Transcript
Page 1: Comparative Analysis of the Global Transcriptional Profile of Human Skin-Homing Memory T Lymphocytes vs. Non-Skin Homing Memory and Naive T Lymphocytes

���������� � �� ���� � ���� �� �������� ������������������� ���� ��� ���� �� � ������ ��� ����� ���������������� �������� ��� �������� ���� � ������ ������� ������� ������������� ������������� �������� � ��� ����� ���� ��������� ��� �!� � ��� ����������� ����� �� !�"#$� �� ������%�� � ������ ��� ��& ����� ������ � ��� ��� �� ����� ���� ��� � �� �� ���%� ����� ��� ���� ���� ���� ������������ ��� �����&�� ����'������ ���� ����� ���� ��������% ��� ��������%� (� ��� ���� ����� �� �"# ��� � ���� ��������� ��� �� ��� �� �� �� ��� � ���% � � ���� � �� � )*++ �� ��� �&�� �� �������� ,-�,.�,� ������� &�� � ��� �� �� � � �� � ��%� /� ���� ����%� � � ���� ����� � �� ��������� ���"�#� � � �� � �� �� 012 ��������� � � �����%� �� ,3 ����� �� ���� �"#� (� �������� � � ���� ����� % ������ � �� � � ������ � � ����� �� ���� � 4� � � �� �� �"�# � � ��� � � � �����' � �% �2 ���� ���� 560 �� � ����� � ������ � �% ��� ��� � ���� � 4� � ��� 0 ����� �� ,7 ������ �"�# ��� � � � � ��� ��� � �� �� ,3 �������� �����"#� (� � � �� � ����� ������ � �� ��� � ���� �� ������������� � ������ �� ���� �� ����� �� �� ���� ��� ���������� �� ��� � � ����� � ������ �� ��� �� ���� �� �� �"�# �� ��� 0����� ���� ���� ���� ��������� ,,8,"� � ��� � ��� � �� ���% �� ��� ��� ��� � ����� ��� 6�� �� �� ��������� � � �� � �� �� *+ ��� ��� �� ����� � � ������ ����&������� #���������� �� ���� ���% ����� � � �����% � �� �� �� '& ������� � ������ � �� ���' � � � ���%��� ���� ��� ������ �� ���� �� ��������� � ���& ��� ����� ���� ��� 2��� ��& �%� �� ���' ����� �� ����������� �� �"�# � ���&�� � �� ����� �� ����� �� ������ ������� �� �"#� ��� ������� & ���� �� �� 5609��� � ���� � � � ���� �� ������ � ���� � ������% �� ���� ��� �� � �� � �� ���������� ����� �� �� ��� � �� �� ���� �� ����� ���������

�������� ���� � ��� ��� ���� ����� �� � ���� � !� "���#�������$��� "%���� &' " ����(��� 5����� ��� �� �������:��� ���� ��� � ���� ;�1� <�� %�� =� =���� �� ��� ��>� 1�� �������������� �������� � $������ %������� ���&'���� �������� �(�)"*�� ++�� ������� ���,��� ��������� ������� ������� (��������� %������ ��������� ��� ,���0� �� &�����% � �������� �� ���� ���� � ���� � 60 �����9���� �� !?��(@���� A$ �� � �� � �� ��� � ������ �� 9� �� � � 60 !�� 9�60$ ��� �� � ���� � ����9 � �� �� %��� '������ ������ ����� ���� ��� � ������ � !2�($� (��� ���� � �������� � �� � ��������% �� ?��(@���� A �� � ���� �� ��� � ��� � ������ ��% ��� � ������ �������� � ���� �� 9�60 � & �� > ��� ��� ����%��� ������� !#1$ �� � ��� � �%�� � �� � �� �� ����������� � �� ���� � ���4� �� ���� � �� ���%� /� �01#1 � � ���& �������� 8++.� �(2�� �� � �� ��� *3 �� �� 2B�,C0, � ��� � � � � �� �� ��� � ��� � � ����� �� 9�� ��� ��� ��� �� � !�(�D�$ ���� ��� �����9���� �� �' � � % � � � � � � ���� � �9��� ������� � ���� ��� �� (� � �� �� ��� ��& ����������� �� � ������ � � � 2B�,C0, ����9 � ��� � �������� #��� *,� /����� *, ��� #��� *3 ������ � �% ��0� ����� 9� 4� � ���� .� �� �� #��� *3� ��� �����9���� �� �� ��� ��� � �9������ � � 3E.( ��� ��� � �01#1 �� ��� ��� � ���� �� ��� ����� � � ���� ������� �� ��� ���� 2B�,C0, �60 ������������ ��� ���� ��� � !2B� ,C0, ����9 � $ ��� �(�- �������� �� �����9���� �� ������������ � �% �� 560 � 4� � ������� #���� *3 �� *- �� 2B�,C0,� (� ����%� �� � ��� %��� �' � � % �� ��9 ��� �����9���� ��� (9�2 � � ����� � � � ����� � ���� � ���� � ������#��� *, �� �� ������� ���� � ��� � ��0�9� & �� ���� � ��� �� � � ���� �� ��9���� ��� �� ��#��� *.9� & �� ���� � ��� � � ���� �� �����9���� ��� ? 4� � ����%��� �� �� (9�2 !#���*,9#��� *.$ ����� � � �������� � �� � ���� �����9���� �� � �� � 2B� ,C0, ��� � ����(�-� (� � � ����� ������% �� �� �� � ��������% �� ?��(@���� A �� ��� � �� � �� � � �� ��� � ��� #1�

��)����� ��� � � ������� *�������+ � � ���� � ,� �� �������� ��� ����-��.��# ��F�� �� 2��� ����� 0 � 1����� 5 1������� 2 1� ������ G 1��� � ��� ���� ?�� ��(�������� ������ ������ � ,��-����� ������ ������ ����&������� ������ �� ������ ����-���������� )������ .������0����������% ������ �� � ���� �� . ���� � ���� �� ��� � ������ ��� ���� ��� ����� � ����������� � ������ &������ !�G$� (�� �%���� ��� �� ��� ���% ��&�� � �� ������ �� ��� ��%����� ���� � ������H �$ ���������� �� ��� ���� ������ �� �� ������� � �� ��$ ��� �� � � ��� �������� ��� ���9����� �������% ���� ����� ������ & ��� ��� � � �� ���� � �� ��&��& ����������� (� ��& ����� �� � ��� �%���� ��� � �������� � � ������ %� ����� � �������������� ��� �9��� !��9I9$ ���%�� ��� ����� � �� �� � ������& � �� �� �G /� ���� ���� �������� ��JIJ � ������ %� �� 1��� �� ����%� � ������% � � ������ 9� ���� � ��� ���� �������� �G /� �� �� �� �� ����� � ; ����� � ��� ���� ��� ���� �� ��� ����� �� ��������� �� �G� ����� � � ��� & � ���% ��� �& � �� ��JIJ � ������ %� �� >� � ����9� ��� ���������� ���� ������� � ���� ��9I9 ���� � ������& � �� �� �G /� ��� � ���� �� /�& ������� �� ��� ������������������ �� ���������� �� ��JIJ ���� � ����� ���� �G /� ������ ������� � �� �� ����������� ���������� �� �� � ����� � ��� � � ��� �� ��%9���� � & � �� �� %������� ��� � ����� � ������� � ��������9���� � �� � �� ������� (� ������ � �� � �� ����' ��� �� ���� ��������� ���� ���� �� �� � � �� �� �G �������% ��� ����� � ������ � � �% � � �� � ����� ��������������� ��&����� �� � � ���� � � ��� � ������ �� � ������ � �������� ������� (2� ��������� �� B�� � ����� � �������� ���� �� �� ������� �� ��� ���' � �� �� ���� ���� �� ��� ���� ��� ����� �� �G �������� � ��� ���&�� &�� � ��� � ��� ���� � ������ ��&��&�� ������������ �� ����� � ��� �� �G� (� � '����� � �� � �� �� '��� ����� �� ��� �� � & ���� �� ��� ��� � � �� �� �� ���������� ��� ��&��& � ������� � �� ��������� �� ���� ��������� ���� �� �� �� � ����� ��� �� �� �� � ���

