1. Flora normal usus.

Duodenum dan jejunum: 102-105 bact/mlLactobacillus, Streptococcus, Bifidobacterium, Enterobacter, Staphylococcus, Entercoccus, yeast

Ileum dan caecum: 103-109bact/mlBifidobacterium, Bacteroides, Lactobacillus, Streptococcus, Enterobacter, Clostridium, Staphylococcus

Colon (500-1000 species, possibly more (?)): 1010-1012 bact/gBacteroides, Eubacterium, Clostridium, Peptostretococcus, Bifidobacterium, Fusobacterium, Lactobacillus, Enterobacter, Staphylococcus, yeast

Famili Genus Species Habitat SifatBifidobacteriaceae Bifidobacterium breve Ileon Gram (+)

bifidum Colon Gram (+)infantis Colon Gram (+)lactis Colon Gram (+)

Moraxellaceae Acinetobacter calcoaceticus Colon Gram (-)Enterococcaceae Enterococcus faecalis GI tract Gram (+)

faecium GI tract Gram (+)Alcaligenaceae Alcaligenes faecalis Ileon Gram (-)Bacillaceae Bacillus spp. GI Tract Gram (-)Lactobacillaceae Lactobacillus spp. GI Tract Gram (+)Campylobacteraceae Campylobacter spp. Colon Gram (-)

coli GI Tract Gram (-)Clostridiaceae Clostridium spp. Ileon Gram (+)

difficile Colon Gram (+)sordellii GI tract Gram (+)

Enterobacteriaceae Enterobacter cloacae GI tract Gram (-)Escherichia coli GI tract Gram (-)

Flavobacteriaceae Flavobacterium spp. Ileon Gram (-)Methanobacteriaceae Methanobrevibacter smithii Instestine

Aulia Izzati - 22010112130116

Mycobacteriaceae Mycobacteria spp. Ileon Gram (+)Mycoplasmataceae Mycoplasma spp. Ileon Gram (+)Peptococcaceae Peptococcous spp. Colon Gram (+)Propionibacteriaceae Propionibacterium spp. Colon Gram (+)Pseudomonadaceae Pseudomonas aeruginosa Ileon Gram (-)Ruminococcaceae Ruminococcus bromii Colon Gram (+)Clostridiaceae Sarcina spp. Colon Gram (+)Staphylococcaceae Staphylococcus aureus Ileon Gram (+)Stretococcaceae Streptococcus anginosus GI tract Gram (+)

viridans Ileon Gram (+)

Aulia Izzati - 22010112130116

2. Media MacConkey, TCBS, dan SSA

MacConkey

Formula/Liter:1. Enzymatic Digest of Gelatin.................................................... 17 g2. Enzymatic Digest of Casein ................................................... 1.5 g3. Enzymatic Digest of Animal Tissue........................................ 1.5 g4. Lactose ................................................................................... 10 g5. Bile Salts Mixture ................................................................... 1.5 g6. Sodium Chloride ....................................................................... 5 g7. Neutral Red.......................................................................... 0.03 g8. Crystal Violet ...................................................................... 0.001 g9. Agar ..................................................................................... 13.5 gFinal pH: 7.1 ± 0.2 at 25C

1. Sumber vitamin dan nitrogen dalam MacConkey Agar2. Sumber vitamin dan nitrogen dalam MacConkey Agar3. Sumber vitamin dan nitrogen dalam MacConkey Agar4. Karbohidrat yang dapat difermentasi (agen diferensial)5. Menghambat pertumbuhan bakteri gram (+) (agen selektif) 6. Menjaga keseimbangan osmotik7. Sebagai indicator warna pada saat pH agar turun akibat fermentasi laktosa8. Menghambat pertumbuhan bakteri gram (+) (agen selektif)9. Pemadat

MacConkey Agar digunakan sebagai media isolasi dan diferensiasi dari Gram-negative enteric bacilli. Elemen terpenting di media ini adalah bile salt-neutral red-lactose yang dapat menjadi agen selektif serta agen diferensiasi.

Aulia Izzati - 22010112130116

TCBS

Formula/Liter:1. Yeast Extract............................................................................. 5 g2. Enzymatic Digest of Casein ...................................................... 5 g3. Enzymatic Digest of Animal Tissue........................................... 5 g4. Sodium Citrate ........................................................................ 10 g5. Sodium Thiosulfate ................................................................. 10 g6. Oxbile........................................................................................ 5 g7. Sodium Cholate ........................................................................ 3 g8. Sucrose................................................................................... 20 g9. Sodium Chloride ..................................................................... 10 g10. Ferric Citrate ........................................................................... 1 g11. Bromthymol Blue................................................................ 0.04 g12. Thymol Blue ........................................................................ 0.04 g13. Agar ...................................................................................... *14 g*10 - 15 g according to gel strengthFinal pH: 8.6 ± 0.2 at 25C

