativement Ă partir de 2003 (on ne prend pas en compte 2002 car seulement 3 carrĂ©s suivis) (Respectivement : -Ââ0.14 ± 0.4, P=0.01 ; cor(Spearman)= -Ââ0.68, P=0.02).
Figure 10 : Evolution de la diversité spécifique moyenne et de l'abondance moyenne par carré EPS de 2003 à 2012
Analyse des tendances des espĂšces
Lâindice est fixĂ© arbitrairement Ă 1 en 2003 pour toutes les espĂšces. Les tendances sont estimĂ©es Ă lâaide de modĂšles log-ÂâlinĂ©aires qui prennent en compte un effet « apprentissage ». Cet effet « apprentissage » rĂ©side dans le fait quâau cours du temps, la familiarisation de lâobservateur avec la mĂ©thode de relevĂ©, avec le site et avec les espĂšces (Jiguet, 2010) augmente la dĂ©tectabilitĂ© de ces derniĂšres.
Les tendances sont obtenues Ă partir des effectifs maximum par point (somme des effectifs par classes de distances) de chaque espĂšce sur les 2 (ou 3) passages rĂ©alisĂ©s par annĂ©e. Trim rĂ©alise des calculs qui permettent dâobtenir un pourcentage de variation dâabondance sur la pĂ©riode considĂ©rĂ©e (ici : 2003-Ââ2012). Le modĂšle calcule Ă©galement la significativitĂ© des rĂ©sultats. On peut ainsi dĂ©terminer si les variations sont le fait du hasard ou sont rĂ©ellement liĂ©es Ă une
3 La frĂ©quence correspond au nombre de carrĂ©s oĂč lâespĂšce a Ă©tĂ© recensĂ©e sur le nombre de carrĂ©s suivis lâannĂ©e en cours. 4 Lâabondance totale est la somme des abondances par carrĂ© pour lâannĂ©e en cours.
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Abon
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Bruant zizi
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Indice ann
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Rougegorge familier
tendance. On a fixĂ© le seuil de significativitĂ© Ă 5% (p<0.05), sauf dans certains cas pour lequel on aura un risque dâerreur compris entre 5 et 10 % (0.05<P<0.10). Le tableau 2 prĂ©sente les rĂ©sultats des tendances selon les critĂšres Ă©tablis au tableau 1.
Tableau 1 : Explication de la signalétique des tendances d'évolution des effectifs.
â Diminution : tendance linĂ©aire nĂ©gative significative (p<0,05) â Tendance Ă la diminution : tendance linĂ©aire nĂ©gative significative (0.05<P<0.10) â Augmentation : tendance linĂ©aire positive significative (p<0,05) â Tendance Ă l'augmentation : tendance linĂ©aire positive significative (0.05<P<0.10) â stable : tendance linĂ©aire non significative
Les espĂšces pour lesquelles nous avons calculĂ© les tendances sont prĂ©sĂ©lectionnĂ©es selon le critĂšre suivant dâĂ©ligibilitĂ© : au moins suivies sur 20 carrĂ©s et plus de 5 ans sur chaque carrĂ©. Les espĂšces Ă©lues selon le premier critĂšre sont en fait suivies sur lâensemble des carrĂ©s de 8 Ă 10 ans (2003-Ââ2012) ce qui permet lâobtention de tendances fiables.
RĂ©sultats
Sur les 60 espĂšces analysĂ©es pour lâAquitaine pendant les 10 ans de STOC-ÂâEPS, 31 espĂšces sont stables, 21 montrent une variation des effectifs par rapport Ă 2003 significative Ă 5% (p<0.05), 5 espĂšces sont en augmentation, 16 en diminution. Les effectifs de 6 espĂšces ont tendance Ă augmenter et ceux de 2 espĂšces ont tendance Ă diminuer (probabilitĂ© de significativitĂ©<10% (p<0.10).
Figure 11 : Evolution des effectifs dâune espĂšce agricole (Bruant zizi) et dâune espĂšce forestiĂšre (Rougegorge familier)
-Ââ34%
-Ââ48%
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Tableau 2: Tendances des 60 espÚces dont la tendance est évaluable au niveau régional (entre 2003 et 2012) et comparaison avec les tendances nationales (entre 2001 et 2011).
EspĂšce
SignificativitĂ© de la tendance linĂ©aire -Ââ Wald
Test (p)
Tendance régionale
Variation des effectifs en Aquitaine (%)
Alouette des champs 0.01 â 369.36 -Ââ10%
Pigeon ramier 0.00001 â 163.14 53%
Pic Ă©peiche 0.0426 â 34.95 15%
Pouillot de Bonelli 0.0176 â 147.07 42%
Pie bavarde 0.0362 â 34.70 11%
Canard colvert 0.0547 â 85.41 43%
Pipit des arbres 0.0983 â 42.30 28%
Geai des chĂȘnes 0.0561 â 31.59 25%
Alouette lulu 0.0816 â 57.40 4% NS
Rossignol philomĂšle 0.0686 â 21.46 25%
Pic vert 0.0548 â 25.46 4%
Bruant zizi 0.098 â -Ââ34.20 18%
Torcol fourmilier 0.0749 â -Ââ58.53 -Ââ4% NS
Martinet noir 0.011 â -Ââ36.47 -Ââ7%
Linotte mĂ©lodieuse 0.0073 â -Ââ65.89 -Ââ39%
Chardonneret Ă©lĂ©gant 0.00001 â -Ââ57.36 -Ââ49%
Verdier d'Europe 0.0008 â -Ââ34.61 -Ââ29%
Cisticole des joncs 0.0254 â -Ââ57.78 -Ââ22%
Pigeon biset 0.0451 â -Ââ27.74 8%
Rougegorge familier 0.00001 â -Ââ48.25 -Ââ23%
Bergeronnette grise 0.0255 â -Ââ37.94 1%
Moineau domestique 0.0003 â -Ââ27.61 -Ââ1%
Pouillot vĂ©loce 0.00001 â -Ââ35.02 -Ââ23%
Accenteur mouchet 0.0212 â -Ââ44.09 -Ââ7%
Tarier pĂątre 0.0001 â -Ââ67.51 -Ââ27%
Serin cini 0.0251 â -Ââ34.02 -Ââ22%
Fauvette grisette 0.0001 â -Ââ53.59 19%
Troglodyte mignon 0.0001 â -Ââ32.03 -Ââ26%
Grive musicienne 0.0001 â -Ââ39.59 -Ââ1%
Epervier d'Europe 0.5233 â 75.35 -Ââ24%
MĂ©sange Ă longue queue 0.711 â 12.92 -Ââ11%
HĂ©ron cendrĂ© 0.246 â -Ââ28.45 -Ââ14%
Buse variable 0.3544 â 24.11 -Ââ19%
Grimpereau des jardins 0.4808 â 13.12 6%
Bouscarle de Cetti 0.79 â -Ââ8.61 -Ââ12%
Corneille noire 0.4614 â 8.34 9%
Coucou gris 0.6082 â -Ââ5.77 13%
Hirondelle de fenĂȘtre 0.8207 â 19.29 11%
Tendance en France 2001-Ââ2011
Analyse de 10 annĂ©es de se suivi STOC EPS â LPO Aquitaine â Avril 2013 â 0032-ÂâFA2013
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Tableau 3: Tendances des 60 espÚces dont la tendance est évaluable au niveau régional (entre 2003 et 2012) et comparaison avec les tendances nationales (entre 2001 et 2011) (suite)
Nous avons comparĂ© les tendances des espĂšces en Aquitaine aux tendances nationales pour les mĂȘmes espĂšces mĂȘme si la pĂ©riode Ă©tudiĂ©e nâest pas exactement la mĂȘme (Figure 11).
