Filatre AnnabelleResponsable ISTAgroParisTech MontpellierMembre du groupe OALRannabellefilatreagroparistechfr
Hensens HankaResponsable ISTIRD MontpellierMembre du groupe OALRhankahensensirdfr
Points Techniques Preacutealables
bull Pensez agrave bull Couper vos microsbull Ouvrir un minimum dapplications (qualiteacute de connexion)bull Choisir si possible une connexion filaire
bull Signaler votre preacutesence par un bref message dans le chat (Nom et preacutenom)
bull Poser vos questions via le chat bull Le confeacuterencier y reacutepondra lors des plages de questions preacutevues durant
le webinairebull Les reacuteponses aux questions non traiteacutees en direct seront accessibles sur
le site OALR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
1 Contours et contexte1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees 2 Geacuterer des donneacutees 3 Publier des donneacutees
Conclusion
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Deacutefinitions des Donneacutees de la recherche
bull Pour lrsquoOCDE laquo Enregistrements factuels (chiffres textes images et sons) qui sont utiliseacutes comme sourcesprincipales pour la recherche scientifique et sont geacuteneacuteralement reconnus par la communauteacutescientifique comme neacutecessaires pour valider les reacutesultats de la recherche raquo(Principes et lignes directrices de lrsquoOCDE pour lrsquoaccegraves aux donneacutees de la recherche financeacutee sur fondspublics ndash 2006 reprise par le Plan National pour Science Ouverte - 2018)
bull Pour la Royal Society de Londres laquo Informations qualitatives ou quantitatives [hellip] qui sont factuelles Ces donneacutees peuvent ecirctre brutesou primaires (directement issue drsquoune mesure) ou deacuteriveacutee de donneacutees primaires mais ne sont pasencore le produit drsquoanalyse ou drsquointerpreacutetation autres que le calculs raquo
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11 Deacutefinitions et typologie
Typologie des donneacutees de la recherche
bull Deacutefinition de la Commission europeacuteenne pour Horizon 2020
1 Les donneacutees sous-jacente (les donneacutees neacutecessaires pour valider les reacutesultats preacutesenteacutes dans les publications scientifiques) incluant les meacutetadonneacutees associeacutees (crsquoest-agrave-dire les meacutetadonneacutees deacutecrivant les donneacutees de recherche deacuteposeacutees)
2Toute autre donneacutee (par exemple les donneacutees conserveacutees qui ne sont pas directement attribuables agrave une publication ou les donneacutees brutes) y compris les meacutetadonneacutees associeacutees
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11 Deacutefinitions et typologie
Donneacutees dobservations
denquecircte
Donneacutees de simulation
Donneacutees expeacuterimentales
Donneacutees deacuteriveacutees
Carnets de terrainQuestionnaires enquecirctesPhotographies films fichiers audiohellip
ModegravelesAlgorithmesScriptshellip
EchantillonsPhotos de microscopeSpectroscopiehellip
Fichiers de donneacuteesDocuments texte Feuilles de calculsBases de donneacuteeshellip
Typologie par meacutethode dobtention11 Deacutefinitions et typologie
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Cycle de vie de la donneacutee
[IST Agropolis 2016]OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Creacuteation Collecte
Traitement et analyse
Conservation
Accegraves et reacuteutilisation
bull Donneacutees traiteacuteesbull Donneacutees analyseacuteesbull Donneacutees enrichies
bull Donneacutees deacuteposeacuteesbull Donneacutees publieacuteesbull Donneacutees archiveacutees
bull Donneacutees reacuteutiliseacuteesbull Donneacutees partageacuteesbull Ethique et proprieacuteteacute
intellectuelle
bull Donneacutees brutesbull Donneacutees sourcesbull Donneacutees recueillies
Ne relevant pas des donneacutees de la recherche
Selon lOCDE Les documents non acheveacutes
bull les carnets de laboratoirebull les analyses preacuteliminaires les projets de documents scientifiques et
les programmes de travaux futursbull les examens par les pairsbull les communications personnelles avec des collegravegues hellip
Les objets mateacuteriels bull les souches bacteacuteriennesbull les animaux de laboratoirehellip
Les productions scientifiquesbull les publications scientifiques communications agrave congregravesbull les supports de formation hellip
Les donneacutees administratives non inteacutegreacutees dans un corpus de recherche
Image de PixabayOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Deacutefinition des jeux de donneacutees (Dataset)
bull laquo Agreacutegation sous une forme lisible de donneacutees brutes ou deacuteriveacutees preacutesentant une certaine uniteacute rassembleacutees pour former un ensemble coheacuterent raquo (Gaillard 2014)
bull Uniteacute de deacutepocirct dans un entrepocirct sa granulariteacute ne doit ecirctre ni trop petite ni trop grande pour faciliter la citation
bull Compleacuteteacute par des meacutetadonneacutees neacutecessaires agrave leur reacuteutilisation et agrave leur validation meacutethodes drsquoobtention logiciels neacutecessaires auteurs couverture temporelle et spatiale etchellip
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11 Deacutefinitions et typologie
Les enjeux de louverture des donneacutees de la recherche scientifique
Enjeux scientifiques bull Deacutefis scientifiques complexes
bull Accroicirctre limpact de la science
bull Faire eacutevoluer les systegravemes deacutedition
bull Eviter la perte de donneacutees
Enjeux eacuteconomiquesbull Valeur eacuteconomique de la donneacuteebull Conditions de financement des
bailleursbull Continuiteacute de la recherchebull Big Data et data science
Enjeux socieacutetauxbull Seacutecurisation des donneacuteesbull Interopeacuterabiliteacute des donneacuteesbull Participation citoyennebull Transparence du processus
scientifique
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la perte des donneacutees
20 ans apregraves publication 80 des donneacutees scientifiques sont perdueshellip
bull Causes bull Destruction des supports virus
bull Obsolescence mateacuterielle ou logicielle
bull Lieu de stockage indeacutefini
bull Erreur humaine deacutepart de personnelhellip
bull Conseacutequences bull Perte de temps drsquoargent (fonds publicshellip)
bull Pas de veacuterification des reacutesultats possible
bull Pas de comparaison des reacutesultats dans le temps ou lrsquoespace
bull Pas de reacuteutilisations par drsquoautres publics pour drsquoautres fins
VINES Timothy H et al The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age Current Biology 2014
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
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12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
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Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Points Techniques Preacutealables
bull Pensez agrave bull Couper vos microsbull Ouvrir un minimum dapplications (qualiteacute de connexion)bull Choisir si possible une connexion filaire
bull Signaler votre preacutesence par un bref message dans le chat (Nom et preacutenom)
bull Poser vos questions via le chat bull Le confeacuterencier y reacutepondra lors des plages de questions preacutevues durant
le webinairebull Les reacuteponses aux questions non traiteacutees en direct seront accessibles sur
le site OALR
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1 Contours et contexte1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees 2 Geacuterer des donneacutees 3 Publier des donneacutees
Conclusion
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Deacutefinitions des Donneacutees de la recherche
bull Pour lrsquoOCDE laquo Enregistrements factuels (chiffres textes images et sons) qui sont utiliseacutes comme sourcesprincipales pour la recherche scientifique et sont geacuteneacuteralement reconnus par la communauteacutescientifique comme neacutecessaires pour valider les reacutesultats de la recherche raquo(Principes et lignes directrices de lrsquoOCDE pour lrsquoaccegraves aux donneacutees de la recherche financeacutee sur fondspublics ndash 2006 reprise par le Plan National pour Science Ouverte - 2018)
bull Pour la Royal Society de Londres laquo Informations qualitatives ou quantitatives [hellip] qui sont factuelles Ces donneacutees peuvent ecirctre brutesou primaires (directement issue drsquoune mesure) ou deacuteriveacutee de donneacutees primaires mais ne sont pasencore le produit drsquoanalyse ou drsquointerpreacutetation autres que le calculs raquo
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11 Deacutefinitions et typologie
Typologie des donneacutees de la recherche
bull Deacutefinition de la Commission europeacuteenne pour Horizon 2020
1 Les donneacutees sous-jacente (les donneacutees neacutecessaires pour valider les reacutesultats preacutesenteacutes dans les publications scientifiques) incluant les meacutetadonneacutees associeacutees (crsquoest-agrave-dire les meacutetadonneacutees deacutecrivant les donneacutees de recherche deacuteposeacutees)
