21
Travail de Travail de Génétique Génétique Charles Houbotte Charles Houbotte Thibaut Jentges Thibaut Jentges Benoît Kesteloot Benoît Kesteloot 24 novembre 2006 24 novembre 2006

Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

Travail de GénétiqueTravail de Génétique

Charles Houbotte Charles Houbotte Thibaut JentgesThibaut JentgesBenoît KestelootBenoît Kesteloot

24 novembre 200624 novembre 2006

Page 2: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

Description phénotypique et génotypique Description phénotypique et génotypique

des caractéristiques des fibres des caractéristiques des fibres

chez les camélidés domestiques chez les camélidés domestiques

d’Amérique du Sud.d’Amérique du Sud.

Phenotypic and genetic description of fibre traits in South Phenotypic and genetic description of fibre traits in South American domestic camelids (llamas and alpacas)American domestic camelids (llamas and alpacas) 

Page 3: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

PLAN de l’exposéPLAN de l’exposé

• IntroductionIntroduction

• Matériels et méthodesMatériels et méthodes

• Déterminisme génétique des caractéristiques de fibresDéterminisme génétique des caractéristiques de fibres

• Quoi d’un point de vue purement génétiqueQuoi d’un point de vue purement génétique

• ConclusionConclusion

• Usages en tant que futur VTUsages en tant que futur VT

• CritiquesCritiques

• BibliographieBibliographie

Page 4: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

IntroductionIntroduction

• Objectif de l’étude:Objectif de l’étude:Décrire les caractères phénotypiques déterminant la qualité des fibres Décrire les caractères phénotypiques déterminant la qualité des fibres et comprendre les mécanismes génétiques les gouvernant.et comprendre les mécanismes génétiques les gouvernant.

Les producteurs de fibres de lama travaillent surtout sur la douceur de Les producteurs de fibres de lama travaillent surtout sur la douceur de la fibre en sélectionnant des toisons fines et en séparant les fibres la fibre en sélectionnant des toisons fines et en séparant les fibres primaires des sous couches plus soyeuses.primaires des sous couches plus soyeuses.

La valeur commerciale des fibres est déterminée, entre autre, par la La valeur commerciale des fibres est déterminée, entre autre, par la finesse, la douceur, la couleur et l’uniformité du diamètre. finesse, la douceur, la couleur et l’uniformité du diamètre.

Page 5: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

Matériel & MéthodeMatériel & Méthode•Seulement 15% des producteurs reçoivent une différence de Seulement 15% des producteurs reçoivent une différence de prix pour la moyenne du diamètre de leurs fibres. => prix pour la moyenne du diamètre de leurs fibres. => beaucoup de petits éleveurs sélectionnent des animaux avec beaucoup de petits éleveurs sélectionnent des animaux avec des fibres plus épaisses => impact négatif sur la valeur de des fibres plus épaisses => impact négatif sur la valeur de leur stock au niveau international.leur stock au niveau international.

• Le blanc est la couleur la plus fréquemment rencontrée.Le blanc est la couleur la plus fréquemment rencontrée.

•Avec les tendances écologiques actuelles, les industries du Avec les tendances écologiques actuelles, les industries du textiles souhaitent des couleurs naturelles (Blanc, noir, roux textiles souhaitent des couleurs naturelles (Blanc, noir, roux et blond). et blond).

•Le principal problème est le manque d’uniformité dû au Le principal problème est le manque d’uniformité dû au mélange ou à la dilution de la toison.mélange ou à la dilution de la toison.

Page 6: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

Déterminisme génétique des Déterminisme génétique des caractéristiques de fibrescaractéristiques de fibres

1.1. Couleur Couleur =>=> données factoriellesdonnées factorielles

2.2. Type de toisonType de toison

3.3. Diamètre de la fibre Diamètre de la fibre

4.4. Longueur de la fibre Longueur de la fibre =>=>donnéesdonnées

5.5. Rendement de tonte Rendement de tonte quantitativesquantitatives

6.6. HéritabilitéHéritabilité

Page 7: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

1. Couleur

• Prédominance de blanc ou de brun suivant Prédominance de blanc ou de brun suivant les régionsles régions

• Absence de pigmentation (tout blanc) est Absence de pigmentation (tout blanc) est dominant avec pénétrance incomplète sur: dominant avec pénétrance incomplète sur:

- Phénotype pigmenté- Phénotype pigmenté

- Phénotype tacheté- Phénotype tacheté

• « Black face » et extrémités noires « Black face » et extrémités noires dominent les phénotypes noir et sauvage.dominent les phénotypes noir et sauvage.