Alouette lulu. Photo : S. Tillo
EspĂšce
SignificativitĂ© de la tendance linĂ©aire -Ââ Wald
Test (p)
Tendance régionale
Variation des effectifs en Aquitaine (%)
Faucon crĂ©cerelle 0.3315 â -Ââ19.21 -Ââ15%
Pinson des arbres 0.6467 â 4.23 11%
HypolaĂŻs polyglotte 0.7285 â 6.50 64%
Hirondelle rustique 0.9992 â 2.83 3%
Milan noir 0.5674 â 14.04 30%
Loriot d'Europe 0.623 â 8.34 16%
MĂ©sange bleue 0.4968 â -Ââ9.99 17%
MĂ©sange huppĂ©e 0.2065 â -Ââ52.83 -Ââ14% NS
MĂ©sange charbonniĂšre 0.8272 â -Ââ1.96 16%
MĂ©sange nonnette 0.6337 â 34.46 54%
Faisan de Colchide 0.6013 â -Ââ12.79 62%
Rougequeue noir 0.4686 â 9.81 0%
Rougequeue Ă front blanc 0.1906 â 48.19 31%
Roitelet Ă triple bandeau 0.2775 â 51.56 -Ââ3%
Sittelle torchepot 0.7098 â 8.24 18%
Tourterelle turque 0.0201 â 27.05 29%
Tourterelle des bois 0.9481 â 1.63 -Ââ22%
Ătourneau sansonnet 0.617 â -Ââ8.61 1%
Fauvette Ă tĂȘte noire 0.4779 â -Ââ5.09 36%
Merle noir 0.1406 â -Ââ9.83 1%
Grive draine 0.1984 â 28.89 -Ââ11%
Huppe fasciĂ©e 0.5261 â -Ââ11.92 17%
Tendance en France 2001-Ââ
2011
Analyse de 10 annĂ©es de se suivi STOC EPS â Avril 2013 â 0032-ÂâFA2013
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Figure 12 : Variations rĂ©gionales en fonction des variations nationales. Chaque point reprĂ©sente la variation dâune espĂšce. Seules les espĂšces dont la variation est significative (jusquâĂ 10%) ont Ă©tĂ© conservĂ©es (1 « outlier » enlevĂ©).
La corrĂ©lation est significative (P<0.001) indiquant que sur lâensemble de ces 28 espĂšces pour lesquelles les tendances sont significatives, les variations dâeffectifs sont similaires dans notre rĂ©gion et au niveau national.
Indicateurs par habitat selon la liste nationale dâespĂšces Le CRBPO produit chaque annĂ©e des indicateurs plurispĂ©cifiques combinant les indices de plusieurs espĂšces. Ce sont la moyenne gĂ©omĂ©trique des indices des espĂšces concernĂ©es pour lâannĂ©e concernĂ©e. Il faut bien sĂ»r que lâannĂ©e Ă laquelle lâindice a Ă©tĂ© fixĂ© arbitrairement à « 1 » soit la mĂȘme pour toutes les espĂšces (http://vigienature.mnhn.fr/page/produire-Ââdes-Ââindicateurs-Ââpartir-Ââdes-Ââindices-Ââdes-Ââespeces-Ââhabitat). Quatre indicateurs sont produits, regroupant les espĂšces selon leur spĂ©cialisation par rapport Ă trois grands types dâhabitat. Ces indicateurs sont ceux des espĂšces spĂ©cialistes des milieux agricoles, espĂšces spĂ©cialistes des milieux forestiers, espĂšces spĂ©cialistes des milieux bĂątis, et espĂšces gĂ©nĂ©ralistes. Le degrĂ© de spĂ©cialisation est calculĂ© Ă partir de la rĂ©partition des effectifs de lâespĂšce (dĂ©nombrĂ©s par le STOC) dans les trois grands types dâhabitat, en proportion de leur disponibilitĂ©. Ainsi, si une espĂšce est plus abondante dans un habitat que ce que prĂ©dirait une rĂ©partition homogĂšne dans les trois habitats, elle est dite spĂ©cialiste de cet habitat. Si une espĂšce ne prĂ©sente pas de biais de rĂ©partition entre les habitats, elle est classĂ©e parmi les espĂšces gĂ©nĂ©ralistes. Au total, 65 espĂšces sont utilisĂ©es pour construire les indicateurs. Elles se rĂ©partissent de la maniĂšre suivante (les espĂšces en bleu nâont pas pu ĂȘtre prises en compte au niveau de lâAquitaine pour deux raisons : non-Âânicheuses dans la rĂ©gion ou mal suivies par le STOC aquitain) : âąEspĂšces gĂ©nĂ©ralistes (14) :
y = 0.3547x + 2.6291RÂČ = 0.6719
-Ââ60
-Ââ40
-Ââ20
0
20
40
60
80
-Ââ100.00 -Ââ50.00 0.00 50.00 100.00 150.00 200.00
Tend
ance nationales
Tendances régionales
Comparaison des tendances nationales et régionales
Analyse de 10 annĂ©es de se suivi STOC EPS â Avril 2013 â 0032-ÂâFA2013
