13
Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013 IVD Sadece in Vitro Diagnostic Kullanım için Trichomonas vaginalis Real- TM El Kitabı Kalitatif Tespiti için Real Time PCR kiti Trichomonas vaginalis REF B6-100FRT REF TB6-100FRT 100

Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

  • Upload
    others

  • View
    2

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

IVD Sadece in Vitro Diagnostic Kullanım için

Trichomonas vaginalis Real-TM

El Kitabı

Kalitatif Tespiti için Real Time PCR kiti Trichomonas vaginalis

REF B6-100FRT

REF TB6-100FRT

100

Page 2: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

İSİM

Trichomonas vaginalis Real-TM

AÇIKLAMA

STDs (cinsel yolla bulaşan hastalıklar) cinsel aktivite yoluyla edinilen bakteriyel, viral ve parasitik

enfeksiyonların çeşitlerine bakınız. HIV gibi bazıları sadece son birkaç on yıl içinde tespit

edilmişken, frengi, bel soğukluğu gibi bazı cinsel yolla bulaşanlar (STDs) yüzyıllardır

bilinmektedir. STDs'ye, 25'ten fazla enfeksiyonlu organizma sebep olur. Daha fazla organizmanın

tanımlanması ile STDs sayısı devamlı artmaktadır. Yaygın STDs 'ler içinde; chlamydia,

gonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır.

Nükleik asit amplifikasyon teknolojisine dayanan testlerin geliştirilmesi, STD'nin tanısı

alanındaki en önemli ilerleme olmuştur. Nükleik asit amplifikasyon oldukça hassas ve spesifik

olması nedeniyle, normalde klinik bakım talep olmayan asemptomik kişilerde , enfeksiyonların

taranması için, invaziv olmayan örnekleme tekniklerini kullanmak için fırsat sunar.

KULLANIM AMACI

Trichomonas vaginalis Real-TM kiti, ürogenital swablar,idrar, prostat sıvısı ve diğer biyolojik

malzemelerde Trichomonas vaginalis 'in kalitatif tespiti için bir testtir.

TAHLİL PRENSİBİ

Trichomonas vaginalis Real-TM kiti, iki ana proses esasına dayanmaktadır: Örneklerden DNA

izolasyonu ve Real time Amplifikasyon. Trichomonas vaginalis DNA, Real Time amplifiye

örneklerden ekstrakte edilir ve Internal (iç) kontrol ve Trichomonas vaginalis için spesifik floresan

reporter boya probları kullanılarak tespit edilir. Internal (iç) Kontrol, olası inhibasyon reaksiyonunu

tanılamak için ve her biri tek tek işlenen numuneler için bir amplifikasyon kontrolü olarak hizmet

vermektedir. IC, Trichomonas vaginalis DNA'dan farklı bir kanalda tespit edilir.

Page 3: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

SAĞLANAN MALZEMELER

Modül No.1: Real Time PCR kit (B6-100FRT)

Part N° 2 – “T.vaginalis Real-TM”: Real Time Amplifikasyon

PCR-mix-1-FL, 1,2 ml;

PCR-mix-2-FRT, 2 x 0,35 ml;

TaqF Polymerase, 2 x 0,03 ml;

Pos C+, 0,2 ml;

Negative Control C-, 1,2 ml;*

Internal Control IC, 1,0 ml;**

DNA-buffer, 0,5 ml;

110 test için reaktifler içerir

Modül No.2: DNA purifikasyon kiti (TB6-100FRT) ile Komple Real Time PCR testi

Part N° 1 – “DNA-sorb-A”: Numune Hazırlama

Lysis Solution, 2 x 15 ml;

Sorbent, 2 x 1,0 ml;

Washing Solution, 2 x 50 ml;

DNA-eluent, 2 x 5 ml;

Transport medium , 30 ml.

