Embed Size (px)
DESCRIPTION
De ADN a proteína. Los genes se expresan con diferente eficiencia. El mecanismo de transcripción. Diferentes clases de ARN´s. Transcripci ón en bacterias. La cadena codificante tiene la misma secuencia que el transcrito. Initiation. - PowerPoint PPT Presentation
Citation preview
De ADN a proteína
Los genes se expresan con diferente eficiencia
El mecanismo de transcripción
Diferentes clases de ARN´s
Transcripción en bacterias
La cadena codificante tiene la misma secuencia que el transcrito
• The promoter functions as a recognition site for transcription factors
• The transcription factors enable RNA polymerase to bind to the promoter forming a closed promoter complex
• Following binding, the DNA is denatured into a bubble known as the open promoter complex, or simply an open complex
Initiation
Elongation
RNA polymerase slides along the DNA in an open complex to synthesize the RNA transcript
Termination
A termination signal is reached that causes RNA polymerase to dissociated from the DNA
Promotor: secuencias de ADN que es reconocida por la ARN polimerasa y proteínas asociadas a ella para iniciar la transcripción
purina
Carácterísticas del promotor
Los promotores tienen orientación
La dirección de la transcripción de los genes puede variar en el cromosoma
La ARN polimerasa es la encargada de copiar el ADN
Factores sigma ()
Existen diferentes estados en la iniciación
Elongación de la cadena
Terminación de la transcripción
terminadores intrínsecos
NusA
URNA-ADNA apareamiento es
débil
No se necesita una proteína para remover físicamente a la RNA polimerasa del DNA
La RNA polimeras
a se detiene
terminadores dependientes de Rho
sitios rutrho utilization site
La proteína Rho es una
helicasa
Note: This is an intrastrand RNA:RNA interaction (folding stabilized by H-bonding of A-U and C-G)
Mensajes policistrónicos
Estructura de los mRNA
Transcripción en eucariontes
Structure of a bacterialRNA polymerase
Structure of a eukaryoticRNA polymerase II
ARN polimerasas
Diferentes tipos de ARN polimerasas
Los promotores eucariontes también tienen sitios consenso
• El núcleo del promotor es relativamente corto• consiste de la caja TATA, quién es importante para determinar el sitio
preciso del inicio de la transcripción
• El núcleo del promotor por sí mismo produce una transcripción de bajo nivel conocida como transcripción basal
Generalmente una adenina
Transcripción basal
A close complex
• TFIIH plays a major role in the formation of the open complex
– It has several subunits that perform different functions
One subunit hydrolyzes ATP and phosphorylates a domain in RNA pol II known as the carboxyl terminal domain (CTD)
This releases the contact between TFIIB and RNA pol II
Other subunits act as helicases Promote the formation of the open complex
Released after the open complex is
formed
RNA pol II can now proceed to the
elongation stage
Factores de transcripción
Proteínas activadoras de la transcripción
Procesamiento del ARN
Adición del CAP
1) La fosfatasa remueve un fosfato del 5´2) Una guanil transferasa agrega GMP3) Una metil transferasa agrega un grupo metilo
RNA displacement loop
mRNA cannot hybridize to this region
because the intron has been spliced out from the mRNA
Identificación experimental de los intrones
Vista al microscopio electrónico
Hybridization caused the formation of two R
loops, separated by a double-stranded DNA
region
Se puede deducir el númerode intrones
Intrones del grupo I y II (autocatálisis)
En eucariontes la transcripción de genes estructurales produce un transcrito largo conocido como pre-mRNA
También RNA heterogéneo nuclear (hnRNA)
Este RNA es alterado por corte y otras modificaciones antes de salir del núcleo
El corte requiere de la ayuda de un multicomponente estructural conocido como spliceosome