2Toute autre donneacutee (par exemple les donneacutees conserveacutees qui ne sont pas directement attribuables agrave une publication ou les donneacutees brutes) y compris les meacutetadonneacutees associeacutees
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11 Deacutefinitions et typologie
Donneacutees dobservations
denquecircte
Donneacutees de simulation
Donneacutees expeacuterimentales
Donneacutees deacuteriveacutees
Carnets de terrainQuestionnaires enquecirctesPhotographies films fichiers audiohellip
ModegravelesAlgorithmesScriptshellip
EchantillonsPhotos de microscopeSpectroscopiehellip
Fichiers de donneacuteesDocuments texte Feuilles de calculsBases de donneacuteeshellip
Typologie par meacutethode dobtention11 Deacutefinitions et typologie
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Cycle de vie de la donneacutee
[IST Agropolis 2016]OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Creacuteation Collecte
Traitement et analyse
Conservation
Accegraves et reacuteutilisation
bull Donneacutees traiteacuteesbull Donneacutees analyseacuteesbull Donneacutees enrichies
bull Donneacutees deacuteposeacuteesbull Donneacutees publieacuteesbull Donneacutees archiveacutees
bull Donneacutees reacuteutiliseacuteesbull Donneacutees partageacuteesbull Ethique et proprieacuteteacute
intellectuelle
bull Donneacutees brutesbull Donneacutees sourcesbull Donneacutees recueillies
Ne relevant pas des donneacutees de la recherche
Selon lOCDE Les documents non acheveacutes
bull les carnets de laboratoirebull les analyses preacuteliminaires les projets de documents scientifiques et
les programmes de travaux futursbull les examens par les pairsbull les communications personnelles avec des collegravegues hellip
Les objets mateacuteriels bull les souches bacteacuteriennesbull les animaux de laboratoirehellip
Les productions scientifiquesbull les publications scientifiques communications agrave congregravesbull les supports de formation hellip
Les donneacutees administratives non inteacutegreacutees dans un corpus de recherche
Image de PixabayOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Deacutefinition des jeux de donneacutees (Dataset)
bull laquo Agreacutegation sous une forme lisible de donneacutees brutes ou deacuteriveacutees preacutesentant une certaine uniteacute rassembleacutees pour former un ensemble coheacuterent raquo (Gaillard 2014)
bull Uniteacute de deacutepocirct dans un entrepocirct sa granulariteacute ne doit ecirctre ni trop petite ni trop grande pour faciliter la citation
bull Compleacuteteacute par des meacutetadonneacutees neacutecessaires agrave leur reacuteutilisation et agrave leur validation meacutethodes drsquoobtention logiciels neacutecessaires auteurs couverture temporelle et spatiale etchellip
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11 Deacutefinitions et typologie
Les enjeux de louverture des donneacutees de la recherche scientifique
Enjeux scientifiques bull Deacutefis scientifiques complexes
bull Accroicirctre limpact de la science
bull Faire eacutevoluer les systegravemes deacutedition
bull Eviter la perte de donneacutees
Enjeux eacuteconomiquesbull Valeur eacuteconomique de la donneacuteebull Conditions de financement des
bailleursbull Continuiteacute de la recherchebull Big Data et data science
Enjeux socieacutetauxbull Seacutecurisation des donneacuteesbull Interopeacuterabiliteacute des donneacuteesbull Participation citoyennebull Transparence du processus
scientifique
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la perte des donneacutees
20 ans apregraves publication 80 des donneacutees scientifiques sont perdueshellip
bull Causes bull Destruction des supports virus
bull Obsolescence mateacuterielle ou logicielle
bull Lieu de stockage indeacutefini
bull Erreur humaine deacutepart de personnelhellip
bull Conseacutequences bull Perte de temps drsquoargent (fonds publicshellip)
bull Pas de veacuterification des reacutesultats possible
bull Pas de comparaison des reacutesultats dans le temps ou lrsquoespace
bull Pas de reacuteutilisations par drsquoautres publics pour drsquoautres fins
VINES Timothy H et al The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age Current Biology 2014
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
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12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
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Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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1 Contours et contexte1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees 2 Geacuterer des donneacutees 3 Publier des donneacutees
Conclusion
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Deacutefinitions des Donneacutees de la recherche
bull Pour lrsquoOCDE laquo Enregistrements factuels (chiffres textes images et sons) qui sont utiliseacutes comme sourcesprincipales pour la recherche scientifique et sont geacuteneacuteralement reconnus par la communauteacutescientifique comme neacutecessaires pour valider les reacutesultats de la recherche raquo(Principes et lignes directrices de lrsquoOCDE pour lrsquoaccegraves aux donneacutees de la recherche financeacutee sur fondspublics ndash 2006 reprise par le Plan National pour Science Ouverte - 2018)
bull Pour la Royal Society de Londres laquo Informations qualitatives ou quantitatives [hellip] qui sont factuelles Ces donneacutees peuvent ecirctre brutesou primaires (directement issue drsquoune mesure) ou deacuteriveacutee de donneacutees primaires mais ne sont pasencore le produit drsquoanalyse ou drsquointerpreacutetation autres que le calculs raquo
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11 Deacutefinitions et typologie
Typologie des donneacutees de la recherche
bull Deacutefinition de la Commission europeacuteenne pour Horizon 2020
1 Les donneacutees sous-jacente (les donneacutees neacutecessaires pour valider les reacutesultats preacutesenteacutes dans les publications scientifiques) incluant les meacutetadonneacutees associeacutees (crsquoest-agrave-dire les meacutetadonneacutees deacutecrivant les donneacutees de recherche deacuteposeacutees)
2Toute autre donneacutee (par exemple les donneacutees conserveacutees qui ne sont pas directement attribuables agrave une publication ou les donneacutees brutes) y compris les meacutetadonneacutees associeacutees
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11 Deacutefinitions et typologie
Donneacutees dobservations
denquecircte
Donneacutees de simulation
Donneacutees expeacuterimentales
Donneacutees deacuteriveacutees
Carnets de terrainQuestionnaires enquecirctesPhotographies films fichiers audiohellip
ModegravelesAlgorithmesScriptshellip
EchantillonsPhotos de microscopeSpectroscopiehellip
Fichiers de donneacuteesDocuments texte Feuilles de calculsBases de donneacuteeshellip
Typologie par meacutethode dobtention11 Deacutefinitions et typologie
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Cycle de vie de la donneacutee
[IST Agropolis 2016]OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Creacuteation Collecte
Traitement et analyse
Conservation
Accegraves et reacuteutilisation
bull Donneacutees traiteacuteesbull Donneacutees analyseacuteesbull Donneacutees enrichies
bull Donneacutees deacuteposeacuteesbull Donneacutees publieacuteesbull Donneacutees archiveacutees
bull Donneacutees reacuteutiliseacuteesbull Donneacutees partageacuteesbull Ethique et proprieacuteteacute
intellectuelle
bull Donneacutees brutesbull Donneacutees sourcesbull Donneacutees recueillies
Ne relevant pas des donneacutees de la recherche
Selon lOCDE Les documents non acheveacutes
bull les carnets de laboratoirebull les analyses preacuteliminaires les projets de documents scientifiques et
les programmes de travaux futursbull les examens par les pairsbull les communications personnelles avec des collegravegues hellip
Les objets mateacuteriels bull les souches bacteacuteriennesbull les animaux de laboratoirehellip
Les productions scientifiquesbull les publications scientifiques communications agrave congregravesbull les supports de formation hellip
Les donneacutees administratives non inteacutegreacutees dans un corpus de recherche
Image de PixabayOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Deacutefinition des jeux de donneacutees (Dataset)
bull laquo Agreacutegation sous une forme lisible de donneacutees brutes ou deacuteriveacutees preacutesentant une certaine uniteacute rassembleacutees pour former un ensemble coheacuterent raquo (Gaillard 2014)
bull Uniteacute de deacutepocirct dans un entrepocirct sa granulariteacute ne doit ecirctre ni trop petite ni trop grande pour faciliter la citation
bull Compleacuteteacute par des meacutetadonneacutees neacutecessaires agrave leur reacuteutilisation et agrave leur validation meacutethodes drsquoobtention logiciels neacutecessaires auteurs couverture temporelle et spatiale etchellip
