Tutorial Chem Sketch

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ACD/ChemSketch freewarefor Microsoft Windows

TutorialDrawing Chemical Structures and Graphical Image

Para obter a verso free acesse: http://www.acdlabs.com/resources/freeware/chemsketch/

1. Utilizao do programa:

ACD / ChemSketch Freeware um pacote de desenho que lhe permite desenhar estruturas qumicas, incluindo compostos orgnicos e organometlicos, polmeros entre outras estruturas e desenhos. Tambm inclui funcionalidades tais como o clculo de propriedades moleculares (por exemplo, o peso molecular, densidade, refratividade molar, etc), visualizao e animao de estruturas 2D e 3D, funcionalidade para nomear as estruturas (com menos de 50 tomos e trs anis), e previso de logP. A verso freeware do ChemSketch no inclui todas as funcionalidades da verso comercial. 2. Instalao da verso free: Para instalar a verso free no seu computador, acesse: http://www.acdlabs.com/download/ Ir aparecer a tela, conforme figura abaixo, clique em Download, conforme indica a seta na figura abaixo.

Aps ser necessrio fazer o seu cadastro no site. Clique em Created an Account, conforme indica a seta abaixo.

Faa o seu cadastro preenchendo os dados conforme figura abaixo. Quando aparecer o smbolo * obrigatrio o preenchimento do campo. Para finalizar clique em Register, conforme indica a seta na figura abaixo.

Abrir a tela abaixo. Clique em

, conforme seta na figura abaixo.

Clique em Download, conforme seta abaixo.

Clique em Save e escolha o lugar para salvar no seu computador.

Para facilitar o acesso ao programa pode-se colocar um atalho na rea de trabalho 3.

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Abrindo o programa ACD / ChemSketch

Depois de ACD / ChemSketch foi instalado no seu computador, siga estes passos bsicos para inici-lo: 1. Iniciar do Microsoft Windows. 2. D um duplo clique no cone ChemSketch (se ele no estiver na sua rea de trabalho, direcione-se at onde o programa ChemSketch est e de o duplo clique).

3. Voc dever ver uma tela de abertura. Se esta a verso freeware, voc vai ver o ACD / Labs Products. Clique em OK para fech-lo.

4. Utilizando o programa ACD / ChemSketch 4.1 Structure (Estrutura) e Draw (desenhar) Quando ACD / ChemSketch inicia, voc vai encontrar muitos comandos do menu e botes da barra de ferramentas aparecer esmaecido (inativos). Elas sero disponibilizadas to logo voc desenhar uma estrutura. Na janela ChemSketch, existem dois modos, Struture e Draw. Voc pode alternar entre eles usando os botes no canto superior esquerdo (indicados pela seta na figura abaixo):

No modo estrutura (Struture) voc pode desenhar estruturas e esquemas de reao, enquanto o modo de desenho (Draw) apresenta-lhe as ferramentas para a insero de texto e desenho de vrios objetos grficos.

4.1.1 Explicando a janela inicial Os nomes e as posies das barras de ferramentas, para ser utilizado em todo o tutorial, so introduzidos neste item. 4.1.1.1 Modo de Estrutura Abaixo voc pode ver a tela com o Modo de Estrutura habilitado (observando a palavra Structure em destaque).

A figura acima demonstra a tela de trabalho que ser descrita abaixo: 1. A primeira barra chamada Barra de ttulo e mostra o nome do programa e o nome do arquivo atualmente aberto. 2. A segunda barra a Barra de menu contm uma srie de palavras. Cada palavra um link para abrir uma lista ('menu') de comandos relacionados para trabalhar na janela no modo estrutura e desenho. 3. A terceira barra a Barra de ferramentas geral que inclui ferramentas que esto presentes tanto no modo estrutura, quanto no modo de desenhar e ir ajud-lo com as tarefas pertinentes a ambos os modos, tais como: salvar, abrir arquivos, desfazer/refazer operaes, copiar e colar, mais ou menos zoom, bem como a insero de vrios modelos. 4. A quarta barra a Barra de ferramentas ChemBasic opcional e contm extras ou outras aplicaes ChemBasic - ferramentas para desenho e manipulao de estruturas qumicas - que sero detalhadas no decorrer desse tutorial. Ela colocada logo acima do espao de trabalho e s existe no modo estrutura.

