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INTRODUCTION! · 2019. 1. 7. · ! 1! INTRODUCTION!! 1.!L’ÉLECTROPHORÈSECAPILLAIRE!! Les!molécules!sont!soumises!à!2!flux!:!! !Le flux!électrophorétique!:!sous! l'influence!

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INTRODUCTION    

1.  L’ÉLECTROPHORÈSE  CAPILLAIRE    Les  molécules  sont  soumises  à  2  flux  :       Le   flux   électrophorétique   :   sous   l'influence   d'un   champ   électrique,   les   molécules  

chargées  se  déplacent  à  une  vitesse  caractéristique  qui  est  fonction  de  leur  charge  et  de  leur  taille.    Les   molécules   chargées   positivement   se   déplaceront   vers   la   cathode   alors   que   celles   chargées  négativement   seront   attirées   vers   l'anode.     Les   molécules   neutres   ne   sont   pas   soumises   à   ce  phénomène.    La  vitesse  de  ce  flux  est  notée  Ve.    

 Le  flux  électroosmotique  :  c'est  un  phénomène  particulier  au  capillaire  de  silice,  en  effet  les   groupements   silanol   sont   très   acides   et   donnent   facilement   S-­‐O2-­‐,   ce   qui   confère   au   capillaire  une   charge   interne   négative.     Dans   le   tampon   les   molécules   chargées   positivement   vont   venir  s'adsorber   à   la   paroi   interne   et   lorsqu'un   courant   est   imposé,   elles   vont   être   entraînées   vers   la  cathode  créant  ainsi  un  flux  comparable  à  un  tapis  roulant.    La  vitesse  de  ce  flux  est  notée  Veo.    La    vitesse  totale  d'une  molécule  est  la  somme  de  ces  deux  vitesses  :    

Vt  =  Ve  +  Veo    La  migration  se  fait  dans  un  capillaire  constitué  de  polymères  de  silicate  d'un  diamètre  inférieur  à  100  µm   (ici   75  µm).     Il   est   rempli   d'une   solution   tampon;   on   injecte   à   l'anode   et   on  détecte   à   la  cathode.    On  applique  une  tension  aux  bornes  du  capillaire  et  le  déplacement  des  espèces  est  régi  par  les  deux  phénomènes  que  sont  l'électromigration  et  l'électro-­‐osmose.      

+  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +                 +Ve  Anode  +                Ve   -­‐          Cathode  -­‐               Veo  

+  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +  +          

2.  LA  DÉTECTION    Sur   le   type   d'appareil   utilisé   en   TP,   la   détection   se   fait   par   spectrophotométrie   UV-­‐visible.     La  mesure  s'effectue  directement  à  travers  le  capillaire  de  silice  dénudé  de  sa  gaine  flexible  polyimide.    Il  est  utilisé  comme  cellule  de  détection  avec  un  trajet  optique  de  l'ordre  de  50  µm.  La  détection  directe  utilise  l'absorbance  naturelle  du  composé.    Il  donnera  un  pic  positif  à  l'écran.  La   détection   indirecte   utilise   l'absorbance   d'un   chromophore   rajouté   au   tampon.     Il   servira   à  détecter   les   composés   qui   n'absorbent   pas,   ceci   donnera   un   pic   négatif   car   ils   vont   diminuer  l'absorption  du  chromophore.      

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PROCÉDURE  D'OBTENTION  D'UN  ÉLECTROPHORÉGRAMME  

 

1.  L'APPAREILLAGE    

MDQ  Système  P/ACE  Beckman  Coulter  

 Capillaires        Electrodes                         Tampon                   Enregistreur                                                                      

     d  

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2.  MISE  EN  ROUTE    F  Allumer  l'appareil  d'électrophorèse  capillaire,  l'imprimante,  l'écran  et  le  PC.,  double-­‐cliquer  sur  l'icône  représentant  l'appareil  d'électrophorèse  capillaire    :    PACE  System  MDQ,    

   Une  fenêtre  s'ouvre  :    

             

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F  Cliquer  sur  OK,  sélectionner  alors  Instrument  1  :    

   La  fenêtre  générale  du  logiciel  apparaît.       1)  Procédure  de  placement  des  vials  dans  la  machine  :    

         

