Embed Size (px)
Citation preview
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
Seminario de Guadalupe, diciembre 2004Seminario de Guadalupe, diciembre 2004Las Humanidades y el Patrimonio Cultural: Los Monumentos y la MeLas Humanidades y el Patrimonio Cultural: Los Monumentos y la Memoriamoria
CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS
Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en las
Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona
Ekaterina AkatovaInstituto de Recursos Naturales y Agrobiologia
Consejo Superior de Investigaciones CientíficasSevilla
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
¡Preservar nuestro patrimonio cultural es
un problema de importancia global!
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
Biodeterioración
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
85
6 9
2
10
13
41 – Mausoleo circular2 – Tumba de Elefante3 – Tumba de los 4 departamentos3 –Tumba de las Guirnaldas5 – Tumba de Servilia6 – Mausoleo cuadrangular7 – Tumba de las 4 columnas8 – Mausoleo circular9 – Tumba de Postumio10 – Centro de Recepcion de visitantes y sede administrativa
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
Tumba de Postumio
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
Tumba de Servilia
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
Eflorescencia
pinturas murales
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
La selección de las
muestras
DGGE
La extracción de ADN
La amplificacion16SrADN(616F,907R - para bacterias y
CYA107F, CYA781Ra:Rb–para cianobacterias)
La clonación
La secuenciación los clones
La Selecciónlos clones por DGGE
El esquema del experimento
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
La selección de las
muestras
DGGE
La extracción de ADN
La clonación
La secuenciación los clones
La Selecciónlos clones por DGGE
La amplificacion16SrADN(616F,907R - para bacterias y
CYA107F, CYA781Ra:Rb–para cianobacterias)
El esquema del experimento
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
La muestra U21 de laTumba de Servilia
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
La muestra Z26 de laTumba de Postumio
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
Tumba de Servilia
BS 2003
U21 2005*
YYY* 2006
Tumba de Postumio
Z26 2005
Z26* 2006*
*- el año de la limpieza
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
La selección de las
muestras
DGGE
La extracción de ADN
La amplificacion16SrADN(616F,907R - para bacterias y
CYA107F, CYA781Ra:Rb–para cianobacterias)
La clonación
La secuenciación los clones
La Selecciónlos clones por DGGE
El esquema del experimento
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
La selección de las
muestras
DGGE
La extracción de ADN
La amplificacion16SrADN(616F,907R - para bacterias y
CYA107F, CYA781Ra:Rb–para cianobacterias)
La clonación
La secuenciación los clones
La Selecciónlos clones por DGGE
El esquema del experimento
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
La selección de las
muestras
DGGE
La extracción de ADN
La amplificacion16SrADN(616F,907R - para bacterias y
CYA107F, CYA781Ra:Rb–para cianobacterias)
La clonación
La secuenciación los clones
La Selecciónlos clones por DGGE
El esquema del experimento
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
La selección de las
muestras
DGGE
La extracción de ADN
La amplificacion16SrADN(616F,907R - para bacterias y
CYA107F, CYA781Ra:Rb–para cianobacterias)
La clonación
La secuenciación los clones
La Selecciónlos clones por DGGE
El esquema del experimento
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
La selección de las
muestras
DGGE
La extracción de ADN
La amplificacion16SrADN(616F,907R - para bacterias y
CYA107F, CYA781Ra:Rb–para cianobacterias)
La clonación
La secuenciación los clones
La Selecciónlos clones por DGGE
El esquema del experimento
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
La selección de las
muestras
DGGE
La extracción de ADN
La amplificacion16SrADN(616F,907R - para bacterias y
CYA107F, CYA781Ra:Rb–para cianobacterias)
La clonación
La secuenciación los clones
La Selecciónlos clones por DGGE
El esquema del experimento
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
La selección de las
muestras
DGGE
La extracción de ADN
La amplificacion16SrADN(616F,907R - para bacterias y
CYA107F, CYA781Ra:Rb–para cianobacterias)
La clonación
La secuenciación los clones
La Selecciónlos clones por DGGE
El esquema del experimento
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
DGGE perfiles de las comunidades debacterias cianobacterias
Tumba de PostumioTumba de Servilia2003BS
2006*Z26*
2005Z26
2005*U21
2006YYY*
Tumba de PostumioTumba de Servilia2003BS
2006*Z26*
2005Z26
2005*U21
2006YYY*
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
Z26
Z26*
U21
BS
YYY*
UPGMA dendrogramas
Bacteriascianobacterias
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
Tumba de PostumioTumba de Servilia2003BS
2006*Z26*
2005Z26
2005*U21
2006YYY*
91% Trichodesmium sp.
94% Chroococcidiopsis sp. 94% Cyanidium sp. (alga roja)
92% Cyanobacterium sp.
90% Cyanothece sp.
92% Synechocystis sp.