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Pigeon ramier, Coucou gris, Pic vert, Fauvette Ă tĂȘte noire, HypolaĂŻs polyglotte, Rossignol philomĂšle, Merle noir, Accenteur mouchet, Loriot dâEurope, MĂ©sange charbonniĂšre, MĂ©sange bleue, Corneille noire, Geai des chĂȘnes, Pinson des arbres. âąEspĂšces spĂ©cialistes des milieux agricoles (20) : Vanneau huppĂ©, Buse variable, Faucon crĂ©cerelle, Perdrix rouge, Perdrix grise, Caille des blĂ©s, Huppe fasciĂ©e, Alouette des champs, Alouette lulu, Pipit farlouse, Bergeronnette printaniĂšre, Fauvette grisette, Tarier pĂątre, Tarier des prĂ©s, Pie-ÂâgriĂšche Ă©corcheur, Corbeau freux, Linotte mĂ©lodieuse, Bruant jaune, Bruant zizi, Bruant proyer. âąEspĂšces spĂ©cialistes des milieux forestiers (18) : Pic Ă©peiche, Fauvette mĂ©lanocĂ©phale, Pouillot de Bonelli, Pouillot siffleur, Pouillot vĂ©loce, Pouillot fitis, Roitelet huppĂ©, Roitelet triple-Ââbandeau, Sittelle torchepot, Grimpereau des jardins, Troglodyte mignon, Grive musicienne, Rouge-Ââgorge familier, MĂ©sange huppĂ©e, MĂ©sange noire, MĂ©sange nonnette, Grosbec casse-Âânoyaux, Bouvreuil pivoine. âąEspĂšces spĂ©cialistes des milieux bĂątis (13) : Tourterelle turque, Martinet noir, Hirondelle de fenĂȘtre, Hirondelle rustique, Rougequeue noir, Rougequeue Ă front blanc, Choucas des tours, Pie bavarde, Chardonneret Ă©lĂ©gant, Verdier dâEurope, Serin cini, Moineau domestique, Moineau friquet. Globalement, la France a perdu 25% de ses oiseaux nicheurs en milieu agricole (Bilan STOC-Ââ
EPS 2009 (Jiguet, 2010)). Les oiseaux forestiers vont un peu mieux mais sont en diminution, seules les espĂšces gĂ©nĂ©ralistes, se portent bien, bĂ©nĂ©ficiant sans doute du dĂ©clin des autres, avec une stabilisation rĂ©cente (Jiguet, 2010). Nous avons regardĂ© ce quâil en Ă©tait dans notre rĂ©gion dont le caractĂšre forestier et agricole,
entre autre, est unique de part sa surface, sa nature et sa gestion.
Figure 13 : Indicateurs des espĂšces spĂ©cialistes dâhabitats forestiers, bĂątis et agricoles ainsi que des espĂšces gĂ©nĂ©ralistes de la liste MNHN. Les valeurs sont arbitrairement fixĂ©es Ă 1 en 2003.
-Ââ21%
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1
1.1
1.2
1.3
1.4
2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012
Agricoles ForĂȘts BĂątis GĂ©nĂ©ralistes Toute espĂšces
+9%
-Ââ10%
+3%
-Ââ21%
-Ââ6%
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Figure 14 : Représentation des indicateurs habitats nationaux de 1989 à 2011 (Jiguet,2010).
Si on compare les indicateurs spĂ©cifiques rĂ©gionaux que nous avons calculĂ©s aux indicateurs nationaux produits par rĂ©gion pour les diffĂ©rents milieux de 2001 Ă 2009 par le CRBPO, on constate que nos rĂ©sultats sont Ă peu prĂšs similaire pour lâindicateur des espĂšces forestiĂšres et des milieux bĂątis, que le dĂ©clin est plus marquĂ© pour les espĂšces agricoles (la rĂ©gion serait en rouge) et quâen revanche, les espĂšces gĂ©nĂ©ralistes sont en augmentation (la rĂ©gion serait en vert) alors quâelles sont prĂ©sentĂ©es au niveau national comme en diminution!
Figure 14. Evolution des 4 indicateurs STOC rĂ©gionaux pour la pĂ©riode 2001-Ââ2009 (Jiguet, 2010)
Analyse de 10 annĂ©es de se suivi STOC EPS â Avril 2013 â 0032-ÂâFA2013
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Indicateurs par habitat selon la liste dâespĂšces aquitaines La liste nationale des espĂšces par type dâhabitat ne correspond pas Ă celle des espĂšces
rĂ©gionales (e.g. la Huppe fasciĂ©e est prĂ©fĂ©rentiellement forestiĂšre en Aquitaine alors quâelle est spĂ©cialiste agricole au niveau national ; le Corbeau freux nâest pas prĂ©sent en AquitaineâŠ). Aussi, Ă partir des donnĂ©es du STOC-ÂâEPS aquitain, nous avons calculĂ© un indice permettant la sĂ©grĂ©gation des espĂšces rencontrĂ©es et crĂ©Ă© ainsi des listes pour chaque milieu propres Ă la rĂ©gion Aquitaine. Par exemple lâindice en milieu agricole est :
IndAgricole = (Amoy(Agricole) â Amoy(Non-Ââagricole))/ Amoy(Agricole) Les valeurs de IndAgricole > 0 indiqueront les espĂšces plus abondantes dans les milieux agricoles que dans les autres milieux.
