Epidémies, Surveillance et Perspectives¨me_réu… · portion du gène NSs (601 bp) est accessible, d’oùla représentation de ce second arbre incluant les souches Mauritanie

Fièvre de la Vallée du Rift en Mauritanie

Epidémies, Surveillance et Perspectives

Dr DOUMBIA Baba, CVO Mauritanie

Faro, le 13 juin 2013

INTRODUCTION

DEFINITION

La fièvre de la Vallée du Rift (FVR) est une zoonose virale touchant principalementles animaux mais pouvant aussi contaminer l'homme.

Elle est également connue sous le nom d’hépatite enzootique du mouton, en raisondes lésions caractéristiques d’hépatite observées et de la sensibilité particulière desovins à cette infection (Provost, 1980 ; Swanepoel & Coetzer, 2004).

La maladie est transmise par des piqûres de nombreuses espèces de moustiquesappartenant aux genres edes, Anopheles, Culex, Eretmapodites et Mansonia.

CULEX AEDES

Les principaux vecteurs en Afrique de l’ouest sont les moustiques des genres :

INTRODUCTION (2)

INTRODUCTION (3)

CONDITIONS D’APPARITION

Les épidémies de FVR sont souvent associées à des facteurs de risque tels que lesaménagements hydrauliques (Egypte 1977, Mauritanie 1987)

Les adaptations et changements biologiques, le trafic et le commerceinternationaux, la démographie et les comportements humains (Wilson, 1994) ;

Les pluies diluviennes qui font suite à une période de sécheresse (Mauritanie,1998, 2010 et 2012) (Martin, 2001).

Source CDC, 2003

Zone épidémique (Gambie, Sénegal, Mauritanie, Namibie, Afrique du Sud, Mozambique, Zimbabwe, Zambie, Kenya,

Soudan, Egypte, Madagascar, Arabie Saoudite, Yémen)Zone enzootique (Botswana, Angola, République Démocratique du Congo, Congo, Gabon, Cameroun, Nigeria,

République Centrafricaine, Tchad, Niger, Burkina Faso, Mali, Guinée, Tanzanie, Malawi, Ouganda, Ethiopie, Somalie)

DISTRIBUTION GEOGRAPHIQUE

Les grandes épidémies:Egypte: 1977/78Mauritanie: 1987/1998/2010/2012Kenya: 1998/2006/07A. Saoudite/Yémen: 2000

INTRODUCTION (4)

• Circulation virale entre 1981 et 1986

• Epidémie en 1987 (+ de 300 décès)

• Reprise de la circulation entre 1993 et 1995

• Epidémie en 1998 (6 décès)

• Epidémie en Adrar et Inchiri en 2010 (13 décès)

• Epidémie en 2012 dans plusieurs wilayas du pays (36 cas FH dont 21 confirmés et 19 décès).

HISTORIQUE DE LA FVR EN RIM

EPIDEMIE DE LA FVR EN 1987

• Mise en évidence une importante circulation du virus de la FVR dans le Sud de la Mauritanie entre 1981 et 1986 (Saluzzo et al., 1987)

• Durant l'hivernage 1987, une épizootie de FVR a touché la basse etmoyenne vallée du fleuve Sénégal entraînant une vague d’avortements chezles ruminants et une mortalité élevée chez les jeunes.Elle a été suivie quelques semaines plus tard, dans cette même région parune épidémie qui a entraîné la mort de plusieurs centaines de personnes.

• L’étendue géographique de l’épidémie, par rapport à la ville de Rosso,s’étend jusqu’à Keur Masséne à l’ouest (63 km), Tiguent au nord (90 km),Mbout à l’est (325 km) en passant par Rkiz et Boghé (Jouan et al., 1990).

• Cette épidémie est probablement due aux changements hydro-écologiquessurvenus à la suite de la mise en eau du barrage de Diama sur le fleuveSénégal en 1987 (Jouan et al., 1990).


Deux foyers de FVR ont été observés en 1993 dans les régions du Gorgolet du Guidimakha en Mauritanie et dans la région de St-Louis au Sénégal(Fontenille et al., 1998).