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11 Deacutefinitions et typologie
Les enjeux de louverture des donneacutees de la recherche scientifique
Enjeux scientifiques bull Deacutefis scientifiques complexes
bull Accroicirctre limpact de la science
bull Faire eacutevoluer les systegravemes deacutedition
bull Eviter la perte de donneacutees
Enjeux eacuteconomiquesbull Valeur eacuteconomique de la donneacuteebull Conditions de financement des
bailleursbull Continuiteacute de la recherchebull Big Data et data science
Enjeux socieacutetauxbull Seacutecurisation des donneacuteesbull Interopeacuterabiliteacute des donneacuteesbull Participation citoyennebull Transparence du processus
scientifique
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la perte des donneacutees
20 ans apregraves publication 80 des donneacutees scientifiques sont perdueshellip
bull Causes bull Destruction des supports virus
bull Obsolescence mateacuterielle ou logicielle
bull Lieu de stockage indeacutefini
bull Erreur humaine deacutepart de personnelhellip
bull Conseacutequences bull Perte de temps drsquoargent (fonds publicshellip)
bull Pas de veacuterification des reacutesultats possible
bull Pas de comparaison des reacutesultats dans le temps ou lrsquoespace
bull Pas de reacuteutilisations par drsquoautres publics pour drsquoautres fins
VINES Timothy H et al The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age Current Biology 2014
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
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12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
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Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Deacutefinitions des Donneacutees de la recherche
bull Pour lrsquoOCDE laquo Enregistrements factuels (chiffres textes images et sons) qui sont utiliseacutes comme sourcesprincipales pour la recherche scientifique et sont geacuteneacuteralement reconnus par la communauteacutescientifique comme neacutecessaires pour valider les reacutesultats de la recherche raquo(Principes et lignes directrices de lrsquoOCDE pour lrsquoaccegraves aux donneacutees de la recherche financeacutee sur fondspublics ndash 2006 reprise par le Plan National pour Science Ouverte - 2018)
bull Pour la Royal Society de Londres laquo Informations qualitatives ou quantitatives [hellip] qui sont factuelles Ces donneacutees peuvent ecirctre brutesou primaires (directement issue drsquoune mesure) ou deacuteriveacutee de donneacutees primaires mais ne sont pasencore le produit drsquoanalyse ou drsquointerpreacutetation autres que le calculs raquo
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11 Deacutefinitions et typologie
Typologie des donneacutees de la recherche
bull Deacutefinition de la Commission europeacuteenne pour Horizon 2020
1 Les donneacutees sous-jacente (les donneacutees neacutecessaires pour valider les reacutesultats preacutesenteacutes dans les publications scientifiques) incluant les meacutetadonneacutees associeacutees (crsquoest-agrave-dire les meacutetadonneacutees deacutecrivant les donneacutees de recherche deacuteposeacutees)
2Toute autre donneacutee (par exemple les donneacutees conserveacutees qui ne sont pas directement attribuables agrave une publication ou les donneacutees brutes) y compris les meacutetadonneacutees associeacutees
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11 Deacutefinitions et typologie
Donneacutees dobservations
denquecircte
Donneacutees de simulation
Donneacutees expeacuterimentales
Donneacutees deacuteriveacutees
Carnets de terrainQuestionnaires enquecirctesPhotographies films fichiers audiohellip
ModegravelesAlgorithmesScriptshellip
EchantillonsPhotos de microscopeSpectroscopiehellip
Fichiers de donneacuteesDocuments texte Feuilles de calculsBases de donneacuteeshellip
Typologie par meacutethode dobtention11 Deacutefinitions et typologie
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Cycle de vie de la donneacutee
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11 Deacutefinitions et typologie
Creacuteation Collecte
Traitement et analyse
Conservation
Accegraves et reacuteutilisation
bull Donneacutees traiteacuteesbull Donneacutees analyseacuteesbull Donneacutees enrichies
bull Donneacutees deacuteposeacuteesbull Donneacutees publieacuteesbull Donneacutees archiveacutees
bull Donneacutees reacuteutiliseacuteesbull Donneacutees partageacuteesbull Ethique et proprieacuteteacute
intellectuelle
bull Donneacutees brutesbull Donneacutees sourcesbull Donneacutees recueillies
Ne relevant pas des donneacutees de la recherche
Selon lOCDE Les documents non acheveacutes
bull les carnets de laboratoirebull les analyses preacuteliminaires les projets de documents scientifiques et
les programmes de travaux futursbull les examens par les pairsbull les communications personnelles avec des collegravegues hellip
Les objets mateacuteriels bull les souches bacteacuteriennesbull les animaux de laboratoirehellip
Les productions scientifiquesbull les publications scientifiques communications agrave congregravesbull les supports de formation hellip
Les donneacutees administratives non inteacutegreacutees dans un corpus de recherche
Image de PixabayOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Deacutefinition des jeux de donneacutees (Dataset)
bull laquo Agreacutegation sous une forme lisible de donneacutees brutes ou deacuteriveacutees preacutesentant une certaine uniteacute rassembleacutees pour former un ensemble coheacuterent raquo (Gaillard 2014)
bull Uniteacute de deacutepocirct dans un entrepocirct sa granulariteacute ne doit ecirctre ni trop petite ni trop grande pour faciliter la citation
bull Compleacuteteacute par des meacutetadonneacutees neacutecessaires agrave leur reacuteutilisation et agrave leur validation meacutethodes drsquoobtention logiciels neacutecessaires auteurs couverture temporelle et spatiale etchellip
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11 Deacutefinitions et typologie
Les enjeux de louverture des donneacutees de la recherche scientifique
Enjeux scientifiques bull Deacutefis scientifiques complexes
bull Accroicirctre limpact de la science
bull Faire eacutevoluer les systegravemes deacutedition
bull Eviter la perte de donneacutees
Enjeux eacuteconomiquesbull Valeur eacuteconomique de la donneacuteebull Conditions de financement des
bailleursbull Continuiteacute de la recherchebull Big Data et data science
Enjeux socieacutetauxbull Seacutecurisation des donneacuteesbull Interopeacuterabiliteacute des donneacuteesbull Participation citoyennebull Transparence du processus
scientifique
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la perte des donneacutees
20 ans apregraves publication 80 des donneacutees scientifiques sont perdueshellip
bull Causes bull Destruction des supports virus
bull Obsolescence mateacuterielle ou logicielle
bull Lieu de stockage indeacutefini
bull Erreur humaine deacutepart de personnelhellip
bull Conseacutequences bull Perte de temps drsquoargent (fonds publicshellip)
bull Pas de veacuterification des reacutesultats possible
bull Pas de comparaison des reacutesultats dans le temps ou lrsquoespace
bull Pas de reacuteutilisations par drsquoautres publics pour drsquoautres fins
VINES Timothy H et al The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age Current Biology 2014
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
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12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
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Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Typologie des donneacutees de la recherche
bull Deacutefinition de la Commission europeacuteenne pour Horizon 2020
1 Les donneacutees sous-jacente (les donneacutees neacutecessaires pour valider les reacutesultats preacutesenteacutes dans les publications scientifiques) incluant les meacutetadonneacutees associeacutees (crsquoest-agrave-dire les meacutetadonneacutees deacutecrivant les donneacutees de recherche deacuteposeacutees)
2Toute autre donneacutee (par exemple les donneacutees conserveacutees qui ne sont pas directement attribuables agrave une publication ou les donneacutees brutes) y compris les meacutetadonneacutees associeacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Donneacutees dobservations
denquecircte
Donneacutees de simulation
Donneacutees expeacuterimentales
Donneacutees deacuteriveacutees
Carnets de terrainQuestionnaires enquecirctesPhotographies films fichiers audiohellip
ModegravelesAlgorithmesScriptshellip
EchantillonsPhotos de microscopeSpectroscopiehellip
Fichiers de donneacuteesDocuments texte Feuilles de calculsBases de donneacuteeshellip
Typologie par meacutethode dobtention11 Deacutefinitions et typologie
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Cycle de vie de la donneacutee
[IST Agropolis 2016]OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Creacuteation Collecte
Traitement et analyse
Conservation
Accegraves et reacuteutilisation
