9
Cloning, sequence analysis, and expression of the genes encoding lytic functions of Bacteriophage Ogle 鋸ay&Ok蓋a,M櫨ik◎Kakik我 響a議,Ka灘y◎Yam我daa,Ak三raTaketob,Ken-Ichi]Kodairaa, aん盈}1εc諺 夏ar8めどogy6蔑》鐸ジ ,C海ε解ica!andβめcherrcicalE鷺9錘8ε 霞 羅9,Fαc駕琵yρプEngineering,T《)yα 吻 αUniversiり ㌧3190,Go.f'uku, Toga灘,Toga灘93α 」吻 αη わ」匿)ε μz搾燐ε寵 ρプ8ぎoc海8桝 誌 甜yI ,auk厩Medicalscゐoo♂,atsuoka,F麗 ん鷹,auk厩910-11,Japan A轟鑓臨雛 丁瓶e豊ysisg¢ 嫉o諏 鰐P恥 φ菖1¢w¢r¢clo麟,一,,鑓dexpressedinE3c海 厩co∫ ∫.Nucleotjdesequencing ◎f&3813-bpφ菖1¢DNArev《 妻a叢 ¢(藍嚢v愈s臆cc奮ss重v¢oP¢n・frames(ORF),IZorf50,Roげ 〃8,hol,andゆ ・∫andRorプ175,i捻the sa鑓eD潤As重ra磁.Byc◎ 蹴p簾 滋ive ';of癒e亙)NAse騨ence,重hepugativeholproduct(holin)hasanestimatedmolecular 聡ig厩ls14,2藍D禽,鍛dco滋 滋 聡s重wopotentialtranseinbran¢helicesa鷺dh重ghlychargedN-andC-termini,resemblingpredicted 奴01i聡(whichar¢th◎4t◎beacy鑑o夢las翻c瓢e鵬bra雛e頑sr腿P纐9μoteln)e皿codedbyotherphagessuchasmvlfrom 趣`励 伽5触r9頗6織 肱c∫lr紹9鰯 盆swe且蚕asmo取ocl麗 飽 ◎mL醜 紘Ontheotherhand,theputativeogle μod獣(墨ys垂 簸)◎ 目8.鰍D農sh翻ss蓋g磁c蹴s重mila鱒w曲presumed澱ura難idase,knownasaceUwaHpeptidoglyca獄 δe暮ra(i茎nge薮2y搬e,e薮cod6{量 わy重he乙露αo西αc諺『麗5P難a蓼e雛v亙 雛簸dφ隷dh,th¢・L鐸cεococα 彦εlactisphageφLC3,and£he∫ 裏アeptococcus ㈱o趨8pぬ 箆g¢sCp4,Cp-7a鶏 δCp3.Whe簸expressedinE.coli,theφg丑elysinand/orhdindecreasedthecemu罫bidity 8i慕 説 翌y,S継9暮es竃i誼9撫 毛曲 φ騒i¢hol-1yssy鵬 甑si蹟VdV¢d量 賎 。ytolyt三cpr◎ceSS. 蚕(ε ン脚rds:懲&αe∫めernφ 蓼1¢;Lac纏c3cidb我c驚 姦 窺;Lysi簸;H◎li競;腿u宴a燃idase;「DNAsequence 焦璽醜騰轟¢麟露 蔓》寛eva璽e鷺ceof璽ys◎9ξ)nyinvar量 ◎鷲slac額caddbac重e]〔ia 致asbee簸rep◎ 鴬ed(D舗ds◎ 登e電a丑。199◎).F◎rre夏 餓se ◎f脚 彦e鷺yp麟c1¢s鋤 伽h◎ 就cd1,suc簸lys◎genic P捻gesap脚 震総 畳G◎d鐙seω ダ鐙zymes,w短c簸deg撒de 癒曲 ◎s寛ce婁le鯉e坤ec◎雛s塁s臨毬ofseve罫a茎structural Go搬P◎ne鷺 重ssuc薮aspep娠d◎菖置yGa鷺1ayer議 難dcy童o- Plas鵬icm《}勲br甕 登e,a難d鑓1e璽ysisgenesseer睡 £ob¢ 《}xpτesseδ 鷲簸dera《 ⊃o醗P販ca象 ¢dc◎ntr◎茎,asi簸the colやha慧 ¢1a鑛 わd義sys叢e雛(食)rareview,s¢eY◎ 購薮蓼, 勝2)。 亘ns¢v鍛IP難ages,撫 ¢cyt◎1ytic脚cess難asbe¢n pres囎¢d宅odepe簸d聯 ◎貸 重w◎ 擁a答 ¢-e聡c◎ded叢ysis P減 鋤s.丁 難e餓 ¢k総 ◎w鷺asa難01泌 豊c弍s墨es玉o麗 童h¢cy蹄 璽段s搬ic鷹 曲ra鷺e,thro認麟w短c難t加 ◎撫er 玉麺sp顛ei簸 搬med豊ys癒 む駐e翫le嬢量y瀬e覆sed宅◎ 出 ¢P戯 丁薮dys沁sbelo簸9給a墓 難P◎ ダ 麟rei籍 d¢騨di豊解 麗yme細u膿midase),羅 曲av曲e。 磁ivide" into several subgroups: lysozyme, glycosidase, amidasc or endopeptidase (for reviews, see Young, 1992; Sabi( and Lortal, 1995). Several presumptive lysins and holins have been re- ported from phages of lactic acid bacteria: Oadh frorr Lactobacillus gasseri (Henrich et al., 1995), mvl and mv4 from Lactobacillus bulgaricus (Boizet et al., 1990) and OLC3 (Birkeland, 1994) and Tuc2009 (Arendt et al. 1994) from Lactococcus lactis. In contrast to coliphage lambda (Young, 1992 Campbell, 1994) and P2 (Ziermann et al., 1994), molecu- lar details on the lytic pathway of the phages from lactic acid bacteria are still insufficient; thus structure, expres- sion, function and enzymatic feature on the phage genes mostly remain to be elucidated (Young, 1992. Sable and Lortal, 1995). Recently, we isolated a new Lactobacillus phage termed Ogle, which contains an about 42.5-kbp DNA and identified the major phage capsid genes (Kakikawa et al., 1996). In this report, we described structures of Ogle genes related to cytolytic process, and theii expressions in E. coli.

