MIKROBIOLOGI DASAR dan HANDLING SPECIMEN

MIKROBIOLOGI DASAR danHANDLING SPECIMENDefinisi InfeksiSuatu fenomena ditandai dengan respons inflamasi akibat masuknya m.o ke jaringan tubuh steril.Definisi InflamasiReaksi jar. Vaskuler thd jejas.3Proses Infeksi:AdherenceColonizationMultiplicationInvasion ? kerusakan jaringan, gannguan fungsi(Penyakit infeksi)4Infection ProgressTimeNumber of microorganismsIncubation periodNo diseaseUncertainly regionOnset of symptomsOvert diseaseDeathCureRecurent disease22/01/2015#Agent dalam mikrobiologiMikrobiologi adalah ilmu yang mempelajari mengenai mikroorgasnismeMikroorganisme merupakan mahluk hidup yang tidak dapat dilihat dengan mata telanjang tanpa bantuan alat.Alat yang dipakai adalah mikroorganisme22/01/2015#5Mikroskop Pertama

Microscope buatan Antony van Leeuwenhoek (1632-1723)22/01/2015#6

Type MicroorganismeBacteriaProtozoaMicroscopik AlgaeMicroscopik FungiVirus

Yang menjadi pembahasan agent mikrobiologi adalah Bacteria, Fungi, Virus

22/01/2015#8Mikroba Sebagai AgentMicroba dapat menyebabkan penyakit, sekaligus dapat melindungi tubuh dari penyakit yaitu sebagai flora normalBeberapa Microba memproduksi antibiotikIlmu Kedokteran modern difokuskan pada kemampuan menjaga tubuh dari infeksi mikroba dan mengobati penyakit yang ditimbulkan mikrobaTeori Hubungan Mikroba dengan Penyakit = Mikroba adalah penyebab/agent dari penyakit22/01/2015#Scale of Microbes

Bacteria Bentuk Batang/Basil

22/01/2015#Bacteria Bentuk Coccus

22/01/2015#Bacteria Bentuk Spiral

22/01/2015#

Bentuk Virus22/01/2015#

Sumbu Spiral

dr. Ridho

Struktur khusus yang penting untuk kelangsungan hidup jamur.Fungsi sporaReproduksi aseksualResistensi terhadap kondisi burukSPORA

SILAHKAN BACA ATLAS MIKOLOGI dr Ridho di Perpustakaan Komputer2121Chitin is the same material used by Arthropods (Insects, crabs, etc.) in their exoskeletonsa

Nuclei of fungi are hard to see without stainsJAMURMIKOSISINFEKSI OPORTUNISTIKFakt. Risiko:DM, keganasan, AB excesive, imunosupr.Flora normal Patogen Staphylococcus S.aureus :Terdapat di rongga hidung, aksila, perineumMenular melalui kontak (tangan), sekresi nasalInfeksi didahului adanya kolonisasi hidung , orofaringPenyebab infeksi kulit dan jaringan lunak, osteomielitisPenyebaran melalui darah bakteremia, sepsisCNS (S.epidermidis, S.saprophyticus) :Mengakibatkan infeksi endogen (dari tubuh pasien sendiri)Patogenitas rendah akibatkan infeksi pada pemakaian alat invasif (kateter urin / intravena), imunitas rendah, benda asing, pemakaian antibiotik berlebihan

22/01/2015#STAPHYLOCOCCUS

Bentuk bulat/sferis, ukuran 0,8-1 m, non motil, spora (-), tampak bergerombol seperti buah anggur, Gram (+) Pewarnaan: Gram dan pewarnaan sederhana (Methylen Blue, Air Fuchsin) Patologi: Pyogenic infection Spesimen: Pus, exudat, aspirasi trachea, cairan spinal, sputumSpesies :S. albus : hemolitik (-), pigmen putihS. citreus : hemolitik (-), pigmen hijauS. aureus : hemolitik (+), pigmen kuning emas

22/01/2015#25StreptococcusS. pyogenes :Penyebab faringitis terutama pada anak-anak, infeksi kulit, luka bakar, infeksi neonatusKomplikasi GNA, demam rheuma (kelainan katup jantung)Penularan melalui udara, kontakEnterococcus :Flora normal ususPenyebab infeksi luka, dekubitus, vagina, meatus, ISK, bakteremia, kulit dan jaringan lunakPenularan melalui tangan petugas22/01/2015#STREPTOCOCCUS

Bentuk bulat/sferis, ukuran 0,5-1 m, non motil, non spora, tampak berderet seperti rantai, Gram (+)Pewarnaan: Gram dan pewarnaan sederhanaPatologi: Pyogenic infection, demam rematik, endocarditis, faringitisSpesimen: Pus, swab tenggorokSpesies :Streptococcus viridans atau alpha hemolitikStreptococcus hemolitik atau beta hemolitikStreptococcus faecalis atau gama hemolitik

22/01/2015#27EnterobacteriaceaeBatang Gram negatip :Flora normal usus : E.coli, Klebsiella, Enterobacter, ProteusKolonisasi orofaring terjadi pd penyakit berat, pemakaian antibiotik berlebih, perawatan lama di RS akibatkan pneumonia endogenousCara penularan :Melalui tangan petugas, permukaan tercemarPemakaian luas sefalosporin generasi 3 meningkatkan infeksi terutama di ICU, pasien kemoterapi22/01/2015#ESCHERICHIA

