11
MS/MS Fragmenta-on of RTSNIKFQD Found in An-gen 85 complex A (Ag85A) (Mycolyl transferase 85A, Fibronec-nbinding protein A) Mycobacterium tuberculosis H37Rv 3804c Ions Score: 17 # b b ++ b* b* ++ b 0 b 0++ Seq. y y ++ y* y* ++ y 0 y 0++ # 1 301.2105 151.1089 284.1839 142.5956 R 9 2 402.2581 201.6327 385.2316 193.1194 384.2476 192.6274 T 952.4734 476.7404 935.4469 468.2271 934.4629 467.7351 8 3 489.2902 245.1487 472.2636 236.6354 471.2796 236.1434 S 851.4258 426.2165 834.3992 417.7032 833.4152 417.2112 7 4 603.3331 302.1702 586.3065 293.6569 585.3225 293.1649 N 764.3937 382.7005 747.3672 374.1872 746.3832 373.6952 6 5 716.4172 358.7122 699.3906 350.1989 698.4066 349.7069 I 650.3508 325.6790 633.3243 317.1658 632.3402 316.6738 5 6 844.5121 422.7597 827.4856 414.2464 826.5015 413.7544 K 537.2667 269.1370 520.2402 260.6237 519.2562 260.1317 4 7 991.5805 496.2939 974.5540 487.7806 973.5700 487.2886 F 409.1718 205.0895 392.1452 196.5763 391.1612 196.0842 3 8 1119.6391 560.3232 1102.6126 551.8099 1101.6285 551.3179 Q 262.1034 131.5553 245.0768 123.0420 244.0928 122.5500 2 9 D 134.0448 67.5260 116.0342 58.5207 1

IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

  • Upload
    others

  • View
    1

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

MS/MS  Fragmenta-on  of  RTSNIKFQD  Found  in    An-gen  85  complex  A  (Ag85A)  (Mycolyl  transferase  85A,  Fibronec-n-­‐binding  protein  A)  -­‐  Mycobacterium  tuberculosis  H37Rv  3804c  

Ions  Score:  17  

#   b   b++   b*   b*++   b0   b0++   Seq.   y   y++   y*   y*++   y0   y0++   #  

1   301.2105   151.1089   284.1839   142.5956   R   9  

2   402.2581   201.6327   385.2316   193.1194   384.2476   192.6274   T   952.4734   476.7404   935.4469   468.2271   934.4629   467.7351   8  

3   489.2902   245.1487   472.2636   236.6354   471.2796   236.1434   S   851.4258   426.2165   834.3992   417.7032   833.4152   417.2112   7  

4   603.3331   302.1702   586.3065   293.6569   585.3225   293.1649   N   764.3937   382.7005   747.3672   374.1872   746.3832   373.6952   6  

5   716.4172   358.7122   699.3906   350.1989   698.4066   349.7069   I   650.3508   325.6790   633.3243   317.1658   632.3402   316.6738   5  

6   844.5121   422.7597   827.4856   414.2464   826.5015   413.7544   K   537.2667   269.1370   520.2402   260.6237   519.2562   260.1317   4  

7   991.5805   496.2939   974.5540   487.7806   973.5700   487.2886   F   409.1718   205.0895   392.1452   196.5763   391.1612   196.0842   3  

8   1119.6391   560.3232   1102.6126   551.8099   1101.6285   551.3179   Q   262.1034   131.5553   245.0768   123.0420   244.0928   122.5500   2  

9   D   134.0448   67.5260   116.0342   58.5207   1  

Page 2: IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

MS/MS  Fragmenta-on  of  MSGLLDPSQ  Found  in  An-gen  85  complex  A  (Ag85A)  Mycobacterium  tuberculosis  H37Rv  3804c  

#   b   b++   b0   b0++   Seq.   y   y++   y*   y*++   y0   y0++   #  

1   132.0478   66.5275   M   9  

2   219.0798   110.0435   201.0692   101.0382   S   816.4098   408.7085   799.3832   400.1953   798.3992   399.7032   8  

3   276.1013   138.5543   258.0907   129.5490   G   729.3777   365.1925   712.3512   356.6792   711.3672   356.1872   7  

4   389.1853   195.0963   371.1748   186.0910   L   672.3563   336.6818   655.3297   328.1685   654.3457   327.6765   6  

5   502.2694   251.6383   484.2588   242.6330   L   559.2722   280.1397   542.2457   271.6265   541.2617   271.1345   5  

6   617.2963   309.1518   599.2858   300.1465   D   446.1882   223.5977   429.1616   215.0844   428.1776   214.5924   4  

7   714.3491   357.6782   696.3385   348.6729   P   331.1612   166.0842   314.1347   157.5710   313.1506   157.0790   3  

8   801.3811   401.1942   783.3706   392.1889   S   234.1084   117.5579   217.0819   109.0446   216.0979   108.5526   2  

9   Q   147.0764   74.0418   130.0499   65.5286   1  

Ions  Score:  17    

Page 3: IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

MS/MS  Fragmenta-on  of  QSGLSIVMPV  Found  in  An-gen  85  complex  B  (Ag85B)  Mycobacterium  tuberculosis  H37Rv  1886c  