functions of Bacteriophage Ogle - COnnecting REpositories · 2017. 4. 23. · 2.3.Ex躍 謡徽 ガψ91898麟 鍛駐coli E.coliXL璽 一b1鵬carryi薮gareco曲i難 煎 幽smld, whlc熱c

  • Upload
    others

  • View
    0

  • Download
    0

Embed Size (px)

Citation preview

Page 1: functions of Bacteriophage Ogle - COnnecting REpositories · 2017. 4. 23. · 2.3.Ex躍 謡徽 ガψ91898麟 鍛駐coli E.coliXL璽 一b1鵬carryi薮gareco曲i難 煎 幽smld, whlc熱c

Cloning, sequence analysis, and expression of the genes encoding lytic

functions of Bacteriophage Ogle

瀬 鋸ay&Ok蓋a,M櫨ik◎Kakik我 響a議,Ka灘y◎Yam我daa,Ak三raTaketob,Ken-Ichi]Kodairaa,

aん 盈}1εc諺夏ar8め どogy6蔑 》鐸ジ,C海 ε解ica!andβ めcherrcicalE鷺9錘8ε 霞羅9,Fαc駕 琵yρ プEngineering,T《)yα 吻 αUniversiり ㌧3190,Go.f'uku,

Toga灘,Toga灘93α 」吻 αη

わ」匿)εμz搾 燐 ε寵 ρプ8ぎoc海8桝 誌甜yI,auk厩Medicalscゐoo♂,atsuoka,F麗 ん鷹,auk厩910-11,Japan

A轟鑓臨 雛

丁瓶e豊ysisg¢ ・ 嫉o諏 磁 鰐P恥 郷 φ菖1¢w¢r¢clo麟,一,,鑓dexpressedinE3c海 醜 厩co∫ ∫.Nucleotjdesequencing

◎f&3813-bpφ 菖1¢DNArev《 妻a叢¢(藍嚢v愈s臆cc奮ss重v¢oP¢n・frames(ORF),IZorf50,Roげ 〃8,hol,andゆ ・∫andRorプ175,i捻the

sa鑓eD潤As重ra磁.Byc◎ 蹴p簾 滋ive  ';of癒e亙)NAse騨ence,重hepugativeholproduct(holin)hasanestimatedmolecular

聡ig厩ls14,2藍D禽,鍛dco滋 滋聡s重wopotentialtranseinbran¢helicesa鷺dh重ghlychargedN-andC-termini,resemblingpredicted

奴01i聡(whichar¢th◎4t◎beacy鑑o夢las翻c瓢e鵬bra雛e頑sr腿P纐9μoteln)e皿codedbyotherphagessuchasmvlfrom

趣`励 磁 伽5触r9頗6織 幽 曲 飾 鵬 捻 伽 肱c∫lr紹9鰯 飢 盆swe且 蚕asmo取ocl麗 飽◎mL醜 紘Ontheotherhand,theputativeogle

躰 μod獣(墨ys垂 簸)◎ 目8.鰍D農sh翻ss蓋g磁c蹴s重mila鱒w曲presumed澱ura難idase,knownasaceUwaHpeptidoglyca獄 一

δe暮ra(i茎nge薮2y搬e,e薮cod6{量 わy重he乙 露αo西 αc諺『麗5P難a蓼e雛v亙 雛簸dφ 隷dh,th¢ ・L鐸cεococα 彦εlactisphageφLC3,and£he∫ 裏アeptococcus

解 ㈱o趨8pぬ 箆g¢sCp4,Cp-7a鶏 δCp3.Whe簸expressedinE.coli,theφg丑elysinand/orhdindecreasedthecemu罫bidity

8i慕磁 ㈱ 説 翌y,S継9暮es竃i誼9撫 毛曲 φ騒i¢hol-1yssy鵬 甑si蹟VdV¢d量 賎 。ytolyt三cpr◎ceSS.

蚕(εン脚rds:懲&αe∫ めernφ 蓼1¢;Lac纏c3cidb我c驚 姦窺;Lysi簸;H◎li競;腿u宴a燃idase;「DNAsequence

焦 璽醜騰轟 ¢麟 露

蔓》寛eva璽e鷺ceof璽ys◎9ξ)nyinvar量 ◎鷲slac額caddbac重e]〔ia

致asbee簸rep◎ 鴬ed(D舗ds◎ 登e電a丑 。199◎).F◎rre夏 餓se

◎f脚 彦e鷺yp麟c1¢s鋤 搬 伽h◎ 就cd1,suc簸lys◎genic

P捻gesap脚 震 総 畳G◎d鐙seω ダ鐙zymes,w短c簸deg撒de

癒 曲 ◎s寛ce婁le鯉e坤ec◎ 雛s塁s臨 毬ofseve罫a茎structural

Go搬P◎ne鷺 重ssuc薮aspep娠d◎ 菖置yGa鷺1ayer議 難dcy童o-

Plas鵬icm《}勲br甕 登e,a難d鑓1e璽ysisgenesseer睡 £ob¢

《}xpτesseδ 鷲簸dera《 ⊃o醗P販ca象 ¢dc◎ntr◎ 茎,asi簸the

colやha慧 ¢1a鑛 わd義sys叢e雛(食)rareview,s¢eY◎ 購薮蓼,

勝2)。

亘ns¢v鍛IP難ages,撫 ¢cyt◎1ytic脚cess難asbe¢n

pres囎 ¢d宅odepe簸d聯 ◎貸 重w◎ 擁a答 ¢-e聡c◎ded叢ysis

P減 鋤s.丁 難e餓 ¢k総 ◎w鷺asa難01泌 櫨 豊c弍s墨es玉o麗 燈

童h¢cy蹄 璽段s搬ic鷹 曲ra鷺e,thro認 麟w短c難t加 ◎撫er

玉麺sp顛ei簸 搬med豊ys癒 幡 む駐e翫le嬢 量y瀬e覆sed宅 ◎

出 ¢P戯 幽 鎌 丁薮dys沁sbelo簸9給a墓 難P◎ ダ麟rei籍

d¢騨di豊 解 麗yme細u膿midase),羅 曲av曲e。 磁ivide"

into several subgroups: lysozyme, glycosidase, amidasc or endopeptidase (for reviews, see Young, 1992; Sabi( and Lortal, 1995).