5. Na vertical esquerda tem-se a Barra de ferramentas dos tomos contm botes que representam tomos, bem como ferramentas para alterar as propriedades dos tomo (carga, valncia, numerao, etc). 6. Colocado direita da janela tem-se a Barra de referncia que contm a tabela de radicais e vrios botes que representam radicais prontos para voc utilizar no desenho de suas estruturas 2D. 7. A rea de trabalho (workspace) o espao em branco, no meio, onde as estruturas so desenhadas. 8. Embaixo da rea de trabalho (workspace) tem-se a paleta de cores que permite, rapidamente, a troca de cores dos tomos e laos nas estruturas qumicas que foram desenhadas por voc anteriormente. Nesta barra, a esquerda, esto as cores mais usadas, seleciona-se primeiramente o que deseja alterar a cor na rea de trabalho e depois clica-se sobre a cor. Mais cores podem ser escolhidas clicando sobre more (mais) no canto direito desta mesma barra. 9. Abaixo da paleta de cores tem-se a Barra de descrio do programa, no utilizada por voc. 10. Abaixo da barra de descrio do programa tem-se a Barra de status que mais a esquerda contm informaes que podem ser teis para a sua localizao no momento atual: o nome do arquivo, ficheiro que est trabalhando, o nmero de pgina no arquivo, nmero de fragmentos no espao de trabalho, a frmula molecular da estrutura selecionada, bem como uma das propriedades qumicas disponveis para a estrutura selecionada. Ela tambm contm um boto de acesso I-Lab automtico que permite seu login ao programa. E mais a direita, voc pode clicar, com o boto esquerdo do mouse em properties (propriedades) ir aparecer as propriedades do tomo e/ou da estrutura desenhada voc pode marcar qual voc prefere que aparea nessa barra. NOTA: Observe figura abaixo. As barras de ferramentas podem ser personalizadas usando o menu de atalho (que aparece quando voc clique com o boto direito na barra de ferramentas). As seguintes opes esto disponveis no menu: botes da barra de ferramentas exibe todos os botes disponveis na barra de ferramentas. Se voc no quer que os botes sejam exibidos na barra de ferramentas, desmarque-os neste menu de atalho. Redefinir Barra de Ferramentas, seleciona todos os botes da barra de ferramentas no menu de atalho. Chevron-Style adiciona mais botes no final da barra de ferramentas (exibe todos os botes quando no cabem na barra de ferramentas); Wrap Style divide a barra em duas partes (uma sob a outra) se os botes no cabem na barra de ferramentas.

4.1.1.2 Modo de Desenho Abaixo voc pode ver a tela com o modo de desenho ativada (observando a palavra Draw em destaque).

A barra de ttulo, de menu e de ferramentas geral tem a mesma designao que para o modo Estrutura. Para relembrar consulte a seo 4.1.1.1 Modo de Estrutura.

1. A quarta barra a Barra de ferramentas de edio est presente apenas no modo de desenhar. Ele incorpora ferramentas de edio e manipulao de objetos de desenho grfico. 2. Verticalmente esquerda da tela tem-se a Barra de ferramentas desenho que contm botes para desenhar vrios objetos grficos e texto. 3. A rea de trabalho (workspace) a rea branca aberta no meio onde os objetos grficos so desenhados e texto digitado. 4. A Paleta de cores, no fundo da rea de trabalho, como no modo estrutura, permite que voc, rapidamente, altere a cor de objetos selecionados. 5. A Barra de status, exatamente como descrito na seo anterior, contm informaes que podem ser teis, como guia, no momento atual: o nome do arquivo que voc est trabalhando, o estado do documento, o nmero da pgina, entre outras. Observao: Para obter informaes sobre como personalizar as barras de ferramentas, por favor, leia a NOTA na seo anterior. 5.