En plus des milieux dĂ©terminĂ©s par le CRBPO, nous nous sommes intĂ©ressĂ©s Ă un indicateur des milieux humides malgrĂ© le fait quâune bonne proportion dâespĂšces spĂ©cialistes de ces milieux ne soit pas bien suivie par le STOC (rapaces) et Ă©galement plus spĂ©cifiquement par le STOC aquitain (HĂ©ron pourprĂ©, Phragmite des joncs). Ainsi, nous disposons de 9 espĂšces pour lâindicateur des milieux agricoles, 16 pour lâindicateur des milieux forestiers, 13 pour lâindicateur des milieux bĂątis (urbain Ă rural), 5 pour lâindicateur des milieux humides et 12 pour lâindicateur des espĂšces gĂ©nĂ©ralistes (nâayant pas de prĂ©fĂ©rence pour un milieu particulier). Lâindicateur des espĂšces de milieux buissonnants (catĂ©gorie B du STOC) nâa malheureusement pas pu ĂȘtre construit car trop peu dâespĂšces bien suivies par le STOC avaient ce milieu comme prĂ©fĂ©rendum.
Phragmite des joncs. Photo : P. Nade
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EspĂšces IndAgricole EspĂšces IndForĂȘt EspĂšces IndBĂątis EspĂšces IndHumide EspĂšces gĂ©nĂ©ralistesFauvette grisette 0.250 Pouillot fitis 0.100 Moineau friquet 0.267 Cisticole des joncs 0.214 MĂ©sange bleueTarier pĂątre 0.370 Pouillot de Bonelli 0.169 Rougequeue noir 0.407 Chevalier gambette 0.250 Loriot d'EuropeTourterelle des bois 0.400 Roitelet Ă triple bandeau 0.357 Accenteur mouchet 0.412 Canard colvert 0.272 Corneille noireFaucon crĂ©cerelle 0.403 Grimpereau des jardins 0.407 Bergeronnette grise 0.452 Gallinule poule-Ââd'eau 0.308 Geai des chĂȘnesBruant proyer 0.417 Grive musicienne 0.410 Serin cini 0.520 Foulque macroule 0.375 Merle noirBruant zizi 0.460 Coucou gris 0.420 Chardonneret Ă©lĂ©gant 0.542 Bouscarle de Cetti 0.431 Pinson des arbresAlouette lulu 0.489 Pic Ă©peiche 0.424 Pigeon biset 0.568 Busard Saint-ÂâMartin 0.438 MĂ©sange charbonniĂšreBuse variable 0.489 Troglodyte mignon 0.427 Verdier d'Europe 0.588 Busard des roseaux 0.457 HypolaĂŻs polyglotteHirondelle rustique 0.526 Huppe fasciĂ©e 0.438 Rougequeue Ă front blanc 0.625 Phragmite des joncs 0.667 Pic vertEtourneau sansonnet 0.842 Rougegorge 0.484 Pie bavarde 0.643 Rousserolle effarvatte 0.700 Rossignol philomĂšleAlouette des champs 0.922 CircaĂšte Jean-Ââle-ÂâBlanc 0.500 Martinet noir 0.676 Hirondelle de fenĂȘtre 0.711 Fauvette Ă tĂȘte noireVanneau huppĂ© 0.952 Sitelle torchepot 0.526 Tourterelle turque 0.681 HĂ©ron cendrĂ© 0.786 Pigeon ramier
Mésange huppée 0.533 Milan noir 0.787 Héron pourpré 0.792Grive draine 0.571 Linotte mélodieuse 0.826 Canard souchet 0.833Pouillot véloce 0.579 Mouette rieuse 0.865Mésange nonnette 0.583 Goéland argenté 0.971Mésange à longue queue 0.658
Tableau 3 : Listes des espÚces indicatrices des différents habitats établies à partir des données STOC aquitain
*Seules les espÚces en gras ont été prises en compte.
Figure 15 : Indicateurs des espĂšces spĂ©cialistes dâhabitats forestiers, bĂątis, agricoles et milieux humides ainsi que des espĂšces gĂ©nĂ©ralistes selon les prĂ©fĂ©rendum calculĂ©s Ă partir des donnĂ©es habitat STOC Aquitaine. Les valeurs sont arbitrairement fixĂ©es Ă 1 en 2003.
Selon la liste des espĂšces bien suivies par le STOC et dont les prĂ©fĂ©rences aux habitats ont Ă©tĂ© dĂ©terminĂ©es Ă partir des donnĂ©es STOC Aquitaine, les espĂšces des milieux bĂątis (qui sont celles prĂ©sentes dans le tableau 3 en gras) ont subi une diminution de leurs effectifs depuis 2003 de 17%, les espĂšces des milieux agricoles, une diminution de 10%, les espĂšces des milieux humides, une diminution de 9% (attention, cet indicateur comporte trĂšs peu dâespĂšces), les espĂšces des milieux forestiers, une augmentation de 4%, les espĂšces gĂ©nĂ©ralistes, une augmentation de 17%. Lâensemble des cortĂšges a subi un faible dĂ©clin de 4%.
0.5
0.6
0.7
0.8
0.9
1
1.1
1.2
1.3
1.4
2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012
Agricoles ForĂȘts BĂątis GĂ©nĂ©ralistes Humides Toutes espĂšces
-Ââ10%
+5%
-Ââ17%
+17%
-Ââ9%
-Ââ4%
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3. Analyses supplémentaires
RĂ©ponses des communautĂ©s aux changements globaux Dans le cadre des Ă©tudes portant sur les rĂ©ponses des espĂšces et des communautĂ©s aux changements globaux, plusieurs indicateurs ont vu le jour, dont deux notamment permettent de mettre en valeur ces rĂ©ponses : le CSI (« Indice de SpĂ©cialisation des CommunautĂ©s ») et le CTI (« Indice de TempĂ©rature des CommunautĂ©s »), tous deux bĂątis Ă partir dâindices spĂ©cifiques, le SSI (« Indice de SpĂ©cialisation de lâEspĂšce ») et le STI (« Indice de TempĂ©rature de lâEspĂšce »).