Several presumptive lysins and holins have been re-ported from phages of lactic acid bacteria: Oadh frorr Lactobacillus gasseri (Henrich et al., 1995), mvl and mv4 from Lactobacillus bulgaricus (Boizet et al., 1990) and OLC3 (Birkeland, 1994) and Tuc2009 (Arendt et al. 1994) from Lactococcus lactis.

In contrast to coliphage lambda (Young, 1992 Campbell, 1994) and P2 (Ziermann et al., 1994), molecu-lar details on the lytic pathway of the phages from lactic acid bacteria are still insufficient; thus structure, expres-sion, function and enzymatic feature on the phage genes mostly remain to be elucidated (Young, 1992. Sable and Lortal, 1995).

Recently, we isolated a new Lactobacillus phage termed Ogle, which contains an about 42.5-kbp DNA and identified the major phage capsid genes (Kakikawa et al., 1996). In this report, we described structures of

Ogle genes related to cytolytic process, and theii expressions in E. coli.

Page 2: functions of Bacteriophage Ogle - COnnecting REpositories · 2017. 4. 23. · 2.3.Ex躍 謡徽 ガψ91898麟 鍛駐coli E.coliXL璽 一b1鵬carryi薮gareco曲i難 煎 幽smld, whlc熱c

2。 擁 鍾 ¢撫 昼§踊d朧 馨磁 磯 §

2.1,翫o勲 α,擁 卿,纒 耀 蜘5諏`お

Th晦s◎ 騨icL照 ぬc'撫5s£ra癬Glca簸di亀s童emper・

頴epha蓼 ¢φgjewere◎rig諭 εも登yis◎ 重鼠乞edi鷺o雛r蓋ab◎ratory

(Kakl髭awaeta1.,1996),顕d聡r¢pr◎pag叙edl簸M茎7

b猷h《Terza麟la簸dS鍛di鵜1975).TheE.融vector

P璽asmidspUC豆8,PUC118,鍛dpUC1藍9,雛dthe重rh◎s蜜

XL蓋 四b1臆eaj窪dC民111野8ご/蛋lac+wer《}f虻o鵬 ◎縫rlabora一

意◎蜜ystock(K◎d&豊ra¢ 重al.,19~ 》2),a職(量we罫epropa碁ated

i簸L猛ar2YThr◎ 豊h(SambrO◎ke乳aL,198攣).

22.護 蔀躍どy3ゴ∫《ぞブ乏)ハ1/童

α ◎鷺inga簸dsequeHcl聡 捷簸alysesofφgieDNAwere

ca綴edo滋esse賊ia且1yasdescribedbyKakik我waetal.

(璽9%).Rec◎mb漁 蹴 幽smidswere裏 瞭 ◎d醜cedi脚

F.coliXL1-b短ebyCat+一(量epende裁 竈ransf◎r搬at量 ◎鍛or

e豊ec鞭OP◎rati《 矯(Taketo,董98S).F併DNAse(lue戴cing,

V撮10鷺sde撤io霞cl◎ 聾¢swerec◎ 簸S翻uct¢dfromseve撒l

series◎f鰍riαlon丑ibr鋸yfr㈱ φ91eDNAIKak童Sawa

e童a蓋.,茎996)byex◎r践 旦dease(至iges竜 重on(Kodaira¢ 重aL,

茎勢 制 ぼheDNAse磯uc簸cewas戯em痴e曲yせhechal蕪

terinatian醗eξho(豊(Sa罰geretal.,1~ η7)。A賛o臨er

pr◎oe(i蟹eswereperf◎r拠e(iasdescribedprev玉o糠sly

(Kodairae塾aL,1994b).

2.3.Ex躍 謡 徽 ガψ91898麟 鍛 駐coli

E.coliXL璽 一b1鵬carryi薮gareco曲i難 煎 幽smld,

whlc熱c◎ 難重ai離s達heφ 蓼1eg¢ 雌es,wasgrownat25℃1魏

LBmedl騰c◎ 漁 翻 登g蹴pici撫(60μ 創ml)。When由c

A660◎f癒ecu1載 礎e飯a(i罫eadled◎.3,thegr◎w街tcmpeト

a蹴 ¢陥ss髄 ¢d秘 μ ◎37°Cwi出o罫wi癒 幟addi縫 ◎n

◎f亘s◎pr◎ 蔦)y1一β畷)一童ぬio慈農夏&c窺◎py鍛n◎sideαPTG}(員nal

c◎鷺ce駿t瞬 臓1㎜M),a薮d重hecellgrowthwas撚 ◎鶴1-

t鵬dby搬 ㈱ 躍i難9重 簸ec薮an蓼el瞼A66。.Activityofμ 一

galaαosldasew&sde建 ¢r瓢1簸ed蔑sfbll◎ws:E.ω 麗CKIH

parry置 鷲9我pl我sm羅 夢L19PPRwa$grow陰 滋25QCinLB

mcdi囎G◎ntai蜘 暮ampiGilli嬢(60μ 悪/m璽),鐙ds膿edto

37°Cwh鱗 撫eA66◎of重heculturehadruchedα3.A佐

ln愉v麓IS,a照liquOωft簸eCU董 醗ewasrem◎ved,C¢ 礁1-

f雛9磯 鍛d癒 ¢sup¢mat謎 滋 撫dw&sr¢serv¢d.β 一

G&且actos漁se顧 玉v蕪y癬 蓬hesupem漁 磁wasassay¢d

滋37℃ 翼sl簸暮0-n疑r◎phe簸yl一 β一9ぬc宅oslde(0,7mM)in

α1醸sod沁 搬ph◎sph飢eb賎 餓 うr(P冤遭73).Thcact豊v煮y

w薦 鯉 ◎聡dby贈as瓢1薮9浸42。of繍 脚 麩e鶴o葦released,

All◎ 童heギm紬ods  'nrinVIVC7exひeτ 重me窟swereas

desc罫 量bedprev量 ◎臆slybyKod雄a硫a1.〈1992).