bull Donneacutees traiteacuteesbull Donneacutees analyseacuteesbull Donneacutees enrichies
bull Donneacutees deacuteposeacuteesbull Donneacutees publieacuteesbull Donneacutees archiveacutees
bull Donneacutees reacuteutiliseacuteesbull Donneacutees partageacuteesbull Ethique et proprieacuteteacute
intellectuelle
bull Donneacutees brutesbull Donneacutees sourcesbull Donneacutees recueillies
Ne relevant pas des donneacutees de la recherche
Selon lOCDE Les documents non acheveacutes
bull les carnets de laboratoirebull les analyses preacuteliminaires les projets de documents scientifiques et
les programmes de travaux futursbull les examens par les pairsbull les communications personnelles avec des collegravegues hellip
Les objets mateacuteriels bull les souches bacteacuteriennesbull les animaux de laboratoirehellip
Les productions scientifiquesbull les publications scientifiques communications agrave congregravesbull les supports de formation hellip
Les donneacutees administratives non inteacutegreacutees dans un corpus de recherche
Image de PixabayOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Deacutefinition des jeux de donneacutees (Dataset)
bull laquo Agreacutegation sous une forme lisible de donneacutees brutes ou deacuteriveacutees preacutesentant une certaine uniteacute rassembleacutees pour former un ensemble coheacuterent raquo (Gaillard 2014)
bull Uniteacute de deacutepocirct dans un entrepocirct sa granulariteacute ne doit ecirctre ni trop petite ni trop grande pour faciliter la citation
bull Compleacuteteacute par des meacutetadonneacutees neacutecessaires agrave leur reacuteutilisation et agrave leur validation meacutethodes drsquoobtention logiciels neacutecessaires auteurs couverture temporelle et spatiale etchellip
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11 Deacutefinitions et typologie
Les enjeux de louverture des donneacutees de la recherche scientifique
Enjeux scientifiques bull Deacutefis scientifiques complexes
bull Accroicirctre limpact de la science
bull Faire eacutevoluer les systegravemes deacutedition
bull Eviter la perte de donneacutees
Enjeux eacuteconomiquesbull Valeur eacuteconomique de la donneacuteebull Conditions de financement des
bailleursbull Continuiteacute de la recherchebull Big Data et data science
Enjeux socieacutetauxbull Seacutecurisation des donneacuteesbull Interopeacuterabiliteacute des donneacuteesbull Participation citoyennebull Transparence du processus
scientifique
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la perte des donneacutees
20 ans apregraves publication 80 des donneacutees scientifiques sont perdueshellip
bull Causes bull Destruction des supports virus
bull Obsolescence mateacuterielle ou logicielle
bull Lieu de stockage indeacutefini
bull Erreur humaine deacutepart de personnelhellip
bull Conseacutequences bull Perte de temps drsquoargent (fonds publicshellip)
bull Pas de veacuterification des reacutesultats possible
bull Pas de comparaison des reacutesultats dans le temps ou lrsquoespace
bull Pas de reacuteutilisations par drsquoautres publics pour drsquoautres fins
VINES Timothy H et al The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age Current Biology 2014
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Donneacutees dobservations
denquecircte
Donneacutees de simulation
Donneacutees expeacuterimentales
Donneacutees deacuteriveacutees
Carnets de terrainQuestionnaires enquecirctesPhotographies films fichiers audiohellip
ModegravelesAlgorithmesScriptshellip
EchantillonsPhotos de microscopeSpectroscopiehellip
Fichiers de donneacuteesDocuments texte Feuilles de calculsBases de donneacuteeshellip
Typologie par meacutethode dobtention11 Deacutefinitions et typologie
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Cycle de vie de la donneacutee
[IST Agropolis 2016]OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Creacuteation Collecte
Traitement et analyse
Conservation
Accegraves et reacuteutilisation
bull Donneacutees traiteacuteesbull Donneacutees analyseacuteesbull Donneacutees enrichies
bull Donneacutees deacuteposeacuteesbull Donneacutees publieacuteesbull Donneacutees archiveacutees
bull Donneacutees reacuteutiliseacuteesbull Donneacutees partageacuteesbull Ethique et proprieacuteteacute
intellectuelle
bull Donneacutees brutesbull Donneacutees sourcesbull Donneacutees recueillies
Ne relevant pas des donneacutees de la recherche
Selon lOCDE Les documents non acheveacutes
bull les carnets de laboratoirebull les analyses preacuteliminaires les projets de documents scientifiques et
les programmes de travaux futursbull les examens par les pairsbull les communications personnelles avec des collegravegues hellip
Les objets mateacuteriels bull les souches bacteacuteriennesbull les animaux de laboratoirehellip
Les productions scientifiquesbull les publications scientifiques communications agrave congregravesbull les supports de formation hellip
Les donneacutees administratives non inteacutegreacutees dans un corpus de recherche
Image de PixabayOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Deacutefinition des jeux de donneacutees (Dataset)
bull laquo Agreacutegation sous une forme lisible de donneacutees brutes ou deacuteriveacutees preacutesentant une certaine uniteacute rassembleacutees pour former un ensemble coheacuterent raquo (Gaillard 2014)
bull Uniteacute de deacutepocirct dans un entrepocirct sa granulariteacute ne doit ecirctre ni trop petite ni trop grande pour faciliter la citation
bull Compleacuteteacute par des meacutetadonneacutees neacutecessaires agrave leur reacuteutilisation et agrave leur validation meacutethodes drsquoobtention logiciels neacutecessaires auteurs couverture temporelle et spatiale etchellip
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11 Deacutefinitions et typologie
Les enjeux de louverture des donneacutees de la recherche scientifique
Enjeux scientifiques bull Deacutefis scientifiques complexes
bull Accroicirctre limpact de la science
bull Faire eacutevoluer les systegravemes deacutedition
bull Eviter la perte de donneacutees
Enjeux eacuteconomiquesbull Valeur eacuteconomique de la donneacuteebull Conditions de financement des
bailleursbull Continuiteacute de la recherchebull Big Data et data science
Enjeux socieacutetauxbull Seacutecurisation des donneacuteesbull Interopeacuterabiliteacute des donneacuteesbull Participation citoyennebull Transparence du processus
scientifique
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la perte des donneacutees
20 ans apregraves publication 80 des donneacutees scientifiques sont perdueshellip
bull Causes bull Destruction des supports virus
bull Obsolescence mateacuterielle ou logicielle
bull Lieu de stockage indeacutefini
bull Erreur humaine deacutepart de personnelhellip
bull Conseacutequences bull Perte de temps drsquoargent (fonds publicshellip)
bull Pas de veacuterification des reacutesultats possible
bull Pas de comparaison des reacutesultats dans le temps ou lrsquoespace
bull Pas de reacuteutilisations par drsquoautres publics pour drsquoautres fins
VINES Timothy H et al The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age Current Biology 2014
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
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12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
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(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Cycle de vie de la donneacutee
[IST Agropolis 2016]OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Creacuteation Collecte
Traitement et analyse
Conservation
Accegraves et reacuteutilisation
bull Donneacutees traiteacuteesbull Donneacutees analyseacuteesbull Donneacutees enrichies
bull Donneacutees deacuteposeacuteesbull Donneacutees publieacuteesbull Donneacutees archiveacutees
bull Donneacutees reacuteutiliseacuteesbull Donneacutees partageacuteesbull Ethique et proprieacuteteacute
intellectuelle
bull Donneacutees brutesbull Donneacutees sourcesbull Donneacutees recueillies
Ne relevant pas des donneacutees de la recherche
Selon lOCDE Les documents non acheveacutes
bull les carnets de laboratoirebull les analyses preacuteliminaires les projets de documents scientifiques et
les programmes de travaux futursbull les examens par les pairsbull les communications personnelles avec des collegravegues hellip
Les objets mateacuteriels bull les souches bacteacuteriennesbull les animaux de laboratoirehellip
Les productions scientifiquesbull les publications scientifiques communications agrave congregravesbull les supports de formation hellip
Les donneacutees administratives non inteacutegreacutees dans un corpus de recherche
Image de PixabayOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Deacutefinition des jeux de donneacutees (Dataset)
bull laquo Agreacutegation sous une forme lisible de donneacutees brutes ou deacuteriveacutees preacutesentant une certaine uniteacute rassembleacutees pour former un ensemble coheacuterent raquo (Gaillard 2014)