100 test için reaktifler içerir

Part N° 2 – “T.vaginalis Real-TM”: Real Time Amplifikasyon

PCR-mix-1-FL, 1,2 ml;

PCR-mix-2-FRT, 2 x 0,35 ml;

TaqF Polymerase, 2 x 0,03 ml;

Pos C+, 0,2 ml;

Negative Control C-, 1,2 ml;*

Internal Control IC, 1,0 ml;**

DNA-buffer, 0,5 ml;

110 test için reaktifler içerir

*izolasyon prosedürü esnasında Ekstraksiyon Negatif Kontrolü olarak kullanılmalıdır. **10 µl Internal Kontrol DNA izolasyonu esnasında doğrudan numune/lysis karışımına eklenir ( DNA-Sorb-A REF K-1-1/A protokolüne bakınız).

Page 4: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

SAĞLANMAYAN GEREKLİ MALZEMELER

Alan 1 : Numune Hazırlama

DNA ekstraksiyon kiti (Modül No.

1) Biyolojik kabin

"eppendorf" tip tüpler için masaüstü mikrosantrifüj

Kuru hava

bloğu, Vorteks

mikser,

Pipetler

Filtreli steril pipet uçları

1,5 ml'lik polipropilen steril tüpler,

Biyolojik tehlikeli atıklar için atık

kabı, buzdolabı, dondurucu

Alan 2: Real Time Amplifikasyon

Real Time Thermal cycler

Reaksiyon Tüpleri

Çalışma İstasyonu

Pipetler (ayarlanabilir)

Filtreli steril pipet uçları

Vorteks mikser

Dondurucu, buzdolabı

Page 5: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

MUHAFAZA KOŞULLARI

Trichomonas vaginalis Real-TM PCR kitinin tüm bileşenleri (polimeraz (TaqF) ve PCR-mix-2-FRT

hariç) kullanılmadıkları zaman, 2–8 ºC'de muhafaza edilir. Trichomonas vaginalis Real-TM PCR

kitinin tüm bileşenleri , etiketlerinde belirtilen son kullanım tarihlerine kadar stabildir. Reaktiflerin raf

ömrü, aksi belirtilmedikçe ilk kullanım öncesi ve sonrası aynıdır.

PCR-mix-1-FL ışıktan uzak tutulmalıdır.

Polymerase (TaqF) ve PCR-mix-2-FRT, ≤ –16 °C'de muhafaza edilmelidir.

STABİLİTE

Trichomonas vaginalis Real-TM, etiketinde belirtilen son kullanım tarihine kadar stabildir. Ürün

etiketinde basılı kontrol tarihine kadar performansını koruyacaktır . Işık, ısı veya neme maruz

kalma kitin bazı bileşenlerinin raf ömrünü etkileyebilir, bunlardan kaçınılmalıdır. Hassasiyet

azalabileceğinden, reaktiflerin tekrarlanan çözülme ve dondurma işlemlerinden kaçınılmalıdır.

KALİTE KONTROL

Her lot , tutarlı ürün kalitesini sağlamak için; Sacace ISO 13485-Sertifikalı Kalite Yönetim

Sistemine uygun olarak, önceden belirlenmiş özelliklere karşı test edilmektedir.

Page 6: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

UYARILAR VE ÖNLEMLER

In Vitro Diagnostic Medikal Cihaz

Sadece In Vitro Diagnostic Kullanım için

Kullanıcı her zaman aşağıdakilere dikkat etmelidir:

Lysis Solution guanidine thiocyanate içerir*. Guanidin tiyosiyanat solunduğunda veya

yutulduğunda veya deri ile temas halinde zararlıdır. Asit ile temasında toksik gaz oluşturur.

(Xn; R: 20/21/22-36/37/38; S: 36/37/39).

Aeresol bariyerli steril pipet ucuları kullanın ve her prosedür için yeni pipet ucu kullanın.

Ekstrakte pozitif malzemeleri (numuneler, kontroller ve amplikonlar) diğer reaktiflerden uzak

tutun/mufaza edin ve bunları reaksiyon karışımına ayrı bir alanda ekleyin.

Bütün bileşenleri tahilile başlamadan önce oda sıcaklığında iyice çözün.