Comme il est dĂ©montrĂ© dans de nombreuses Ă©tudes que les espĂšces ne sont pas Ă©gales face Ă ces changements (Olden and Rooney 2006, Filippi-ÂâCodaccioni et al. 2010a,b ; Devictor et al. 2008b et c ; Filippi-ÂâCodaccioni et al. 2008 ; McKinney 2008), nous supposons observer la mĂȘme diminution du CSI et augmentation du CTI au niveau Aquitain que celles constatĂ©es au niveau national (Devictor et al. 2008a,b,c) et international (Devictor et al. 2012).
a. Lâindice de spĂ©cialisation des communautĂ©s Pour une espĂšce donnĂ©e (k), lâindice de spĂ©cialisation des communautĂ©s (CSI) peut ĂȘtre calculĂ© comme la moyenne de lâindice de spĂ©cialisation de tous les individus identifiĂ©s dans la communautĂ©. Cet indice, calculĂ© en chaque point STOC (j), est donnĂ© par :
OĂč aij correspond au nombre dâindividus de lâespĂšce i (iâ k), SSIi Ă lâindice de spĂ©cialisation de cet espĂšce et N au nombre dâespĂšces (diffĂ©rentes de lâespĂšce k) dans cette communautĂ©.
b. Lâindice de TempĂ©rature des communautĂ©s Le CTI (Devictor et al. 2008c) prĂ©sente lâavantage dâassocier une tempĂ©rature Ă une communautĂ© considĂ©rĂ©e, ce qui permet de dĂ©tecter un Ă©ventuel changement de composition de la communautĂ© Ă partir de son affinitĂ© thermique. Pour obtenir ce CTI, un STI est calculĂ© pour chaque espĂšce de la communautĂ© considĂ©rĂ©e (Devictor et al., 2008c) Ă partir de la tempĂ©rature moyenne que rencontre lâespĂšce considĂ©rĂ©e dans son aire de nidification europĂ©enne (e.g. un STI de 5°C pour une espĂšce signifie que la tempĂ©rature moyenne sur toute son aire de nidification est de 5°C). Ainsi, une espĂšce quâon retrouve principalement dans les rĂ©gions septentrionales aura un STI faible, et inversement pour les espĂšces dâaffinitĂ© mĂ©ridionale (les STI France â calculĂ©s Ă partir de lâaire de nidification française â et les STI Europe sont hautement corrĂ©lĂ©s ; Devictor et al. 2008c). Le CTI est ensuite calculĂ© Ă partir de la moyenne des STI de la communautĂ©, pondĂ©rĂ© ou pas par les abondances de chaque espĂšce (mĂȘme calcul que pour le CSI).
c. RĂ©sultats pour lâAquitaine
Les rĂ©sultats rĂ©gionaux sont conformes aux rĂ©sultats nationaux et europĂ©ens. Le CSI a diminuĂ© et le CTI a augmentĂ© sur la pĂ©riode 2003-Ââ2012 (2002, avec 3 carrĂ©s, nâa pas Ă©tĂ© prise en compte dans lâanalyse). On peut noter toutefois que le dĂ©clin du CSI nâest pas linĂ©aire contrairement Ă lâaugmentation du CTI (Figure 16).
Analyse de 10 annĂ©es de se suivi STOC EPS â Avril 2013 â 0032-ÂâFA2013
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Statistique : CTI : Rho (Spearman)=0.69, p=0.03 ; CSI : Rho (Spearman)=-Ââ0.45, p=0.19, Generalized Additive Model (GAM) (3 degrĂ©s de libertĂ© assignĂ©s Ă la partie non-ÂâlinĂ©aire du modĂšle (fonction spline), soit, lâannĂ©e), significativitĂ© du terme lissĂ© (lâannĂ©e) : p=0.03. La distribution du CSI est presque normale (test de Shapiro (P=0.10), log-ÂâtransformĂ© : P=0.09. Si on considĂšre sa distribution comme normale, la rĂ©gression indique un dĂ©clin du CSI (-Ââ0.002 ± 0.001, P=0.08) avec donc une probabilitĂ© de significativitĂ© infĂ©rieure Ă 10%. Dans ce cas, le dĂ©clin du CSI avec le temps serait linĂ©aire.
Figure 16 : Evolution du CSI et du CTI de 2003 Ă 2012 sur les carrĂ©s STOC-ÂâEPS aquitains
d. Conclusion Les rĂ©sultats montrent une diminution non-ÂâlinĂ©aire du CSI et une augmentation du CTI de 2003 Ă 2012 (Cf. figure 16). Ces tendances traduisent respectivement une modification des communautĂ©s dâoiseaux au profit dâespĂšces gĂ©nĂ©ralistes (ayant une niche Ă©cologique large comme le Merle noir) et ayant un prĂ©fĂ©rendum thermique haut (espĂšces Ă affinitĂ©s thermiques mĂ©ridionales) au dĂ©triment des espĂšces Ă prĂ©fĂ©rendum thermique bas. Les espĂšces spĂ©cialistes Ă prĂ©fĂ©rendum thermique bas sont les plus affectĂ©es. Le constat rĂ©gional sur lâĂ©volution des communautĂ©s dâoiseaux est similaire au constat national.
RĂ©ponses des espĂšces aux changements globaux Reprenant la mĂ©thodologie de Jiguet et al. (2007), nous avons calculĂ© le taux de croissance moyen des espĂšces bien suivies par le STOC aquitain sur la pĂ©riode 2003-Ââ2012. Une approche explicative de ses variations est proposĂ©e selon les traits de ces espĂšces :
- statut migratoire : distance moyenne log-ÂâtransformĂ©e entre les distances dâhivernage et de nidification dâindividus baguĂ©s Ă partir de la base de donnĂ©es nationale,
- distances de dispersion natale : oiseaux bagués poussins et contrÎlés nicheurs, - fécondité annuelle : nombre moyen de couvée par an, - régime alimentaire,
Analyse de 10 annĂ©es de se suivi STOC EPS â Avril 2013 â 0032-ÂâFA2013
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- maximum thermique : en °C, tempĂ©rature moyenne de printemps/Ă©tĂ© sur les 50 cellules de la grille de lâaire de nidification de chaque espĂšce en Europe, prĂ©fĂ©rence de milieu (dĂ©fini Ă partir du STOC aquitain).
