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Expertise : la recherche d’informations et de
documents
PL ToutainUMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales
INRA/ENVT
ECOLENATIONALEVETERINAIRET O U L O U S E
Toulouse, le 28 novembre 2008
Objectifs de la présentation
1. Identifier les différents types de sources documentaires et d’informations : sources originales et sources secondaires
2. Connaître les bases, plateformes et portails documentaires
3. Savoir utiliser les outils de recherche documentaire (moteur de recherche pour l’exploration des bases)
4. Dresser une liste de références correctement présentée et indexée
5. Se tenir informé par les flux RSS
Comment se maintenir informé, Comment gérer le flot des informations
I ndustrie pharmaceutique
articles
Livres
I nternet
T.V.quotidiens
Conf érences
I ndustrie pharmaceutique
articles
Livres
I nternet
T.V.quotidiens
Conf érencesarticles
Livres
I nternet
T.V.quotidiens
Conf érences
L’expert clinicien ne peut pas suivre de façon prospective toute la littérature primaire pertinente de son domaine.
Il devra, pour l’essentiel, faire appel de façon rétrospective à des outils documentaires adaptés à son budget « temps »
Le vocabulaire normalisé en documentation
Masse de l’information biomédicale
Plusieurs centaines de milliers d’articles originaux
publiés chaque année, dans plusieurs milliers de
revues scientifiques et médicales, publiant de
quelques dizaines à quelques milliers de pages
Une première idée : consulter les périodiques scientifiques
Combien de journaux «vétérinaires»?
Articles publiés dans l’ «American Journal of Physiology » en 2008:
N=2591
Impossibilité de suivre sa bibliographie en feuilletant les revues et nécessité
d’avoir recours à des bases de données et des outils (moteurs de recherche)
pour les explorer
Base de données (database)définition européenne
• Une base de données est « un recueil d'œuvres, de données ou d'autres éléments indépendants, disposés de manière systématique ou méthodique, et individuellement accessibles par des moyens électroniques ou par tout autre moyen » (Art. L.112-3 al.2 du code de la propriété intellectuelle)
Pour s’y retrouver dans les bases de données
Les bases de données utiles pour la médecine vétérinaires
Les bases de données médicales
Les bases de données juridiques
Un premier exemple de recherche dans une base de
données (Medline) avec PubMed comme outil de
recherche
Beaucoup de ces références ne concernent pas directement le cheval comme animal
Nombre total de références dans PubMed avec « horse » comme mots clés
Nombre de références dans PubMed de «2008» à aujourd’hui avec «horse» comme mots clés
Nombre de références dans PubMed de «2008» à aujourd’hui avec «horse» comme mots clés
et publiées dans l’ «American Journal of Veterinary Research»
Nombre de références dans PubMed de « 2008 » à aujourd’hui avec « horse » comme mot-clé et publiées dans l’ « American Journal of Veterinary Research »
avec le mot « dexamethasone » dans le texte
• Nécessité de poser les questions de façon appropriée pour ne pas être noyé par le nombre de références et savoir utiliser les filtres
Recherche dans les bases
Types de sources documentaires
Types de sources documentaires
• Sources primaires (originales)– Produites par les auteurs d’un travail de recherche
• Sources secondaires – Type Vulgarisation d’informations originales
• Souvent synthèse et simplification, en fonction du lectorat visé (public large, étudiants, découverte du sujet…)
– Type Méta-analyses et revues systématiques• Visant les professionnels , focalisées, informations
opérationnelles
1. Sources secondaires de vulgarisation
• Périodiques spécialisés en formation continue
–Compendium on Continuing Education for the Practicing Veterinarian
https://secure.vetlearn.com/pvsearch.cfm–Veterinary Clinics of North Americahttp://www.us.elsevierhealth.com/product.jsp?isbn=01955616–Encyclopédie médico-chirurgicale (EMC)
vétérinairehttp://www.elsevier.fr/html/dettraiteF.cfm?code=FVET
Articles de formation continue professionnelle
Sources secondaires (vulgarisation)
Sources secondaires: Wikipedia
Informations différentes selon les langues; non validées
Les ressources « sœurs » de Wikipedia
• Le site web d'IVIS propose une large collection d'articles, de comptes rendus, de comptes rendus de conférences (proceedings) et de documents interactifs, ressources particulièrement précieuses pour des étudiants. La newsletter d'IVIS informe nos membres des nouveaux documents publiés sur le site (cliquez ici).