Bileşenler çözündüğünde karıştırın ve kısa bir süre santrifüjleyin.

Reaktif ve örnekler ile çalışırken , atılabilir eldiven, laboratuar önlüğü ve göz koruyucu

kullanın. İşlem sonrası ellerinizi iyice yıkayın.

Laboratuar çalışma alanlarında, sigara içmeyin, herhangi birşey yemeyin- içmeyin, kozmetik

uygulamayın veya kontakt lenslere elle dokunmayın. Son kullanım tarihlerinden sonra kitleri

kullanmayın.

Tüm numuneleri ve kullanılmayan reaktifleri ,yerel yönetim kurallarına uygun olarak imha edin.

.

Örnekler potansiyel enfeksiyöz olabilir , işlemleri uygun biyogüvenlik uygulamaları ile bir

güvenlik kabini içerisinde gerçekleştirin.

Dökülen/ saçılan tüm numune veya reaktifleri temizleyin ve %0.5 lik sodyum hipoklorit veya

diğer uygun dezenfektanlarla dezenfekte edin.

Numune veya reaktiflerin deri, göz veya mukoza zarları ile temasından kaçının. Deri, göz veya

mukoza zarları ile temas olması halinde, hemen su ile yıkayın ve acilen tıbbi yardım alın.

Malzeme Güvenlik Bilgi Formları (MSDS) istek üzerine verilebilir.

Bu ürünün kullanımı, DNA amplifikasyonu teknikleri konusunda eğitimli personel ile sınırlı olmalıdır.

Laboratuvar süreci tek yönlü olmalı; Ekstraksiyon Alanında başlamalı ve sonra

Amplifikasyon ve Tespit alanlarına gidilmeli/ yönlenmelidir. Örnekleri, ekipmanları ve

reaktifleri önceki adımın yapıldığı bölgeye/alana geri döndürmeyin.

Bu kitteki bazı bileşenler koruyucu olarak sodyum azid içerir. Reaktif transferi için metal

tüp kullanmayın.

* Sadece Modül No.2

Page 7: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

ÜRÜN KULLANIM SINIRLARI

Tüm reaktifler sadece in vitro diagnostik kullanılabilir. Bu ürünün kullanımı, DNA amplifikasyonu

teknikleri konusunda eğitimli personel ile sınırlı olmalıdır (UNI EN ISO 18113-2:2012). Kullanım

kılavuzu ile tam uyum, optimum PCR sonuçları için gereklidir. Kutu üzerinde ve tüm bileşenlerin

etiketlerinde yazılı olan son kullanma tarihlerine dikkat edilmelidir. Kiti, son kullanım tarihinden

sonra kullanmayın.

NUMUNE TOPLAMA, MUHAFAZA VE TAŞIMA

Trichomonas vaginalis Real-TM , aşağıdakilerden ekstrakte DNA analizi yapabilir:

selvikal, uteral swablar: Swabı nükleaz içermeyen 1,5 ml'lik tüpe yerleştirin ve 0,2 ml

Transport medium ekleyin. Swabları medium içimde 15-20 sn. çalkalayın.

idrar sedimenti: 10-20 ml ilk idrar steril kap içerisine alınır. 3000 x g 'de 30 dk. santrifüjleyin,

200 µl solüsyon bırakarak süpernatantı dikkatlice ayırın. Sedimenti resüspanse edin.

Süspansiyonu DNA ekstraksiyon için kullanın.

prostatik sıvı , “Eppendorf” tüpte muhafaza edilir.

seminal sıvı: semen sıvılaşana kadar 40 dk. karanlıkta bekletin. DNA ekstraksiyon için 100 µl 'sini kullanın.

Prosesin, numuneler alındıktan hemen sonra gerçekleştirilmesi önerilir. Numuneler 24 saatten

fazla olmamak koşulu ile 2–8 °C ‘de muhafaza edilir ya da–20/80°C dondurulur. Klinik

örneklerin taşınması, etiyolojik ajanların taşınmasına yönelik ülke , federal , eyalet ya da yerel

yönetmeliklere, uymak zorundadır.