Page 8: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

2. Type de toison

• A l’origine, on considérait que les fibres du A l’origine, on considérait que les fibres du lama étaient une toison à double couchelama étaient une toison à double couche

• Suivant les régions on observe une Suivant les régions on observe une prédominance des toisons à simple couche prédominance des toisons à simple couche (à part une exception, le Pérou)(à part une exception, le Pérou)

• Les toisons doubles couches et les toisons Les toisons doubles couches et les toisons lustrées sont moins fréquenteslustrées sont moins fréquentes

Page 9: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

• Il existe 5 phénotypes:Il existe 5 phénotypes:- Double couche- Double couche

- Intermédiaire- Intermédiaire

- Simple couche- Simple couche

- Semi lustré- Semi lustré

- Lustré- Lustré

• Caractère simple ou double suivant les follicules Caractère simple ou double suivant les follicules primaires et secondairesprimaires et secondaires

• Caractère lustré ou non lustré d’après l’épaisseur Caractère lustré ou non lustré d’après l’épaisseur de la racine du follicule de la racine du follicule

Page 10: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

• Le type de toison n’influence pas le diamètre ni le Le type de toison n’influence pas le diamètre ni le poidspoids

• Le type lustré donne moins de volume que le non Le type lustré donne moins de volume que le non lustré lustré donc utilisation du second donc utilisation du second

• Le phénotype lustré est dominant sur le non Le phénotype lustré est dominant sur le non lustré avec un effet de pénétrance qui permet lustré avec un effet de pénétrance qui permet une phénotype intermédiaireune phénotype intermédiaire

• Phénotype double couche est gouverné par un Phénotype double couche est gouverné par un mécanisme additifmécanisme additif

Page 11: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

FacteurFacteur EffetEffet

ÂgeÂge Augmente avec l’âgeAugmente avec l’âge

OrigineOrigine VariableVariable

SexeSexe Pas d’effetPas d’effet

Race Race Suri + épaisse que HuacayaSuri + épaisse que Huacaya

CouleurCouleur Noir +fine que les blanchesNoir +fine que les blanches

Âge de productionÂge de production VariableVariable

AlimentationAlimentation ↑ ↑ avec un bon niveauavec un bon niveau

SaisonSaison ↓ ↓ en hiveren hiver

3.Facteurs influençant le diamètre des fibres

Page 12: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

4. Longueur de la fibre

• La longueur moyenne des fibres est de La longueur moyenne des fibres est de plus ou moins 19 cm.plus ou moins 19 cm.

• La croissance moyenne des poils est La croissance moyenne des poils est d’environ 15 cm en 12 mois qui d’environ 15 cm en 12 mois qui correspond à une récolte normale.correspond à une récolte normale.

• Ces données varient en fonction de la Ces données varient en fonction de la régionrégion

• La longueur varie également en fonction La longueur varie également en fonction du diamètre de la fibre.du diamètre de la fibre.

Page 13: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

5. Le rendement de tonte (éjarrer)

• Principe : enlèvement des fibres grossières provenant des Principe : enlèvement des fibres grossières provenant des follicules primaires.follicules primaires.

• 35-50% du rendement est d’excellente qualité. On doit 35-50% du rendement est d’excellente qualité. On doit séparer la fibre fine de la fibre grossière et des contaminants.séparer la fibre fine de la fibre grossière et des contaminants.

Page 14: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

6. Héritabilité6. Héritabilité

• La structure de la toison est principalement La structure de la toison est principalement déterminée par : déterminée par :

- la longueur des fibres- la longueur des fibres

- leur diamètre- leur diamètre

- la relation entre ces ≠ caractères.- la relation entre ces ≠ caractères.

• L’héritabilité pour le poids de la toison , le L’héritabilité pour le poids de la toison , le diamètre et la longueur des fibres est grande, diamètre et la longueur des fibres est grande, voir très grande, en Australie et en Nouvelle-voir très grande, en Australie et en Nouvelle-zélande tandis qu’elle est basse dans les régions zélande tandis qu’elle est basse dans les régions d’altitude d’Amérique du Sud. d’altitude d’Amérique du Sud.