Statistique : Le calcul du taux de croissance a Ă©tĂ© estimĂ© en modĂ©lisant le nombre dâindividu dâune espĂšce donnĂ©e par un effet additif du site (carrĂ©s STOC, variable qualitative) et de lâannĂ©e (variable continue), avec une distribution de type Poisson et une fonction log-Ââlink. La sortie du modĂšle (estimate) et son erreur ont Ă©tĂ© utilisĂ©s, respectivement, comme variable dâintĂ©rĂȘt et comme poids dans le modĂšle.
a. RĂ©sultats pour lâAquitaine
Une fois lâeffet de chaque variable ajustĂ© Ă celui des autres (toutes variables dans le modĂšle), aucune variable nâest ressortie significative (Anova, erreur type II) Ă lâexception de la variable « milieu » avec une probabilitĂ© infĂ©rieure Ă 10% (P=0.08), ce qui signifie que certaines espĂšces de certains milieux ont des taux de croissance infĂ©rieurs Ă celles dâautres milieux. Le test a Ă©tĂ© effectuĂ© sur le meilleur modĂšle sĂ©lectionnĂ© par une rĂ©gression pas Ă pas (variables restantes : milieu, fĂ©conditĂ©, dispersion natale et statut migratoire). Nous nous sommes alors intĂ©ressĂ©s Ă la rĂ©ponse non-ÂâlinĂ©aire du SSI (suite aux rĂ©sultats sur le CSI) et Ă son effet ajustĂ© Ă celui des autres variables (statut migratoire, fĂ©conditĂ©, maximum thermique, rĂ©gime alimentaire, distance de dispersion natale).
Statistique : Generalized Additive Model (GAM, 3 degrĂ©s de libertĂ© assignĂ©s Ă la partie non-ÂâlinĂ©aire du modĂšle (fonction spline), soit le SSI), significativitĂ© du terme lissĂ© (SSI): p=0.03, Figure 17).
Figure 17 : Variation du taux de croissance moyen 2003-Ââ2012 des espĂšces du STOC aquitain en fonction de leur indice de spĂ©cialisation (SSI)
b. Conclusion
Une tendance linĂ©aire stricte nâayant pas Ă©tĂ© trouvĂ©es, nous ne pouvons pas conclure que les espĂšces ayant le taux de croissance moyen le plus important correspond strictement aux espĂšces les plus gĂ©nĂ©ralistes (SSI le plus faible) et que les taux de croissance minimaux sont atteints chez les espĂšces les plus spĂ©cialistes. Il semble quâune relation plus complexe sâĂ©tablit entre ces deux facteurs.
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Cartes dâabondances relatives La large couverture spatiale des sites suivis au niveau rĂ©gional et la standardisation de recueil des donnĂ©es permettent lâĂ©tude des variations spatiales de lâabondance relative des espĂšces communes. Pour chaque carrĂ© suivi, on calcule le nombre total dâindividus dâune espĂšce pour lâensemble des 10 points moyennĂ© sur lâensemble des annĂ©es suivies. On obtient ainsi une valeur dâabondance relative de lâespĂšce rapportĂ© Ă une unitĂ© de surface fixe de 4 km2 (surface du carrĂ© STOC). A partir de ces valeurs dâabondance relative, on peut utiliser des outils de statistiques spatiales pour interpoler lâabondance relative dâune espĂšce Ă lâensemble du territoire (modĂšles de krigeage). Cette mĂ©thode tient compte de lâhĂ©tĂ©rogĂ©nĂ©itĂ© de densitĂ© de carrĂ©s STOC suivis. La reprĂ©sentation graphique de ces variations spatiales est une carte nationale dâabondance relative pour lâespĂšce considĂ©rĂ©e. Cette reprĂ©sentation matĂ©rialise les cĆurs des populations des espĂšces communes. La coloration sur les cartes reprĂ©sente lâaugmentation de lâabondance relative, du clair au foncĂ©. La coloration la plus claire nâimplique pas une absence de lâespĂšce, mais une abondance relative nĂ©gligeable par rapport Ă celle mesurĂ©e sur lâensemble des carrĂ©s EPS ailleurs en Aquitaine.
Nous avons interpolĂ© les donnĂ©es dâabondance des espĂšces Ă partir de leurs relations Ă leur habitat (donnĂ©es Corine Landcover, krigeage universel). De meilleures cartes de prĂ©diction seraient possibles avec dâautres couches dâhabitat plus prĂ©cises de mĂȘme quâavec dâautres variables jouant sur les variations dâabondance des oiseaux (relation Ă la fragmentation du paysage, Ă sa diversitĂ©âŠ). Nous y travaillons.
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4. Conclusion
Le STOC-ÂâEPS est le seul suivi participatif standardisĂ© des populations dâoiseaux au niveau national qui permet de surveiller leur Ă©tat de santĂ© Ă lâĂ©chelle rĂ©gionale ou nationale. La rigueur des observations (mĂȘme observateur, mĂȘme date, mĂȘme heure, mĂȘme lieu) dans le suivi des points dâĂ©coute diminuera le biais et le « bruit » et amĂ©liorera la qualitĂ© de cet observatoire. Si nous sommes arrivĂ©s aujourdâhui Ă faire un suivi sur une dizaine dâannĂ©es, un lĂ©ger essoufflement se fait sentir au sein des observateurs (carrĂ©s abandonnĂ©s ou non-Ââsuivis certaines annĂ©es). Il est important de savoir quâun manquement au suivi une annĂ©e nâest pas grave en soi, surtout si le nombre dâannĂ©es de suivi est dĂ©jĂ grand ou sera grand. Il ne faut pas abandonner pour autant, les donnĂ©es des autres carrĂ©s sur cette annĂ©e manquante nous permettront de combler ce manque grĂące Ă la modĂ©lisation statistique. Lâimportant est de pĂ©renniser le suivi ! Il nous permettra de surveiller la rĂ©ponse des communautĂ©s dâoiseaux Ă lâurbanisation et Ă la fragmentation des espaces naturels dans notre rĂ©gion, de prioriser la protection des communautĂ©s ou des espĂšces en difficultĂ©.
Alors tous à vos carrés STOC et bonne saison de suivi 2013 !
Photo : Y. Charbonnier
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5. Bibliographie
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Devictor, V., R. Julliard, J. Clavel, F. Jiguet, A. Lee and D. Couvet. 2008b. Functional biotic homogenization of bird communities in disturbed landscapes. Global Ecol. Biogeogr. 17, 252â261.
Devictor, V., Julliard, R, Couvet, D., Jiguet, F. (2008c). Birds are tracking climate warming, but not fast enough. Proc. R. Soc. B 275, 2743-Ââ2748.
