IPOL Journal: Image Processing On Line Principe et ... · Citations et indexation en cours, actuellement indexe par :´ ... Demonstration en ligne peut convaincre un reviewer pour

IPOL Journal: Image Processing On LinePrincipe et experience en geometrie discrete

Bertrand Kerautret

LORIA - Equipe ADAGIO

En collaboration avec:Nicolas Limare et Jean-Michel Morel (CMLA ENS Cachan)

Journees ”Informatique et Geometrie”LORIA, 14-15 novembre 2013

http://www.ipol.im

B. Kerautret IPOL Journal: Image Processing On Line JIG 2013- LORIA 1 / 18

http://www.ipol.im

1. Presentation du journal IPOL 1.1 Origine et motivation

IPOL Journal : origine et motivation

Origine

Journal initie vers octobre 2009.

Sous l’initiative de Nicolas Limare, Jean-Michel Morel et l’equipe Image du CMLA,ENS Cachan.

Premier article publie en 2010.

Motivation [Limare & Morel 2009]

Recherche reproductible.

Nouvelle facon de publier.

Permettre a tout le monde de tester les algorithmes :⇒ avec ses propres images.

Etre independant de la plateforme (pouvoir tester sans telecharger du code, sansmeme ressource systeme)


1. Presentation du journal IPOL 1.1 Origine et motivation

IPOL Journal : origine et motivation

Origine

Journal initie vers octobre 2009.

Sous l’initiative de Nicolas Limare, Jean-Michel Morel et l’equipe Image du CMLA,ENS Cachan.

Premier article publie en 2010.

Motivation [Limare & Morel 2009]

Recherche reproductible.

Nouvelle facon de publier.

Permettre a tout le monde de tester les algorithmes :⇒ avec ses propres images.

Etre independant de la plateforme (pouvoir tester sans telecharger du code, sansmeme ressource systeme)


1. Presentation du journal IPOL 1.2 Principe et forme actuelle

IPOL Journal : principe

Caracteristiques

Journal de recherche en traitement et analyse d’images.

Chaque article contient une description d’un algorithme et du code source.

Association d’un article avec sa demonstration en ligne, avec archives.

Processus de relecture/evaluation du texte et code source ainsi que lesdemonstrations.

Journal Open Source et de recherche reproductible.



IPOL Journal : principe (2)

Ce que IPOL n’est pas :

IPOL publie des algorithmes et leurs implementations, pas de logiciels.

IPOL n’est pas une bibliotheque logicielle (library).

IPOL n’est pas une plateforme logicielle ou de diffusion de code.



IPOL Journal : structure de la publication

Forme article ”classique” (pdf en ligne).

Demonstrations associees.Zone d’archive/historique des experimentations effectuees en ligne.




Forme article ”classique” (pdf en ligne).Demonstrations associees.

Zone d’archive/historique des experimentations effectuees en ligne.




Forme article ”classique” (pdf en ligne).Demonstrations associees.Zone d’archive/historique des experimentations effectuees en ligne.



IPOL Journal : structure editoriale

Aspect classique d’un journal :

Projet editorial, comite editorial.

Articles, auteurs, editeurs.

Processus de relecture et validation

ISSN, DOI.

Citations et indexation en cours, actuellement indexe par :Scirus, Google Scholar, DOAJ, SHERPA/RoMEO, Heloıse, WorldCat, Cross-Ref, Ulrich, Index Copernicus, PBN, JGate, VisionBib, CVonline, JournalSeekand NewJour.

Aspect logiciel :

Chaque article doit proposer une implementation.

Phase de relecture, verification validation et publication de l’implementation.

Rapporteurs : verifier la correspondance texte/code (+ lisibilite et doc du code)



IPOL Journal : structure editoriale

Aspect classique d’un journal :

Projet editorial, comite editorial.

Articles, auteurs, editeurs.

Processus de relecture et validation

ISSN, DOI.

Citations et indexation en cours, actuellement indexe par :Scirus, Google Scholar, DOAJ, SHERPA/RoMEO, Heloıse, WorldCat, Cross-Ref, Ulrich, Index Copernicus, PBN, JGate, VisionBib, CVonline, JournalSeekand NewJour.

Aspect logiciel :

Chaque article doit proposer une implementation.

Phase de relecture, verification validation et publication de l’implementation.

Rapporteurs : verifier la correspondance texte/code (+ lisibilite et doc du code)



IPOL Journal : soumission au niveau software

→ https://tools.ipol.im/wiki/ref/software_guidelines

Instruction niveau Software :

Langage : C89, C99 ou C++98

portable, 32/64-bits

libtiff, libjpeg, libpng, zlib, fftw, cblas ou clapack (+ libgsl, libeigen)

ligne de commande, non-interactive

max 1 Gb memoire et 30 s calcul en demo

formats PNG, TIFF, PNM, EPS, SVG, VRML ou PLY

info copyrightet brevet

doc essentielle README.txt

code correct et propre en anglais

commentaires pour chaque fonction et partie non triviale du code


https://tools.ipol.im/wiki/ref/software_guidelines

1. Presentation du journal IPOL 1.3 Impacts du journal

IPOL Journal : impact

Quelques chiffres :

48 articles publies depuis 2010.