Bentuk batang, Gram (-), non spora, motil, flagella peritrik, kapsul (-), ukuran 0,5x3 mPewarnaan: Gram Methylen Blue, Air fuchsin, Gray atau Leifson.Patologi: ISK, luka infeksi, peumoni, meningitis, septikemi Spesimen: Darah, tinja, urine, pus, secret uretra dan vagina, makanan, minuman, air, dllSpesies :E. coli22/01/2015#29Gram negatip NonfermentersPseudomonas aeruginosa :Melekat pd epitel trakea, kornea akibat kerusakan jaringanPasien imunitas rendah kolonisasi di faring, rektumMenghasilkan glikokaliks terlindung dari efek fagositosis leukosit, terapi aminoglikosidaSumber : air kran, tempat lembab penularan melalui kontak dg sumber di lingkunganStenotrophomonas maltophilia :Sebenarnya tidak virulen, kuman lingkunganPenyebab infeksi pd imunitas rendahPenularan melalui kontak tangan petugasDampak pengobatan imipenem berlebihan22/01/2015#PSEUDOMONAS

batang, non spora, non kapsul, motil, flagel polar, Gram (-), ukuran 0,5-1x3-4 mPewarnaan: Gram, Methylen Blue, Air fuchsinPatologi: nosocomial infectionSpesimen: Sesuai gejala klinikSpesiesPseudomonas aeruginosaPseudomonas cepaciaPseudomonas maltophillaPseudomonas mallei Pseudomonas pseudomallei 22/01/2015#31Acinetobacter :Kuman lingkunganFlora normal pada 25% orang normalAkibatkan infeksi pd pasien imunitas rendah, gizi burukPenularan melalui kontak permukaan lingkungan, tangan petugasNonfermenters dapat hidup dlm disinfektan : povidone-iodine, klorheksidin, benzalkonium kloride, heksaklorofenPseudomonas sp, Burkholderia cepacia tumbuh dlm lingkungan basah/lembab spt air kranGram negatip Nonfermenters22/01/2015#ACINETOBACTER

Bentuk kokus/kokobasil, non motil, spora (-), Gram (+) Pewarnaan: Gram Patologi: nosocomial infection Spesimen: darah, kulit, cairan pleura, urine, sputumSpesies :A. johnsoniiA. baumanniA. lwoffiiA. haemolyticus

22/01/2015#ALUR PERJALANAN PEMERIKSAAN MIKROBIOLOGI

KERJASAMA SELURUH UNIT TERKAIT MENUNJANG KEBERHASILAN PEMERIKSAANSPESIMEN YANG REPRESENTATIVDIAMBIL DARI LOKASI YANG TEPATDIAMBIL DENGAN TEKNIK YANG TEPATDIKEMAS DALAM WADAH YANG TEPATDIKIRIM DALAM WAKTU, CARA DAN KONDISI YANG TEPATKRITER IA PENOLAKAN SPESIMENTanpa label atau label tidak memadaiTransport prolongedWadah tidak sterilWadah rusak/pecahTerkontaminasi (mis : tinja terkontaminasi urin)Jumlah tidak mencukupiDuplikasi spesimenSPUTUM+Sputum Culture ReliabilityExpectorated unreliable because of contaminationReliability if physician observesLaboratory reliability screen> 25 PMNs, < 10 oral squamous cells per hpfSputum Container

INDUKSI :Uap NaCl Minum air hangat FisioterapiMukolitikEkspektoranNebuliser

+SPUTUMCATATAN PENTING :Sputum bukan material yang baik untuk deteksi infeksi sal. nafas ok tidak dapat menghindari kontaminasi flora mulut

Bronchoalveolar lavage, aspirasi tracheal lebih akurat

Lukens trap

Swab tenggorok+Swab tenggorok

Swab Hidung+Swab hidung

Kadang dapat dijumpai orang-orang pembawa (carrier) MRSA. Ini berarti bakteri ini hidup di dalam tubuh mereka tanpa menimbulkan sakit.

+ 46

DARAH+Apa yang harus diperhatikan?Label identifikasi harus lengkapJangan menempelkan label menutupi BarcodeAntiseptik harus benar-benar kering- Isopropyl Alcohol 70%, DAN- Iodine Tincture atau ChlorhexidineDesinfeksi tutup Bactec dengan Isopropyl Alcohol 70%Volume darah adekuatDelay time s.d 48 jam (suhu kamar).

DEWASA: 8 10 mL/ botol

BALITA s.d ANAK 10 th: 1 3 mL/ botol

BERAPA BANYAK SAMPEL DARAH YANG HARUS DIAMBIL UNTUK KULTUR DARAH?SAMPEL KURANG = HASIL RENDAH Kontaminasi

Sumber KontaminasiKulitTangan/ sarung tangan pekerja kesehatanHubungan atau sentral peralatan intravenaKESULITAN DALAM PENGAMBILAN SAMPEL KULTUR DARAHDARAH

Pilih site samplingDesinfeksi iodineDesinfeksi alkoholAspirasi darahMasukkan dalam botol bactecBersihkan sisa darahGoyangkan botol agar larutan homogenSampling Blood Culture+BACTEC PLUS AEROBICBACTEC PLUS PEDS

8 10 mL1 3 mL+DarahCairan tubuh steril:LCSCairan PleuraCairan Synovial

SAMPEL YANG DAPAT DITANAM+DARAHCATATAN : BEBERAPA HAL PENTINGDarah diambil pada saat demamSebaiknya darah diambil sebelum diberikan antibiotikaMinimal pengambilan darah untuk kultur adalah 2 setsVolume sampel darah untuk kultur harus adekuatBila terpasang intravena feeding (infus), darah diambil pada sisi yang tidak terpasang infus. Bila bersama-sama pengambilan sampel untuk pemeriksaan kimia klinik, dahulukan pengambilan darah untuk mikrobiologi

Apapun Rs nyaPpi pilihannya+