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Jiguet F (2010). Les rĂ©sultats nationaux du programme STOC de 1989 Ă 2009. www2.mnhn.fr/vigie-Âânature. Jiguet F, Gadot A-ÂâS, Julliard R, Newson SE & Couvet D (2007) Climate envelope, life history traits and the resilience of birds facing global change. Global Change Biology 13: 1672-Ââ1684
Jiguet F, Julliard R, Thomas CD, Dehorter O, Newson SE & Couvet D (2006) Thermal range predicts bird resilience to extreme temperatures. Ecology Letters 9: 1321-Ââ1330.
McKinney, M.L. (2008) Do humans homogenize or differentiate biotas? It depends. Journal of Biogeography 35, 1960â1961
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Lien internet : http://vigienature.mnhn.fr/page/le-Ââsuivi-Ââtemporel-Ââdes-Ââoiseaux-Ââcommuns-Ââstoc
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Annexe1. Nomenclature des habitats STOC-ÂâEPS (Source MNHN / CRBPO)
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Annexe1. Nomenclature des habitats STOC-ÂâEPS (Source MNHN / CRBPO) (suite)âŠ
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Annexe2. Analyses des tendances STOC-ÂâEPS / Utilisation du logiciel TRIM (Source MNHN / CRBPO)
ANALYSE DES TENDANCES STOC EPS
UTILISTION DU LOGICIEL TRIM
CREER DES FICHIERS ANALYSABLES PAR LE LOGICIEL TRIM Le CRBPO gĂšre sa base de donnĂ©es STOC EPS avec le logiciel FNAT2000, dĂ©veloppĂ© par la sociĂ©tĂ© Saxrub (site www.saxrub.fr). Dans ce logiciel, diverses requĂȘtes automatiques permettent dâanalyser les donnĂ©es comme nous le faisons au niveau national (production automatique des tableaux tels que nous les publions dans la revue âOrnithosâ. Parmi les requĂȘtes automatiques proposĂ©es par le logiciel FNAT2000 pour traiter les donnĂ©es STOC EPS, il en existe une qui crĂ©e des fichiers directement analysables par le logiciel gratuit TRIM. Cette requĂȘte se trouve dans la rubrique Centrale, SynthĂšses et Impressions, SynthĂšse STOC EPS, Constitution dâun fichier permettant lâanalyse des variations temporelles avec le logiciel TRIM. On sĂ©lectionne une espĂšce, des carrĂ©s, des annĂ©es (le maximum), et la requĂȘte crĂ©e un fichier en format PRN oĂč chaque ligne contient : n° de carrĂ©, annĂ©e, effectif de lâespĂšce concernĂ©e. Si le suivi a Ă©tĂ© effectuĂ© et que lâespĂšce nâa pas Ă©tĂ© vue une annĂ©e donnĂ©e, lâeffectif est Ă©gal Ă â0â. Si le suivi nâa pas Ă©tĂ© effectuĂ© une annĂ©e donnĂ©e, la valeur manquante est codĂ©e â-Ââ1â. Les lignes du fichier final sont triĂ©es par carrĂ©, puis par annĂ©e. Il nây a pas dâen-ÂâtĂȘtes de colonne. Ce fichier est directement importable dans le logiciel TRIM pour ĂȘtre analysĂ©. Exemple de dĂ©but de fichier, enregistrĂ© sous le nom ORIORI0105.PRN (donc donnĂ©es de Loriot de 2001 Ă 2005). Le fichier de donnĂ©es âloriotâ est joint Ă ce document pour exemple de traitement. 010295 2001 -Ââ1 010295 2002 6 010295 2003 2 010295 2004 7 010295 2005 3 010604 2001 -Ââ1 010604 2002 1 010604 2003 4 010604 2004 2 010604 2005 0 etc⊠Le suivi de ces deux carrĂ©s a dĂ©butĂ© en 2002 (pas de donnĂ©es en 2001 donc des â-Ââ1â), et lâobservateur du carrĂ© 010604 nâa pas dĂ©tectĂ© de loriot en 2005. Si vous ne possĂ©dez pas le logiciel FNAT2000, le fichier peut Ă©galement ĂȘtre crĂ©Ă© sous Excel en respectant les indications suivantes (un fichier par espĂšce) : - remplir trois colonnes, sans en-ÂâtĂȘtes, avec dans la premiĂšre colonne les numĂ©ros de carrĂ©
(que des chiffres), dans la deuxiĂšme les annĂ©es, dans la troisiĂšme les effectifs dĂ©tectĂ©s - ne sont pris en compte que les carrĂ©s oĂč lâespĂšce a Ă©tĂ© dĂ©tectĂ©e au moins une annĂ©e - si un carrĂ© a Ă©tĂ© prospectĂ© une annĂ©e mais lâespĂšce nâa pas Ă©tĂ© dĂ©tectĂ©e, la valeur des
effectifs est â0â - si un carrĂ© nâa pas Ă©tĂ© prospectĂ© une annĂ©e donnĂ©e, la valeur des effectifs est â-Ââ1â (code pour
les valeurs manquantes) - le fichier est triĂ© dâabord par numĂ©ro de carrĂ© croissant, puis par annĂ©e croissante - la feuille Excel est enregistrĂ©e en format texte PRN dans le rĂ©pertoire de travail du logiciel
TRIM âŠ
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Annexe3. Milieux principaux des points d'Ă©coute par dĂ©partements dâAquitaine