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F  Cliquer  sur  l'icône  Control   ,  la  fenêtre  de  contrôle  s'affiche  :    

   F  Cliquer  sur  LOAD.    Cette  manipulation  va  vous  permettre  d'ouvrir  le  couvercle  de  plateau  de  l'EC  afin  de  pouvoir  placer  correctement  les  différents  vials.    Remarque  :  laisser  toujours  en  arrière  plan  cette  fenêtre  ouverte.    ATTENTION  :  Tous  les  vials  doivent  contenir  1,4  mL  de  liquide  !    Sur  le  plateau  tampons  entrée  :  (à  gauche  en  avant)    �   Placez   en   BI:A1   (Buffer   Inlet   Position   A1),   un   vial   de   soude   à   0,1   mol.L-­‐1   qui   va   servir   au  nettoyage  du  capillaire;  (En  principe  :  ce  nettoyage  n'est  effectué  qu'une  seule  fois  par  jour  !)  �  Placez  en  BI:B1  (Buffer  Inlet  Position  B1),  un  vial  d'eau  ultrapure  qui  va  servir  au  rinçage  du  capillaire;  �  Placez  en  BI:C1  (Buffer  Inlet  Position  C1),  un  vial  de  tampon  qui  va  servir  à  la  fois  à  la  détection  des  anions  et  à  l'inversion  de  flux  électro-­‐osmotique  (imprégnation  de  l'intérieur  du  capillaire);  �  Placez  en  BI:D1  (Buffer  Inlet  Position  D1),  un  vial  de  tampon  qui  va  servir  à  la  fois  à  la  détection  des  anions  et  à  l'inversion  de  flux  électro-­‐osmotique  (vial  utilisé  lors  de  la  séparation).    �  Placez  en  BI:F1  (Buffer  Inlet  Position  F1),  un  vial  vide  (vial  utilisé  pour  le  stockage  du  capillaire).    Remarque   :   les  anions  à  séparer  et  à  quantifier  n'absorbent  pas  dans   l'UV   :   la  détection   indirecte  utilise   l'absorbance   d'un   chromophore   rajouté   au   tampon   (le   chromate).     Ceci   donnera   un   pic  négatif  car  ils  vont  diminuer  l'absorption  du  chromophore  :  le  fait  de  travailler  en  inverse  permet  d'observer  des  pics  positifs  !  D'autre  part,  les  anions  se  dirigeant  vers  l'anode  (électrode  +),  le  tampon  dispose  d'un  inverseur  de  flux  électroosmotique  (cela  va  permettre  de  raccourcir  la  durée  d'analyse).  

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Sur  le  plateau  tampons  sortie  :  (à  droite  en  avant)    �   Placez   en   BO:A1   (Buffer   Outlet   Position   A1),   un   vial   vide   (vial   utilisé   comme   poubelle   de  récupération);  �   Placez   en  BO:D1   (Buffer   Outlet   Position   D1),   un   vial   de   tampon   qui   va   servir   à   la   fois   à   la  détection  des  anions  et  à  l'inversion  de  flux  électro-­‐osmotique  (vial  utilisé  lors  de  la  séparation);  �  En  BO:B1  et  BO:C1  (Buffer  Outlet  Position  B1  et  C1),  les  emplacements  restent  vides;    �   Placez   en   BO:F1   (Buffer   Outlet   Position   F1),   un   vial   vide   (vial   utilisé   pour   le   stockage   du  capillaire).      Sur  le  plateau  échantillons  :  (à  gauche  à  l'arrière)    �  Placez  en  SI:A1  (Sample  Inlet  Position  A1),  un  vial  rempli  d'ions  Cl-­‐  à  une  concentration  de  20  ppm;  �  Placez  en  SI:B1  (Sample  Inlet  Position  B1),  un  vial  rempli  d'ions  SO42-­‐  à  une  concentration  de  40  ppm;  �  Placez  en  SI:C1  (Sample  Inlet  Position  C1),  un  vial  rempli  d'ions  NO3-­‐  à  une  concentration  de  40  ppm;  �  Placez  en  SI:D1  (Sample  Inlet  Position  D1),  un  vial  rempli  d'ions  HCO3-­‐  à  une  concentration  de  20  ppm.    F  Fermer  le  couvercle  de  plateau  de  l'EC.       2)  Procédure  de  programmation  d'une  analyse  :    

