Hospital de la Santa Creu i Sant Pau...Ehrlichia/Anaplasma Si PCR de sang. En LCR menys sensible Rickettsia ricketsii Si/No Serologia. PCR de la biòpsia cutània Causes de meningoencefalitis

LOGO

Servei de MicrobiologiaHospital de la Santa Creu i Sant Pau

Hos

pita

l de

la S

anta

Cre

u i S

ant P

au

Nombre i percentatge de tractament empíric inapropiat en la primera dosi i l'adaptació posterior a les 24 hores

Lueangarun S and Leelarasamee A. Interdisciplinary Perspectives on Infectious Diseases 2012 ,

Cont, Continuació de la teràpia antimicrobiana empírica.

Adapt, l'adaptació de la teràpia antimicrobiana empírica.

Tractament empíric inapropiat

La mortalitat en bacterièmia/sèpsia segons tractament empíric adequat o no

Ulldemolins M. Crit Care Clin 2011; 27: 35–51

•Gravetat de la infecció•Síndrome infecciosa / Focus d’infecció•Optimització del diagnòstic

microbiològic•Probabilitat de participació de

microorganismes resistents

Considerar:

Antibioteràpia empírica

Evolució de resistències1

Aportacions de les tècniques ràpides2

Rellevància dels estudis de sensibilitat

NºSoques

Resistència en tants per cent

PEN CTX ERY CLI LEV VAN RIF TET

Estreptococ betahemolític Grup A(Streptococcus pyogenes) 41 0 0 9,8 9,8 0 0 0 17,1

Estreptococ betahemolític Grup B(Streptococcus agalactiae) 66 0 0 27,3 18,2 4,5 0 0 72,3

Estreptococ betahemolític. Altres grups1 15 0 0 40 33,3 0 0 0 26,7

Estreptococ grup viridans 235 21,3 8,9 41,3 18,7 6,8 0 1,3 23,4

Situacions on es fàcil predir la sensibilitat i per tant el tractament empíric

NºSoques

Resistència en tants per cent

AMP AMC CTX AZT1 IMP ERT GEN COT CIP NIT FOS

E. coli 2561 67,2 19,1 11,8 11,8 0 0,04 11,7 35,7 39,3 5 2

K. pneumoniae 494 100 22,3 15,4 15,4 0,6 1 6,3 16,8 19,8 39,1 8,5

K. oxytoca 86 100 10,5 10,5 10,5 1,2 2,3 0 1,2 4,7 3,5 7

P. mirabilis 269 49,4 10 6,7 6,7 0,7 0 17,1 41,6 40,1 100 24,5

Quin és el nivell acceptat per considerar que és un bon tractament empíric?

Rellevància dels estudis de sensibilitat

Rello J, et al. Eur Respir J. 2011;37:1332

Tractament antibiòtic empíric segons diferents països.

Diagnòstic microbiològic

Clin Microbiol Infec. 2010;16:1044-1053

Tècniques moleculars (PCR)

EspecíficaÚnica/múltiple

vsUniversal

Convencionalvs

Temps real

Qualitativavs

Quantitativa

Quina metodologia usar- Mínima manipulació - No experiència- Ràpid (>2h) - Unitari

Diagnòstic ràpid

Diagnòstic de les meningoencefalitis

Diagnòstic de la infecció respiratòria

Diagnòstic de la infecció respiratòria

Microorganisme

Streptococcus pyogenes

Streptococcus pneumoniae

Legionella pneumophila

Haemophilus influenzae

Tècniques ràpides de diagnòstic de les infeccions respiratòries

FAMÍLIA SUBFAMÍLIA GÈNERE VIRUS

Orthomyxoviridae

Influenzavirus A

Influenzavirus B

Influenzavirus C

virus gripal A (FLUAV)

virus gripal B (FLUBV)

virus gripal C (FLUCV)

Paramyxoviridae ParamyxovirinaeRespirovirus

Rubulavirus

virus parainfluença (1,3) (PIV‐1, PIV‐3)

virus parainfluença (2,4) (PIV‐2, PIV‐4)

PneumovirinaePneumovirus

Metapneumovirus

virus respiratori sincicial (RSV)

metapneumovirus (HMPV)

PicornaviridaeEnterovirus

Rhinovirus

enterovirus (HEV)

rinovirus (HRV)

Coronaviridae Coronavirus coronavirus (HCoV)

Parvoviridae Parvovirinae Bocavirus bocavirus (HBoV)

Adenoviridae Mastadenovirus adenovirus (AdV)

MúltiplexDianes específiques

http://www.seimc.org/documentos/protocolos/microbiologia


CLART Kit ® Pneumovir (GENOMICA SAU)

Seeplex ® kit de detecció RV12 ACE (Seegene)

FilmArray® respiratory panel (Idaho Technology)


The GeneXpert® (Cepheid)

BD Max (Jaguar; Becton, Dickinson and Co./HandyLab, Inc.).

The Verigene SP (Nanosphere, Inc., IL, USA)

xTAG® Respiratory Viral Panel (RVP) Products



Conclusions

BM permeten la detecció de més virus que els mètodes

convencionals.