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EspĂšce NbcarrĂ©s FrĂ©quence Abondance EspĂšce NbcarrĂ©s FrĂ©quence AbondanceCorneille noire 38 1.000 407 Pouillot fitis 5 0.132 10Merle noir 38 1.000 503 Fauvette pitchou 5 0.132 11Mesange charbonniere 37 0.974 298 Mouette rieuse 4 0.105 85Fauvette Ă tĂȘte noire 37 0.974 358 Locustelle tachetee 4 0.105 8Troglodyte mignon 37 0.974 348 Gobemouche gris 4 0.105 5Grive musicienne 37 0.974 234 Bouvreuil pivoine 4 0.105 10Verdier d'Europe 36 0.947 170 Epervier d'Europe 3 0.079 4Pouillot veloce 36 0.947 242 Perdrix rouge 3 0.079 4Rougegorge familier 35 0.921 279 Heron garde-Ââboeufs 3 0.079 8Pinson des arbres 35 0.921 354 Cigogne blanche 3 0.079 11Hirondelle rustique 35 0.921 504 Caille des blĂ©s 3 0.079 6Mesange bleue 35 0.921 217 Aigrette garzette 3 0.079 10Pic vert 34 0.895 150 GoĂ©land leucophĂ©e 3 0.079 166Tourterelle turque 34 0.895 333 Roitelet huppĂ© 3 0.079 6Ătourneau sansonnet 34 0.895 880 Fauvette des jardins 3 0.079 4Chardonneret Ă©lĂ©gant 32 0.842 206 Phragmite des joncs 2 0.053 3Coucou gris 32 0.842 253 Rousserolle effarvate 2 0.053 14Moineau domestique 32 0.842 772 Martin-ÂâpĂȘcheur d'Europe 2 0.053 5Rougequeue noir 32 0.842 116 Tarin des aulnes 2 0.053 2Geai des chĂȘnes 31 0.816 123 Busard Saint-ÂâMartin 2 0.053 4Bergeronnette grise 31 0.816 73 Busard cendrĂ© 2 0.053 6Pic Ă©peiche 30 0.789 105 Grosbec casse-Âânoyaux 2 0.053 3Rossignol philomele 30 0.789 135 Choucas des tours 2 0.053 14Huppe fasciee 29 0.763 100 Cygne tuberculĂ© 2 0.053 3HypolaĂŻs polyglotte 28 0.737 90 Faucon hobereau 2 0.053 2Pigeon ramier 27 0.711 140 Foulque macroule 2 0.053 3Pie bavarde 27 0.711 117 Vautour fauve 2 0.053 21Grimpereau des jardins 26 0.684 78 Echasse blanche 2 0.053 8Milan noir 26 0.684 155 Milan royal 2 0.053 2Serin cini 26 0.684 75 BondrĂ©e apivore 2 0.053 2Tarier pĂątre 25 0.658 78 Chouette hulotte 2 0.053 2Tourterelle des bois 25 0.658 120 Autour des palombes 1 0.026 1Martinet noir 24 0.632 823 Chevalier guignette 1 0.026 1Sittelle torchepot 24 0.632 88 Canard pilet 1 0.026 1Accenteur mouchet 23 0.605 64 Canard siffleur 1 0.026 1Mesange Ă longue queue 21 0.553 62 Oie cendrĂ©e 1 0.026 2Buse variable 21 0.553 59 Pipit rousseline 1 0.026 1Loriot d'Europe 21 0.553 94 HĂ©ron pourprĂ© 1 0.026 3Pipit des arbres 20 0.526 78 Tournepierre Ă collier 1 0.026 4Bruant zizi 20 0.526 73 Fuligule milouin 1 0.026 5Faucon crecerelle 18 0.474 37 Grimpereau des bois 1 0.026 1Fauvette grisette 18 0.474 56 Grand Gravelot 1 0.026 1Grive draine 18 0.474 49 Cincle plongeur 1 0.026 1Canard colvert 15 0.395 75 Busard des roseaux 1 0.026 9Faisan de Colchide 15 0.395 42 Circaete Jean-Ââle-Ââblanc 1 0.026 1Linotte melodieuse 13 0.342 75 Grand Corbeau 1 0.026 1Cisticole des joncs 13 0.342 30 Pic mar 1 0.026 1Pigeon biset 13 0.342 546 Bruant des roseaux 1 0.026 3Heron cendre 12 0.316 33 Faucon pĂšlerin 1 0.026 1Torcol fourmilier 12 0.316 25 Gobemouche noir 1 0.026 1Alouette lulu 12 0.316 27 Cochevis huppe 1 0.026 2Roitelet Ă triple bandeau 12 0.316 30 Pie-Ââgrieche Ă tĂȘte rousse 1 0.026 1Bouscarle de Cetti 11 0.289 24 GoĂ©land argentĂ© 1 0.026 257Alouette des champs 10 0.263 26 Mouette mĂ©lanocĂ©phale 1 0.026 6Rougequeue Ă front blanc 10 0.263 34 Gorgebleue Ă miroir 1 0.026 2Hirondelle de fenĂȘtre 9 0.237 53 Bergeronnette des ruisseaux 1 0.026 1MĂ©sange nonnette 9 0.237 14 Courlis corlieu 1 0.026 1Pouillot de Bonelli 9 0.237 24 Traquet motteux 1 0.026 1MĂ©sange huppĂ©e 8 0.211 19 MĂ©sange noire 1 0.026 2Pipit farlouse 7 0.184 42 GrĂšbe huppĂ© 1 0.026 1Bruant proyer 7 0.184 15 Hirondelle de rivage 1 0.026 18Pic epeichette 6 0.158 9 Tarier des prĂ©s 1 0.026 1Gallinule poule-Ââd'eau 6 0.158 8 Tadorne de Belon 1 0.026 4Pie-Ââgrieche ecorcheur 6 0.158 10 Chevalier arlequin 1 0.026 1Bruant jaune 5 0.132 19 Chevalier aboyeur 1 0.026 2Bergeronnette printaniĂšre 5 0.132 18 Chevalier gambette 1 0.026 3Moineau friquet 5 0.132 34 Grive litorne 1 0.026 5
Vanneau huppé 1 0.026 19
Annexe 4. FrĂ©quence des espĂšces contactĂ©es lors du STOC-ÂâEPS 2005 (38 carrĂ©s suivis = max 2002-Ââ2012)
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Annexe 5. RĂ©partition des carrĂ©s STOC-ÂâEPS de 2002 Ă 2012
Carte1 :
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Annexe 5. RĂ©partition des carrĂ©s STOC-ÂâEPS de 2002 Ă 2012 (suite)
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Bouvreuil pivoine
Troglodyte mignon
Annexe 6. Cartes de rĂ©partition dâabondances relatives de quelques espĂšces
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Rougegorge familier
Mésange huppée
* Les valeurs en lĂ©gende correspondent Ă lâabondance en log, il faut les transformer (10^x) pour avoir lâabondance estimĂ©e.
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Ce travail a été réalisé dans le cadre de
lâAtlas RĂ©gional des Oiseaux Nicheurs dâAquitaine.
Ce projet bénéficie du soutien financier de :