Une étude de prévalence de la FVR, conduite en Mauritanie en 1993,conclut à une reprise de la circulation du virus dans les régions du Gorgol,de l’Assaba et du Hodh El Gharbi (Schneegans, 1999).

En 1998 une deuxième épidémie a frappé Aïoun El Atrouss au Hodh ElGharbi à environ 800 km de la zone des foyers de 1987.

Six personnes sont décédées à l’hôpital d’Aïoun El Atrouss entre le 15septembre et le 1 octobre 1998 (Nabet et al., 2001).


Durant l’hivernage 2010 une épidémie de FVR est survenue en Adrar aunord de la Mauritanie, dans une zone où on s’attendait le moins.

Cependant cette épidémie a suivi le tableau classique habituel à savoir :

o Une pluviométrie sans précédant au niveau des zones affectées

o Une pullulation inhabituelle de moustiques

o Des vagues d’avortement chez les animaux

o Une contamination de l’Homme

EPIDEMIE DE LA FVR EN 2010 (2)

Repartition des cas de Fievre de la Vall e du Rif t de la semaine 43 � la semaine 52/ 2010 par districts au niveau des rˇgions de l'Adrar et de l'Ichiri en Mauritanie

3

6

2 23

1

4

1 0

2

0

1

6

3

3

12

14

1

2

2

0

5

10

15

20

25

S43 S44 S45 S46 S47 S48 S49 S50 S51 S52

Semaine epidemiologique 2010

No

mb

re d

e

Akjoujt

Ajoueft

Chinguitti

Atar

Octobre Novembre

25

†D

† 2fillettes

† berger

31

Décembre

21

2 susp. cliniques dont 1 †

26

Le 15/12 : dernier cas humain connu

EPIDEMIE DE LA FVR EN 2010 (3)Facteurs d’émergence: Un environnement modifié…

… et favorable aux populations de moustiques


En Adrar et l'Inchiri, les analyses effectuées sur les échantillons prélevésont confirmé la présence de la fièvre de la Vallée du Rift (FVR) chez despatients et des animaux.

La situation de l’épidémie chez les humains se résume officiellement à 68cas (21 à Atar, 2 à Chinguitty, 41 à Aoujeft et 4 à Akjoujt) avec 13 décès,soit un taux de létalité de 19%.

D’autre part, sur les 546 prélèvements effectués sur les animaux, 123 sontpositifs, soit 22,5 %.

Le dromadaire, une espèce affectée


Techniques utilisées : Test VNT (recherche d’anticorps anti FVR) Test d’Isolement virus sur cellules vero E6 Test RT-PCR en pool de 4 sérums (recherche de

génome du virus FVR) avec les séquences amorcesciblant gène NS1 RVF1- F 5’-TGT CAC ACT GCTCTC AGT GCC et RVF2-R5’-GGA GCT TGC CTGAAT CAG TTC- (Taille fragment: 363pb)

Résultats : Test VNT : 67 sérums positifs pour

117 sérums testés, soit unpourcentage de 57,3

Conclusions : Confirmation dudiagnostic de la fièvre de la vallée duRift par détection de génome etd’anticorps spécifiques des sérums dedromadaires et de petits ruminants deAdrar (Akjoujt) et de Nouakchott(Nouadibou).

N°ISRA Echantillon Espèce Résultats RT PCR Résultats Isolement

4 Sang Dromadaire Négatif Négatif

7 Sang Dromadaire POSITIF POSITIF

SN Sérum Dromadaire POSITIF POSITIF


EPIDEMIE DE LA FVR EN 2010 (7)Tableau N°2: Résultats des sérums de chèvres et de dromadaires de la région

d’Inchiri et d’Adrar, Mauritanie.

N°

Echantillon

Espèce

Résultats

RT PCR

Résultats

Isolement

1 Sérum Chèvre Négatif Négatif








9 Sérum Chèvre Négatif POSITIF







16 Sérum Chèvre Négatif POSITIF





21 Sérum Dromadaire POSITIF Négatif


23 Sérum Dromadaire Négatif Négatif

24 Sérum Dromadaire POSITIF POSITIF






30 Sérum Dromadaire POSITIF POSITIF




Isolement du virus puis séquençage chez le dromadaire (pour la 1ère fois) : letypage par séquençage complet des segments S et M des virus FVR au CIRAD àpartir des souches isolées au LNERV-ISRA à partir de sérums de caprins et decamélidés échantillonnés en Mauritanie par les services vétérinaires.