DNA İZOLASYON

Herhangi bir ticari RNA / DNA izolasyon kiti, burada belirtilen IVD-CE "NUMUNE TOPLAMA,

MUHAFAZA VE TAŞIMA" paragrafındaki örnek türleri için valide ise, kullanılabilir.

Sacace Biotechnologies aşağıdaki kitleri kullanmanızı önerir:

DNA-Sorb-A (Sacace, REF K-1-1/A);

SaMag STD DNA Extraction kit (Sacace, REF SM007).

Lütfen, DNA ekstraksiyonunu, üreticinin talimatlarına uygun olarak gerçekleştirin. 10

Internal (iç) Kontrol 'ü DNA izolasyon prosedürü esnasında doğrudan numune/lysis

karışımına ekleyin. (Not: Sacace Internal Control tüm ürogenital enfeksiyon Real Time

kitleri için aynıdır.)

Page 8: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

NUMUNE VE RAKTİF HAZIRLAMA (modül no.2 ile sağlanan reaktifler)

1. Lysis Solution ve Washing Solution (+2-8°C de muhafaza edildikleri için) buz kristalleri yok

olana kadar 60–65°C' ye kadar ısıtılmalıdır. Bir tüp te Ekstraksiyon Negatif Kontrolü için

olmak üzere, gereken miktarda 1,5 ml'lik polipropilen tüpleri hazırlayın.

2. Her tüpe 10 µl Internal Control ve 300 µl Lysis Solution ekleyin.

3. Uygun tüpe 100 µl numunelerden ekleyin.

4. Kontrolleri aşağıdaki gibi hazırlayın :

Cneg etiketli tüpe 100 µl of C– (Neg Control) ekleyin.

5. Bütün tüpleri vorteksleyin ve 5 dk. 65°C'de inkübe edin. 5-7 sn. santrifüjleyin. Eğer numune

tamamen çözünmezse, tüpün maksimum (12000-16000 g.) hızda 5 dk. yeniden

santrifüjlenmesi önerilir. Süpernatantı DNA ektraksiyon için, yeni bir tüpe aktarın.

6. Sorbenti kuvvetlice vorteksleyin ve her tüpe 20 µl ekleyin.

7. 5-7 sn. vorteksleyin ve bütün tüpleri, oda sıcaklığında 3 dk. inkübe edin. Bu adımı tekrarlayın.

8. Bütün tüpleri 30 sn. 5000 g'de santrifüjleyin ve tıkaçlı aerosol bariyer uçlu mikropipet

kullanarak, her tüpten pelleti dağıtmadan, süpernatantı dikkatlice ayırın ve kaldırın. Tüpler

arasında pipet uçlarını değiştirin.

9. Her tüpe 500 µl Washing Solution ekleyin. Çok kuvvetli vorteksleyin ve 30 sn 10000 g'de

santrfifüjleyin. Her bir tüpten süpernatantı ayırın ve kaldırın.

10. 9. adımı tekrarlayın ve bütün tüpleri kapakları açık halde 65°C'de 5-10 dk. inkübe edin.

11. Pelleti, 100 µl DNA-eluent 'te resüspanse edin. 65°C 'de 5 dk. inkübe edin ve periyodik

olarak vorteksleyin.

12. Tüpleri, 12000 g'de 1 dk. inkübe edin.

13. Süpernatant, amplifikasyon için hazır DNA içerir. Eğer amplifikasyon ekstraksiyon ile aynı

gün gerçekleştirilmezse, işlenmiş numuneler 5 günden fazla olmamak koşulu ile 2-8°C'de

muhafaza edilebilir veya –20°/-80°C'de dondurulabilir.

PROTOKOL

Toplam reaksiyon hacmi 25 µl, DNA örnek hacmi ise 10 µl 'dir.