F  Cliquer  sur  l'icône  de  Time  Program   ,  une  fenêtre  apparaît  :    

 

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F  Vérifier  les  informations  suivantes  dans  la  colonne  de  gauche  :  Initial  Conditions  :      

           

  Inlet  Sample  Tray  :  48  Vial     Outlet  Sample  Tray  :  48  Vial     Cartridge  :  25,0  °C     Sample  :  25,0  °C     Power  :  (no  data  collection)       Max  =  9,00  W     Voltage  :  (no  data  collection)       Max  =  30,00  kV     Current  Channel  C       Max  =  300,00  µA     Peak  Detect  :       Threshold  :  2       Peak  Width  :  9    

F  Vérifier  les  informations  suivantes  dans  la  colonne  de  droite  :  PDA  Detector  Initial  Conditions  :    

      Scan  Data  :  Channel  A       Data  Rate  :  4,0     Channel  1  :  Channel  B       Use  Reference  Channel  :  No       Wavelength  :  254       Bandwith  :  10     Channel  2  :  (no  data  collection)     Channel  3  :  (no  data  collection)     Peak  Detect  :  (no  data  collection)     Data  Rate  :  4,0     Filter  Normal  :  16  to  25     Relays  :  Off  

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F  Vous  allez  maintenant  créer  la  programmation  de  l'électrophorèse  capillaire.       �  Rinçage  du  capillaire  avec  de  la  soude  à  0,1  mol.L-­‐1  sous  une  pression  de  20  psi  pendant     1  minute.  (Etape  de  rinçage  qui  ne  s'effectue  que  pour  la  première  analyse)       �  Rinçage   du   capillaire   avec   de   l'eau   ultrapure   sous   une   pression   de   20   psi   pendant   1     minute.       �  Rinçage  du  capillaire  avec  du  tampon  sous  une  pression  de  20  psi  pendant  1  minute.       �  Injection  de  l'échantillon  sous  une  pression  de  0,5  psi  pendant  4  secondes.       �  Phase  de  Séparation  sous  -­‐  18  kV  pendant  5  minutes.    F   Pour   cela,   vous   allez   créer   les   différents   événements   en   cliquant   dans   la   case  Event,   comme  indiqué  ci-­‐dessous  :    

     F  Choisir  Rinse;  une  fenêtre  s'ouvre  :  dans  la  zone   Values,   dans   la   case   Pressure,   choisir  20,0  psi;  dans   la  case  Duration,  choisir  1,00  min;   dans   la   zone   Tray   Positions   :   dans   la  case  Inlet,  choisir  BI:A1;  dans  la  case  Outlet,  choisir  BO:A1.  Ne   rien   changer   dans   les   autres   zones   de   la  fenêtre,  cliquer  sur  OK.  

   

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F  Pour  le  deuxième  événement  :  dans  la  case  Event,  choisir  Rinse;  dans  la  case  Pressure,  choisir  20,0  psi;  dans   la  case  Duration,   choisir  1,00  min;  dans   la  case  Inlet,   choisir  BI:B1;  dans   la  case  Outlet,  choisir  BO:A1.    F  Pour  le  troisième  événement  :  dans  la  case  Event,  choisir  Rinse;  dans  la  case  Pressure,  choisir  20,0  psi;  dans   la  case  Duration,   choisir  1,00  min;  dans   la  case   Inlet,   choisir  BI:C1;  dans   la  case  Outlet,  choisir  BO:A1.    F  Pour  le  quatrième  événement  :  dans  la  case  Event,  choisir  Inject;  dans  la  zone  Values,  dans  la  case  Pressure,  choisir  0,5  psi;  dans  la  case  Duration,  choisir  4,0  sec;  dans  la  zone  Tray  Positions,  dans  la  case  Inlet,  choisir  SI:A1;  dans  la  case  Outlet,  choisir  BO:A1.    

   Ne  rien  changer  dans  les  autres  zones  de  la  fenêtre,  cliquer  sur  OK.    F  Pour  le  cinquième  événement  :  dans  la  case  Event,  choisir  Separate;  dans  la  zone  Values,  dans  la   case   Voltage,   choisir   18,0   KV;   dans   la   case  Duration,   choisir   5,00   min;   dans   la   zone   Tray  Positions,   dans   la   case   Inlet,   choisir   BI:D1;   dans   la   case   Outlet,   choisir   BO:D1;   dans   la   zone  Polarity,  côcher  Reverse.    

