Upload
others
View
1
Download
0
Embed Size (px)
Citation preview
Servicio de Proteómica y Bioquímica
CABD
Responsable científico: Belén Floriano Pardal
Responsable técnico: Laura Tomás Gallardo
Encuentro CABD-IG Junio 2016
Encuentro CABD-IG Junio 2016
SERVICIOS
Separación de proteínas mediante Electroforesis Nativa, Electroforesis
monodimensional SDS-PAGE y Electroforesis bidimensional 2D-PAGE.
Separación de proteínas de una mezcla compleja mediante purificación
de proteínas.
Estudios de proteómica cuantitativa mediante electroforesis.
bidimensional con marcaje fluorescente (2D-DIGE).
Estudios de proteómica cuantitativa sin gel (iTRAQ).
Estudios de interacciones moleculares (Biacore).
Caracterización de actividades enzimáticas.
Cuantificación de la expresión de proteínas mediante western blot.
Asistencia técnica en el diseño y realización de experimentos con
proteínas.
Entrenamiento personal en el uso de equipos o programas de análisis
de imagen.
Encuentro CABD-IG Junio 2016
Laboratorio de Espectrometría de Masas MALDI-TOF (Upo)
EQUIPAMIENTO
a) Miniprotean® Tetra-cell (Bio-Rad)
Electrophoresis cell for 1-D or 2-D gel electrophoresis to
run up to four minigels (7 x 8 cm) at the same time.
b) IPGphor (GE Healthcare)
Unit for Isoelectric focusing equipped with individual Strip
Holders (6 of 24 cm and 6 of 7 cm long) and a Manifold
Unit (to run up to 12 Immobiline DryStrips from 7 to 24 cm
at the same time).
c) Ettan Dalt six (GE Healthcare)
Electrophoresis cell for 2-D able to run up to 6 maxi gels
(24 x 20 cm) at the same time.
d) ÄKTA Explorer (GE Healthcare)
Platform for protein purification
Encuentro CABD-IG Junio 2016
e) BiacoreTM X100 (GE Healthcare)
f) Typhoon 9410 and Image scanner III
(GE Healthcare)
g) ChemiDoc XRS
Encuentro CABD-IG Junio 2016
1. Abengoa Research (Sevilla): Caracterización de celulasas.
2. IBVF-CSIC (Sevilla): Análisis proteómico de plantas de fresas.
3. Centro Médico Trigrama (Canarias): Análisis de los efectos de la ingesta de
placenta en mujeres tras el parto.
4. Universal Diagnostics, S.L. (Sevilla): Caracterización diferencial de proteínas
en plasma humano.
5. Estación Experimental El Zaidín-CSIC (Granada): Caracterización de la unión
de un regulador transcripcional a su región promotora mediante SPR.
6. CABIMER (Sevilla): Análisis de interacción de la alfa-sinucleína con la
chaperona Hsp70 mediante SPR.
7. Bionaturis: Purificación de proteínas.
8. Instituto de Biología Molecular e Celular (Oporto): Caracterización del
fosfoproteoma de discos imaginales de Drosophila.
SERVICIOS EXTERNOS
Encuentro CABD-IG Junio 2016
Encuentro CABD-IG Junio 2016
PROTEÓMICA APLICADA A BACTERIAS DE INTERÉS MEDIOAMBIENTAL
Laura Tomás Gallardo, Eduardo Santero y Belén Floriano
Visualización del 3% de la proteína presente en cada spot. Visualización del 97% de la proteína presente en cada spot.
Encuentro CABD-IG Junio 2016
2D-DIGE (Difference gel electrophoresis)
T/G
N/G
Naftaleno/tetralina
Encuentro CABD-IG Junio 2016
Tomás-Gallardo, L., Canosa, I., Santero, E., Camafeita, E., Calvo, E., López, J.A., and B. Floriano*. 2006. Proteomic and transcriptional characterization of aromatic degradation pathways in Rhodococcus sp. strain TFB. Proteomics 6:119-132. Tomás-Gallardo, L., Santero, E., Camafeita, E., Calvo, E., Schlömann, M., and B. Floriano*. 2009. Molecular and biochemical characterization of the tetralin biodegradation pathway in Rhodococcus sp. strain TFB. Microbial Biotechnology 2:262-273. Tomás-Gallardo, L., Santero, E., and Floriano B*. 2012. Involvement of a putative CRP-like binding sequence and a CRPlike protein in glucose-mediated catabolite repression of thn genes in Rhodococcus sp. strain TFB. Applied and Environmental Microbiology 78:5460-5462. Tomás-Gallardo, L., Gómez-Álvarez, H., Santero, E., and B. Floriano*, B. 2014. Combination of degradation pathways for naphthalene utilization in Rhodococcus sp. strain TFB. Microbial Biotechnology 7:100-113.
Encuentro CABD-IG Junio 2016
Encuentro CABD-IG Junio 2016
Proteome-wide search for PP2A substrates in fission yeast. Manuel Bernal, Jacob Zhurinsky, Ana B.
Iglesias-Romero, Maria A. Sanchez-Romero, Ignacio Flor-Parra, Laura Tomas-Gallardo, Antonio J. Perez-
Pulido, Juan Jimenez and Rafael R. Daga. Proteomics 2014, 14, 1367–1380
Encuentro CABD-IG Junio 2016
Total protein staining with Coomassie based stain (left panels) and
phosphoprotein-specific staining with ProQ Diamond stain (right panels)
of Gpd1 protein spots resolved in 2D gel.
Encuentro CABD-IG Junio 2016
ECM-Regulator timp Is Required for Stem Cell Niche Organization and Cyst Production in the
Drosophila Ovary. Pearson JR, Zurita F, Tomás-Gallardo L, Díaz-Torres A, Díaz de la Loza MdC, Franze K,
Martín-Bermudo D, Acaimo González-Reyes (2016). PLoS Genet 12(1): e1005763.
Proteómica cuantitativa sin gel
iTRAQ (isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation)
Encuentro CABD-IG Junio 2016
Encuentro CABD-IG Junio 2016
Chaperoned amyloid proteins for immune manipulation: a-Synuclein/Hsp70 shifts immunity toward a
modulatory phenotype. Adahir Labrador-Garrido, Marta Cejudo-Guillen, Rebecca Klippstein, Erwin J. De
Genst, Laura Tomas-Gallardo, María M. Leal, Javier Villadiego, Juan J. Toledo-Aral, Christopher M. Dobson,
David Pozo, & Cintia Roodveldt. Immunity, Inflammation and Disease. 2014; 2(4): 226–238
SPR (Surface Plasmon Resonance)
Servicio de Proteómica y Bioquímica
CABD
(ponga una proteína en su proyecto)
Responsable científico: Belén Floriano Pardal
Responsable técnico: Laura Tomás Gallardo
MUCHAS GRACIAS