Tous les mois nous publions de nouveaux chapitres dans notre bibliothèque qui embrassent une large variété de disciplines et d'espèces (voir " Recent Additions"). Nos publications les plus récentes concernent :- la médecine clinique aviaire- la dermatologie des petits animaux- l'anesthésie et l'analgésie des animaux de compagnie- les maladies des chèvres et- Maladies respiratoires equines
Voici nos comptes rendus de conférence les plus récents, disponibles dans la section "Proceedings" : American Association of Equine Practitioners - AAEPAmerican College of Veterinary Pathologists - ACVPAmerican Academy of Veterinary Pharmacology and Therapeutics - AAVPTNAVC - North American Veterinary Conference Italian Association of Equine Veterinarians - SIVEWorld Buiatrics Congress - WBCGeneva Congress on Equine Surgery and MedicineWorld Equine Airways Symposium - WEASEuropean Society of Veterinary Orthopaedics and Traumatology - ESVOTEuropean Association of Veterinary Diagnostic Imaging - EAVDICanine Cancer Conference: Genes, Dogs, and CancerCongress of the Italian Association of Companion Animal Veterinarians - SCIVACWSAVA - World Small Animal Veterinary Association Annual CongressInternational Congress on Yak et beaucoup d'autres : cliquez ici pour voir la liste complète.
Les autres domaines de la bibliothèque d'IVIS recouvrent l'anesthésiologie, la reproduction, la chirurgie, la parasitologie, les maladies infectieuses, l'immunologie, la neurologie, et la la gastroentérologie.
Moodle
Sources secondaires: les cours en ligne de l’ENVT
Sources secondaires: les cours en ligne de l’ENVT
Enseignements et documents relatifs à la documentation et à la communication
scientifiques et médicales, depuis l'initiation (A1) jusqu'à l'approfondissement (Internat)
Enseignements et documents relatifs à la documentation et à la communication
scientifiques et médicales, depuis l'initiation (A1) jusqu'à l'approfondissement (Internat)
Pour retrouver la première partie de la conférence sur l’expertise
Pour retrouver la première partie de la conférence sur l’expertise
Pour retrouver la première partie de la conférence sur l’expertise
Les archives ouvertes de Toulouse
Les archives ouvertesLes références de l’Ecole n=827
Les thèses vétérinaires sont en libre accès (OATAO pour Toulouse)
Sources secondaires: la presse professionnelle
• Hebdomadaire d’informations professionnelles vivant à plus de 90% des annonceurs– Publicités– Publicité rédactionnelle
• Un site internet associé : Planetevet http://www.planete-vet.com/
– (accès restreint)
2. Sources secondaires de méta-analyses
Sélection de ressources pour l’EBM
Revues méthodiques & méta-analyses
Méta-analyseRevue systématique
Essai 1
Essai 2
Essai 3
Essai 4
Méta-analyses et revues méthodiques sont réalisées par des spécialistes de ce type de travail et selon une méthodologie formalisée
La méta-analyse peut faire appel à des outils statistiques capables de créer de la nouvelle information à partir des documents primaires
(ex: rendre significatif des résultats qui individuellement ne l’étaient pas)
La bibliothèque Cochrane (présentation en français)
La bibliothèque Cochrane
La bibliothèque Cochrane
• La Cochrane Library a pour objectif d'assurer la dissémination des résultats des essais cliniques et des méta-analyses par la création d'une base de données évaluant les interventions médicales, préventives et thérapeutiques ainsi que les performances des tests diagnostiques.
Caractéristiques de la bibliothèque Cochrane
• Pertinente sur le plan clinique
• Indépendante
• Actualisée
• Systématique– Revues systématiques et méta-analyse
La collaboration Cochrane
Préparer, tenir à jour, et diffuser les revues systématiques sur l'efficacité desthérapeutiques et des stratégies thérapeutiques
La collaboration Cochrane
L’exploration des bases de données
Les ressources du NCBI
Les outils d’exploration des bases de données accessibles gratuitement
1. PubMed
2. Google scholar
3. Scirus
4. Agricola
PubMed
Interface utilisée pour interroger la base Medline
PubMed: une vue générale
PubMed: le tutoriel
Limiter la recherche
• Les filtres permettent de limiter la recherche de documents sur certains critères comme les essais cliniques ne portant que sur l’homme ou au contraire des essais portant sur l’animal; pour l’homme on peut sortir les essais portant spécifiquement sur une tranche d’âge, sur des essais publiés entre deux dates etc.
