43
Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis Ulrich Jordis

Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Literatur- und Informationssuche in

naturwissenschaftlichen Datenbanken806746 VO

Ulrich Jordis

Ulrich Jordis

Page 2: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

""THE AGE OF THE AGE OF INFORMATIONINFORMATION""

Page 3: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis
Page 4: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Education in Chemistry Education in Chemistry DatabasesDatabases

• Education of all chemists as end-users of electronic information

• Foundation of the use of professional information retrieval in the curricula

GDCh Program

Page 5: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Educational Goals:

• Knowledge about Databases and Retrieval Languages

• Precise Formulation of Problem & Strategy

• Knowledge about existing Databases

• Creation of Personal Databases

Page 6: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Wachstum der LiteraturWachstum der Literatur

1999: 21.000.000

Page 7: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Wachstum der LiteraturWachstum der Literatur

Page 8: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Growth of Computer Power: Growth of Computer Power: Additions / secAdditions / sec

10000

100000

1000000

10000000

100000000

1000000000

1971 1974 1979 1982 1985 1989 1993 1995

Page 9: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Chemie Information im Chemie Information im InternetInternet

• U. Jordis Chemistry Bookmarks

• TU Bibliothek

• Garry Wiggins

• Chemical Abstracts

• BeilsteinBeilstein

• Datenbanken ETH Zürich

• STN Database Summary Sheets

Page 10: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Media for Chemistry DatabasesMedia for Chemistry Databases

• PCPC

• CD-ROMCD-ROM

• IN-HOUSEIN-HOUSE

• ON-LINEON-LINE

• INTERNETINTERNET

Page 11: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Types of DatabasesTypes of Databases

• Structure

• Facts

• Bibliographic

• Spectra

Page 12: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

IN-HOUSEIN-HOUSE

• Beilstein Crossfire

• SpecInfo

• Gmelin

• Cambridge Crystallographic Data

• ISIS/Host Reaction Databases

Page 13: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Logische OperatorenLogische Operatoren

PesticidesInsecticides

Herbicides

„Pest“

InsecticidesPesticidesHerbicides

OR

ResiduesSolvents

Page 14: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Computer and Chemical Information

Topic Today 2000

ComputerLiteracy

Low-Moderate

Moderate-High

Tele-Communi-cations

ModerateUsage

INTERNETeverywhere

Programs &Interfaces

Not easy touse, bugs

User friendly

Graphics Usage inInfancy

PredominantUse

Page 15: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis
Page 16: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Beilstein und Beilstein Crossfire

• http://www.infochem.ethz.ch/Xfire.html

General SachregisterGeneral Formelregister

Hauptwerk (HW) 1779-1909EI 1910-1919EII 1920-1929EIII 1939-1949EIV 1950-1959EV 1960-1979

Einzelregister:EV Formula Index z.B. 17-19, 20-22

Zitierweise Beilstein:Hauptwerk 0-25-326EII/EIV 3/4-25-2588

5-25-11-98

Page 17: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis
Page 18: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

STN on the WebSTN on the Web

• Start Demo

Page 19: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Beispiel eines Datensatzes (=record):

JournalartikelAN CA98(9):65037k CATI Isolation, identification, and synthesis of

the major sulpiride metabolite in primatesAU Brennan, J . J .; Imondi, A. R.;

Westmoreland, D. G.; Williamson, M. J .CS Corp. Health Saf. Dep., Rohm Haas Co.LO Bristol, PA 19007, USASO J . Pharm. Sci., 71(11), 1199-203SC 1-2 (Pharmacology)SX 27DT JCO J PMSAEIS 0022-3549PY 1982LA EngGI

AB Isolation by column chromatog. and purifn.by high-performance liq. chromatog.(HPLC), with subsequent identification byFourier transform NMR, chem. ionizationmass spectroscopy, HPLC, andunambiguous chem. synthesis has shownthat the major urinary metabolite ofsulpiride (I; R = H) [15676-16-1] in themonkey (Macaca mulatta) is N-[(1-ethyl-5-oxo-2-pyrrolidinyl)methyl]-5- sulfamoyl-2-anisamide (I; R = :O) [84367-96-4].

KW sulpiride metabolite isolation prepn;pyrrolidinylanisamide prepn isolation

IT Urine (sulpiride metabolite in monkey)IT Macaca mulatta (sulpiride urinary

metabolite in)IT 15676-16-1 (metab. of, in monkey)IT 84285-37-0P (prepn. and ammonolysis of)IT 84367-95-3P (prepn. and reaction with

methoxysulfamoylbenzoyl chloride)IT 84285-35-8P (prepn. and redn. of)

Page 20: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Feldbezeichnungen nach Codes AB Abstract Text

AC Application Country AD Application Date AI Application Information (selects and appends / AP) AN Accession Number AP Application Number APPS Application and Priority Number (appends / APPS) AU Author AY Application Year CO CODEN CS Corporate Source DS Designated States DT Document Type IC IPC, Main and Secondary ICA Additional (Supplementary) IPC ICI Index (Complementary) IPC ICM IPC, Main ICS IPC, Secondary IN Inventor Name IPC IPC (selects IC, ICA, ICI and appends / IPC) IS ISSN (International Standard Serial Number) IT Index Entries (appends / BI)