1. Sumber asam amino, vitamin, dan nitrogen dalam TCBS Agar2. Sumber asam amino, vitamin, dan nitrogen dalam TCBS Agar3. Sumber asam amino, vitamin, dan nitrogen dalam TCBS Agar4. Memberikan pH yang alkali untuk menginhibisi gram (+) dan mensupresi coliform5. Memberikan pH yang alkali untuk menginhibisi gram (+) dan mensupresi coliform,

serta menjadi sumber sulfur yang akan bekerja sama bersama Ferric Citrate sebagai indikasi produksi H2S

6. Memberikan pH yang alkali untuk menginhibisi gram (+) dan mensupresi coliform7. Memberikan pH yang alkali untuk menginhibisi gram (+) dan mensupresi coliform8. Karbohidrat yang dapat difermentasi9. Menstimulasi pertumbuhan organisme dan menjaga keseimbangan osmotic10. Indikator pembentukan H2S11. Indikator pH12. Indikator pH13. Pemadat

Aulia Izzati - 22010112130116

TCBS Agar merupakan singkatan dari Thiosulfate-Citrate-Bile-Sucrose Agar yang disebut juga sebagai Vibrio Selective agar, dan dipersiapkan sesusai dengan formula dari Kobayashi et al. Semua patogenik Vibrio spp. akan tumbuh pada TCBS Agar kecuali Vibrio hollisae. Agar yang sangat selektif ini memenuhi kriteria kebutuhan nutrisi dari Vibrio spp. sehingga vibrio dapat tumbuh dan bersaing dengan flora intestinal. Vibrio spp. dapat tumbuh di media yang memiliki konsentrasi garam yang tinggi, dan beberapa spesiesnya merupakan halophilic.

Aulia Izzati - 22010112130116

SSA

Formula / Liter:1. Beef Extract .............................................................................. 5 g2. Enzymatic Digest of Casein ................................................... 2.5 g3. Enzymatic Digest of Animal Tissue........................................ 2.5 g4. Lactose ................................................................................... 10 g5. Bile Salts ................................................................................ 8.5 g6. Sodium Citrate ....................................................................... 8.5 g7. Sodium Thiosulfate ................................................................ 8.5 g8. Ferric Citrate ............................................................................. 1 g9. Brilliant Green ................................................................ 0.00033 g10. Neutral Red........................................................................ 0.025 g11. Agar ..................................................................................... 13.5 gFinal pH: 7.0 ± 0.2 at 25C

1. Sumber nitrogen, karbon, dan vitamin untuk pertumbuhan organisme2. Sumber nitrogen, karbon, dan vitamin untuk pertumbuhan organisme3. Sumber nitrogen, karbon, dan vitamin untuk pertumbuhan organisme4. Karbohidrat yang dapat difermentasi (agen diferensial)5. Menginhibisi gram (+) dan coliform6. Menginhibisi gram (+) dan coliform7. Mendeteksi pembentukan H2S8. Mendeteksi pembentukan H2S9. Mengihibisi swarming dari Proteus spp.10. Indikator pH11. Pemadat

Salmonella Shigella Agar digunakan sebagai media isolasi bagi Salmonella spp. dan beberapa strain dari Shigella spp.. Salmonella Shigella Agar adalah modifikasi dari desoxucholate Citrate Agar yang lebih superior dari berbagai media isolasi Salmonella spp. dan Shigella spp.

Aulia Izzati - 22010112130116

3. Media Mycobacterium

Löwenstein-Jensen

Formula/Liter:1. L-Asparagine .......................................................................... 3.6 g2. Monopotassium Phosphate .................................................... 2.5 g3. Magnesium Sulfate...............................................................0.24 g4. Sodium Citrate........................................................................0.6 g5. Malachite Green ..................................................................... 0.4 g6. Potato Flour.............................................................................30 g

Supplement:7. Glycerol, 12 mL8. Egg suspension 1000 mL

1. Sumber nitrogen dan vitamin di Löwenstein-Jensen2. Membantu pertumbuhan organisme dan sebagai buffer3. Membantu pertumbuhan organisme dan sebagai buffer4. Agen selektif untuk menginhibisi pertumbuhan kontaminan dan mempercepat pertumbuhan mycobacterium5. Agen selektif untuk menginhibisi pertumbuhan kontaminan dan mempercepat pertumbuhan mycobacterium6. Sumber nitrogen dan vitamin di Löwenstein-Jensen7. Sumber asam lemak dan protein untuk metabolism mycobacterium8. Sumber asam lemak dan protein untuk metabolism mycobacterium

Penggunaan media berbasis telur sebagai media isolasi primer untuk mycobacteria memiliki dua keuntungan. Yang pertama, dapat mensupport berbagai macan species mycobacteria. Kedua, pertumbuhan mycobacteria di media telur dapat digunakan untuk tes niasin.