Saindo do programa ACD / ChemSketch

Voc pode sair do programa em qualquer uma das seguintes maneiras: 1. Clique em Fechar no canto superior direito da barra de ttulo de qualquer janela. 2. A partir do menu ACD/Labs, escolha exit all (fechar tudo). Esta vai tentar fechar todos os programas de ACD/Labs que esto abertos, um por um. 3. No menu file (arquivo), escolha exit (sair). Isto ir fechar apenas o arquivo atualmente aberto. Voc ser avisado para salvar seu trabalho, nos formatos adequados, em funo da janela que voc est saindo. 6. Desenho de estruturas simples em 2D Esta seo considera as noes bsicas de desenho no modo Estrutura e pretende dar uma viso geral dos recursos de desenho disponveis no ACD/ ChemSketch (freeware), como: Desenhar tomos considerando: suas ligaes (simples, duplas, triplas); coordenaes; caractersticas qumicas; 2. Desenhar estrutura molecular; 3. Selecionar, girar e redimensionar as estruturas desenhadas; 1.

Certifique-se de que voc est no Modo de Estrutura para todas as seguintes aes: 6.1.1. Desenho de tomos e estruturas Como fazer: A ferramenta Desenhar Normal ferramenta padro quando o programa for iniciado. Neste modo, voc pode facilmente desenhar um tomo no seu estado normal, ramificado e em correntes e substituir os tomos com outros tomos da tabela peridica dos elementos. 1. Certifique-se a ferramenta desenhar normal ativado na barra de ferramentas Estrutura e que o tomo de carbono selecionado na barra de ferramentas tomos, conforme indica os crculos na figura abaixo.

2. Clique em um espao vazio para desenhar CH4 NOTA: Para desenhar de forma padro conforme descrito nessa seo e necessrio verificar o comando conforme figura abaixo. Na barra de menu clique em Options Set Structure Drawing Style Normal. Para mudar para qualquer outro padro que voc necessite s marcar o estilo desejado.

3. Clique em CH4 para adicionar um grupo -CH3, criando CH3-CH3 com um comprimento de ligao padro. Clique duas vezes no mesmo carbono para desenhar a estrutura visualizada na figura abaixo.

4. Clique em Configurar ligao verticalmente , na barra de ferramentas Estrutura, e clicar em qualquer ligao da estrutura para gir-lo para essa orientao, demonstrada na figura abaixo:

Observao: os botes ao lado desse descrito nesse item tambm servem para girar a sua estrutura para diferentes direes. Dica: teste todos e verifique o que mais se adapta ao que voc necessita. 6. Clique sobre o tomo de carbono mais direita para desenhar essa estrutura:

NOTA: Para copiar a estrutura desenhada, conforme estrutura acima, clique em Edit Select All, vai aparecer a estrutura selecionada (figura abaixo) ento aperte Edit Copy (ou as teclas de atalho Ctrl+C) e depois cole no documento desejado, ou no mesmo documento, se for o caso.

7. Repita o passo anterior para desenhar as seguintes estruturas:

8. Para acrescentar ligaes duplas clique uma vez na ligao simples j desenhada:

9. Para acrescentar uma ligao tripla clique duas vezes na ligao simples j desenhada.

10. Clique na ligao tripla ou dupla para torn-las uma ligao simples novamente. Observao: Para os itens acima o boto de desenhar normal selecionado. deve estar

11. Para fazer uma ramificao maior clique no boto e v para a rea de trabalho clique com o boto esquerdo do mouse e arraste para o lado desejado at ter o nmero de tomos que voc deseja.

12. Para desfazer ou refazer as estruturas clique no boto correspondente (botes em seta vermelha, na barra de ferramentas). 13. Voc pode apagar os tomos que tenha colocado a mais, como o boto (boto com uma borracha, na barra de ferramentas), clicando neste e clicando em cima do tomo que se deseja excluir. 14. Para substituir um tomo v na barra de ferramenta de tomos, a esquerda da rea de trabalho, clique no tomo desejado e na estrutura clique no tomo que voc deseja substituir, exemplo abaixo, substituio de C por F.

Ou, se o elemento no estiver na barra de ferramentas tomos, clique na Tabela Peridica , na barra de ferramentas tomos para abrir a tabela peridica dos elementos, escolha o tomo desejadoe clique em OK. Note que este tomo vai estar na barra de ferramentas tomos a partir de agora.