En effet, aucun lien proche avec les souches isolées en 1987. Aucune séquencecomplète de souches FVR de l’épisode 2002-2003 n’est accessible, seule uneportion du gène NSs (601 bp) est accessible, d’où la représentation de ce secondarbre incluant les souches Mauritanie (Figure 6). Les souches isolées en 2003font partie du clade Est africain avec les souches kenyannes et malgaches, lessouches Mauritanie de 2011 se trouvent dans un clade isolé.

Total of precipitation (in mm) in Atar, Adrar region, from 1950 to Oct. 2010 Source: CLIMPAG / FAOClimNet and meteorological service of the Ministry of Rural Development, Mauritania

CONDITIONS D’EMERGENCE: EFFET DE LA PLUVIOMETRIE

0

50

100

150

200

250

300

350

400

moyenne annuelle

moyenne annuelle

CONDITIONS D’EMERGENCE: EFFET DE LA PLUVIOMETRIE (2)


L’alerte a été donnée par le Ministère de la Santé suite à la confirmation de la FVR par le laboratoire d’un cas suspect de fièvres hémorragiques à Ouad Naga, le 16 septembre.

Une première enquête épidémiologique réalisée du 27 septembre au 04 octobre dans les sites de Ouad Naga (Trarza), Ouneija (Brakna), Tourgueyline (Tagant) et Kiffa (Assaba) n’a pas pu mettre en évidence un lien étroit entre les cas humains et l’Animal.

Au cours de cette enquête l’analyse de 97 prélèvement de sang réalisés à Lehlewa (27), Ouneija (20), Tourgueyline (31) et Kiffa (18) a permis de révéler un seul animal (bovin) positif en IgM

Il a été ensuite recommandé d’urgence une enquête au niveau national.

EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (2) L’enquête nationale a été élaborée suivant trois axes :

axe Tagant-Assaba-Hodh EL Gharbi et Hodh Charghi

axe des régions de la vallée du fleuve Sénégal

axe des régions du Nord

Cette enquête a permis de détecter des foyers de FVR chez l’animaldans les régions du Tagant, Hodh Chargui, Hodh EL Gharbi,Braknaet Gorgol.

Les espèces les plus touchées sont les petits ruminants et lesdromadaires.


Région Nombre de prélèvements Avortements Ig M positifs

Tagant 205 33 48

Brakna 151 11 9

Hodh Charghi 176 35 26

Hodh El Gharbi 144 59 53

Assaba 93 20 46

Trarza 286 11 3

Gorgol 162 50 6

Adrar 118 0 1

Inchiri 107 0 0

Guidimakha 127 0 0

Tiris Zemmour 79 0 1

Nouakchott 215 2 9

Total 1.863 221 202

EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (4)Espèce Avortements Ig M Ig G

PR 200 164 242

Camelins 19 27 224

Bovins 7 12 54

0

50

100

150

200

250

300

PR Camelins Bovins

Avortements

IgM

IgG


EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (6)RELATION ENTRE CAS HUMAINS ET CAS ANIMAUX

Région Nombre de prélèvements Avortements IgM positifs Cas conf Décés

Tagant 205 33 48 6 8

Brakna 151 11 9 1 2

Hodh Charghi 176 35 26 2 2

Hodh El Gharbi 144 59 53 4 4

Assaba 93 20 46 2 1

Trarza 286 11 3 3 2

Gorgol 162 50 6 0 0

Adrar 118 0 1 0 0

Inchiri 107 0 0 0 0

Guidimakha 127 0 0 0 0

Tiris Zemmour 79 0 1 0 0

Nouakchott 215 2 9 0 0

Total 1863 221 202 18 19


0

50

100

150

200

250

300

350

Taga

nt

Brakn

a

Hod

h Cha

rgui

H.G

harbi

Ass

aba

Trar

za

Gor

gol

Adrar

Inch

iri

Guidimak

ha

Tiris

zem

mou

r

Nou

akch

ott

Nombre de prélèvements

Avortements

IgM positifs

Cas conf

Décés

EPIDEMIE DE LA FVR EN 2012 (8) En santé humaine•Réunion technique présidée par le Ministre en présence du Représentant de l’OMS ;