37 en cours d’evaluation.

200+ citations (Google Scholar).

Statistiques janv → sept 2013 :

100 000 visites.

25 000 telechargements (1/2 code/donnees, 1/2 pdf).




Quelques chiffres :

48 articles publies depuis 2010.

37 en cours d’evaluation.

200+ citations (Google Scholar).

Statistiques janv → sept 2013 :

100 000 visites.

25 000 telechargements (1/2 code/donnees, 1/2 pdf).




Impact des demonstrations en ligne

Test immediat sans aucun investissement.

Incitation a comparer les methodes (quelque soit le resultat).

Verifier les resultats annonces dans l’article.

Mesurer tres rapidement les limites ou la pertinence de l’algorithme/code parrapport a un probleme donne.

Impact pour les auteurs

FeedBack utilisateur (a travers l’historique des images testees).

Detection de problemes particuliers ou nouveaux cas.

Mesure direct de la robustesse (niveau parametre ou type de donnees).

Impact pour la publication/reviewer

Demonstration en ligne peut convaincre un reviewer pour la publication.































IPOL Journal : impact (3)

Utilisation demonstrations en ligne (periode 2013 : janvier → septembre)

50 000 experiences.

20 000 donnees originales d’experiences (100/j)

75 000 archives, 170 Go, 1500 archives/demos

Exemple demonstration de l’article LSD (detection de droite)→ 11 300 experimentations



IPOL Journal : impact (3)

Utilisation demonstrations en ligne (periode 2013 : janvier → septembre)

50 000 experiences.

20 000 donnees originales d’experiences (100/j)

75 000 archives, 170 Go, 1500 archives/demos

Exemple demonstration de l’article LSD (detection de droite)→ 11 300 experimentations


2. Experience Edition speciale DGCI 2.1 Organisation

Edition speciale IPOL sur la geometrie discrete (DGCI 2011)

Edition speciale IPOL : Geometrie Discrete

Proposition d’une edition speciale lors de la Conference Internationale DGCI(2011-LORIA)→ En lien avec la premiere edition d’une ”special demonstration session” .

Constitution d’un groupe editorial : J. Batenburg (University of Antwerp, Belgique)D. Coeurjolly (Lyon ,France), B. Kerautret (Loria, France), U. Kothe (UniversitatHamburg, Germany), J.-O Lachaud (Chambery, France), T. Lewiner (UniversidadeCatolica do Rio de Janeiro ; Brasil).

Selection d’articles issus la conference DGCI

11 contributions potentiellement selectionnables.

3 ne souhaitaient pas soumettre (manque de temps ou pas precise).

Limite a 6 articles selectionnes.






















2. Experience Edition speciale DGCI 2.2 Processus d’edition

Processus d’edition : mise en oeuvre

Trois phases dans le processus de publication :

Relecture du texte, description de l’algorithme.

Relecture du code.

Construction des demonstrations en ligne.

Nouvelle initiative :

Premiere edition speciale IPOL.

Modification du mode de publication de la partie texte :format HTML → format PDF.

Gestion des relectures :gestion manuelle → gestion par OJS.



Processus d’edition : mise en oeuvre

Trois phases dans le processus de publication :

Relecture du texte, description de l’algorithme.

Relecture du code.

Construction des demonstrations en ligne.

Nouvelle initiative :

Premiere edition speciale IPOL.

Modification du mode de publication de la partie texte :format HTML → format PDF.

Gestion des relectures :gestion manuelle → gestion par OJS.



Processus d’edition : mise en oeuvre (2)

Avantages de l’aspect ”edition speciale”

Premiere selection et evaluation deja effectuee sur les articles conferences.→ sur les 6 articles, 4 etaient des articles publies a la conference.

Favoriser l’ouverture/echange des communautes (image/geometrie).

Mutualisation de l’experience des contraintes sur le code.

Exemple de mutualisation : exploitation de la bibliotheque [DGtal]

Deux articles partagent la meme structure de code exploitant la librairie.→ version speciale modifiee : uniquement des dependances statiques.

Processus de review du code plus facile dans ce cadre ”simplifie”.

Le code est globalement deja valide/documente dans DGtal.



Processus d’edition : mise en oeuvre (2)

Avantages de l’aspect ”edition speciale”

Premiere selection et evaluation deja effectuee sur les articles conferences.→ sur les 6 articles, 4 etaient des articles publies a la conference.