15. Para desenhar estruturas cclicas, na barra de ferramentas a direita da rea de trabalho clique na estrutura desejada e clique na rea de trabalho. Da mesma maneira que descrito acima, voc pode substituir os tomos dessas estruturas j desenhadas.

16. Para acrescentar um dos radicais existentes nesta barra de ferramentas, selecione o radical desejado e clique em cima do tomo, na estrutura j desenhada, que se deseja ligar este radical.

Observao: para apagar essa estrutura inteira clique na borracha e clique na parte branca da rea de trabalho, toda estrutura vai ficar selecionada, ento aperte o boto delete do seu teclado. 17. Para desenhar estruturas mais complexas o programa tem uma biblioteca de estruturas prontas. Clique em Templates window na barra de ferramentas e vai surgir uma tela como a da figura abaixo.Deixe structure selecionado, conforme figura, e escolha a estrutura desejada no menu a esquerda, no exemplo Alkaloids. Selecione a estrutura desejada clicando sobre ela, voc pode escolher atravs da barra ou trocando de pgina com o auxlio desses

botes , a janela Templates window vai se fechar, ento clique na rea em branco para inserir a estrutura desejada.

NOTE: Voc pode trocar a cor dos nmeros ou tomos selecionando o que voc deseja alterar com um clique sobre e indo na patela de cores e clicando na cor desejada ou em more na mesma barra e clicando sobre a cor desejada:

7. Para Limpar a tela Se voc tiver que limpar a tela, voc pode fazer uma das seguintes opes: 1. Clicando em new document (documento novo) , na barra de menu. 2. No menu file (arquivo), selecione new (novo). Isto ir abrir um novo documento. 3. Na barra de menu clique em Pages (Pginas) - new (nova) para inserir uma nova pgina vazia. 4. No menu Edit (Editar), escolha Select all (Selecionar tudo) e, em seguida, no mesmo menu edit, escolha delete.

8. Salvando as estruturas Assim que uma ou mais estruturas que voc desenhou estiverem prontas pode salv-las em um arquivo, imprimi-las, ou inseri-las em outras aplicaes como o MS Word, Excel, etc. 8.1 Salvando em um arquivo: 1. No menu file (arquivo), selecione salve as (salvar como), vai aparecer uma caixa de dilogo, conforme a da figura abaixo. Escolha em que pasta (save in) voc deseja salvar no seu computador, o nome do arquivo (file name) e a extenso que deseja salvar (save as type), clique em Save.

NOTA: importante observar o tipo de arquivo que se deseja salvar. No prprio formato do programa (*.sk2) possvel editar a figura. Um formato padro compartilhada por muitos programas o formato *.mol, ele no salva

imagens grficas, textos, s mantm a estrutura molecular. Em *.gif ou *.png mantm a imagem grfica. Escolha e melhor extenso para o seu caso, as disponveis iro aparecer na caixa de dilogo, conforme figura abaixo.

9. Incorporando a estrutura em um documento

Para inserir a estrutura em um relatrio escrito em outras aplicaes, por exemplo, um documento Word, planilha Excel, etc.: 1. Selecione a estrutura necessria, usando o boto de seleo , na barra de menu e selecionando a figura segurando o boto esquerdo do mouse arrastando a seta ao redor da estrutura desejada, voc vai observar que a estrutura vai ficar marcada. Ou clique em edit (editar) - select all (selecione tudo). 2. Para copiar a seleo para a rea de Transferncia, clique em copy (copiar), na barra de menu. Ou pressione Ctrl+C ou ainda, na barra de menu, edit (editar) copy (copiar). 3. Alterne para a aplicao onde deseja que a estrutura seja inserida e usando a funo Colar do pedido cole sua estrutura no documento desejado. Observao: Para colocar uma imagem da estrutura, use o recurso Colar Especial no aplicativo que voc est colando. Entre as opes de colagem escolher o ACD ChemSketch 2.0 Object ou a opo Imagem. Permitindo, assim, que voc edite a estrutura inserida via ChemSketch, clicando duas vezes sobre a imagem.