ecoQuery : a Semantic Module to Query Biodiversity Data on the Web

Authors : Julie Chabalier, Olivier Coullet, Amandine Sahl and Olivier Rovellotti

I. Problématique

II. Solution technique

III. Résultat

IV. Perspective

ecoQuery : a Semantic Module to Query Biodiversity Data on the Web

Key Factors of Successful Responses to Biodiversity Loss:Mobilize knowledge. Ensure that the availableknowledge is presented in ways that can be used by decision-makers.

Millenium assessment

Scientifique

monitoring of statusand trends ofbiodiversity

Politique Development

anddecision making

Gestionnaire

Conservation andsustainable use ofbiodiversity

DATA

UN Secretary-General 2000: Kofi Annan

Contexte

DATA

http://imgs.xkcd.com/comics/desert_island.png

Données de biodiversitédisponibles & exploitables

DATA

• Grande Diversité (Biologie, Climatologie, Pédologie)• Différentes échelles (temps, espace)• Volume important

DATA

+ Cout d'acquisition important

ecoQuery

Offrir un outil qui permette d’extraire et d’exploiter des données hétérogènes

Comment ?

Technologie web sémantique

IHM riche et conviviale

Web sémantique

Tim Berners-Lee, James Hendler, Ora Lassila, The Semantic Web, ScientificAmerican, Mai 2001.

« The Semantic Web is an extension of the current web in which information is given well-defined meaning, better enabling computers and people to work in cooperation. »

Link Open Data

Identification des éléments par un URI

Utilisation d'URI HTTP déréférençables

Mise à disposition des informations en RDF

Ajouter des liens RDF vers les autres URIs

ecoQuery: Assistant

REST

SQL SPARQL

ecoQuery

Temps Espace Ressource

(Observateur) Taxon

EcoQuery : Requête

PREFIX dwc:<http://rs.tdwg/org/dwc/terms/#>PREFIX rdf:<http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#>PREFIX geo:<http://www.w3.org/2003/01/geo/wgs84_pos#>PREFIX dcterms:<http://purl.org/dc/terms/>SELECT distinct ?scientificName?lat?long?dateFROM <urn:rdf.Occurences.AvianKnowledgeNetworkWHERE {?occurence rdf:type dwc:Occurence;dwc:Identification ?id ;geo:lat ?lat;geo:long ?long;dcterms:date?date.?id dwc:scientificName?scientificName}

ecoQuery

SparQL

Interface Riche

Carte

Données

Outils

Mashup

Mise en oeuvre

Resultat

Cas d'utilisation

Dispositifs de protection contre les crues (Sénas, Cheval Blanc)

Impact sur l'avifaune

Crue

Cas d'utilisation

Objectif : déterminer les conséquences de ce projet sur l'environnement

Démarche :

– Collecte de données (bibliographie, terrain)

• Occurrence des taxons

• Statuts de protection

– Détermination de l'importance du site pour l'avifaune

Récolte de données (LOD) Récolte de données (Terrain)

Récolte de données (LOD)

Source : AKN (Avian Knowledge Network)

Format : TaxonConcept (Peters De Vries)

Résultat :

2 Stations

6 Taxons

=> Effort de prospection trop faible

=> Réalisation d'une étude de terrain complémentaire

Récolte de données (Terrain)

Réalisation d'une série de relevé de terrain

Prise de données Pocket-eRelevé

17 taxons

Import ecoRelevé Data

Acrocephalus arundinaceus (Linnaeus, 1758)Rousserolle turdoïde (Français)

Sont interdites sur les parties du territoire métropolitain où l'espèce est présente ainsi que dans l'aire de déplacement naturel des noyaux de populations existants la destruction, l'altération ou la dégradation des sites de reproduction et des aires de repos des animaux.

Article 3 // Oiseaux protégés Arrêté du 29 octobre 2009 fixant la liste des oiseaux protégés

Résultat

Mise en commun de données hétérogènes

Technologie web sémantique

Pour les acteurs de la biodiversité Interface graphique « conviviale »

Bémol

Faible volume d’observations disponibles

Les données sont porter par NS sur le LOD

Les données ne sont pas libre

Faible expressivité de l’ontologie• Filtre simple

Perspective

Plus d’observation: Gbif : 293 485 946 records

Plus d’expressivité

= ecoOnto (NS)

= DWC Ontology

= TDWG Ontology

Demain: Limite optimum du Parc des Calanques ?

Olivier Rovellottiwww.natural-solutions.eu

Merci

International Fund for HoubaraConservation

IFHC