Existen secuencias específicas en los límites exón-intrón
Moléculas de ARN-proteína (snRNP) son las responsables del corte
Intron loops out and exons brought closer
together
Intron will be degraded and the snRNPs used again
Puede existir corte alternativo en los genes
El corte alternativo puede producir varias isoformas a partir de un gen
Terminación (Poliadenilación)
El ARN es cortado y la enzimaPoli-A polimerasa (PAP) agrega A´s
Proteínas de unión al poli-Ase unen al extremo 3´ hastaque el mensaje sale del núcleo
Procesamiento del ARNr
procariontes
eucariontes
Otros tipos de ARNs pequeñosayudan en la metilación
El nucleolo es el lugar de síntesis de ARNr y ribosomas
La RNAasa P, una endonucleasa que reconoce la conformación del extremo 5´ corta un grupo de nucleótidos dejando este extremo en su forma final. La RNAasa P es una ribonucleoproteína formada por un RNA de 377 nucleótidos y una proteína de 20 KDa. En este complejo la acción catalítica la aporta el RNA. Es posible que la RNAasa P actúe antes que la transcripción culmine. En el extremo 3´ actúa una endonucleasa no caracterizada que elimina un grupo de bases, después una exonucleasa, la RNAsa D elimina los restantes nucleótidos. El triplete CCA característico de estas moléculas es añadido por una RNAt nucleotidil tranferasa
Procesamiento de ARNt en procariontes
Procesamiento del ARNt en eucariontes
La modificación de los extremos 5´y 3´de estas moléculas de RNAt en eucariontes ocurre de
manera muy similar al de bacterias. El triplete CCA del extremo 3´ no está codificado por el
gen en cuestión sino que es añadido posteriormente por otras enzimas. En las
moléculas de RNAt eucariotas se encuentran las mismas bases modificadas aunque en menor medida. Estas, al igual que en procariontes tienen una posición fija y se encuentran en zonas de no apareamiento de la molécula.
En los organismos eucariotas la existencia de genes fragmentados implica un evento adicional en el procesamiento de los RNAt, la eliminación
de intrones.
Procesamiento del intron en los ARNt en eucariontes
Una endonucleasa corta en lossitios donde hay protuberanciasy una ARN ligasa sella esoscortes
INHIBIDORES DE LA TRANSCRIPCIÓNINHIBIDORES DE LA TRANSCRIPCIÓN
ACTINOMICINA D y ACRIDINA:ACTINOMICINA D y ACRIDINA: inhiben la elongación. Se intercalan en el inhiben la elongación. Se intercalan en el DNA entre sucesivos pares GC, deformando la doble hélice, impidiendo DNA entre sucesivos pares GC, deformando la doble hélice, impidiendo el avance de la RNA polimerasa. el avance de la RNA polimerasa.
RIFAMPICINA:RIFAMPICINA: antibiótico que se une a la subunidad antibiótico que se une a la subunidad de la RNA de la RNA polimerasa bacteriana, impidiendo el inicio de la transcripción.polimerasa bacteriana, impidiendo el inicio de la transcripción.
-AMANITINA:-AMANITINA: inhibidor específico de la transcripción en eucariotas. inhibidor específico de la transcripción en eucariotas. Tóxico veneno producido por el hongo Tóxico veneno producido por el hongo Amanita phalloides.Amanita phalloides. Bloquea la Bloquea la síntesis de mRNAs por la Pol II y a altas concentraciones a Pol III. NO síntesis de mRNAs por la Pol II y a altas concentraciones a Pol III. NO AFECTA A LA RNA POLIMERASA BACTERIANA.AFECTA A LA RNA POLIMERASA BACTERIANA.
Las rifamicinas son antibióticos producidos por Streptomyces mediterranei, con buena actividad contra bacterias Gram-positivas y contra Mycobacterium tuberculosis. Su mecanismo de acción estriba en la inhibición del inicio de la transcripción, uniéndose de modo no covalente a la subunidad ß de la ARN polimerasa bacteriana.
-amanitina
Es un octapéptido bicíclico que se obtiene del hongo Amanita phalloides. Inhibe la transcripción de la RNA polimerasa II eucarionte.