��/������������� �� 0�� , ��� ���� ���� ,�� "���� �� ���� ��� , �! ��� �� 1���� � ���� � � �� �� �������(� =���%��� � ��&��� K ����� ��� �#1 K�������������� �������� � %��� .�� %����� ������� ������� ������� �( ��� �5 ����� �� ��1�� � �����% ��� ==�/ � 6<� � �� �� 2 �� �� 6 � <���� 6<�0 � ������ � � ��������� �� ��� ��� ��� �� � �� �� � & ����� � ���� %� ��� � �� ����� � � �������� �� � ���� %� � & ���� �� ���� �� � ���� � ��� (���� �� �� ��� ���� �� � ��� �� �=�= �� ��� �0?=9, ���� �� �������� ���������� /���0 ������ � � � � ��� ����� � .�3 �� ���� �� �� ��� ����� �� � ������% � 4� � ���� � �� � ��0� ����� 9�� �& ����� �� �� ����� ����1 � � 0 ���� �� ���������� ����� � ���� � ����� ��� ������ ���%� ����� � ���9��� �� �� �� ���������� �, ��� �%� (� �, ��� �% ��������� � �� ����� � ���� ���������� �% *+L �� 4� � % �� �3 ��� �% ���� ���� � �� �� ���%� � 0���%��� ���� % �� ����� �� ���%�� �� #,,�* � & �� � �� �� � � �� � � & ����� � �� ��� � ���� �������% �� =�� & �� �� ���� ��� ��� ������� ������� ���% �� �� �� ����� �� �� � ����� ��� �� � ���� ���� !�#$ ��� �������� � �% � ���9��� �� � ��% �� � �� � �#9��� ��% �� ���� �� ��� ���� �� �� ��� �� 0� #,8�*� �� � ���� ���� �� ����� �� ��� �� �#9��� ��% � �� ��� ��� ������ �� � ��� ������ � ���� ��������� ���� ��� �� � ����� � �� �����& �� � ������ (� � ������� ��� ���� �� ���%� � �� �� ���22����1 ����� �� ��� � �������� ���� ��� ����� �� ����1�� ��� �� �� �� ������ ��� �� �� � & ���� �� �� ���� � �������� �� ���� ���9� ���� � ��9� ��& � ��� �� �� �# ��� � ���� � ��9� ��& � � ���� %� �� (� � ��� ������� � ���� �� �� ������ �� ���� � % � & ���� �� ��� �� � ���������% ��� ��� � ������ ��� ���� �� ���%� �� �� ��& �%�

��2���� �� 3����� ������� ��4��� , ���� ���� )5 � !6 � ������#3��� �7 �����(� �� ��8� "���������;5 ?�������� (� 1��� � � ����� ��� 1; ��� � �������� ���� ���� ��� �������� � ,) ����������� ������� ������� ������� )3�/� ��:��� � ���� ������� �� ��� � �� � ����� � ����� � � ������ %� � ���� � � ���� ���� ������ ������ !#2�$ ��� �� � ��&�� � �� ��� �� ����� ��� � �� � ��� ���������� ��� ���� � ������ ������I���� � �������� ������ �� �� ���� �������� � ���� �� �� ����� � � �� (%� / ���� �� �� �������� � ���� #2� ���� ��� ���%� �� ��������� ��� �� � ������ %� � ��&����� �� ��� � �� ��H������ ��� �� ����� ���� ����� ����� � 4��� � ��� � 9 ���� ������������/�� �� � ������ %� ���� � ���� ���� � ���� � �� ��� ����� �� ���9,� � ������� ��������� ���� ��� �� � ��&�������% �% � ��&�� � � ������ %� � �� �� ����� � ���� �� �� ����� ��� �������� � ���� �� � ��� � � ����� ��(9�2 ��� �� � �� �� ����% ��� �� ��&�����9�� �' � � ���� �� ������� � �� � ������ %� � �������� ���� � ���� ���� �� 560 ��� �0�8�,� � ��& � ����� ���� ���� ��% ���� � !3+9����$ �������� ���� � ���� ����� � 4� � � ��� ����� �� ��& ,++L �� ����% �� �� � ���� � ,+3.C9,+.CE �� ����� �������� ,C ��� �2/(�33M;M3,� ?��� 4� �� �����' ����� ��� ����������� �� �� ����9� ��� 560 � & �� � ���� .� � ��& � -.3 ����� � �� ���� �� ��� �% � ��� � ��� ��� ������ � ����� �� �� �� �� ���� ���� �� �����%� #����� , ��� 3 �� ���������& �% ��� ���4�������% ��� �� ����� ��� ���� ��� ���� �� ��� ���� ���� � � 4��� � ��� �������9� ���� � ��� %������/�� � �����%� ��� �� ������� �� ��� � ����� ������ � ����� ���� ���� . �� ��� �� ��� �' ���% ��� ��&�������% �% ���� �9� ��&�� � � ������ %� �� �� � �� ��� ����� ��� ��� ������� ��% ��� � �� �� ����� ����� �� ��� �& �� � � � ���� � ���� �� ����� � �� �� ������������� ���� � ��� � 4��� � ��� ���� ���� �� ������ ��� �� ����� ���� � �� ������ ���� . ��� ������ �����%� ������� ����� ������ ������� ������%� � � � 4��� � ��� ���� � ���� ���� ������ ���9, ��� ���� .� �� ���� � ����� � ������ � ���� �� ��� ����� �� ��������� ����� �������� ������ ���� �� (���� � ��& �� ���' � � ��& � ���� ���� �� ���� ��������� � ������ %� � ��&����� �� �� ��� ������� �� ��H������ ��� �� ������ �� ���� ���� ��������� ���� � �& � � ���4� ��� � 4��� � ��� ����� ��� ���� � �����

��9��������6 ���(��� , �� ��.�� "����������� ��8� , ���� �-�#����� ��( " 0(����(� � 6�� !#�-� ���� � ��( �� !��6 " 0(����(� ��0� � ?� 2�� ���� �� �� 2� ������� � �� �� =��� ?� & � � ������� ��� (����� ?�;��� ��%��-��� �!�� ������� "������� ������� ������� ��� 4���5� %������� ����� ��( �%���� %� � ���% � ����� ��� �� �� ����� � ��� �� � ���� � �� ��N�������%� ��������� ��� � ������� ���� ��� �� �� (���� ��������� ���'��� �� ���&�� ����������� ������� ���� �� � ������� � ������ �� � & ���� �� ��� ��� ���� �� �� ( �� ����������� ��&��& � �� �� � ������ ��� > ��& ����� � ������ � ���� �� ������% � �����% !� � 2��� ���� 0���%?%�� �� 0��%� ����$ �� � ����� �� '��� ����� ��������� �� � ��� ����� � �� � ����9� ��� ���� ���9���� � ��� � ( �� ������������ > � ���� � ��������& �������� ��� ����%��� �� C,++����� � ��� ����� ����� �� � �� � � ���� ��OF& !258*0J$� ����9����� � ���%! ���� ��� �%���� %� ���� � !2�0$J� 258*BJ$ ��� ���9���� ����� � ���% !2�09�258*BJ$ ( ���� B& ����� � �� ���' � 3, � � ���� �������� ���% ����' ��� ��� ����� � & ����� � � � !P 39����$ �� � ���% ( ��� ����� � ���� ��OF& ��� ��� ,, � � ���� ���� � ����� ��� ����� �� ����9����� !2�0J$ &�� ���9���� ����� !2�09$ � ���% ( ���� ,�+C- � �������% � �� ��� �� � & �� �� ��� ����� !�Q +�++,$ � ���� ��� ��� ( �%���� %� ������������� ����� � & ��� � � ���� ��& ��� �� &�����% � � � ���� � �� �� ��� �� �� ( �%���� %� ��� ���� ��� � ������ ���� � ���� ��& ��� % � � � ��� �������% ���� � ��� �� (� � �� �� ������%�� ���� � ���4� �� �� ����%��� �� ���� ��� ��� �� � �� � ��� ����� ���'� �� ( ��� ������ ����� � ���� �� ���� � �� �� ���� ��� ( �� �%������ !2(2�$ !258J� 258*BJ� 25C9�253*J� 2�0J$ ��� ����� � ���� ���� �� ������ ���9��������� � 2�0J � ���% ( ���� 3E+ � � ���� �������� ���% ����' ��� �� � �� � ��� ����� �� 2(2� ��� � � �� ���' �� ���� ���& � ��� ��� � ����������� ���� � �� �%�� � !���� � �� � � 1���� �� �� ����� ?>/??9�B(� B�/�� (/�� � ���� � � $ � & ��� � �� ������������ ���� � � �� �� ������� ��� �� � ��& ������� � ��� ��� �������% ���� � � ���� � � �� �& �9 ��� �� � � �� B������%��� ���� �� � ���� � & ��� �� �� � � � ��% ���% � ����� �� ��� �� 2(2�� � ��� 9��� ������ � ����%��� �� �� ��� ����� ���� ��� �� ( �� ����������� ��&��& � �� ���� ��� �� � ��� �� ��� ����� �� ���&�� ���4� ������� ���� �� ������� � 9 � ��� �� ����� ��� ��%�� �� ���� � ����� �� �� � ������ ���

))� 01?(02(? (=# �B�60� B� /6G#?(/�0(/G# 5#�0(B�B�<

Recommended