Aulia Izzati - 22010112130116

Middlebrook 7H11 Agar

Formula / Liter:1. Enzymatic Digest of Casein ...................................................... 1 g2. Disodium Phosphate .............................................................. 1.5 g3. Monopotassium Phosphate ................................................... 1.5 g4. Ammonium Sulfate ................................................................ 0.5 g5. Monosodium Glutamate......................................................... 0.5 g6. Sodium Citrate ....................................................................... 0.4 g7. Ferric Ammonium Citrate..................................................... 0.04 g8. Magnesium Sulfate .............................................................. 0.05 g9. Copper Sulfate ................................................................... 0.001 g10. Pyridoxine .......................................................................... 0.001 g11. Zinc Sulfate ........................................................................ 0.001 g12. Biotin ................................................................................ 0.0005 g13. Malachite Green............................................................. 0.00025 g14. Agar ..................................................................................... 13.5 gFinal pH: 6.6 ± 0.2 at 25°C

Supplement:15. Glycerol, 5 mL16. OADC Enrichment, 100 mL

1. Sumber vitamin, nitrogen, dan asam amino pada Middlebrook Agar2. Menjaga pH dari Middlebrook Agar 3. Menjaga pH dari Middlebrook Agar4. Mensupply growth factor5. Mensupply growth factor6. Mensupply growth factor7. Sumber dari trace ions yang untuk pertumbuhan Mycobacterium spp.8. Sumber dari trace ions yang untuk pertumbuhan Mycobacterium spp.

Aulia Izzati - 22010112130116

9. Sumber dari trace ions yang untuk pertumbuhan Mycobacterium spp.10. Mensupply growth factor11. Sumber dari trace ions yang untuk pertumbuhan Mycobacterium spp.12. Mensupply growth factor13. Menginhibisi organisme kontaminan14. Pemadat15. Mempercepat pertumbuhan Mycobacterium avium dan Mycobacterium spp. lain16. Berisi dextrose dan asam oleat sebagai sumber carbon

Ada dua jenis media solid untuk isololasi primer mycobacteria, media berbasis coagulated egg (Löwenstein) dan berbasis agar (Middlebrook). Isokasi dengan menggunakan agar memiliki beberapa keuntungan, yaitu:

1. Media berbasis agar tidak akan mengalami liquidasi saat terkena organisme kontaminan proteolytic.

2. Lebih direkomendasikan untuk specimen yang berasal dari tempat yang tidak steril.

3. Telur dapat menginaktivasi beberapa kandungan dari media, sehingga tidak dapat menjaga konsentrasi yang tetap bagi medianya, Agar tidak mengandung telur.

Aulia Izzati - 22010112130116

ATS (American Trudeau Society) Medium

Formula / Liter:1. Egg Yolk Suspension ................................... 500 ml2. Glycerol Extract of Potatoes ...................... 500 ml3. Malachite Green ………................................ 0.2 mlFinal pH 6.4-7.5 at 25°C

1. Sumber asam lemak dan protein untuk metabolism mycobacterium2. Sumber asam lemak dan protein untuk metabolism mycobacterium3. Menginhibisi pertumbuhan kontaminan dan mempercepat pertumbuhan Mycobacteria

ATS medium merupakan media berbasis telur yang mengandung Malachite Green dengan kadar yang rendah. Rendahnya konsentrasi malachite green pada media membuat formula ini dapat mendeteksi coloni mycobacteria dengan relative cepat. Media ini cocok untuk specimen yang tidak terkontaminasi berat seperti cerebal spinal fluid (CSF/LCS) dan cairan pleura. Jika terdapat banyak kontaminan yang proteolitik, mikroorganisme kontaminan tersebut dapat meliquidasi medium.

Petragnani Medium

Formula / Liter1. Whole Milk..................................... 900 ml2. Potato Flour.......................................,. 36 g3. Potato .............................................. .500 g4. Whole Eggs.................................... 1200 ml5. Egg Yolks ......................................... 115 ml6. Glycerol ..............................................70 ml7. Malachite Green.................................. 1.2 gpH 7.2 ± 0.2 at 25°C

1. Sumber protein2. Starch yang menjadi sumber karbohidrat3. Starch yang menjadi sumber karbohidrat4. Sumber protein5. Sumber protein6. Sumber carbon7. Menginhibisi oganisme kontaminan

Medium Petragnani merupakan medium berbasis telur yang mengandung malachite green dalam konsentrasi besar yang dapat menginhibisi pertumbuhan organisme kontaminan. Medium ini cocok untuk specimen yang berasal dari area yang tidak steril yang dapat mengandung contaminant dalam jumlah besar.

Aulia Izzati - 22010112130116

Media lain yang dapat digunakan sebagai media isolasi Mycobacterium spp.

Aulia Izzati - 22010112130116