EDUCATION  AND  POSITIONS  2014-­‐    Principal  Investigator,  Fungal  Genomics  &  Evolution  Lab  (Lendület  Program),  Institute  of  

Biochemistry,  BRC,  Szeged,  Hungary.Positions  2013    Postdoctoral  Research  Fellow,  Clark  University,  Worcester,  USA.    

2012    Research  Fellow  (Rosztóczy  Alapítvány),  Clark  University,  Worcester,  USA.  

2012    PhD.  University  of  Szeged,  Hungary.  

2010      Visiting  researcher  (SYNTHESYS  Program),  University  of  Leiden,  The  Netherlands.  

2009      The  Fungal  Research  Trust  Fellow  (3  years),  University  of  Szeged,  Hungary.    

2008      M.Sc.  in  Biology,  University  of  Szeged,  Hungary.  

2006    Visiting  researcher  (SYNTHESYS  Program),  University  of  Leiden,  The  Netherlands.  

 

PUBLICATIONS  2014  Nagy  GL,  Ohm  R,  Kovacs  GM,  Floudas  D,  Riley  R,  Gacser  A,  Davis  JM,  Doty  SL,  de  Hoog  S,  Spatafora  J,  Martin  F,  Grigoriev  IV,  Hibbett  DS.  (2014)    Latent  homology  and  convergent  regulatory  evolution  underlies  the  repeated  emergence  of  yeasts.    Nat  Comms  5:4471  DOI:  10.1038/ncomms5471.      Riley  R,  Salamov  A,  Brown  D,  Nagy  GL,  Floudas  D,  Held  B,  Levasseur  A,  Morin  E,  Otillar  R,  Linquist  E,  Baker  S,  Pisabarro  A,  Walton  J,  Blanchette  R,  Henrissat  B,  Martin  F,  Cullen  D,  Hibbett  DS,  Grigoriev  IV  (2014)    Extensive  sampling  of  basidiomycete  genomes  demonstrates  inadequacy  of  the  white  rot/brown  rot  paradigm  for  wood  decay  fungi.    Proc  Natl  Acad  Sci  U.  S.  A.  doi/10.1073/pnas.1400592111.      2013  Ruiz-­‐Duenas  FJ,  Lundell  T,  Floudas  D,  Nagy  GL,  Barrassa  JM,  Hibbett  DS,  Martinez  AT.  (2013)    Lignin-­‐degrading  peroxidases  in  Polyporales:  an  evolutionary  survey  based  on  10  sequenced  genomes.    Mycologia  105(6):  1426-­‐44.    Morin  E,  Kohler  A,  Baker  AR,  Foulongne-­‐Oriol  M,  Lombard  V,  Nagy  GL,  Ohm  RA,  Patyshakuliyeva  A,  Brun  A,  Aerts  AL,  Bailey  AM,  Billette  C,  Coutinho  PM,  Deakin  G,  Doddapaneni  H,  Floudas  D,  Grimwood  J,  Hildén  K,  Kües  U,  LaButti  KM,  Lapidus  A,  Lindquist  EA,  Lucas  SM,  Murat  C,  Riley  RW,  Salamov  AA,  Schmutz  J,  Subramanian  V,  Wösten  HAB,  Xu  J,  Eastwood  DC,  Foster  GD,  Sonnenberg  ASM,  Cullen  D,  de  Vries  RP,  Lundell  T,  Hibbett  DS,  Henrissat  B,  Burton  KS,  Kerrigan  RW,  Challen  MP,  Grigoriev  IV,  Martin  F.  (2013)    Genome  sequence  of  the  button  mushroom  Agaricus  bisporus  reveals  mechanisms  governing  adaptation  to  a  humic-­‐rich  ecological  niche.    Proc  Natl  Acad  Sci  U.  S.  A.  doi:  10.1073/pnas.1206847109    