•Réunion de la Cellule de Veille conjointe•Mission d’évaluation conjointe MDR et MS •la lutte anti vectorielle en collaboration avec le MDR•Diffusion des directives sur détection, la prise en charge et préventionde la FVR

•Envoi des messages à tous les Walis pour le renforcement de la situation épidémiologique•Emission de sensibilisation et d’ information du public dans les médias (TV, Radio)

•Dispositions en cours pour le renforcement du plateau technique de l’ INRSP , des banques de sang , laboratoires régionaux et stocks de médicaments.

•Acquisition en cours de 100.000 moustiquaires imprégnées.


En santé animale : Les principales mesures prises ont consisté, entre autres, à :

Détection et détermination de l'amplitude de la maladie chez les animaux à travers une surveillance active et passive, et le suivi des suspicions et des rumeurs;

Mission d’investigation du 28 septembre au 04 octobre 2012 au niveau des foyers humains à Ouad Naga, Maghta Lahjaar, Letfetar et Kiffa ;

Acquisition de nouveaux kits Elisa IgM et IgG.

Renforcement de l’inspection des viandes, le renforcement du personnel et des mesures d’hygiène des viandes, distribution du matériel de protection, examen systématique des animaux à l’abattoir et consignes pour mettre en quarantaine tout animal suspect;


Utilisation de produits répulsifs chez les animaux pour limiter la transmissionde la maladie au sein du cheptel (six équipes opèrent actuellement dans leswilayas qui ont connu une circulation virale).

Enquête épidémiologique sur l’ensemble du territoire dont l’objectif est de détecter la circulation virale et collecter les données relatives à la maladie.

Surveillance des élevages laitiers et les marchés à bétail ;

Lutte anti vectorielle en collaboration avec la Santé;

Information et sensibilisation de l’opinion publique (émissions radio ettélévisées, posters et guide de surveillance de la maladie) ;

Soumission de requêtes aux partenaires techniques.


Ces résultats montrent :

l’étendue de l’épidémie contrairement à celle de 2010, limitée à la région de l’Adrar.

Un taux de létalité relativement élevé quoi que expliqué en partie par la faible prise en charge des malades nécessitant des transfusions .

Une absence, pour le moment de la maladie animale dans des zones très « sensibles » comme le Trarza et le Guidimakha.

Un lien étroit avec la pluviométrie et la pression des moustiques.

Les conditions climatiques étaient favorables à une telle émergenceavec l’importance de la pluviométrie enregistrée cette année etconsécutive à une année de sécheresse.

L’émergence de la maladie en 2012, soit moins de deux ans aprèsl’épidémie de l’Adrar, explique soit que cette dernière était associée àune activité du virus dans le sud non décelée, soit qu’on est en face dedeux situations indépendantes, l’une au nord et l’autre dans le reste dupays.

l’absence de données entomologiques reste un facteur limitant pourmieux comprendre le maintien du virus et l’épidémiologie de lamaladie.


PERSPECTIVES

Particularité de la FVR chez le dromadaire

Mécanisme de Maintien du virus

Mécanismes d’émergence de la maladie

Et surtout : Gestion de toutes les alertes avec des données et des prélèvements

adéquats

Amélioration du système des Troupeaux sentinelles

Enquêtes entomologiques

Analyses virologiques et histologiques

Vaccination

Approfondir les investigations sur les prélèvements déjà réalisées (PCR,Isolement, séquençage) pour mieux caractériser la souche 2012 et voir lelien probable avec celle de 2010.

Nbeika (Tagant), octobre 2012

Nbeika (Tagant), octobre 2012

Oualata (Hodh Charghi), octobre 2012

Oualata (Hodh Charghi), octobre 2012

Tintane (Hodh El Gharbi), octobre 2012

Documents

Epidémies, Surveillance et Perspectives¨me_réu… · portion du gène NSs (601 bp) est accessible, d’oùla représentation de ce second arbre incluant les souches Mauritanie