•Els resultats varien en funció de la població estudiada.

•Calen més estudis sobre la interpretació clínica dels resultats.

• infeccions múltiples

Plantegen qüestions

relatives a la significació clínica dels

virus detectats.

Diagnòstic de les meningoencefalitis

PCR Consideracions

Enterovirus Si En femta suggestiu

EBV Si Possibles falsos +

HHV-1, -2 Si PCR gold standard

VZV Si

Arbovirus No Serologia

Virus de la ràbia Si/no Serologia / PCR saliva o LCR

S. pneumoniae, H. influenzae, N. meningitidis

Si/No Gram i Cultiu

Bartonella Si/No Serologia. PCR del nódul linfàtic

MTB Si/No Mostres respiratòries pos. sónsuggestives

Ehrlichia/Anaplasma Si PCR de sang. En LCR menys sensible

Rickettsia ricketsii Si/No Serologia. PCR de la biòpsia cutània

Causes de meningoencefalitis MúltiplexDianes específiques

PCR Consideracions




VZV Si




Si/No Gram i Cultiu





MultiplexDianes especifiques

Causes de meningoencefalitis

PCR Consideracions




VZV Si




Si/No Gram i Cultiu





MultiplexDianes especifiques

Causes de meningoencefalitis

Diagnòstic de les meningitis víriques

Enterovirus i virus de la familia herpes

Múltiplex / SimpleDianes específiques

Esparcia, O. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 2011;69:153.

Diana universal

Diagnòstic de les meningitis bacterianes

Meningitis bacteriana(nº=108)

Sèpsia neonatal(nº=83)

PBE(nº=55)

Cultiu Molecular Cultiu Molecular Cultiu Molecular

Sensibilitat 78.1 90.6 70.0 60.0 80.6 45.2

Especificitat 100 100 100 100 100 100

VPP 100 100 100 100 100 100

VPN 36.4 57.1 96.1 94.8 80.0 58.5

CCD (%)* 80.6 91.7 96.4 95.2 89.1 69.1

Resum sensibilitat, especificitat, VPP, VPN y CCD

Diagnòstic de les meningitis bacterianes

Esparcia, O. Diagnostic Microbiology and Infectious Disease 2011;69:153.

Diagnòstic ràpid en Microbiologia

Estudis moleculars de sensibilitats

Gens únics

• Vancomicina• MRSA• Rifampicina M. tuberculosis

Detecció de gens de resistència

Enterococcus resistents a vancomicina

van

S. aureus resistent a la meticil·lina

mecA

Detecció de la resistència en M. tuberculosis

Importància de la tuberculosi multiresistent.Tècniques convencionals (4-6 setmanes).

Rifampicina: 81 pb rpoB

Boehme CC, et al. N Engl J Med 2010;363:1005-1015

Detecció de la resistència en M. tuberculosis

Situacions complexes

Detecció de gens de resistència a β-lactàmics

Mecanismes de resistència β-lactàmics

Permeabilitat.

Sistemes d’expulsió activa.

Alteració de la diana.

Presència d'enzims inactivants.

BLEA

209

173 142

TEM-1AMP

CXM

CTX

CAZ

AMC

CF

FEP

AMC IMI

PTZ

CIP

NALCEPPIP

AZT

SHV-1 CTX-M-9

AMP

CXM

CTX

CAZ

AMC

CF

FEP

AMC IMI

PTZ

CIP

NALCEPPIP

AZT

TEM-12

1 mutació

AMP

CXM

CTX

CAZ

AMC

CF

FEP PTZ

CIP

NALCEPPIP

AMC IMIAZT

SHV-2

1 mutació

TEM-30


OXA-1

OXA-24

AMP

CXM

CTX

CAZ

AMC

CF

FEP

AMC IMI

PTZ

CIP

NALCEPPIP

AZT

Amp-C

AltresMecanismes de resistència β-lactàmics

• TEM-1/SHV-1 BLEAIRT.

Fenotips diferents de resistència poden ser deguts a mutacions

puntuals:

• TEM-1 i SHV-1, SHV-16 i CTX-M-13.Fenotips iguals deguts a gens

diferents.

• TEM, SHV, CTX-M, OXA, KPC, NDM, IMP, VIM... Nombroses famílies de gens:

Nombrosos subgrups dins de les famílies amb fenotips iguals i

diferents.

Alteracions de gens reguladors.


Check-points

Consideracions vàries / Conclusions

IDbox System from GenturaDx

QIAsymphony RGQ from Qiagen

3M Integrated Cycler from Focus Diagnostics

Verigene® System from Nanosphere

PLEX-ID from Abbott

FilmArray. Idaho

Reflexió de Futur

Drug dicovery today 2002;7:1092

LOGO

Hos

pita

l de

la S

anta

Cre

u i S

ant P

au

Documents

Hospital de la Santa Creu i Sant Pau...Ehrlichia/Anaplasma Si PCR de sang. En LCR menys sensible Rickettsia ricketsii Si/No Serologia. PCR de la biòpsia cutània Causes de meningoencefalitis