bull Uniteacute de deacutepocirct dans un entrepocirct sa granulariteacute ne doit ecirctre ni trop petite ni trop grande pour faciliter la citation
bull Compleacuteteacute par des meacutetadonneacutees neacutecessaires agrave leur reacuteutilisation et agrave leur validation meacutethodes drsquoobtention logiciels neacutecessaires auteurs couverture temporelle et spatiale etchellip
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11 Deacutefinitions et typologie
Les enjeux de louverture des donneacutees de la recherche scientifique
Enjeux scientifiques bull Deacutefis scientifiques complexes
bull Accroicirctre limpact de la science
bull Faire eacutevoluer les systegravemes deacutedition
bull Eviter la perte de donneacutees
Enjeux eacuteconomiquesbull Valeur eacuteconomique de la donneacuteebull Conditions de financement des
bailleursbull Continuiteacute de la recherchebull Big Data et data science
Enjeux socieacutetauxbull Seacutecurisation des donneacuteesbull Interopeacuterabiliteacute des donneacuteesbull Participation citoyennebull Transparence du processus
scientifique
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la perte des donneacutees
20 ans apregraves publication 80 des donneacutees scientifiques sont perdueshellip
bull Causes bull Destruction des supports virus
bull Obsolescence mateacuterielle ou logicielle
bull Lieu de stockage indeacutefini
bull Erreur humaine deacutepart de personnelhellip
bull Conseacutequences bull Perte de temps drsquoargent (fonds publicshellip)
bull Pas de veacuterification des reacutesultats possible
bull Pas de comparaison des reacutesultats dans le temps ou lrsquoespace
bull Pas de reacuteutilisations par drsquoautres publics pour drsquoautres fins
VINES Timothy H et al The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age Current Biology 2014
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
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12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
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Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Ne relevant pas des donneacutees de la recherche
Selon lOCDE Les documents non acheveacutes
bull les carnets de laboratoirebull les analyses preacuteliminaires les projets de documents scientifiques et
les programmes de travaux futursbull les examens par les pairsbull les communications personnelles avec des collegravegues hellip
Les objets mateacuteriels bull les souches bacteacuteriennesbull les animaux de laboratoirehellip
Les productions scientifiquesbull les publications scientifiques communications agrave congregravesbull les supports de formation hellip
Les donneacutees administratives non inteacutegreacutees dans un corpus de recherche
Image de PixabayOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
11 Deacutefinitions et typologie
Deacutefinition des jeux de donneacutees (Dataset)
bull laquo Agreacutegation sous une forme lisible de donneacutees brutes ou deacuteriveacutees preacutesentant une certaine uniteacute rassembleacutees pour former un ensemble coheacuterent raquo (Gaillard 2014)
bull Uniteacute de deacutepocirct dans un entrepocirct sa granulariteacute ne doit ecirctre ni trop petite ni trop grande pour faciliter la citation
bull Compleacuteteacute par des meacutetadonneacutees neacutecessaires agrave leur reacuteutilisation et agrave leur validation meacutethodes drsquoobtention logiciels neacutecessaires auteurs couverture temporelle et spatiale etchellip
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11 Deacutefinitions et typologie
Les enjeux de louverture des donneacutees de la recherche scientifique
Enjeux scientifiques bull Deacutefis scientifiques complexes
bull Accroicirctre limpact de la science
bull Faire eacutevoluer les systegravemes deacutedition
bull Eviter la perte de donneacutees
Enjeux eacuteconomiquesbull Valeur eacuteconomique de la donneacuteebull Conditions de financement des
bailleursbull Continuiteacute de la recherchebull Big Data et data science
Enjeux socieacutetauxbull Seacutecurisation des donneacuteesbull Interopeacuterabiliteacute des donneacuteesbull Participation citoyennebull Transparence du processus
scientifique
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la perte des donneacutees
20 ans apregraves publication 80 des donneacutees scientifiques sont perdueshellip
bull Causes bull Destruction des supports virus
bull Obsolescence mateacuterielle ou logicielle
bull Lieu de stockage indeacutefini
bull Erreur humaine deacutepart de personnelhellip
bull Conseacutequences bull Perte de temps drsquoargent (fonds publicshellip)
bull Pas de veacuterification des reacutesultats possible
bull Pas de comparaison des reacutesultats dans le temps ou lrsquoespace
bull Pas de reacuteutilisations par drsquoautres publics pour drsquoautres fins
VINES Timothy H et al The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age Current Biology 2014
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
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12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
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Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Deacutefinition des jeux de donneacutees (Dataset)
bull laquo Agreacutegation sous une forme lisible de donneacutees brutes ou deacuteriveacutees preacutesentant une certaine uniteacute rassembleacutees pour former un ensemble coheacuterent raquo (Gaillard 2014)
bull Uniteacute de deacutepocirct dans un entrepocirct sa granulariteacute ne doit ecirctre ni trop petite ni trop grande pour faciliter la citation
bull Compleacuteteacute par des meacutetadonneacutees neacutecessaires agrave leur reacuteutilisation et agrave leur validation meacutethodes drsquoobtention logiciels neacutecessaires auteurs couverture temporelle et spatiale etchellip
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11 Deacutefinitions et typologie
Les enjeux de louverture des donneacutees de la recherche scientifique
Enjeux scientifiques bull Deacutefis scientifiques complexes
bull Accroicirctre limpact de la science
bull Faire eacutevoluer les systegravemes deacutedition
bull Eviter la perte de donneacutees
Enjeux eacuteconomiquesbull Valeur eacuteconomique de la donneacuteebull Conditions de financement des
bailleursbull Continuiteacute de la recherchebull Big Data et data science
Enjeux socieacutetauxbull Seacutecurisation des donneacuteesbull Interopeacuterabiliteacute des donneacuteesbull Participation citoyennebull Transparence du processus
scientifique
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la perte des donneacutees
20 ans apregraves publication 80 des donneacutees scientifiques sont perdueshellip
bull Causes bull Destruction des supports virus
bull Obsolescence mateacuterielle ou logicielle
bull Lieu de stockage indeacutefini
bull Erreur humaine deacutepart de personnelhellip
bull Conseacutequences bull Perte de temps drsquoargent (fonds publicshellip)
bull Pas de veacuterification des reacutesultats possible
bull Pas de comparaison des reacutesultats dans le temps ou lrsquoespace
bull Pas de reacuteutilisations par drsquoautres publics pour drsquoautres fins
VINES Timothy H et al The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age Current Biology 2014
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
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12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
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bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Les enjeux de louverture des donneacutees de la recherche scientifique
Enjeux scientifiques bull Deacutefis scientifiques complexes
bull Accroicirctre limpact de la science
bull Faire eacutevoluer les systegravemes deacutedition
bull Eviter la perte de donneacutees
Enjeux eacuteconomiquesbull Valeur eacuteconomique de la donneacuteebull Conditions de financement des
bailleursbull Continuiteacute de la recherchebull Big Data et data science
Enjeux socieacutetauxbull Seacutecurisation des donneacuteesbull Interopeacuterabiliteacute des donneacuteesbull Participation citoyennebull Transparence du processus
scientifique
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la perte des donneacutees
20 ans apregraves publication 80 des donneacutees scientifiques sont perdueshellip
bull Causes bull Destruction des supports virus
bull Obsolescence mateacuterielle ou logicielle
bull Lieu de stockage indeacutefini
bull Erreur humaine deacutepart de personnelhellip
bull Conseacutequences bull Perte de temps drsquoargent (fonds publicshellip)
bull Pas de veacuterification des reacutesultats possible
bull Pas de comparaison des reacutesultats dans le temps ou lrsquoespace
bull Pas de reacuteutilisations par drsquoautres publics pour drsquoautres fins
VINES Timothy H et al The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age Current Biology 2014
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
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12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