Tóth  A,  Hausknecht  A,  Krisai-­‐Greilhuber  I,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T,  Nagy  GL.  2013.    An  iterative  alignment  strategy  helps  eliminating  guide  tree  bias  from  alignment  and  phylogeny  of  the  mushroom  family  Bolbitiaceae.    Plos  One  8(2):  e56143,  doi:10.1371/journal.pone.0056153    Nagy  GL,  Desjardin  D,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T.  2013.    A  phylogenetic  species  concept  identifies  multiple  species  within  morphologically  discerned  taxa  of  sections  Lanatuli  and  Atramentarii  of  the  genus  Coprinopsis.    Mycologia  105(1):  112-­‐24.    Nagy  GL,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T.  2013.    Morphological  characterization  of  clades  of  the  Psathyrellaceae  (Agaricales)  inferred  from  a  multigene  phylogeny.    Mycological  Progress,  12(3):  505-­‐517.      2012  Nagy  GL,  Kocsubé  S,  Csanádi  Z,  Kovács  GM,  Petkovits  T,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T.  2012    Re-­‐Mind  the  gap!  Insertion-­‐Deletion  Data  reveal  neglected  phylogenetic  potential  of  the  fungal  internal  trabscribed  spacer.    Plos  One  7(11):  e49794.  doi:10.1371/journal.pone.0049794      Floudas  D,  Binder  M,  Riley  R,  Barry  K,  Blanchette  RA,  Henrissat  B,  Martínez  AT,  Otillar  R,  Spatafora  JW,  Yadav  JS,  Aerts  A,  Benoit  I,  Boyd  A,  Carlson  A,  Copeland  A,  Coutinho  PM,  de  Vries  RP,  Ferreira  P,  Findley  K,  Foster  B,  Gaskell  J,  Glotzer  D,  Górecki  P,  Heitman  J,  Hesse  C,  Hori  C,  Igarashi  K,  Jurgens  JA,  Kallen  N,  Kersten  P,  Kohler  A,  Kües  U,  Kumar  TK,  Kuo  A,  LaButti  K,  Larrondo  LF,  Lindquist  E,  Ling  A,  Lombard  V,  Lucas  S,  Lundell  T,  Martin  R,  McLaughlin  DJ,  Morgenstern  I,  Morin  E,  Murat  C,  Nagy  GL,  Nolan  M,  Ohm  RA,  Patyshakuliyeva  A,  Rokas  A,  Ruiz-­‐Dueñas  FJ,  Sabat  G,  Salamov  A,  Samejima  M,  Schmutz  J,  Slot  JC,  St  John  F,  Stenlid  J,  Sun  H,  Sun  S,  Syed  K,  Tsang  A,  Wiebenga  A,  Young  D,  Pisabarro  A,  Eastwood  DC,  Martin  F,  Cullen  D,  Grigoriev  IV,  Hibbett  DS  (2012)    Paleozoic  origin  of  enzymatic  lignin  decomposition  reconstructed  using  31  fungal  genomes.  Science  336:  1715-­‐19.      Schoch  CL,  Seifert  KA,  Huhndorf  S,  Robert  V,  Spouge  JL,  Levesque  CA,  Chen  W,    Bolchacova  E,  Voigt  K,  Crous  PW,  Miller  AN,  Wingfield  MJ,  Aime  MC,  An  KD,  Bai  FY,  Barreto  RW,  Begerow  D,  Bergeron  MJ,  Blackwell  M,  Boekhout  T,  Bogale  M,  Boonyuen  N,  Burgaz  AR,  Buyck  B,  Cai  L,  Cai  Q,  Cardinali  G,  Chaverri  P,  Coppins  BJ,  Crespo  A,  Cubas  P,  Cummings  C,  Damm  U,  de  Beer  ZW,  de  Hoog  GS,  Del-­‐Prado  R,  Dentinger  B,  Diéguez-­‐Uribeondo  J,  Divakar  PK,  Douglas  B,  Dueñas  M,  Duong  TA,  Eberhardt  U,  Edwards  JE,  Elshahed  MS,  Fliegerova  K,  Furtado  M,  García  MA,  Ge  ZW,  Griffith  GW,  Griffiths  K,  Groenewald  JZ,  Groenewald  M,  Grube  M,  Gryzenhout  M,  Guo  LD,  Hagen  F,  Hambleton  S,  Hamelin  RC,  Hansen  K,  Harrold  P,  Heller  G,  Herrera  C,  Hirayama  K,  Hirooka  Y,  Ho  HM,  Hoffmann  K,  Hofstetter  V,  Högnabba  F,  Hollingsworth  PM,  Hong  SB,  Hosaka  K,  Houbraken  J,  Hughes  K,  Huhtinen  S,  Hyde  KD,  James  T,  Johnson  EM,  Johnson  JE,  Johnston  PR,  Jones  EB,  Kelly  LJ,  Kirk  PM,  Knapp  DG,  Kõljalg  U,  Kovács  GM,  Kurtzman  CP,  Landvik  S,  Leavitt  SD,  Liggenstoffer  AS,  Liimatainen  K,  Lombard  L,  Luangsa-­‐Ard  JJ,  Lumbsch  HT,  Maganti  H,  Maharachchikumbura  SS,  Martin  MP,  May  TW,  McTaggart  AR,  Methven  AS,  Meyer  W,  Moncalvo  JM,  Mongkolsamrit  S,  Nagy  GL,  Nilsson  RH,  Niskanen  T,  Nyilasi  I,  Okada  G,  Okane  I,  Olariaga  I,  Otte  J,  Papp  T,  Park  D,  Petkovits  T,  Pino-­‐Bodas  R,  Quaedvlieg  W,  Raja  HA,  Redecker  D,  Rintoul  TL,  Ruibal  C,  Sarmiento-­‐