24.撫 η 耀3醗4わ ∫oc舵 擁c認5

飛¢s建重Ct重o難¢羅zy麹至es,phageT尋DNA難gase,and畿 葺ka-

line凶os麟 撫se(calfl瓢estlne!werep騒rchasedfrom

T'akaraShuzo(Kyoto)andNipponGene(Toyama),

,"foreachenzymcswereasrecommendedbythe

蓬nanufacturers。

[x-32P]dCTPwasfromNEN.A蓋lothermaterials

wereasdescribedpreviouslybyKadairaetal.(1992}.

3。 艶s麟s翻 繍戯sc鵬 §量⑭髄

3.1,Sequence⑳ 助5な げthe吻geφ918姻59ε 魏ε5

8acter雲ophageφ91einducedfr◎maIysogenic

加 αo勧cl撫 ∬tral簸G董ehasadouble-strandedDNAof

approximately42.5kbp.decently,wehaveconstructed

aφ 琶1erestrictionreap,&nddetermlnedthenucle◎ 象idc

lnt)segcaenceso鍬)urstructuralgenes,G,P,B,andO,

whichcodeformajorcapsidproteins(Kakikawaetal.,

1.996}.

Downs芝reamofthegeneO,theextendedsequenci捻g

analysis◎fa38B-bpDNArevealed伽eORFsRoヴ50

(茎53bp),R《 》げ▼〃8(357bp),阪 ♪'(429bp},'y(1329bp),

袋ndRoψ75(528bp),inadditめntoa.min◎r・ ・

Roが94(285bp)andonetrunc飢edORFRolプ148

(Fig.1>.InFig.2,theDNAsequenceof38Bbpcon{ain-

ing撫eseORFs(geneOthroughRorf148)ispresented

togetherwiththeirpredictedaminoacid(aajsequences.

X111theC)RFsareencodedononestrand,andpreceded

byap◎tentialribos◎mebindingsequence,which{sin

goodagreementwi山 由oseofscvera1加 α0わ 如 伽3

(5㌦AGGAGG-3',Pouwe豆sandLcer,1993)alx蓋

勲cω`occ鋸(5'-AGAAAGGAGGT-3',LudwigetaL,

195;Schouleretai.,1934}genes.

figsdescribedbelow,thetwopotentialgenesholand

lysareprobablyinvolvedinbacterialcelllysis,andtheir

putativeμoduc竃sweretermedh◎linandlysin,respec一

亀ively.ノcolbeginswithATGatntposition978(Fig,2),

andcodesfarabasicprotein(holm)of142aa,whase

es瞼 飢edMWandp∫arc9450and14.2,respectively.

Gntheotherhand,tysstartswithGTGlocatedatnt

position1390(Fig.2),anditsputativeproduct(藍ys量n>

of422as(48.4・kDa.)量salsobasic(with9.700fpl).lys

hasonemarepotentialstartcolon(!-LTG}locatedatnt

pUSition1.432,althoughitsribosomalbindingsequence

(5'●CiCaA-3')isveryshort(Fig_2}_

1no撫erthreeORFsRα ヅ50,Roヴ118,andIRoヴ175

aswellasaminorORFRα ヅ94,theirputativeproducts

shownosignificantsimilaritiestootherprofeins,and

theirfunctionsinthedigledevelopmenthavenatbeen

ascer捻i且ed.Y簸gpRoヴ175,however,itsm至(圭dlcregions

sh●wsalimnedresemblance(30%identical,40%sim-

filar)蓬oalysisprotein,namedLysA,ofcohphageP2,

whichhasbeenpredictedtoplayaroleinthecorrect

timingoflysisgalthoughnonessential(Ziermannetal.,

1994).gpRoが50(50aa)lsveryacid三c(w嚢h3.850fpl),

a簸dhε 匿saleucine-richhydr◎phobicN-terminus(F{9.2),

Page 3: functions of Bacteriophage Ogle - COnnecting REpositories · 2017. 4. 23. · 2.3.Ex躍 謡徽 ガψ91898麟 鍛駐coli E.coliXL璽 一b1鵬carryi薮gareco曲i難 煎 幽smld, whlc熱c

Ec Ps 滅HiXb麟 とG SuDrHi 擁dεc}唱d3a費s彫 緒dEc

・ \〕噺 「/

薩1捻Pレ8し 《昔 》

,. 《号 夢

臥 籔8旺蝿し 《管 》

魏 雛 鰍$uしr;,f

夢u簑繊 耽

t".:1し

《号 》

《条 》

鱒 搏E網1し 《一 峯一

一一一

醜裏豊鰍

:1`.

c+》

《昔 夢

薩 量$蝋 鱒1《 壱 》

醜 薯8葱鰍 《一 襲

一 一一 一 コ一 '5f=.

置 呂.LPhysicalz簸apofセhcφ 暮1clyticge嚢cs.Th¢recombine飢plasmidsand癬eirpredictedlyticphenotypesareindicated.Thcco蝕structionof出e

r¢c◎mbina蹴plasr践 緑s至s滋 磁c縫 豊ed諭 了畿b}eLTh¢closedb◎xessh◎w胎eφgleDNAinner重sc豊o陰edu鍛derthe'αcZ'pfomoter.Thclyt韮cphcnotype

(+or-)WiLSpredlctedby出edecrease◎f£.coli¢ell匙 蟹bkii£yasshown藍nF1孟g.6.Ba,BurnHl;鷺c,EcoKI;Dr,Prα1;Hd,H腕dlII;}{i,Hincll;Ps,

1'stl;S雛,ε 鼻躍3Ai;X毫),♪ ぐわ鐸夏.

o簸 撫eo童herha賊 即Roヴ'148鼓 縫s翻argi蜘e-rich

N-te繊1TitYS,W短 曲S◎mc曲 滋rese曲1¢S撫e雛g量 血e一

鑑ichr駿 ◎笠if藪)雛簸d雲na蝕ti重err践h茎 我t◎rpro重 ¢i豊s◎fc◎璽ipぬa琶es

重&瓢bd盆 段簸dφ21,農 費dS認 蹴o麗8」髭肩yρ 腕溺鐸r・旗灘ph盆 慈eP22

(f◎rareview,se露 蟹da籔dDreyf魏ss,1勢4).