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Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
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bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Contexte scientifique la perte des donneacutees
20 ans apregraves publication 80 des donneacutees scientifiques sont perdueshellip
bull Causes bull Destruction des supports virus
bull Obsolescence mateacuterielle ou logicielle
bull Lieu de stockage indeacutefini
bull Erreur humaine deacutepart de personnelhellip
bull Conseacutequences bull Perte de temps drsquoargent (fonds publicshellip)
bull Pas de veacuterification des reacutesultats possible
bull Pas de comparaison des reacutesultats dans le temps ou lrsquoespace
bull Pas de reacuteutilisations par drsquoautres publics pour drsquoautres fins
VINES Timothy H et al The Availability of Research Data Declines Rapidly with Article Age Current Biology 2014
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12 Enjeux et politiques
Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Contexte scientifique la reproductibiliteacute de la science
ldquoMore than 70 of researchershave tried and failed to reproduceanother scientists experimentsand more than half have failed toreproduce their ownexperimentsrdquo ()
Nature mai 2016 httpswwwnaturecomnews1-500-scientists-lift-the-lid-on-reproducibility-119970
Les effets neacutegatifs du laquo Publish or Perish raquohellip
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12 Enjeux et politiques
Contexte international la Science Ouverte
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Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Contexte international la Science Ouverte
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Loi Cada (1978)Directive PSI
(2003)
Directive Inspire (2007)
Charte du G8 (2013)
Loi Valter(2015)
Initiative de Budapest (2002)
Initiative de Berlin(2003)
Directive Inspire (2003)
Deacuteclaration de lOCDE
(2006)
Plan S (2018)
Horizon 2020
(2013-2016)
Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique
(2016)
Plan National pour la Science Ouverte (2018)
ANR politique Science Ouverte
(2019)
Open Data
Open Access
Open Science
12 Enjeux et politiques
Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Focus Plan National pour la Science Ouverte
Juillet 2018
bull Axe 1 Geacuteneacuteraliser lrsquoaccegraves ouvert aux publications
bull Axe 2 Structurer et ouvrir les donneacutees de la recherche
bull Axe 3 srsquoinscrire dans une dynamique durable europeacuteenne et internationale
laquoLa France sengage pour que les reacutesultats de la recherche scientifique soient ouverts agrave tous chercheurs entreprises et citoyens sans entrave sans deacutelai sans payementraquo (httpswwwouvrirlasciencefr)
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12 Enjeux et politiques
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
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ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Focus Politique science ouverte de lrsquoANR
bull Favoriser le libre accegraves aux publications (Open Access)
bull Contribuer agrave lrsquoouverture des donneacutees quand cela est possible (Open ResearchData)
bull Coordonner les actions aux niveaux europeacuteen et international
httpsanrfrfrlanr-et-la-rechercheengagements-et-valeursla-science-ouverteOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
12 Enjeux et politiques
Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Le cadre juridique franccedilais
bull Drsquoune maniegravere geacuteneacuterale les donneacutees sont reacuteputeacutees laquo de libre parcours raquo elles ne sont pas proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur
bull Les donneacutees issues de la recherche sont consideacutereacutees comme des documents administratifs si elles ont eacuteteacute produites dans le cadre dune mission de service public ou majoritairement gracircce agrave des fonds publics
bull Elles sont donc communicables agrave la demande (sauf exceptions leacutegales) si elles sont acheveacutees
bull Depuis la Loi pour une Reacutepublique Numeacuterique (2016) elles sont mecircme soumises agrave un principe drsquoouverture par deacutefaut
bull Ces donneacutees publiques doivent ecirctre diffuseacutees gratuitement et librement reacuteutilisables
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13 Cadre juridique
Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Les exceptions publication sous conditions
bull Les donneacutees personnelles (RGPD) en particulier les donneacutees sensibles (CNIL)
bull Les donneacutees proteacutegeacutees par le droit drsquoauteur (œuvres originales)
bull Les donneacutees qui impliquent un partenaire eacutetranger ou priveacute (Droit sui generis des bases de
donneacutees)
bull Les donneacutees concernant les ressources geacuteneacutetiques et laquo connaissances traditionnelles raquo
associeacutees Protocole de Nagoya
bull Les informations pouvant avoir un impact sur la conservation de la biodiversiteacute Code de
lrsquoEnvironnement
bull Les donneacutees preacutesentant des risques pour la protection du potentiel scientifique et technique
de la nation produites dans des laboratoires classeacutes laquo zones agrave reacutegime restrictif raquo (ZRR)
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13 Cadre juridique
Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Les exceptions Publication interdite
bull Donneacutees relatives agrave la seacutecuriteacute publique sureteacute de lrsquoEtat et seacutecuriteacute des lrsquoeacutetablissements biens personnes informatique hellip
bull Secret professionnel secret des proceacutedeacutes secret meacutedical secret de lrsquoinstruction secret bancaire hellip
bull Secret deacutefenseOALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
13 Cadre juridique
Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Les licences preacutecisent les droits de diffusion
Deacutecret ndeg 2017-638 du 27 avril 2017 relatif aux licences de reacuteutilisation agrave titre gratuit des informations publiques et aux modaliteacutes de leur homologation
bull lrsquoODbL (Open Database License version 10) pour controcircler les redistributions et les travaux deacuteriveacutes ou pour une diffusion internationale (~CC-BY-SA)
bull la Licence Ouverte Etalab si le suivi du devenir des donneacutees nrsquoest pas rechercheacute et si les donneacutees sont essentiellement distribueacutees en France (~CC-BY)
Les licences Creative Commons alternative internationale possiblebull Pour choisir httpscreativecommonsorgchooselang=frbull Pour comprendre httpscreativecommonsorglicenseslang=fr-FR
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13 Cadre juridique
Des Questions
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Des Questions
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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1 Contours et contexte
1 Deacutefinition et typologie
2 Enjeux et politiques
3 Cadre juridique
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2 En pratique1 Rechercher et utiliser des donneacutees
2 Geacuterer des donneacutees
3 Publier des donneacutees
Introduction aux donneacutees de la recherche Plan
Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Rechercher des donneacutees les entrepocircts de donneacutees
bull Un entrepocirct est un service en ligne permettant le deacutepocirct la description la conservation la recherche et la diffusiondes jeux de donneacutees
bull Les entrepocircts peuvent ecirctre geacuteneacuteralistes ou theacutematiques publics ou proprieacutetaires gratuits ou payants reacuteserveacutes agrave un organisme ou ouvert agrave tous
bull Leurs interfaces de recherche peuvent ecirctre plus ou moins avanceacutees moteurs de recherche interne vocabulaires filtres facettes hellip
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
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bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Rechercher des donneacutees les reacutepertoires et annuaires
Les annuaires et reacutepertoires classent les entrepocircts par critegraveres geacuteographiques theacutematiques hellip
Annuaires multidisciplinairesbull Re3databull OAD (Open Access Directory)Annuaires speacutecialiseacutes
bull FAIRsharing (sciences de la vie et biomeacutedecine)bull NIH Data Sharing Repositories (Biomeacutedecine)bull CAT Opidor (Entrepocircts de donneacutees franccedilais)Annuaires mixtesbull OpenDOARbull ROARAnnuaires d rsquoentrepocircts certifieacutesbull CoreTrustSeal
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21 Rechercher et utiliser
Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Rechercher des donneacutees les moteurs de recherche
bull Recherche feacutedeacutereacutee sur plusieurs entrepocircts
bull Donneacutees de tous types et de tous les domaines
bull Filtres puissants
Moteurs de recherche de donneacutees
bull Datacite (DOI)
bull DataSearch (Elsevier v Beta)
