Upload
internet
View
114
Download
4
Embed Size (px)
Citation preview
Influência de Parâmetros Influência de Parâmetros Ambientais na Variação Ambientais na Variação
Populacional de Moluscos Populacional de Moluscos Biomphalaria glabrata em Biomphalaria glabrata em
Carne de Vaca - GOCarne de Vaca - GOBaseado no artigo: Fu, S. C.; Baseado no artigo: Fu, S. C.; Milne, G. Epidemic modelling Milne, G. Epidemic modelling
using cellular automata. In using cellular automata. In Proceedings of the 1st Australian Proceedings of the 1st Australian
Conference on Artificial Life Conference on Artificial Life (ACAL.03)(ACAL.03), Canberra, December , Canberra, December
2003, pp. 43-57. 2003, pp. 43-57. Por Jones, Marco e Silvana
AgendaAgenda
Definição de célulaDefinição de célula Definição de mundoDefinição de mundo Parâmetros de simulação Parâmetros de simulação Regras de transiçãoRegras de transição
Definição física da célulaDefinição física da célula
Cada célula define uma porcentagem Cada célula define uma porcentagem do espaço a ser modelado. No caso do espaço a ser modelado. No caso de Carne de Vaca, esta porcentagem de Carne de Vaca, esta porcentagem é de 0.1%. A área modelada em é de 0.1%. A área modelada em Carne de Vaca, baseada no Mapa de Carne de Vaca, baseada no Mapa de Helen, é de 3.2Km x 1.1Km, o que dá Helen, é de 3.2Km x 1.1Km, o que dá 3.41Km3.41Km22. Assim cada célula terá . Assim cada célula terá 3.41m3.41m2,2,, em forma de quadrado com , em forma de quadrado com que vizinhança de Moore. que vizinhança de Moore.
Definição dos Parâmetros Definição dos Parâmetros da Célulada Célula
Parâmetros (Estados)Parâmetros (Estados) Carrying capacityCarrying capacity
Vide protocolo de campo. Observar se por Vide protocolo de campo. Observar se por cluster de ponto de coleta se os parâmetros cluster de ponto de coleta se os parâmetros ficam mais precisos em ordem de grandezaficam mais precisos em ordem de grandeza
Total populationTotal population Marco vai responder quantos moluscos, no Marco vai responder quantos moluscos, no
máximo, cabem em 1mmáximo, cabem em 1m22! Em Carne de Vaca. ! Em Carne de Vaca. Suposição: Suposição: Aquário de 1mAquário de 1m22 e 30cm de e 30cm de profundidade, 500 caramujos! (baseado profundidade, 500 caramujos! (baseado em experiência de laboratório)em experiência de laboratório)
Definição de MundoDefinição de Mundo
Matriz retangular bidimensional de Matriz retangular bidimensional de células. A área modelada em Carne de células. A área modelada em Carne de Vaca, baseada no Mapa de Helen, é de Vaca, baseada no Mapa de Helen, é de 3.2Km x 1.1Km, o que dá 3.41Km3.2Km x 1.1Km, o que dá 3.41Km22
Os limites do mundo são barreiras Os limites do mundo são barreiras impenetráveis (impenetráveis (sistema micro sistema micro canônicocanônico, canônico e gran , canônico e gran canônico?canônico?). Como um autômato com ). Como um autômato com condições de contorno FECHADAScondições de contorno FECHADAS
Parâmetros de SimulaçãoParâmetros de Simulação
São utilizados na definição das São utilizados na definição das regras de transição.regras de transição.
Todos os dados serão Todos os dados serão determinísticos.determinísticos.
Parâmetros de Simulação Parâmetros de Simulação (cont.)(cont.)
São eles:São eles: Neighbourhood radius;Neighbourhood radius; Motion probability;Motion probability; Immigration probability;Immigration probability; Birth rate;Birth rate; Death rate;Death rate; Virus morbidity;Virus morbidity; Vectored infection probability;Vectored infection probability; Contact infection probability;Contact infection probability; Spontaneous infection probability;Spontaneous infection probability; Recovery probability;Recovery probability; Re-susceptible probability.Re-susceptible probability.