Ions  Score:  18    

Page 4: IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

MS/MS  Fragmenta-on  of  QELDEISTNI  Found  in  EsxB  (10  kDa  culture  filtrate  an-gen)    -­‐  Mycobacterium  tuberculosis  H37Rv  3874  

Ions  Score:  44    

#   Immon.   a   a*   a0   b   b*   b0   Seq.   v   w   w'   y   y*   y0   #  

1   101.0709   101.0709   84.0444   129.0659   112.0393   Q   10  

2   102.0550   230.1135   213.0870   212.1030   258.1084   241.0819   240.0979   E   1115.5691   1114.5739   1189.6059   1172.5794   1171.5953   9  

3   86.0964   343.1976   326.1710   325.1870   371.1925   354.1660   353.1819   L   1002.4851   1001.4898   1060.5633   1043.5368   1042.5527   8  

4   88.0393   458.2245   441.1980   440.2140   486.2195   469.1929   468.2089   D   887.4581   886.4629   947.4792   930.4527   929.4687   7  

5   102.0550   587.2671   570.2406   569.2566   615.2620   598.2355   597.2515   E   758.4155   757.4203   832.4523   815.4258   814.4417   6  

6   86.0964   700.3512   683.3246   682.3406   728.3461   711.3196   710.3355   I   645.3315   658.3519   672.3675   703.4097   686.3832   685.3991   5  

7   60.0444   787.3832   770.3567   769.3727   815.3781   798.3516   797.3676   S   558.2994   557.3042   590.3256   573.2991   572.3151   4  

8   74.0600   888.4309   871.4044   870.4203   916.4258   899.3993   898.4153   T   457.2518   470.2722   472.2514   503.2936   486.2671   485.2831   3  

9   87.0553   1002.4738   985.4473   984.4633   1030.4687   1013.4422   1012.4582   N   343.2088   342.2136   402.2459   385.2194   2  

10   86.0964   1115.5579   1098.5313   1097.5473   1143.5528   1126.5263   1125.5422   I   230.1248   243.1452   257.1608   288.2030   271.1765   1  

Page 5: IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

MS/MS  Fragmenta-on  of  NIVNMLHGV  Found  in  EsxP  (puta-ve  ESAT-­‐6  like  protein)  -­‐  Mycobacterium  tuberculosis  H37Rv  2347c  

#775   Immon.   a   a*   b   b*   Seq.   v   w   w'   y   y*   #  

1   87.0553   87.0553   70.0287   115.0502   98.0237   N   9  

2   86.0964   200.1394   183.1128   228.1343   211.1077   I   980.5094   993.5298   1007.5455  1038.5877  1021.5611   8  

3   72.0808   299.2078   282.1812   327.2027   310.1761   V   881.4410   894.4614   925.5036   908.4771   7  

4   87.0553   413.2507   396.2241   441.2456   424.2191   N   767.3981   766.4029   826.4352   809.4087   6  

5   104.0528   544.2912   527.2646   572.2861   555.2595   M   636.3576   635.3624   712.3923   695.3657   5  

6   86.0964   657.3752   640.3487   685.3702   668.3436   L   523.2736   522.2783   581.3518   564.3253   4  

7   110.0713   794.4342   777.4076   822.4291   805.4025   H   386.2146   468.2677   451.2412   3  

8   30.0338   851.4556   834.4291   879.4505   862.4240   G   331.2088   314.1823   2  

9   72.0808   950.5240   933.4975   978.5189   961.4924   V   230.1248   243.1452   274.1874   257.1608   1  

Page 6: IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

MS/MS  Fragmenta-on  of  EALATLVVN  Found  in  GroEL  1  (60  kDa  chaperonin)-­‐  Mycobacterium  tuberculosis  H37Rv  3417c    