bull Google Dataset Search (v Beta)bull BASE (ressources laquo acadeacutemiques raquo)
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21 Rechercher et utiliser
Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Droits drsquoutilisation
bull Si une licence est associeacutee au jeu de donneacutees cela clarifie les droits drsquoutilisation mecircme si ccedila peut les restreindre
bull En lrsquoabsence de licence un jeu de donneacutees peut ecirctre proteacutegeacute par le code de la proprieacuteteacute intellectuelle (œuvres originales bases de donneacutees priveacutees ayant neacutecessiteacute des investissements substantiels) mieux vaut alors demander lrsquoautorisation du titulaire du droithellip
bull Dans tous les cas sauf dans le cadre de la licence CCO lrsquoutilisateur de donneacutees est obligeacute de citer sa source car le droit de paterniteacute en tant que droit moral est inalieacutenable
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21 Rechercher et utiliser
Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Citer un jeu de donneacutees
Le format minimal drsquoune reacutefeacuterence bibliographique drsquoun jeu de donneacutees comporte 5 eacuteleacutements selon la recommandation de DataCite
Auteur (Anneacutee de publication) Titre Editeur (=organisme responsable) Identifiant
Ce format minimal peut ecirctre compleacuteteacute par la version et le type de ressource Auteur (Anneacutee de publication) Titre Version Editeur Type de ressource Identifiant
Lrsquooutil en ligne DOI Citation Formatter deacuteveloppeacute par DataCiteet CrossRef geacutenegravere agrave partir du DOI la reacutefeacuterence bibliographique du jeu de donneacutees dans plus de 500 formats au choix
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21 Rechercher et utiliser
Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Changer les pratiques de gestion des donneacutees
Conception projet
Conception meacutethode(s)
Deacutemarrage projet
Analyse donneacutees
Fin du projet
PUBLICATION
Description Deacutepocirct
Stockage
DeacutecouvertePartageNouvelles recherches publications citations
PGD
ENTREPOT
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22 Geacuterer des donneacutees
Acquisition donneacutees
Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Un PGDDMP Qursquoest-ce que crsquoest
Deacutefinition
Un document formaliseacute (type formulaire)
Liste toutes les questions agrave se poser
A toutes les eacutetapes du cycle de vie des donneacutees
A commencer le plus tocirct possible (au deacutemarrage dun projet)
Objectifs
Aide agrave la mise en place de bonnes pratiques de gestion des donneacutees
Pour des donneacutees plus fiables compreacutehensibles disponibles tout au long du projet
Preacuteserveacutees si elles le meacuteritent pour une reacuteutilisation future
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22 Geacuterer des donneacutees
Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
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22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Les PGD ont toujours les mecircmes rubriques
1 Description du projet de recherche but partenaires responsabiliteacutes leadershiphellip
2 Inventaire et Description des donneacutees type taille meacutethode de collecte et traitementhellip
3 Documentation meacutetadonneacutees documents compleacutementaires logiciel neacutecessairehellip
4 Sauvegarde et seacutecuriteacute mateacuteriel et meacutethode peacuteriodiciteacute et nombre de copies versioning nommagehellip
5 Droit et eacutethique selon le type de donneacutees (personnelles santeacute vivant) les loishellip
6 Conservation quelles donneacutees agrave long terme combien de temps agrave quel endroit
7 Partage (pendant et apregraves le projet) accegraves licences embargo confidentialiteacutehellip
8 Ressources mateacuterielles financiegraveres humaines hellip
Fiche syntheacutetique Doranum
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22 Geacuterer des donneacutees
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
LE PGD est eacutevolutif
Un PGD nrsquoest pas figeacute
bull il doit ecirctre mis agrave jour tout au long du projet
bull Il doit comporter des versions successives
bull Exemple H2020 3 versions minimum (pas de maximum)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Le PGD est un travail de groupe
Participent agrave la gestion des donneacutees et donc agrave la reacutedaction du PGD bull Scientifiques description validationbull Ingeacutenieurs-donneacutees sauvegarde qualiteacutebull Informaticiens seacutecurisation infrastructurebull Speacutecialistes IST modegraveles de PGD standards
de meacutetadonneacutees bull Archivistes donneacutees agrave conserver dureacutees et
solutions techniquesbull Juristes proprieacuteteacute intellectuelle leacutegislation
donneacutees personnelles sensibleshellipbull Chargeacutes de valorisation reacutedaction des
conventions agrave signer Reymonet N Moysan M Cartier A amp Deacuteleacutemontez R (2018) Reacutealiser un plan de gestion de donneacutees laquo FAIR raquo
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22 Geacuterer des donneacutees
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
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proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
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ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Diffusion des donneacutees dans le respect des principes FAIR
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
bull Licence drsquoutilisation approprieacutee
bull Formats ouverts
bull Vocabulaire partageacute
bull Standards de meacutetadonneacutees communs
bull Accegraves peacuterenne aux donneacutees
bull Accord des producteurs
bull Identifiant
peacuterenne
bull Meacutetadonneacutees
Facile agrave trouver
Accessible
ReacuteutilisableInter-opeacuterable
Aussi ouvert que possible aussi fermeacute que neacutecessaire
23 Publier des donneacutees
Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Entrepocircts de donneacutees critegraveres de choix
Caracteacuteristiques Fonctionnaliteacutes Limites
Peacuterenniteacute de lrsquoentrepocirctPreacuteservation et archivage des donneacutees garanti
Discipline(s)
Faciliteacute de deacutepocirct Identifiant peacuterenne (DOI) Coucircts
Faciliteacute de recherche deacutecouverte des donneacutees
Controcircle drsquoaccegraves aux donneacutees Types de donneacutees
Localisation du serveur Gestion des droits Formats accepteacutes
Description des donneacutees _meacutetadonneacutees_ (adaptationdisciplinaire utilisation de standards controcircleshellip)
Statistiques drsquousage (consultation teacuteleacutechargement traccedilabiliteacute provenancehellip)
Volumes maximaux (fichier jeu de donneacutees)
Production de citation Versionning Licences proposeacutees
Organisation (arborescencehellip)Interopeacuterabiliteacute moissonnage
Deacuteposants autoriseacutes (pays organismehellip)
Preacutepublication (lien priveacute pour reviewershellip)
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23 Publier des donneacutees
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
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Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Principe du Data paperData paper
Deacutecrire un jeu de donneacutees
en vue de sa reacuteutilisation
Jeu de donneacutees
Informer la communauteacute
scientifiqueMettre agrave dispositiondrsquoune
communauteacute scientifique
Entrepocirct de donneacutees
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23 Publier des donneacutees
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Contenu et Objectif du Data Paper
Un article scientifiquehellip pas comme les autres
bull Deacutecrit un jeu de donneacutees pour permettre leur reacuteutilisation et leur identification
bull Deacutetaille les meacutethodes drsquoobtention pour permettre de reproduire lrsquoeacutetude
pour montrer rigueur scientifiquequaliteacute donneacutees
bull Montre le potentiel de reacuteutilisation des donneacutees
originaliteacute des donneacutees
pour qui et pour quoi elles peuvent ecirctre utiles
bull Donne accegraves aux donneacutees
Ni reacutesultats ni analyses ni discussion
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Rubriques types
23 Publier des donneacutees
Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Partage de donneacutees entre injonctions hellip
Incitation ou obligation de partage de PGDhellip des bailleurs des politiques des eacutediteurs des eacutetablissementshellip
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Conclusion
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
hellip et beacuteneacutefices
Augmenter sa visibiliteacute et ses citationsLe partage des donneacutees augmente
lrsquoattractiviteacute de lrsquoarticle
Eacutetendre son reacuteseaunouvelles opportuniteacutes pour
eacutechangercollaborer
Ameacuteliorer sa reacuteputationet attirer sur son profil chercheur
Renforcer ses possibiliteacutes de recevoir des financements