3.2.5醜cε 灘lc肱 耀 言e臨 ∫c3(ゾ漉εφ91ε 秒5魏

φ9蓋e至ysi鍍sha,resS重 慈賊妻}c暴登tsim銭 縁ritywi豊}玉pres猛 撚P一

鳶翌ve勲 腹犠r3r簸id我ses¢ 登C◎(豊¢dbyt舞eL麗CオOCOCC麓51actic

pha菖eφLC3{B重rkela簸d,董 曾94>a登d!・IAr¢r1(量 重

¢匙al.,11)9鶴),重heLαc£o蓋 履 く〕鋸如5み 羅9麗 擁α`5P難a暮emv1

(B◎ 重ze霊e宅al.,19~ 》◎)a鑓d難 臓v4(it戯a夏.,裏 ≦》~》3),匙he

L扉 αoみ 轟d器麗5ga∬eriP蝕ageψadh(Hei買 重c蝕就 農1.,豊995),

童heε 診潔ρ重ococc㍑8P鷺 ε躍弄雛o厩 縫εP簸a琶 ¢Cp-1,Cp-7a麹 《至

Cp-9{G蟹c童aetaL,蔓 ≦)9◎),竃heGdiph聡da搬bda(S罎 菖er

e惚 豊」 タ82),鑛 猷 豊¢fu麹 騨 σ 観癖o確5(Foucheand

を翼a.sh,1~》78).F◎ 罫example,thesl踏 段ilar難yわetwe鋤 施e

翌ys璽費s◎fφ9量ea簸dφLC3is3璽%ide鷺 娠ca玉a薮d52`ンU

eq鷲ivale搬,

亙難c翫 ≧此躍OP5ど3,般1¢ 宅騨◎ac三d棄cres叢d魏esAs茎)6a瓢 糞Gl疑33

hav¢bee鷲s醜a箋6戯 ◎bep圭vot乏 琶蹟 》rthe灘r鋤idase

a磁v鯉 伊 ◎u醜a磁 薮 農sh,1978).N『 一欝 麟 簸us◎fφ91e

1ysinhasalsoide飢lcalaaresidues,Asp36andGlu6フ

(Fig.3A),s糠99estingtha亀anactivecen毛erofφ91elysin

islocalizedi践theN-terminus(seeFig.6C).Middie

regionofφglelysin(inabout90-aaregion)contains

fourhomologousregionswiththatofotherphagessuch

asφadh,mv4,φLC3,andCp-1(Fig、3B).Henricheta1.

{1995)havereportedthatthesefourregions,termed

motifA,B,C,andD,mayplaysomestructuralor

f魏nctio蹴alr◎les.C一 建erminalhalfofφ91eIysinisdifferent

fromotherlysinsinbothlengthandassequence{see

dig.S).IntheC-terminusof43aa,oglesharessequence

sim銭army(19aaidentica1,seeFig.3C)withφLC3.Tn

φLC3〈 駐irkclandJ994),the43-aaregi・nhasbccn

suggestedtobeafunctiOnaldomaininvolvedinbinding

tothebacterialcellwall,possiblythroughrecognition

ofthepeptido搭1ycanmoiety.Thus,φgleIyslnseemsto

beGomp◎sedofthreemodulos:theN-terminus(termed

medalsICE}functianingasanactivecenterofthe

e鷲zyme;伍emiddleregion(moduleABCD);the

σ 蔵crml簸alhalf(moduleMEM)actingasarecognition

sitols)ofcellwal1(Fig.5).Aspo重nte(五 ◎utbyBirkeiand

{1994),exchangeofthesemodularunitsmaybean

importantprincipleinlysisproteinevolution.

Page 4: functions of Bacteriophage Ogle - COnnecting REpositories · 2017. 4. 23. · 2.3.Ex躍 謡徽 ガψ91898麟 鍛駐coli E.coliXL璽 一b1鵬carryi薮gareco曲i難 煎 幽smld, whlc熱c

τrY

FG了C

云5rf

~角f賢

`G段画

κ

濯rCズ6G了

孟τ7《

漸βCC

湾εサ了

解fC下

'みC轟

κεC虞

κ汽ττ

F

マC65λfr

7C了

7煮κ^了T

rT猷

西

rr

Cぐ

f

^丁貞

路C^

内ρC^τ

駐Cム

κ

^fハ

`

縮ρ冨

てCム

7

了轟ゼ

霞義λ

`

rτ了

了C了

`

f

G

r

C

轟τT

匹τ盈

7

T轟旺

r

ザC

7

《丁τ

-

貞Tt

B鳶^

0

し角負

ρ

ετ轟

5了^

4τ冨

-

貞《τ

`

f^τ

4

f

ρ

'

G

ρ

τ

κ

タ喬^

了義C

6

穿

鐸ド

`

β

r

G

r

7

0

T

,

6

τ

A^為

σ

C茜C

可ττF轟GI

角f了

了聖r《

rτr

Cr轟

《rr

f

5fC

r

《r3^

マ罵ニ

5

η

P

ρs

β

8

丁了

F

GT6

ε

GT嚢

κ

ハG

£

9

C

5

5

7

C轟丁

τ了兵

7

了丁7

f

ττ

γ

C

5

夕讐e

κ野7

F

轟τCΣ

r

薄'看

ε

6ττ

f

T貞匹

6

Gε轟

GTC

ρ

Cr冨

'

肉τf

5

τεr

ε

しC

y

λゼ《

F

τ煮貞

f

ε事r

轟武C

5《み

σ

響r^

£

G義↑

6ムr

τ

了TO

r

Cfr

r

4塵

r

^Cτ

y

5AT

`

丁τC

^GC

自^了

'

C《藷

角磁ε

Gττ

^CC

5轟轟

C武鳥

CG義

6マt

GαC

r

点義C

C轟G

6

Gτ6

5

'了λ

ρ

G《C

C盈C

ム貞C

rf瓶

'

σyτ

C'C

i《ド

窮TT

g

r'

τr^

為ム霞

β

rT滴

^τf

むrす

CT7

`

A

κ

^了

武Ar

G

K㎝

G海`

r

'