#   b   b++   b0   b0++   Seq.   y   y++   y*   y*++   y0   y0++   #  

1   130.0499   65.5286   112.0393   56.5233   E   9  

2   201.0870   101.0471   183.0764   92.0418   A   800.4876   400.7475   783.4611   392.2342   782.4771   391.7422   8  

3   314.1710   157.5892   296.1605   148.5839   L   729.4505   365.2289   712.4240   356.7156   711.4400   356.2236   7  

4   385.2082   193.1077   367.1976   184.1024   A   616.3665   308.6869   599.3399   300.1736   598.3559   299.6816   6  

5   486.2558   243.6316   468.2453   234.6263   T   545.3293   273.1683   528.3028   264.6550   527.3188   264.1630   5  

6   599.3399   300.1736   581.3293   291.1683   L   444.2817   222.6445   427.2551   214.1312   4  

7   698.4083   349.7078   680.3978   340.7025   V   331.1976   166.1024   314.1710   157.5892   3  

8   797.4767   399.2420   779.4662   390.2367   V   232.1292   116.5682   215.1026   108.0550   2  

9   N   133.0608   67.0340   116.0342   58.5207   1  

Ions  Score:  14  

Page 7: IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

MS/MS  Fragmenta-on  of  IPTKRSETFT  Found  in  Chaperone  protein  dnaK  (Heat  shock  protein  70)  -­‐  Mycobacterium  tuberculosis  H37Rv  0350    

Ions  Score:  27  

#   b   b++   b*   b*++   b0   b0++   Seq.   y   y++   y*   y*++   y0   y0++   #  

1   114.0913   57.5493   I   10  

2   211.1441   106.0757   P   1066.5528   533.7800   1049.5262   525.2667   1048.5422   524.7747   9  

3   312.1918   156.5995   294.1812   147.5942   T   969.5000   485.2536   952.4734   476.7404   951.4894   476.2483   8  

4   440.2867   220.6470   423.2602   212.1337   422.2762   211.6417   K   868.4523   434.7298   851.4258   426.2165   850.4417   425.7245   7  

5   596.3879   298.6976   579.3613   290.1843   578.3773   289.6923   R   740.3573   370.6823   723.3308   362.1690   722.3468   361.6770   6  

6   683.4199   342.2136   666.3933   333.7003   665.4093   333.2083   S   584.2562   292.6318   566.2457   283.6265   5  

7   812.4625   406.7349   795.4359   398.2216   794.4519   397.7296   E   497.2242   249.1157   479.2136   240.1105   4  

8   913.5102   457.2587   896.4836   448.7454   895.4996   448.2534   T   368.1816   184.5944   350.1710   175.5892   3  

9   1060.5786   530.7929   1043.5520   522.2796   1042.5680   521.7876   F   267.1339   134.0706   249.1234   125.0653   2  

10   T   120.0655   60.5364   102.0550   51.5311   1  

Page 8: IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

MS/MS  Fragmenta-on  of  ATTLPVQR  Found  in  Heat  Shock  protein  HspX  (α-­‐crystallin)  -­‐  Mycobacterium  tuberculosis  H37Rv  2031c  

#   Immon.   a   a*   a0   b   b*   b0   Seq.   v   w   w'   y   y*   y0   #  

1   44.0495   44.0495   72.0444   A   8  

2   74.0600   145.0972   127.0866   173.0921   155.0815   T   768.4363   781.4567   783.4359   814.4781   797.4516   796.4676   7  

3   74.0600   246.1448   228.1343   274.1397   256.1292   T   667.3886   680.4090   682.3883   713.4305   696.4039   695.4199   6  

4   86.0964   359.2289   341.2183   387.2238   369.2132   L   554.3045   553.3093   612.3828   595.3562   5  

5   70.0651   456.2817   438.2711   484.2766   466.2660   P   457.2518   456.2565   499.2987   482.2722   4  

6   72.0808   555.3501   537.3395   583.3450   565.3344   V   358.1833   371.2037   402.2459   385.2194   3  

7   101.0709   683.4087   666.3821   665.3981   711.4036   694.3770   693.3930   Q   230.1248   229.1295   303.1775   286.1510   2  

8   129.1135   R   74.0237   73.0284   175.1190   158.0924   1  

Page 9: IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

MS/MS  Fragmenta-on  of  HADEGASKLP  Found  in  34KD_MYCTU  (34  kDa  an-genic  protein  homolog)  -­‐  Mycobacterium  tuberculosis  H37Rv  0954  