Los miembros de la comunidad de cianobacterias
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
Los miembros de comunidad bacteriana
Tumba de PostumioTumba de Servilia2003BS
2006*Z26*
2005Z26
2005*U21
2006YYY*
γ-Proteobacteria
NitrospiraeFirmicutes
β-Proteobacteria
α-Proteobacteria
Actinobacteria
Cyanobacteria
Bacteroidetes
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
Tumbade Postumio
Tumba de Servilia
Z262005
Z26*2006*
BS2003
U212005*
YYY*2006
Actinobacteria 37,5 58,4 54,5 37 44Bacteroidetes 18,75 11 14 8,5 34,5Cianobacteria 12,5 8,3 8,7 14 6α-Proteobacteria 3,75 8,5 3,3 11,5 9,5β-Proteobacteria 7,5 5,5 6,5 6 6γ-Proteobacteria 20 8,3 13 14 -Firmicutes - - - 6 -Nitrospirae - - - 3 -
Los porcentajes de los grupos filogénicos en las comunidades de las muestras investigadas
*- el año de la limpieza
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
Tumbade Postumio
Tumba de Servilia
Z262005
Z26*2006*
BS2003
U212005*
YYY*2006
Actinobacteria 37,5 58,4 54,5 37 44Bacteroidetes 18,75 11 14 8,5 34,5Cianobacteria 12,5 8,3 8,7 14 6α-Proteobacteria 3,75 8,5 3,3 11,5 9,5β-Proteobacteria 7,5 5,5 6,5 6 6γ-Proteobacteria 20 8,3 13 14 -Firmicutes - - - 6 -Nitrospirae - - - 3 -
Los porcentajes de los grupos filogénicos en las comunidades de las muestras investigadas
*- el año de la limpieza
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
Tumba de Postumio
Tumba de Servilia
Z262005
Z26*2006*
BS2003
U212005*
YYY*2006
Actinobacteria 37,5 58,4 54,5 37 44Bacteroidetes 18,75 11 14 8,5 34,5Cianobacteria 12,5 8,3 8,7 14 6α-Proteobacteria 3,75 8,5 3,3 11,5 9,5β-Proteobacteria 7,5 5,5 6,5 6 6γ-Proteobacteria 20 8,3 13 14 -Firmicutes - - - 6 -Nitrospirae - - - 3 -
Los porcentajes de los grupos filogénicos en las comunidades de las muestras investigadas
*- el año de la limpieza
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
Tumba de Postumio
Tumba de Servilia
Z262005
Z26*2006*
BS2003
U212005*
YYY*2006
Actinobacteria 37,5 58,4 54,5 37 44Bacteroidetes 18,75 11 14 8,5 34,5Cianobacteria 12,5 8,3 8,7 14 6α-Proteobacteria 3,75 8,5 3,3 11,5 9,5β-Proteobacteria 7,5 5,5 6,5 6 6γ-Proteobacteria 20 8,3 13 14 -Firmicutes - - - 6 -Nitrospirae - - - 3 -
Los porcentajes de los grupos filogénicos en las comunidades de las muestras investigadas
*- el año de la limpieza
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
•Monitorización del desarrollo de comunidades microbianas en as Tumbas
de la Necrópolis Romana de Carmona. Ekaterina Akatova
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
97% 99%
Propionibacterium sp.
92% Saccharopolyspora sp.
96%97%91%94%
Rubrobacter sp.
93%87% Kibdelosporangium sp.
Pseudomonas sp.99%100%
Tumba de Postumio
Tumba de Servilia
2003BS
2006*Z26*
2005Z26
2005*U21
2006YYY*
γ-Proteobacteria
β-Proteobacteria
α-Proteobacteria
Actinobacteria
Nordella sp.94%95%
97% Mesorhizobium sp. 99% Phyllobacterium sp.
98% Acinetobacter sp.
94% Salinisphaera sp.90% Alkalilimnicola sp.99% Stenotrophomonas sp.
95% Mycobacterium sp.99% Micrococcus sp.97%99%
Arthrobacter sp.
93% Saccharothrix sp. 95% Pseudonocardia sp.
82%93% Ralstonia sp.99%
TTéécnicas avanzadas de diagncnicas avanzadas de diagnóóstico. Cesstico. Cesááreo reo SSááiziz
INSTITUTO DE RECURSOS NATURALES Y AGROBIOLOGIA, SEVILLA Y RED TEMATICA DEL CSIC DE PATRIMONIO HISTORICO Y CULTURAL
ConclusionesLas comunidades de cianobacterias de las Tumbas de Servilia y Tumba de Postumio
son diferentes.La comunidad bacteriana de la muestra YYY* de la Tumda de Servilia que fue recogida
después de 1 año del la tratamiento de restauración fue más parecida a la muestra Z26 de la Tumba de Postumio que fue recogienda antes de estos procedimientos que de otras muestras de la Tumba de Servilia.Los miembros de las comunidades de cianobacterias de las Tumbas de Servilia y
Postumio tienen porcentajes de similitud de secuencia menores de 95%. Esto indica que las cianobacterias correspondientes podría ser miembros de grupos filogenéticos nuevos o todavía no descritos.El grupo filogénico predominante en todas las muestras es Actinobacteria. Los porcentajes de Actinobacteria y α-Proteobacteria subieron después de los
tratamientos de restauración. Estos grupos podria ser los más resistentes a estos procedimientos.
La mayoría de las secuencias pertenecen a microorganismos no cultivables.