轟塵

r

猟薦

c7τ

`

O

/

C6

5

5

西

2

τ看

f

了Eε

σ

GC6

`

了rA

ρ

G弓貞

κ

み《τ

L

TO

罵76

しム苫

ε

τC

L

τ声

ρ

6

ρ

T

5

r

C

r

β

q

δ

τ

声町棄

¥

^T了

C為

訴㎎

F

ガ導3

κ

壽`書

r霊》

《^丁五

丁冨r

6

ド?C

8

1

κじ

τ

r

9

ε

5了夙5了《36

#ぎ魔

署飛筑勲τ肉《

rετC

7^CC

-

~丸

ε

C

"

5了

β

し4`し7

r6了森

y

τε丹

β

G轟《

G了5

6

Cτr

r

《τT

'

^5し

ム董み

'

声τノ

Tτ卉

θ

rメ践

π

汽1r

《ε7π轟き

月》ξT`

`

6τr

τ露了

y

O為了

Gτρ

`

下了《

6C

ρしCG

γ

下σ《

'

f了G

f

ρり^τ

£

ぐ口直

9

C7点

,

f了6

`

らCT

義Cr

-

義C義

γ

τC^

ゼ武r

CGC

C⊂C

r

轟G6

¥

了Cλ

κ

C裁轟

ε貞

P

¢τ肴

底てγ

,

《6τ

F

¢4C

β

CTr

"

塚fT

-

事6了

y

馴r窯

-`メτ

ビ《

暉ξ 

C

ーマ

'

ε

菟r

tも為

9

CGT

-匡τC

κ

尭^鳶

'

`C《

A鳥C

ρ隅ττ

,

真TA

rA仁

iτr

'

cC為

4Tτ

-

轟`了

fCε

σ

5直τ

、君C

ρ

C尭

㎝冨

点了6

6

G"τ

γ

rrτ,

^為了

-rrr

6

rrf

樗rτ

墨r奮丁

'

マTT

,

^Gτ

¢fτ

λ画ド

7

^

<

『r

>

湾e

7

1

q

《ττ

r■《下ム

}

7

p

T

5

^

匿β

C

£C

GT角

ρ

G

`

C

τも

CG^

κ

P

2

ε

[

轍~

p避

κ

r

G

P

~OG為

κ為丁貞

月C等T

f義^⊂

凶唱丁《

汐Grr

オ6丁貞

¥為組

も了

σ

rC下

,

爵rマr

ハ轟丁了

《罵義

オ`

r

《τ

CT^

,

鳥`

τT

Ad

^

ρ

'

τ

re

e」看^C

7

み了マ

ハTT

-

論量黛

ρ

B

,

C

σ

互《鑓晶50網ぼρ3

廼召

了了ε《rτ直義6

7

マ《査

κ

義τ6

r

GCτ

;

轟λ^

轟溝^

r'r直^

《G了

'

CT^

ム直A

'

ゼ了了

'

義ム貞

OT可

-

P

T

2

r

n

5

2

r

U

貞マ億

σ

r《て

f温

`4丁

τC《

r

↑Cr

直τ《

¥

4CA

ム7

町鑓

κ

貞C匹

`

6CC

7

《6轟

κ

《臼最

κ

轟↑τ

-

《CC

O《轟

穿

CC

7

α賢メ

^輩了

9

0ε`

6

G7τ

-

璽ハ丁丁

'

丁τ丁'τrG

5為CT

,

義7丁'CGC

河C鳶γ

'TC^

¢TC

6

07r遍εCr

r

み《も酒6みτ

,

TI

6

C冨τ

む丁τ

1

4ハG丁

TrC

6

6C£

r了丁

F

GGC

5τ¢

Gτ《

轟露↑

TC^

7

Tr《

A轟ぐ

r

貞了ゐ

9

0ゐ角

ムτr

^^了

Grτ

レfT

crr

`rC

ーST

r`r

`

蒋τr

/

r、τ

'

fτ匿

'

C,r'

露ττ

-

長rO

凝仔

丁 τ

'

貞τ

C

ATτ

`

《6C涌C6も

瀬CTC

τ

^G

肉TC渚薪^C

溺もt貞

ρ

日6鳶

κ

^了C

7

轟6仁

6C為

κ

^了C

輩Cε

7

轟Cr

7

《真

51q

GOζ

5

了CC

7

轟Cr

6

6CT

p

rし

κ菖

,

rしO

r

rゼ鳥

9

r

^海了

-

了^6

6

尊冷し

5

τCC

7

^Tr

6后し

G丁r

κ

8

ビ丁

C

r

鳥《

'

6

,

6

幽も

7

轟了C

5

為抵

`9

δ

σり8

8斎£

F

CGC

《丁轟

声了C

5

罫5C

r

ムτあ

《TC

6ゐτ

ε武轟

C《C

r

幽《C

7

《τみ

0

銭了C

5

τ為じ

5

了角λ

κ

《罪r7

《6r7

^7薦β

海C↑-みC君

^C庖κ汽6T

`丁霞τ

FετC

メ6貞義

8CC

丁7

'

^丁

err

P

rττ

義r

5

τ疏丸

2

rr聾

5

《下6

¢F

鳶《丁

了具

7

薦煮^

9

17r

し了為

んr

5了^

践ST

鳥rr

8

$A丁

ττ

T"

π

£

"

 

<

rr

>

7

飛rC

r^f

τ

τ83

「δ

r

8

∬r

γ

《Gτ

'

ぐ渦

'

τ森τ画芦

β

了幽

κ

`

響^

κ

《へ嬉

ρ

FTA

^轟貞

r

GτG

`

書了^

F

丁TG

σ

GOC

r

《TC

κ

し瑠τ

z

C了丁

角τT

GC6

σ

`τ6

'

OτC

5

了ム点

eτG

6

6nロム

眞義雪

了渓ム

σ

ε《《

π

轟ff

C了f

了轟f

零ヂγ

y

G^f

《《τ

'

ぞTC

5

τ了《

轟査跨

σ

CτT

f

τ轟

腿τ

ε

丁εも

β

C了C

弓丁^

σ

GT6

鳶じC

G璽^

武Cτ

-

^?

r

77舷

σ

CTB

6

5fA

7

丁書^

σ

CC為

r

Tτ婁

,

轟も露

GT轟

r

T了C

'