Raio da VizinhançaRaio da Vizinhança
Square Moore Square Moore neighbourhood.neighbourhood.
Usado na migração Usado na migração dos hospedeiros e dos hospedeiros e no avanço da no avanço da infecção.infecção.
Probabilidade de Probabilidade de Movimento x Taxa de Movimento x Taxa de
Infecção VetorialInfecção Vetorial Probabilidade de Probabilidade de
MovimentoMovimento Indica a saída de Indica a saída de
hospedeiros da sua hospedeiros da sua célula para uma célula para uma célula próxima.célula próxima.
Taxa de Infecção Taxa de Infecção VetorialVetorial Transmissão do Transmissão do
vírus através das vírus através das células. células.
inputvectored Pcapacityoodneighbourh
populationesusceptiblP
_
_
Regras de TransiçãoRegras de Transição
Fase de MovimentoFase de Movimento Fase de Infecção e CuraFase de Infecção e Cura
Fase de MovimentoFase de Movimento
Escolha uma célula do mundo.Escolha uma célula do mundo. Para cada indivíduo da célula, Para cada indivíduo da célula,
selecionar aleatoriamente um selecionar aleatoriamente um vizinho e mover o indivíduo para vizinho e mover o indivíduo para este vizinho de acordo com o este vizinho de acordo com o parâmetro “motion probability”.parâmetro “motion probability”.
Repita este passo em todas as Repita este passo em todas as células do mundo.células do mundo.
Fase de Infecção e CuraFase de Infecção e Cura
Selecione a 1ª célula.Selecione a 1ª célula. Retire da população as “mortes Retire da população as “mortes
naturais”.naturais”. Retire da população os indivíduos Retire da população os indivíduos
mortos devido à morbidade do vírus.mortos devido à morbidade do vírus. Adicione à população os recém-Adicione à população os recém-
nascidos.nascidos. Adicione à população os imigrantes.Adicione à população os imigrantes.
Fase de Infecção e Cura Fase de Infecção e Cura (cont.)(cont.)
Compute as infecções inter-células Compute as infecções inter-células (vetores);(vetores);
Compute as infecções intra-células Compute as infecções intra-células (contato);(contato);
Compute infecções espontâneas;Compute infecções espontâneas; Compute a cura dos hospedeiros;Compute a cura dos hospedeiros; Compute os que não ficaram imunes;Compute os que não ficaram imunes; Repita os passos para a próxima célula.Repita os passos para a próxima célula.
Resultados da SimulaçãoResultados da Simulação
Corredores de avanço da infecção.Corredores de avanço da infecção. Barreiras ao avanço.Barreiras ao avanço.
Corredores de Avanço da Corredores de Avanço da Infecção - CenárioInfecção - Cenário
Corredores de Avanço da Corredores de Avanço da Infecção - ParâmetrosInfecção - Parâmetros
Corredores de Avanço da Corredores de Avanço da Infecção - SimulaçãoInfecção - Simulação
Barreiras ao Avanço - Barreiras ao Avanço - CenárioCenário
Barreiras ao Avanço - Barreiras ao Avanço - ParâmetrosParâmetros
Barreiras ao Avanço - Barreiras ao Avanço - SimulaçãoSimulação
Considerações finaisConsiderações finais
Aumento de complexidade em Aumento de complexidade em relação ao jogo da vida:relação ao jogo da vida: Conformação das células;Conformação das células; N° de estados;N° de estados; Regras de transição;Regras de transição; Dois raios de vizinhos.Dois raios de vizinhos.
Considerações finais Considerações finais (cont.)(cont.)
Contextualização com a Contextualização com a esquistossomose:esquistossomose: População recuperada?População recuperada? Modelagem da infecção!Modelagem da infecção! 2 raios de vizinhos.2 raios de vizinhos. E a modelagem das coleções de água?E a modelagem das coleções de água?