Page 21: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Feldbezeichnungen nach Codes (2) KW Keywords (appends / BI)

LA Language LO Corporate Source or Patent Assignee Location NCL National Patent Classification Code OS Other Source PA Patent Assignee PATS Patent Numbers (selects PN and appends / PATS) PC Patent Country PCS Patent Countries (selects PC and DS and appends / PCS) PD Publication Date PI Patent Information (selects and appends / PN) PK Kind of Patent PN Patent Number PRAI Priority Information (selects and appends / PRN) PRC Priority Country PRD Priority Date PRN Priority Number PRY Priority Year PY Publication Year RN CAS Registry Number SC Chemical Abstracts Section Code and Title SO Source (Name of J ournal) SX Chemical Abstract Section Cross-Reference Code TI Title of Document

Page 22: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Beispiel Datensatz Patent

• AN CA101(11):90755f LCA• TI Substituted N-

benzenesulfonyloxyphthalimides• IN Selassie, Cynthia Dias; Lien, Eric Jung-Chi• PA University of Southern California• LO USA• SO PCT Int. Appl., 28 pp.• PI WO 8400888 A1 840315• DS W: JP RW: AT, BE, CH, DE, FR, GB, LU, NL, SE

• AI WO 83-US1328 830830• PRAI US 82-413947 820901• SC 27-11 (Heterocyclic Compounds (One Hetero

Atom))• SX 1• DT P• CO PIXXD2• PY 1984• LA Eng• IC A61K031-40; C07D209-48• GI For diagram(s), see printed CA Issue

• AB Title phthalimides I (R = NH2, OH, NHCONH2, NHCSNH2, NHAc, NHOH, NHNH2, NHCHO, NHSO2Me) were prepd. Thus, di-Et 4-aminophthalate was treated with Na and HONH2, and the product was treated with PhSO2Cl to give I (R = NH2), which exhibited antitumor and antiviral activity.

• KW phthalimide benzenesulfonyloxy prepn antitumorantiviral*** ; benzenesulfonyloxyphthalimide *prepn antitumor*antiviral

• IT Neoplasm inhibitors Virucides and Virustats ((benzenesulfonyloxy)phthalimide derivs.)

• IT 7803-49-8, reactions(cyclocondensation of, with aminophthalate ester)

• IT 610-27-5 (esterification of, by ethanol)

• IT 91517-75-8P (prepn. and antitumor and*antiviral*** activity of)

Page 23: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Display Formats BIB AN, plus Bibliographic DataCBIB AN, plus Bibliographic Data (compact display)IBIB BIB, indented, with text labelsSTD BIB, IPC, and NCLISTD STD format, indentedALL AN, BIB, Abstract, and Index DataMAX Same as ALLIALL ALL, indented, with text labelsABS AN, plus AbstractAPPS Application and Priority InformationIPC International Patent ClassificationIND Indexind dataCAN List of CA abstract numbers without answer numbersHIT - Fields containing hit termsHITRN Index fields containing hit CAS Registry NumbersHITIND Index fields containing hit termsKWIC Hit term plus 20 words on either sideOCC Number of occurrence of hit term and field in which it

occurs

Page 24: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

http://phoenix.tuwien.ac.at/http://phoenix.tuwien.ac.at/

[email protected]@pop.tuwien.ac.at

Page 25: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

3D Searching: Query

Page 26: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

3D Result: Physiostigmine Derivat!

Page 27: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

3D Searching: Building the Query

Page 28: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Search / Same Transformation / Narrow / Yield >95 % finds:

Page 29: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Suche nach Mulzer 1997

Page 30: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

View Scheme

Page 31: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Suchmaschinen Vergleich

Alta

Vista

Yaho

o

Hot

Bot

Info

Seek

Alad

in

Excit

e

Mag

ellan

Web

Craw

lerLy

cos

Ope

n Te

xt

Heliobacterpylori

65 (ca.700)

2102AltaVista

70 32 1 79more

like this

245find

similar

201 16 16

Farbstoff-datenbank*

0 0 0 1 - 0 0 0 3 0

Molecularmodellingsoftware

>5000 3 6419 64 5102 503 217753

2 -

Lebensborn 54 1 68 32 - 80 4 3 11 6

Page 32: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Finished Query

Page 33: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Search Results: ChemInform RXL

Page 34: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Search Example

RSS Query:

Find examples of Diels-Alder reactionsusing methacrylates as reactant

Page 35: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Molecule Searches

• Select Search Type

• Select molecule role Add structure

Page 36: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

ACD/Prices

Page 37: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

ACD

Page 38: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Beilstein Crossfire: Commander

Page 39: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Crossfire Structure Editor

Zurück zum

Commander

Page 40: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Crossfire Structure Search

Page 41: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Help (F2) Available Fields

Page 42: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Searching Structures and Facts

Page 43: Literatur- und Informationssuche in naturwissenschaftlichen Datenbanken 806746 VO Ulrich Jordis

Crossfire Display Hits