こ曝T

`

τ6r

β

εεr

鍔C

7丁τ

,

貞τギ

β

9鳶じ

Gム轟

κ

A

5

r

'T

¥《

践C月"了践

β

6了丁

,

轟可《

κ

fτ《

r

丁τ義

Ofー

0Ω設

BO、

O駐4

日Oら

OPF

00

駐O臼

009

玉Geo

lion

臣00

斗コoo

i姐 巳

isun

博oo

け 臼o

'盆fAArμ £ 湾PH湾 訂frドYβ バff}7775C5r滑J」 レ

YfAAGfTfCGf^MfAtATAATfffGfACfAfAifGLAATTTTA7GiTAACCATGCFGACGAkFACACCACFACAAGTGGCAGCTATGCAGfACCGGTT

κ'埋i算

ρ 煮 財A㌢'琴Wκ'7轟AP∫ 旨'Yぐ 「R∫Pγ 轟 正7'κ5亨76γ

(AAcrr,*rrr,「Tif「fiA'ATfAChA〃 αM「1AAr.FnrrrAAτ 丁併ATτG了ATAGTTACLGTτ し↑質 了了ATAA「7TGt灯 解cM靖CGA創ACGGGT7

r潅 γ ゲ'漣 露 γA'q拶r4rrρ}'厚 ガ 々 跨 正AA擢 ア ∫'Sえ ン

ercntrr(隙AT^fpTfffflfTTpTtppAAnrrnnrcrrA億 郎cロ 了耕 麟 讐ATG船 罐"YCCCAGAnTf.A献Aif,CG[AT了Acτ 丁fTTATfTTTCAA

ρ オ ∫D湘 ℃ ダ'rJ5鳶"《 乏5Ytlfε 旬 ∫ を ち75疋ypμr,rア東 舶 臼arcncn了{}irnr{AA〔,馴 日*tnritrnaaecハ 了TCAiinAGi7GL7GL丁rr【,6脳 訂 能b肝 τ触 丁nCTTI{A蓋 解ACfCGAATGGTUUCてAマ

ダ 「r辱`r8'角 声f'τ γrσTr7π 躍Cρ ∫ ∠ ア 罵7∬LTYxa

ancrrcc「 罵 轟マxxsctttxittAAAfCCしffYA了 τAC讐aciATcs了ACCn〔CbC7AAAOCA麟ALGpC↑CAC了 τATT*A6ACTAAdTTAAぼ 儲`AAG5

ド κ7ダyr'「 ⊆ τ0ド'r,r解`5斥5'6爵 レ 君Aρ ρ ソ7κ5

CAfT7AtlAltfTfiAfffTffAAU7fAAGEfAACTffiCdCTf,TTiAGAATGGCACfAAACTGATCCGfCAAGTTCGTGCfCAGGATfTAACTAAGGi

'・5∫ 「'竃 κP~ κ ∫ 声 π 膨Y喜f5∬PP7'鳶F霜Yκ{R76オ

TεGGTひ 照rκ 轟fC信τ「「A轟6rf月 「rxAFT「ACfCSAGiGGf,了MA照A6T〔 邸 貞GA「賀Aしarse了rAAGA「TGC6G了cAA尊 〔Tf.{:GCAcAGGLGCA

ワ7Ss¥Flrr'ア ノ σTrYπ 「rσ β'rσr,'ンf汐yA{}〃B

rcAAffTし ムYLRMIAff71義 τfκ ドlfTTf/(Y了Cf了fftAfThCGC7fAFAA(TCh7CAACこTAiCATTCABf.GTCGじ 丁ATτ6転τG醐τACCCfA嘔CCハ 「

'躍 轟 μGr'涯rrρS5〃rL∫rYず ア ∫ 刈5N請7rτ レyS{7

f,ATTTnpTrGACkfLffTnTETnGltnfCfffffp7CnAGtaaTACGCiGGaaipCGTCCAApCTkLTCCTTCTChCGCGTATtAfAGUfiLCiTT[ACG

n写Yセ κ'ゐ σPκ6'雪 κ アT`メ{ρ 芹6碍3」,5r'YPC戸

rc弄{Tf1Y〔c1f,f,AdlAYiCしu舶rρrMCfい11'Acraic了hThfGfYGG`εAGT「ArAACCGfAAATCAATC7A了ACTAじ6A了zTnrrrTSCr紬f

κ ノ'「',

角妬 暮 「RTiAttAnnTAhnT〔TMロi巨 舐1冒 〔訂An+CU,GCL〔cn,r{rrrrrrrrrce〔 匡丁納 崩 麟 灯A碍 τ隣M長 τArA撚A触 〔A旺し{TT~ 》(

舜ゆr"75

戸'B7f4乙Xヨ!囑oA

ihCTiCiTTCACTAPA了AfhYiA崩 灯AτATFTGiAAAGTTAAhTGATAttlaa曜'嬉Ac儲cAcAATGGCしCCCACE6AAECT了 τ紅AA`εGACCACAGG

冴e陶 ㎡ 董H

κyσ κ 黄 βfFダ ツ κ'刀 』 ノ κ5κR匿8F'長 ド 酒8丹 π デf蓋 〃

CaAAdiATCaAAAfAAfnATCCA[hGAAGAaCAAC,CTAGCGG(GkiTAAGtCknATCCTnhAAkATTTATCaAAGYTCCAGAYAATAaGGAGCYGGaAAA

厚 ズ ζ ρ`ε ワ4'fεvκA∫ ε5£ 」 κ κ'b9APEHARr'fτkTG轟aaaaAc轟 τArτ〔'nr〔AiA轟'1τr瓦 声r了cみ轟(戸AAAAAAIrcAAA6【riτGfiAAAA轟GATTGQGATAATfCfGAAAATGICCGi了A了7了SLAA

'κ 溜sA}」SPπ 海r∫ κ 凋 π4r',ダ ρxFV喜 」AYrAf馴 ノfAAAT6PRiCAIlA(MIGAT*PCTfttAhf,4{tAlffAfXR.GCTDAAGCTO.fLCTTGTi6MlfThAAGAAGTUA4GCkCACGTfACTAACGGCGTGA