Ions  Score:  29  

#   b   b++   b*   b*++   b0   b0++   Seq.   y   y++   y*   y*++   y0   y0++   #  

1   138.0662   69.5367   H   10  

2   209.1033   105.0553   A   887.4469   444.2271   870.4203   435.7138   869.4363   435.2218   9  

3   324.1302   162.5688   306.1197   153.5635   D   816.4098   408.7085   799.3832   400.1953   798.3992   399.7032   8  

4   453.1728   227.0901   435.1623   218.0848   E   701.3828   351.1951   684.3563   342.6818   683.3723   342.1898   7  

5   510.1943   255.6008   492.1837   246.5955   G   572.3402   286.6738   555.3137   278.1605   554.3297   277.6685   6  

6   581.2314   291.1193   563.2209   282.1141   A   515.3188   258.1630   498.2922   249.6498   497.3082   249.1577   5  

7   668.2634   334.6354   650.2529   325.6301   S   444.2817   222.6445   427.2551   214.1312   426.2711   213.6392   4  

8   796.3584   398.6828   779.3319   390.1696   778.3478   389.6776   K   357.2496   179.1285   340.2231   170.6152   3  

9   909.4425   455.2249   892.4159   446.7116   891.4319   446.2196   L   229.1547   115.0810   2  

10   P   116.0706   58.5389   1  

Page 10: IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

MS/MS  Fragmenta-on  of  SLENYIAQT  Found  in  immunogenic  protein  MPT64  -­‐  Mycobacterium  tuberculosis  H37Rv  1980c  

#   Immon.   a   a*   a0   b   b*   b0   Seq.   v   w   w'   y   y*   y0   #  

1   60.0444   60.0444   42.0338   88.0393   70.0287   S   9  

2   86.0964   173.1285   155.1179   201.1234   183.1128   L   1049.5011   1048.5058   1107.5793   1090.5528   1089.5687   8  

3   102.0550   302.1710   284.1605   330.1660   312.1554   E   920.4585   919.4632   994.4952   977.4687   976.4847   7  

4   87.0553   416.2140   399.1874   398.2034   444.2089   427.1823   426.1983   N   806.4155   805.4203   865.4526   848.4261   847.4421   6  

5   136.0757   579.2773   562.2508   561.2667   607.2722   590.2457   589.2617   Y   643.3522   751.4097   734.3832   733.3992   5  

6   86.0964   692.3614   675.3348   674.3508   720.3563   703.3297   702.3457   I   530.2681   543.2885   557.3042   588.3464   571.3198   570.3358   4  

7   44.0495   763.3985   746.3719   745.3879   791.3934   774.3668   773.3828   A   459.2310   475.2623   458.2358   457.2518   3  

8   101.0709   891.4571   874.4305   873.4465   919.4520   902.4254   901.4414   Q   331.1724   330.1772   404.2252   387.1987   386.2146   2  

9   74.0600   992.5047   975.4782   974.4942   1020.4997   1003.4731   1002.4891   T   230.1248   243.1452   245.1244   276.1666   259.1401   258.1561   1  

Page 11: IonsScore: 17 - NISCAIRnopr.niscair.res.in/bitstream/123456789/31736/10/IJEB 53... · 2016-07-20 · 6$ 617.2963 309.1518$ 599.2858 300.1465 D$ 446.1882 223.5977$ 429.1616 215.0844

MS/MS  Fragmenta-on  of  LTRDIEEV  Found  in  KatG  Mycobacterium  tuberculosis  H37Rv  1908c    

#   b   b++   b*   b*++   b0   b0++   Seq.   y   y++   y*   y*++   y0   y0++   #  

1   114.0913   57.5493   L   8  

2   215.1390   108.0731   197.1285   99.0679   T   1194.5671   597.7872   1177.5405   589.2739   1176.5565   588.7819   7  

3   371.2401   186.1237   354.2136   177.6104   353.2296   177.1184   R   1093.5194   547.2633   1076.4929   538.7501   1075.5088   538.2581   6  

4   486.2671   243.6372   469.2405   235.1239   468.2565   234.6319   D   937.4183   469.2128   919.4077   460.2075   5  

5   599.3511   300.1792   582.3246   291.6659   581.3406   291.1739   I   822.3913   411.6993   804.3808   402.6940   4  

6   728.3937   364.7005   711.3672   356.1872   710.3832   355.6952   E   709.3073   355.1573   691.2967   346.1520   3  

7   857.4363   429.2218   840.4098   420.7085   839.4258   420.2165   E   580.2647   290.6360   562.2541   281.6307   2  

8   956.5047   478.7560   939.4782   470.2427   938.4942   469.7507   V   451.2221   226.1147   433.2115   217.1094   1  

Ions  Score:  27