Medical Imaging Data StructureUna extensión del BIDS - Brain Imaging Data Structure

Maria de la Iglesia Vayád e l a i g l e s i a _ m a r @ g v a . e s

Jose Manuel Saborit Torresj o s a t o r 2 @ g m a i l . c o m

Jhon Jairo Saenz Gamboaj s a e n z @ c i p f. c o m

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Introducción: Ingesta de imágenes medicas

Arterias – HSJ de Alicante

Win 1 RA600

10.192.66.40

Win 2 RA600

10.192.66.45

Win 3 RA600

10.192.66.47

E: E: E:

Linux CTP – ANONIMIZADOR - CEIBANON 10.192.66.xx

Disco linux & visibilidad de las unidades E: vía samba

vpn.san.gva.es

BIMCV

GVA - CIPF

A

B

DESCOMPRESION, LIMPIEZA, ANONIMIZACIÓN

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Introducción:Ingesta de imágenes medicas

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Introducción:Ingesta de imágenes medicas

¿Que estructura deberíamos utilizar en Big Data? 5

XNAT

XNAT es una aplicación web de código abierto que permite tareas de gestión, productividad y seguridad de las imágenes.

Tiene soporte como repositorio de imágenes medicas y sus respectivos datos médicos.

Ofrece una estructura estándar para repositorios de imágenes médicas.

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Estructura de Datos Actual en XNAT

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1. Id del proyecto2. Id del sujeto3. Id de la sesión

4. Id de la imagen5. Tipo de imagen6. Archivo con la imagen

Estructura BIDS

Estructura sencilla

Hay herramientas para crear directorios con formato BIDS a partir de imágenes DICOM

PROBLEMA: Sólo se especifica para imágenes RM cerebral

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MIDS: una extensión de BIDS

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Pretende no limitar su uso a un tipo de imagen.

No pierde la esencia BIDS

Se especifica y amplia toda la información requerida en archivos localizados

MIDS:Una extensión de BIDS

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1. Id del proyecto2. Fichero participants.csv3. Grupo de control

4. Id del Sujeto5. Fichero participant.json6. Id de sesión

7. Carpeta imágenes anatómicas8. Información de la imagen9. Imagen

10. Carpeta imágenes de difusión11. Carpeta imágenes funcionales12. Carpeta no clasificados

Medical Imaging Data StructureUna extensión del BIDS - Brain Imaging Data Structure

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Gracias por vuestra atención