(compatibiliteacute avec les exigences des financeurs)
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Conclusion
Lever les freins agrave louverture des donneacutees
ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
proprieacuteteacute intellectuelle hellip
ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
les sites de reacutefeacuterence les services drsquoappui travailler en eacutequipehellip
ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
ndash Crsquoest risqueacute hellipndash Des sites vous aident agrave repeacuterer les exceptions agrave la regravegle geacuteneacuterale
douverture des donneacuteeshellip et les services drsquoappui peuvent ecirctre contacteacutes au moindre doute
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
OALR Deacutecembre 2019 Filatre A - Hensens H
Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
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bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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ndash Cest agrave moi ndash Les donneacutees de la recherche ne relegravevent pas du champs de la
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ndash Crsquoest compliqueacute hellipndash Utiliser les standards de votre discipline un modegravele de PGDDMP
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ndash Crsquoest cher hellipndash Les frais (de stockage dorganisation de deacutepocirct dans un entrepocirct -
la plupart sont gratuits - ) sont eacuteligibles dans les appels agrave projets
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Conclusion
Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
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bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
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bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
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bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
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bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Sourcesbull Ateliers du Colloque Science Ouverte au Sud Dakar (Seacuteneacutegal) 23-25112019
httpsopensciencesudsciencesconforgresourcepageid6
bull Ciolek-Figiel A et Cosserat F 2016 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche Vandoeuvre-legraves-Nancy Inist ndash CNRS Disponible agrave httpsdrivegooglecomfiled0BxKZLWq08xX-TW5VOEUtd2FSRE0view
bull CoSO httpswwwouvrirlasciencefrcollege-donnees-de-la-recherche Livrables amp productions (en particulier cadre juridique ndash2017)
bull CoopIST CIRAD httpscoop-istciradfrgerer-des-donnees
bull Datapartage INRA httpwww6inrafrdatapartage
bull Fabre C 2019 Gestion et diffusion des donneacutees de la recherche ndash Urfist Toulouse ndash 17 amp 18 juin 2019 82 p
bull Fiches pratiques CIST Agropolis httpwwwistagropolisfrles-ressourcesfiches-pratiques
bull IRD Data httpsdatairdfr
bull Lafosse 2018 Initiation aux donneacutees de la recherche ndash URFIST Paris ndash 27 amp 28 mars 2019
bull Maurel L 2018 La reacuteutilisation des donneacutees de la recherche apregraves la loi pour une Reacutepublique numeacuterique La diffusion numeacuterique des donneacutees en SHS - Guide de bonnes pratiques eacutethiques et juridiques Presses Universitaires de Provence 9791032001790 ⟨hal-01908766⟩
bull Seacuteminaire de lancement de DataSuds Montpellier (en particulier intervention de Lionel Maurel sur la cadre juridique des donneacutees de la recherche) httpsdatairdfrseminaire-de-lancement-de-lentrepot-datasuds
bull Serres httpsguides-formadoctubretagneloirefrdonnees_recherche
bull Slide Share IST IRD httpsfrslidesharenetIST_IRDpresentations
bull Sites drsquoaide agrave la deacutecision pour le partage des donneacutees questionnaire INRA logigramme de lrsquoENPC
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Des Questions
Merci agrave toutes et agrave tous
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Questions reacuteponses (1)bull Pourquoi les cahiers de laboratoire ne sont-ils pas consideacutereacutes comme des donneacutees Essentiellement parce qursquoils sont consideacutereacutes comme des documents laquo non acheveacutes raquo cf Diapo 8
bull Comment partager les donneacutees conformeacutement au cadre leacutegal et quels sont les points drsquoattention particuliers Vous avez une premiegravere reacuteponse agrave ces questions sur les diapos 16 agrave 18 Pour aller plus loin explorez nos sources Diapo 39
bull Que signifie versioning Le laquo versioning raquo (pardon pour le franglais) est la gestion manuelle semi-automatiseacutee ou automatiseacutee des versions successives drsquoun fichier quand creacutee-t-on une nouvelle version (majeuremineure) comment elles sont nommeacutees combien on en conserve combien de tempshellip
bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
Mandateacute par le Ministegravere de lEnseignement Supeacuterieur et de la Recherche le CINES propose des solutions darchivage numeacuterique Pour en savoir plus httpswwwcinesfrarchivage
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bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
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bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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bull Dans le cas des donneacutees qui ne peuvent ecirctre rendues publiques quel sont les moyens de les conserver de maniegravere durable et pas dans un coin du disque dur
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Questions reacuteponses (2)bull Comment formaliser un PGD pour un projet europeacuteen Il existe plusieurs modegraveles de PGDDMP pour les projets H2020 ECShellip (en franccedilais en anglais FAIR ou pashellip)Vous les trouverez entre autres sur les sites drsquoaide agrave la gestion de PGD comme DMP Opidor (onglet Modegraveles de DMPPublic Templates)
bull Les PGD sont ils publics (accessibles par tous) Les PGD sont publics si leurs reacutedacteurs les rendent publics sur le site ougrave ils ont eacuteteacute reacutedigeacutes comme DMP Opidorou DMP Tool (onglet Public Plans) ou les publient dans un journal comme RIO (Research Ideas and Outcomes) qui a une section DMP
bull Ougrave peut-on conserver les PGD Les outils en ligne drsquoaide agrave la reacutedaction (et notamment DMP Opidor) ne conservent que 5 ans apregraves la derniegravere modification les PGD non publics Pour conserver un PGD plus longtemps vous pouvez le publier (cf ci-dessus) ou le joindre aux jeux de donneacutees que vous deacuteposez dans un entrepocirct comme un fichier de meacutetadonneacutees suppleacutementaire
bull Le PGD est-t-il inclus dans la norme ISO9001 PGD et Deacutemarche qualiteacute se complegravetent reacutediger un Plan de Gestion de Donneacutees est un gage de qualiteacute de la recherche et les deacutemarchescertifications qualiteacute sont agrave signaler dans le Plan de Gestion de Donneacutees
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bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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Questions reacuteponses (3)bull Y a -t-il des formations speacutecifiques pour mettre en place des PGD (profil IST) Il existe de nombreuses formations pour reacutediger ou aider agrave la reacutedaction de Plans de Gestion de Donneacutees LrsquoURFIST par exemple en organise reacuteguliegraverement
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bull Est-ce quon peut encrypter les donneacutees sensibles pour les proteacuteger Les donneacutees personnelles en geacuteneacuteral et les donneacutees sensibles en particulier doivent leacutegalement ecirctre anonymiseacutees soigneusement avant toute publication pour eacuteviter que les personnes puissent ecirctre reconnues Avant anonymisation des mesures (agrave deacutetailler dans la partie juridique et eacutethique des PGD) doivent ecirctre mises en place durant le projet pour les proteacuteger lrsquoencryptage (en particulier lors des transferts) peut en faire partie
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bull Ougrave deacuteposer un data paper Le data paper est un article soumis pour publication dans une revue qui publie uniquement des data papers appeleacutee data journal ou dans une revue qui a une section Data Papers (cf la liste mise agrave jour sur le site du CiradCoopIST) httpscoop-istciradfractualitesrediger-et-publier-un-data-paper2)Le processus de reviewing par les pairs est identique agrave celui drsquoun article scientifique laquo classique raquo
bull Les publications dans les data papers comptent-elles pour la qualification CNU Le CNU est le Conseil National des Universiteacute qui donne la qualification neacutecessaire pour preacutetendre agrave un poste de Maitre de confeacuterence La liste des critegraveres neacutecessaires deacutepend des domaines Il faut donc vous rapprocher de votre section pour savoir si les data papers font partie des types de publication pris en compte
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