1. Numuneler(N) ve kontroller (N+2) için reaksiyon tüplerini, gereken sayıda hazırlayın.

2. Yeni steril tüpte 10*N µl PCR-mix-1-FRT, 5*N µl PCR-mix-2-FRT ve 0,5*N µl TaqF DNA Polymerase hazırlayın.

Vorteksleyin ve kısaca santrifüjleyin.

3. Her tüpe 15 µl Reaction Mi ve 10 µl ekstrakte DNA ekleyin. Pipetlemeyle karıştırın.

4. Her panel için 2 kontrol hazırlayın:

● NCA (Amplifikasyon Negatif Kontrol) etiketli tüpe , 10 µl DNA-buffer ekleyin;

● C+ (PCR Pozitif Kontrol) etiketli tüpe , 10 µl Positive Control ekleyin;

5. Tüpleri thermalcycler'a yerleştirin.

Page 9: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

Rotor-tip Enstrümanlar1

Plate- veya modüler tip Enstrümanlar2

Adım Sıcaklık

°С

Süre

Tekrarlar

Sıcaklık °С

Süre

Tekrarlar

1 95 15 min 1 95 15 dk. 1

2

95 5 sn. 5

95 5 sn. 5 60 20 sn. 60 20 sn.

72 15 sn. 72 15 sn.

3

95 5 sn.

40

95 5 sn.

40

60 20 sn floresan sinyal tespiti

60

30 sn. floresan sinyal

tespiti

72 15 sn. 72 15 sn.

Amplifikasyon

1. Enstrümanınızda aşağıdaki gibi bir sıcaklık profili oluşturun:

1 Örneğin; Rotor-Gene™ 3000/6000/Q (Corbett Research, Qiagen)

örneğin,SaCycler-96™ (Sacace), CFX/iQ5™ (BioRad); Mx3005P™ (Agilent), ABI® 7300/7500/StepOne Real Time PCR (Applied Biosystems), SmartCycler® (Cepheid), LineGeneK® (Bioer)

Floresan, 2.Cycling evresinde (60 °C) , FAM/Green ve JOE/Yellow/Hex/Cy3 floresan kanallarda tespit edilir.

Trichomonas vaginalis FAM (Green) kanalda, IC DNA

JOE/Yellow/HEX/Cy3 kanalda tespit edilir.

ENSTRÜMAN AYARLARI Rotor-tip enstrümanlar

Kanal Calibrate/Gain Optimisation…

Eşik Çizgisi Diğer Ayarlar/

Outlier Removal

Slope Correct

FAM/Green 5 FI ila 10 FI 0,1 %5 Açık

JOE/Yellow 4 FI ila 8 FI 0,1 %5 Kapalı

Plate -tip enstrümanlar

Eşik çizgisi, yalnız pozitif örneklerin sinyal birikiminin sigmoid eğrilerini geçmeli ve taban

çizgisini geçmemelidir; aksi takdirde eşik çizgi seviyesi yükseltilmelidir. Eşik çizgisini , floresan

eğrilerinin linear ve negatif numunelerin eğrilerinin geçmediği yerde ayarlayın.

Cycle eşik çizgisi sınır değeri, Ct

Numune

Florofor için kanal

Ct sınır değeri

Rotor-tip enstrümanlar

Plate-tip enstrümanla

r

C+ FAM/Green 33 36

JOE/Yellow/HEX/Cy3 30 33

Klinik numuneler, C- JOE/Yellow/HEX/Cy3 30 33

Page 10: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

Kontrol

Kontrol Evresi

Ct kanal Fam

Ct kanal Joe

Yorumlama

NCE

DNA izolasyon

NEG

POS

Geçerli sonuç

NCA

Amplifikasyon

NEG

NEG

Geçerli sonuç

C+

Amplifikasyon

POS

POS

Geçerli sonuç

VERİ ANALİZLERİ

Floresan sinyal yoğunluğu iki kanalda tespit edilir:

Trichomonas vaginalis DNA amplifkasyon ürününün siyali, FAM/Green kanalda tespit edilir.

Internal Control amplifikasyon ürününden gelen sinyal, JOE/Yellow/HEX/Cy3 kanalında tespit edilir.