Ramírez  JM,  Schmitt  I,  Schüßler  A,  Shearer  C,  Sotome  K,  Stefani  FO,  Stenroos  S,  Stielow  B,  Stockinger  H,  Suetrong  S,  Suh  SO,  Sung  GH,  Suzuki  M,  Tanaka  K,  Tedersoo  L,  Telleria  MT,  Tretter  E,  Untereiner  WA,  Urbina  H,  Vágvölgyi  C,  Vialle  A,  Vu  TD,  Walther  G,  Wang  QM,  Wang  Y,  Weir  BS,  Weiß  M,  White  MM,  Xu  J,  Yahr  R,  Yang  ZL,  Yurkov  A,  Zamora  JC,  Zhang  N,  Zhuang  WY,  Schindel  D.  (2012)    Nuclear  ribosomal  internal  transcribed  spacer  (ITS)  region  as  a  universal  DNA  barcode  marker  for  Fungi.    Proc  Natl  Acad  Sci  U  S  A.  109:6241-­‐6.      Pintye  A,  Bereczky  Z,  Kovács  GM,  Nagy  GL,  Xu  X,  Legler  SE,  Váczy  Z,  Váczy  KZ,  Caffi  T,  Rossi  V,  Kiss  L  (2012)    No  Indication  of  Strict  Host  Associations  in  a  Widespread  Mycoparasite:  Grapevine  Powdery  Mildew  (Erysiphe  necator)  Is  Attacked  by  Phylogenetically  Distant  Ampelomyces  Strains  in  the  Field.    Phytopathology  102:707-­‐16.      Nagy  GL,  Házi  J,  Szappanos  B,  Kocsubé  S,  Bálint  B,  Rákhely  G,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T.  (2012)    The  Evolution  of  Defense  Mechanisms  Correlate  with  the  Explosive  Diversification  of  Autodigesting  Coprinellus  Mushrooms  (Agaricales,  Fungi).    Systematic  Biology,  61:  595-­‐607.      Nagy  GL,  Házi  J,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T.  (2012)    Phylogeny  and  Species  Delimitation  in  the  Genus  Coprinellus  with  Special  Emphasis  on  the  Haired  Species.    Mycologia  104:  254-­‐275.      2011  Petkovits  T,  Nagy  GL,  Hoffmann  K,  Wagner  L,  Nyilasi  I,  Griebel  T,  Schnabelrauch  D,  Vogel  H,  Voigt  K,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T.  (2011)    Data  Partitions,  Bayesian  Analysis  and  Phylogeny  of  the  Zygomycetous  Fungal  Family  Mortierellaceae,  Inferred  from  Nuclear  Ribosomal  DNA  Sequences.    Plos  One,  6(11):  e27507.  doi:10.1371/journal.pone.0027507      Nagy  GL,  Petkovits  T,  Kovács  GM,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T.    Where  is  the  unseen  fungal  diversity  hidden?  A  study  of  Mortierella  reveals  a  large  contribution  of  reference  collections  to  the  identification  of  fungal  environmental  sequences.      New  Phytologist  191,  2011,  789-­‐794.      Házi  J,  Nagy  GL,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T.  (2011)    Coprinellus  radicellus,  a  new  species  with  northern  distribution.    Mycol  Progress.  10:363-­‐371.      Nagy  GL,  Walther  G,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T.  (2011)    Understanding  the  Evolutionary  Processes  of  Fungal  Fruiting  Bodies:  Correlated  Evolution  and  Divergence  Times  in  the  Psathyrellaceae.  Systematic  Biology,  60:303-­‐317.      Nagy  GL,  Urban  A,  Örstadius  L,  Larsson  E,  Papp  T,  Vágvölgyi  Cs.  (2010)    

The  evolution  of  autodigestion  in  the  mushroom  family  Psathyrellaceae  (Agaricales)  inferred  from  Maximum  Likelihood  and  Bayesian  methods    Mol.  Phylogenet.  Evol.  57(3):1037-­‐48.      Nagy  GL,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T.  (2010)    Type  studies  and  nomenclatural  revisions  in  Parasola  (Psathyrellaceae)  and  related  taxa  Mycotaxon  112:103-­‐114.    Nagy  GL,  Kocsubé  S,  Papp  T,,  Vágvölgyi  Cs.  (2009)  Phylogeny  and  character  evolution  of  the  coprinoid  mushroom  genus  Parasola  as  inferred  from  LSU  and  ITS  nrDNA  sequence  data    Persoonia  22:28-­‐37.      Takó  M,  Tóth  A,  Nagy  GL,  Krisch  J,  Vágvölgyi  Cs,  Papp  T.  (2010)    A  new  b-­‐glucosidase  gene  from  the  zygomycete  fungus  Rhizomucor  miehei.    Antonie  van  Leeuwenhoek  97:1–10.      Kredics  L,  Kocsubé  S,  Nagy  GL,  Komon-­‐Telazowska  M,  Manczinger  L,  Nagy  A,  Vágvölgyi  Cs,  Kubicek  CP,  Druzhinina  IS,  Hatvani  L.  (2009)    Molecular  identification  of  Trichoderma  species  associated  with  Pleurotus  ostreatus  and  natural  substrates  of  the  oyster  mushroom.    FEMS  Microbiol  Lett  FEMS  Microbiol  Lett  300:58-­‐67      Bidartondo  MI,  Bruns  TD,  Blackwell  M,  ...  Nagy  GL  (65th  author)  ...  et  al.  (2008)    Preserving  accuracy  in  GenBank.    Science  319:1616.