Favoriser l’ouverture/echange des communautes (image/geometrie).

Mutualisation de l’experience des contraintes sur le code.

Exemple de mutualisation : exploitation de la bibliotheque [DGtal]

Deux articles partagent la meme structure de code exploitant la librairie.→ version speciale modifiee : uniquement des dependances statiques.

Processus de review du code plus facile dans ce cadre ”simplifie”.

Le code est globalement deja valide/documente dans DGtal.


2. Experience Edition speciale DGCI 2.3 Resultat de l’edition speciale

Resultat de l’edition speciale :

Bilan

6 articles acceptes apres modifications et reviews.

6 demonstrations en ligne proposees aux auteurs.

Code exploite dans les demonstrations egalement publie.

Liste des articles :Digital Level Layers for Digital Curve Decomposition and VectorizationLaurent Provot, Yan Gerard, Fabien Feschet

A Streaming Distance Transform Algorithm for Neighborhood-Sequence DistancesNicolas Normand, Robin Strand, Pierre Evenou, Aurore Arlicto

A near-linear time guaranteed algorithm for digital curve simplification under the Frechet distanceIsabelle Sivignon

Interactive segmentation based on component-treesBenoıt Naegel, Nicolas Passat

Extraction of Connected Region Boundary in Multidimensional ImagesDavid Coeurjolly, Bertrand Kerautret, Jacques-Olivier Lachaud

Meaningful Scales Detection : an Unsupervised Noise Detection Algorithm for Digital ContoursBertrand Kerautret, Jacques-Olivier Lachaud, Jacques-Olivier Lachaud

Demonstration en locale du serveur de demo :

http://127.0.0.1:8080/

Demonstration en ligne du serveur de test :

http://kerrecherche.iutsd.uhp-nancy.fr:81


http://127.0.0.1:8080/




Bilan











http://127.0.0.1:8080/




http://127.0.0.1:8080/




Bilan











http://127.0.0.1:8080/




http://127.0.0.1:8080/


3. Evolution et orientation actuelle 3.1 Evolution

Evolution du journal

Principales nouveautes en cours [LesTreilles 2013]

Nouveau processus de generation automatiques de demonstrations.→ Dans les cas de demonstrations standards (image en entre, image en sortie).

Extension vers d’autres standards de langages (autre que C/C++)→ prototypes de demonstrations basees Matlab

Reflexion pour l’ouverture vers une speciale issue ”Informatique Graphique”.→ prototypes deja testes.

Nouveau Journal J-RASP (oriente audio) porte par L. Oudre


























3. Evolution et orientation actuelle 3.2 Nouvelles orientations


Serveurs de demonstrations delocalises

Diminuer les contraintes de soumission par rapport aux dependances de librairies.

Faciliter la soumission pour d’autres specialites.

Alleger la charge en calcul du serveur principal.

Nouveau serveur commande et heberge au LORIA

Installation du meme moteur de demonstration.

Rajout de librairies orientees geometrie (DGtal, GCal ou autre).

Maintenance avec des choix etudies sur les librairies disponibles.

→ Initiative suivie aussi avec une branche ”Computer Vision” (OpenCV).


























4. Conclusion

Conclusion

Nouveau type de publications

Valorisant niveau de la qualite d’une publication.

Demande un effort mais moteur pour l’impact.

Experience grandissante pour le processus de publication.

Aspect au dela de la ”publication”

Mesure de l’utilisation des resultats de recherche (au dela des comunautesthematiques).

Mettre en evidance des domaines d’application.

Nouvel outil de collaborations/experimentations.


4. Conclusion

Conclusion










4. Conclusion

Conclusion










4. Conclusion

References

Limare N. and Morel, J-M (2009)IPOL Project Presented at the CMLA Seminarhttp://www.ipol.im/news/20091022_cmla/s5.htmlCMLA ENS Cachan

DGtal TeamDGtal : Digital Geometry tools and algorithms libraryhttp://libdgtal.org

Limare, N (november 2013)IPOL : publications scientifiques avec logiciel et demo webhttp://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.820160LIRIS Lyon

Limare, N (June 2012)Recherche reproductible, qualite logicielle, publication et interfaces en ligne pour le traitement d’imagehttp://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00783299Ecole normale superieure de Cachan - ENS Cachan

(July 2013)Report on the Workshop on Reproducible Research in Signal, Image, and Geometric ProcessingFondation Les Treilles, July 22-27, 2013


http://www.ipol.im/news/20091022_cmla/s5.html

http://libdgtal.org

http://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.820160

http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00783299

Documents

IPOL Journal: Image Processing On Line Principe et ... · Citations et indexation en cours, actuellement indexe par :´ ... Demonstration en ligne peut convaincre un reviewer pour