Sonuçların Yorumlanması

Sonuçlar, eşik çizgisi ile floresan eğrinin geçişi (veya geçmeyişi) ile, enstrüman yazılımı

vasıtası ile yorumlanır.

Yorumlama Prensibi

Trichomonas vaginalis DNA, FAM kanalda Ct değeri var ise, numune içinde tespit edilir.

Floresan eğrisi, üstel floresan artış alanında eşik çizgisini geçmelidir.

Ct değeri JOE kanalda 33'ten daha küçükken, Ct değeri FAM kanalda yoksa (floresan eğrisi

eşik çizgisini geçmiyor), numunede Trichomonas vaginalis DNA tespit edilmez.

JOE kanaldaki CT değeri, belirtilen sınır değerden (Ct>33) daha büyük veya yok iken,

numunenin Ct değeri FAM kanalda yoksa, sonuç geçersizdir.

Bu gibi numunelerin PCR analizinin tekrar edilmesi gereklidir. Eğer , sadece Ekstraksiyon Kontrol (Tablo 2)doğruysa ve bunun yanı sıra sonuçlar amplifikasyon Pozitif ve Negatif kontroller için elde edilmişse , analiz sonuçları güvenilir kabul edilir.

Tablo 2. Kontrol Sonuçları

Page 11: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

KALİTE KONTROL PROSEDÜRÜ

Internal Kontrol (IC) tanımlanmış miktarı,her bir numunenin ekstraksiyon prosesini kontrol etmek

ve olası inhibasyon reaksiyonunu tanımlamak için , her numune ve kontrolün numune hazırlama

prosedürünün başlangıcından itibaren işleme konulur.

Ekstraksiyon Negatif Kontrol (NCE), aplifikasyon negatif kontrol (NCA), pozitif amplifikasyon

kontrol (C+) , numune hazırlama, amplifikasyon ve tespit adımlarının doğru gerçekleştirilip

geçekleştirilmediğini doğrulamak için her çalışmada gereklidir.

Eğer kontroller beklenilen aralıkların dışındaysa ( Kontrol Sonuçları tablosuna bakınız), bu

çalışmadaki numuneler ve kontroller , numune hazırlama adımından itibaren yeniden işlenmelidir.

SPESİFİKASYONLAR

Hassasiyet Trichomonas vaginalis Real-TM PCR kitinin analitik hassasiyeti, aşağıdaki tabloda

belirtilmiştir.

Klinik malzeme DNA ekstraksiyon kiti Analitik hassasiyet, GE/ml*

Urogenital swablar DNA-sorb-A 5 x 102

İdrar DNA-sorb-A 1 x 103

* Belirtilen transport mediumda yer alan klinik numunenin 1 ml başına mikroorganizmanın Genom eşdeğerleri (GE).

Özgüllük Trichomonas vaginalis Real-TM PCR kitinin analitik özgünlüğü, kitinin analitik özgünlüğü, sıkı reaksiyon koşullarıyla birlikte spesifik primerler ve probların seçimiyle sağlanır Primerler ve problar, sekans karşılaştırma analizi ile gen bankalarında yayınlanan tüm sekanslara mümkün olan homolojiler açısından kontrol edilmiştir. İnsan DNA'sının yanı sıra aşağıdaki mikroorganizmaların DNA panelinin de , inceleme esnasında nonspesifik tepkileri yok idi: Gardnerella vaginalis, Lactobacillus spp., Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Streptococcus agalactiae, Candida albicans, Neisseria gonorrhoeae, Ureaplasma urealyticum, Ureaplasma parvum, Mycoplasma genitalium, Neisseria flava, Neisseria subflava, Neisseria sicca, Neisseria mucosa, Chlamydia trachomatis, Mycoplasma hominis, Treponema pallidum, Toxoplasma gondii, HSV tip1 ve 2, CMV, ve HPV.