• Pour appliquer ces limites, cliquez sur LIMITS
PubMed: les filtres
Pubmed: question sur un thème horse AND lameness
Pubmed: question pour un auteurToutain PL AND antibiotics
Pubmed: questionQuelles sont les publications de Cat (un auteur)
sur les antibiotiques? Cat [AU] AND antibiotics
Je cherche un auteur dont le nom commence par Tout… et qui publie en pharmacologie:
utilisation du Wildcard *
Je cherche un auteur dont le nom commence par Tout… et qui publie à
Toulouse
PubMed: S’abonner à un flux RSS pour recevoir sur ma boite mail en temps réel
les articles de PL Toutain sur les antibiotiques
PubMed: Abonnement à un flux RSS
Les autres bases de données gérées par PubMed
Les autres bases de données gérées par PubMed: les livres
Les autres bases de données gérées par PubMed: les substances chimiques
PubMed :systematic review
Google: recherche avancée
Google: question horse AND laminitis AND corticosteroids
Comment « préparer » une conférence Powerpoint sur le dopage du cheval en
quelques minutes
Comment « préparer » une conférence Powerpoint sur le dopage du cheval en
quelques minutes
Google: question & filtre PDF horse AND laminitis AND corticosteroids
Google: question & filtre PDF horse AND laminitis AND corticosteroids
Les outils Google
Conseil: Installer la barre d’outil et visiter « à propos de Google » pour découvrir toutes les bases spécialisées dont « Google Scholar »
Google Scholar
Google Scholar: Martineau + Pig
Google Scholar: recherche avancée
Google Scholar: question horse AND laminitis AND corticosteroids
& au moins triamcinolone acetonide
Scirus
HighWire
Agricola
Les bases et outils payants
Le Web Of Knowledge
Les bases de données de L’ISI Web Of Knowledge
Web Of Knowledge: question horse AND laminitis AND corticosteroids
Web Of Knowledge:les bases de données
Web Of Knowledge horse AND laminitis AND corticosteroids
Web Of Knowledgehorse AND 31076 (code postal ENVT)
Web Of Knowledgehorse AND 31076 (code postal ENVT)
Web Of Knowledgeque s’est-il publié à l’ENVA entre 2000 et 2009
code postal:94700
Exclusion des articles de l’Afssa qui partage le même code postal
Web Of Knowledgeque s’est-il publié à l’ENVA entre 2000 et 2009
Que s’est-il publié à l’ENVA entre 2000 et 2009?et dans quels champs disciplinaires?
Que s’est-il publié à l’ENVA entre 2000 et 2009Quels nombre de citations?
Quels nombre d’autocitations? Quel H index?
Que s’est-il publié à l’ENVA entre 2000 et 2009Les publications les plus citées
Science Direct
Comment se procurer un article original
• Quelques revues disponibles gratuitement sur Internet; Souvent 6-12 mois après parution
• Sites de journaux accessibles gratuitement – http://www.freemedicaljournals.com/
– http://www.gfmer.ch/Medical_journals/Free_medical.php
– http://www.medical-journals.com/
– http://highwire.stanford.edu/lists/freeart.dtl
• Ecrire à l’auteur et demander un tiré à part (adresse internet donnée)
• Acheter l’article (INIST)
Inist
Network pour PL Toutain
Network pour PL Toutain
Network pour Horse
Find an expert
Trouver un expert pour la triamcinolone acetonide
key words: chemical & drugs
Trouver un expert pour la triamcinolone acetonide
Trouver un expert pour la triamcinolone & triamcinolone acetonide
Biomedexpertpossibilité d’y tenir à jour son CV
Préparer une liste de références
• Doit comprendre :– toutes les sources qui ont été utilisées– seulement les sources qui ont été utilisées, c’est-à-dire
appelées dans le texte
• Doit utiliser exclusivement des sources validées• Doit être vérifiée avec les publications complètes
(jamais à partir d’une autre liste de références, ni d’une base de données et/ou de résumés)
• Doit donner toutes les indications qui permettent de retrouver la source
• Doit être ordonnée selon les recommandations de la publication à laquelle elle est destinée
Préparer une liste de références• On ne saisit plus ses références (ce qui limite considérablement les
erreurs) : on les récupère dans les bases et on les formate au style voulu avec un logiciel type EndNote