Page 15: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

Facteurs non-génétiquesFacteurs non-génétiques

• Âge : Âge : ø ø ↑ jusque 5-6 ans puis ↓.↑ jusque 5-6 ans puis ↓.• Fréquence de tonte et localisation Fréquence de tonte et localisation

géographique influence la longueur.géographique influence la longueur.• La localisation géographique influence le La localisation géographique influence le

poids de la toison. poids de la toison. • Faible influence du sexeFaible influence du sexe

Page 16: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

Quoi d’un point de vue purement génétique?Quoi d’un point de vue purement génétique?

Applications des différentes formules:Applications des différentes formules:

P = G + E + IP = G + E + I

avecavec G = A + NAG = A + NAE = Ep + EtE = Ep + Et

- Içi, le - Içi, le phénotypephénotype recherché est basé sur les critères de qualité de recherché est basé sur les critères de qualité de la toison.la toison.- Comme illustré précédemment, les - Comme illustré précédemment, les effets environnementauxeffets environnementaux influencent, de manière variable, le phénotype.influencent, de manière variable, le phénotype.- - L’environnement transitoireL’environnement transitoire (exemple: pathologie) va également (exemple: pathologie) va également influencer la quantité et la qualité de la toison. influencer la quantité et la qualité de la toison. - On observe des - On observe des interactionsinteractions entre différents paramètres tels que entre différents paramètres tels que la longueur des fibres et leur diamètre. Ceci aura une influence sur la longueur des fibres et leur diamètre. Ceci aura une influence sur le phénotype.le phénotype.

Page 17: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

ConclusionConclusion• Les principaux facteurs pour une fibre de qualité:Les principaux facteurs pour une fibre de qualité:

- diamètre fin- diamètre fin- couleur blanche- couleur blanche- uniformité dans le diamètre- uniformité dans le diamètre- soyeux - soyeux - le moins rude- le moins rude

• Des améliorations génétiques seraient possible par le Des améliorations génétiques seraient possible par le développement de programmes de sélection de caractères développement de programmes de sélection de caractères spécifiquesspécifiques

• Plus d’études sont nécessaires pour comprendre la relation Plus d’études sont nécessaires pour comprendre la relation entre les caractères quantitatifs et les effets entre les caractères quantitatifs et les effets environnementaux.environnementaux.

Page 18: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

Rôle du vétérinaire dans la filièreRôle du vétérinaire dans la filière

• Conseiller les éleveurs sur un schéma de Conseiller les éleveurs sur un schéma de sélection pour améliorer le rendement et la sélection pour améliorer le rendement et la qualité de la fibre de lama. qualité de la fibre de lama.

• Les éleveurs devraient mettre en commun leurs Les éleveurs devraient mettre en commun leurs production sous forme de registre pour une production sous forme de registre pour une meilleure connaissance des données en ce meilleure connaissance des données en ce domaine.domaine.

• Une harmonisation des résultats est nécessaire Une harmonisation des résultats est nécessaire mais encore indisponible pour décrire clairement mais encore indisponible pour décrire clairement les influences génétiques des fibres du lamales influences génétiques des fibres du lama

Page 19: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

CritiquesCritiques• Un manque d’études et donc de données est observé.Un manque d’études et donc de données est observé.

• L’article discute principalement des conclusions des études L’article discute principalement des conclusions des études et ne concerne pas une étude en particulier.et ne concerne pas une étude en particulier.

• Même si des améliorations de la production peuvent être Même si des améliorations de la production peuvent être apportées par une sélection génétique, la plupart des apportées par une sélection génétique, la plupart des éleveurs observés sont des paysans qui travaillent plus par éleveurs observés sont des paysans qui travaillent plus par rapport à leurs coutumes que dans un but de production.rapport à leurs coutumes que dans un but de production.

Pour les élevages plus importants, une aide professionnelle Pour les élevages plus importants, une aide professionnelle de sélectionneurs pourraient les aider à optimiser leur de sélectionneurs pourraient les aider à optimiser leur

production et donc leur rendement financier.production et donc leur rendement financier.

Page 20: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

BibliographieBibliographie

Phenotypic and genetic description of fibre traits in South American domestic camelids (llamas and alpacas)  Small Ruminant Research, Volume 61, Issues 2-3, February 2006, Pages 113-129 E.N. Frank, M.V.H. Hick, C.D. Gauna, H.E. Lamas, C. Renieri and M. Antonini

• Cours de génétique de 1°doc

Page 21: Travail de Génétique Charles Houbotte Thibaut Jentges Benoît Kesteloot 24 novembre 2006

MERCI pour votre attention