Page 12: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

SORUN GİDERME

1. Ekstraksiyon Negatif Kontrol için, zayıf ya da olmayan IC (Joe/Hex/Cy3 kanal) sinyali.

PCR inhibe edilmiştir.

Önerilen DNA ekstraksiyon metodunu kullandığınızdan ve üreticinin

talimatlarını izlediğinizden emin olun.

Bütün tüpleri ekstrakte DNA pipetlemeden önce, 2 dk. maksimum

(12000-16000 g) hızda yeniden santrifüjleyin ve süpernatantı dikkatlice

alın. Pelleti dağıtmayın, sorbent reaksiyonu inhibe eder.

Reaktif muhafaza koşulları talimatlara uygun değil.

Muhafaza koşullarını kontrol edin.

Yanlış DNA ekstraksiyonu

DNA ekstraksiyon aşamasndan başlamak üzere analizi tekrarlayın.

PCR koşulları talimatlara uygun değil.

Protokolde belirtilen IC tespit floresan kanalını seçin ve PCR koşullarını

kontrol edin.

IC, reaktif pipetleme esnasında numuneye eklenmemiş.

DNA ekstraksiyon prosedürü esnasında dikkatli olun.

2. Zayıf ya da olmayan Pozitif Kontrol sinyali.

PCR koşulları talimatlara uygun değil.

Manuelde belirtilen floresan kanalını seçin ve aplifikasyon prosedürünü

kontrol edin.

3. Ekstaksiyon Negatif Kontrolü ile Fam (Green) sinyal.

DNA ekstraksiyon prosedürü esnasında kontaminasyon. Tüm sonuçlar geçersizdir.

Bütün yüzeyleri ve enstrümanları sodyum hipoklorid ve etanol ile

dekontamine edin.

Ekstraksiyon prosedürü esnasında sadece filtre pipet uçlarını kullanın.

Tüpler arasında pipet uçlarını değiştirin.

Yeni reaktif setleriyle DNA ekstraksiyonunu tekrarlayın.

4. PCR Negatif Kontrol (DNA-buffer) ile herhangi bir sinyal yok.

PCR hazırlama prosedürü esnasında kontaminasyon. Tüm sonuçlar geçersizdir.

Bütün yüzeyleri ve enstrümanları sodyum hipoklorid ve etanol veya özel

DNA dekontaminasyon reaktifleriyle dekontamine edin.

Pozitif Kontrolü en son pipetleyin.

Yeni reaktif setleriyle PCR hazırlamayı tekrarlayın.

Page 13: Trichomonas vaginalis TM B6-TB6 ver 21032013peramed.com/peramed/docs/TB6-100FRT-B6-100FRT_TR.pdfgonorrhea, herpes, HIV, HPV, syphilis, gardnerella ve trichomoniasis yer almaktadır

Sacace™ Trichomonas vaginalis Real-TM VER. 21.03.2013

KULLANILAN SEMBOLLERİN ANLAMLARI

Liste Numarası Dikkat!

Lot Numarası <n> testleri için

yeterlilik içerir

in Vitro Diagnostic için

Kullanım Versiyon

..'de muhafaza NCA Amplifikasyon Negatif

Kontrol Amplifikasyon

Üretici NCE Ekstraksiyon Negatif

Kontrol .

Kullanım için talimatlara bakınız C+

Pozitif Kontrol Amplifikasyon

Son Kullanım Tarihi IC Internal (iç) kontrol

* SaCycler™ Sacace Biotechnologiestescilli markasıdır. * CFX™ and iQ5™Bio-Rad Laboratories tescilli markasıdır. * Rotor-Gene™ Qiagen tescilli markasıdır. * MX3005P® Agilent Technologies tescilli markasıdır. * ABI® Applied Biosystems tescilli markasıdır. * LineGeneK® Bioer tescilli markasıdır.

* SmartCycler® Cepheid tescilli markasıdır.

Sacace Biotechnologies Srl via Scalabrini, 44 – 22100 – Como – Italy Tel +390314892927 Fax +390314892926

mail:

[email protected] web: [email protected] web: www.sacace.com