 

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 Lorsque   la   programmation   est   terminée,   la   fenêtre   Time   Program   doit   présenter   toutes   les  informations  suivantes  :    

   Assurez-­‐vous  que  les  positionnements  des  vials  sur  les  plateaux  correspondent  bien  à  votre  programmation  !    F  Lorsque  la  programmation  est  terminée,  fermer  la  fenêtre.    Sauvegarder  votre  méthode  sous  un  nom  explicite  (8  caractères  au  plus)  en  cliquant  sur  File  →  Save  As.                                  

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  3)  Procédure  de  lancement  d'une  seule  analyse    

F  Cliquer  sur  l'icône  de  Run  Single   ,  une  fenêtre  apparaît  :    

   F  Dans  Sample  ID  :  indiquer  l'échantillon  à  analyser  ainsi  que  sa  concentration.  F  Dans  Method,  aller  chercher  la  méthode  que  vous  avez  sauvegardée  précédemment  et  que  vous  voulez  utiliser  pour  faire  votre  analyse.  F  Dans  Save  Run  As,  donner  un  nom  explicite  (8  caractères  au  plus)  à  votre  analyse.    F  Cliquer  sur  Start  pour  démarrer  l'analyse.    F  Cliquer  dans   la   fenêtre  Control,  pour  vérifier  que   les  différentes  étapes  de  rinçages  se  passent  comme  prévu;  puis,  dès  que   l'étape  de  séparation  est  entamée,  vous  pouvez  alors  cliquer  dans   la  fenêtre  principale  pour  voir  apparaître  l'électrophorégramme.    Fermer   la   fenêtre   Channel   A   qui   ne   servira   à   rien   ici   et   agrandir   la   fenêtre   Channel   B  représentant  l'électrophorégramme.    Remarque  :  Pour  zoomer  en  temps  réel  :  appuyer  simultanément  sur  les  touches  Ctrl  +  Z.                          

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F  À  la  fin  de  l'analyse,  si  le  ou  les  pics  de  l'électrophorégramme  ne  sont  pas  intégrés,  cliquer  dans  Analysis  →  Analyze   pour   faire  apparaître   le  ou   les   temps  de  migration  ainsi  que   la  ou   les  aires  sous  le  ou  les  pics.    

   

   

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F  Pour  imprimer,  cliquer  sur  l'icône    et  Print  Electropherogram  Channel  B.    

                                             

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  4)  Procédure  d'étalonnage  :    F  Lorsque  le  1er  point  de  gamme  est  réalisé,  il  faut  avant  tout,  créer  une  table  des  pics,  pour  cela  cliquer  sur  Method  →  Graphical  Events  Programming  →  Define  Peak(s)..    

   F   Il   faut   remplir   la   table   des   pics   en   fonction   de   leur   temps   de  migration.     Lorsque   la   table   est  remplie,  vous  devez  obtenir  la  table  suivante  :    

   Remarque  :  pour  supprimer  une  ligne,  il  suffit  de  la  sélectionner  et  Edit  Delete.  

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F  Dans  la  table  des  pics,  il  faut  indiquer  toutes  les  concentrations  des  différents  points  de  gamme  (Level).  Faire  une  sauvegarde  de  la  méthode.    

F   Cliquer   sur   l'icône   de   recalcul     afin   de   créer   le   premier   point   de   gamme   de   la   courbe  d'étalonnage.    Réitérer  le  processus  pour  chaque  électrophorégramme  de  chaque  point  de  gamme.    F   Cliquer   dans   Method   Review   Peak   Calibration   Curve   pour   observer   le   résultat   de   la  calibration  comme  indiquer  ci-­‐dessous  :    

                             

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F  Pour  visualiser   toutes   les   courbes  de  calibration,   il   suffit  de   sélectionner  dans   la   liste  des  pics  (zone  de  la  fenêtre  en  haut  à  droite)  le  composé  désiré.    Exemple  du  chlorure  ci-­‐dessous  :    

   Pour  imprimer  un  rapport  personnalisé,  cliquer  sur  Print  report  →  Custom  :