Fω餌

r6駐C浬 εSf竪'"ゴGり 遷AY刃rρ 正A2ρr.王'ε 遍y'ρ

TPfCTC「rcAAGCitATGO.AACCT7TTGLATfCTf(ifAf.CCGiC貞TGfTCCAG賞6r凝AfCA花 鶴 鯖CCGCGp了6ぢ6しTGTiTGApGCACiATTGGA

κFρd【BRa.Y[Ps`t

κ ρ`ど ↑ ビ'拶 「r,バYrrrπ'嚴L'π'アf正r落y盈e幸

「AArfArrrrr塊AMIGτ5「 「六TIATG'「 τに「τf.「τ"fGTA角 虹Af.TAA轟CττTGATGGTcr[AAAhTTC`AGAACτ τGτG轟ハAGT丁AFTCGAI縄A冨A7fCτ

ATCeTfAhT「rTnirr「 町Arrrrrr`161'rt丁NAAffACAACGG蔚ATTTTTTTCTfAART鯖 τ冠A解 触A触ITAAAAfiSnpGfAeiercir.丁T7~ 一 一 一 一 》{一 一 一一 一 一 一一》

加 ρch

釦r〃 硲bπ5πBρ £'〃A潔RFん'

ACAAGihAIA[AdAAPfiCTThATATGTATTiCTA6AAAegaaaAAaACiCTTAAAAATGATGAGCAAGfAAGATCf,TATfAATCGTCGCCGYCGCAATA

(一 凝8

潔 π ρ4髭2JAκ'∫y∫"rcoYμV湘 κ π'a'躍rVY躍rπ

了∫A!しAFIG轟TlしA「馬T暫{1真lf6「丁'あAT「AA「τし1τ了C義ハ亀C6てT6GεεATτAτ爵τGしTCCCTATGAAGCTTGtTCTCA真 嘔A〔AfiCiATOCCτ 轟じAA

Nindlit

Aκ ρ`'F{望'rβ 戸7fNκr'P'`Dcr縛 ぞ σ8泥 芦Pδ'fCCAA7でfCCAへA儲 κ 下enrrArrrrrrrr4AtrtTCttroaaicrA「ACi「terror了AC『 鵬A弼 繍 ↑AcrrACG冗 妬rA薦 τ了CG鳥ACCiGAAτ 了1

レA61

騎TGlも しGAATTC玉to[1

FCaR{

Anna

f900

zo醐

z田O

ZiUO

2300

EdOO

zsoa

zaoo

2700

1808

asuo

7000

、薩Dp

1160

aaoa

SiCO

15UO

JR60

ηoo

aaaa

F壌2DNA麟dpredlc童ed&鱒 醗oaα 《量sequencesofge鼓 ¢sO,Roヴ94,RorfS(1,Roヴ118,hol,lys,Roザ175,andRoげ148.Asterisks1鷲d豆catestop

cod幡 離 ◎wssh・w鵬vert¢dr¢ 卿 匙sBoldtitaltcloveぎ 量戯 αs1麟catcpu宅at且veribasoroebindingsates(RB)D・tteddoublellnespresentrepeated

se甲 蹴es{RS).Rcs雛cti◎ 難s王tesusingthec◎TDStF'UCt玉◎鱒fthereco曲mantplasmlds銭reshownaswell.

3.3、 ε纏c顔 雇c勧 醗 αεη3漉 εげ 議εφg1ε 加 伽betwee負 φg1亀monoci登(Zinketaし1995、andφLC3is

shown並F培4B.

ogle難o蓋in曲owshighseq鷲e駕es重 搬il&r鮭ywi出 ◎出c罫

sev¢rali`}'ith◎ 藍重難S◎f諏 嬉esl◎r鱒n◎c溢)fro鵬3.4.Ex脚38漉 ψ 海eφ91⑳S∫39ε η8謝Ecol重

赫 繊Q,whl¢ む 我re重 ぬ◎u暮h員of磁G重1◎ 撚saseco難d

P1識9¢iys圭spr◎teir監(Zi嚢 駐e重a夏.,hers◎ 懸 至c◎㎜munica-ToeIuckiatepropertiesof色heφ91e至yticsystemらvari一

電沁 簸):e.g.鱗or¢ 癒 離zor¢sl由esi鍛a58鴫ar¢gi◎nofousDNAregi◎nscaptaining海o'a且d/orむ ノswerecloned

憩(搬 ◎d鷺 無dm(Zi鷺k就a玉 。,狂》~》5)ire量de鷺 豊i()a璽to癒osein童 ◎F.cOliexpressi◎nvector(pUC18,pUCn80r

◎fφ91e簸01i蝦Fl94鰹)。pU℃119)underpl。 。L'O飢roLandexpressedinE、co髭

G鱗e寒ally,h◎ 薫重nse鑓c()dedby欝hages鍵e出 ◎ught重oXL1-b1"e憂 》hysicaユmapsoftheserecombina嬢plasmids

bedi饒re蹴 癒ass閃 鵬 鷺c鉱b磁th¢lrphysica璽 鰍 宅鷲resareshowninTab裏elandFig.1:pL119P8L(con-

arepr¢ 磁αed匙 ◎ わe甲 貿es量羅1ぬr偉1汰el蹴 嬬 蓋994;Yo顕g,tai薮in暮Roヅ50-Raヅ 〃&hod-dys);pL119XBL伍o∫ 一砂5);

1勢2).夏 簸 出e1畿 鵬bd禽syst¢ 搬,童h¢h◎ 蔓醗 畷c◎dedby蓼enepL笠18髭HL(lys);pL119XSuL(んoり.XL1-bluecellscarry-

S呈scs宣 無 麟ed乾 ◎ 鹸m亙esi◎ 麹si綱 敷ecyめ 幽s癒c搬em-ingPmgP肌growatlowtcmperature,buttheycan

bran,宅 搬o賑 帥w短ch重 鼓elysine簸c《)de《1byge鶏e賦can盤o重mu鴛lply我bov¢20℃evenwltho磁 蔓PTGXL1-b董ue

beef6cie蟹lyre蔓 ¢ase《童t◎ 豊hepe罫IP蔓asm(fora鴛vlew,seebac琶er捻harboringtherecombin鋤 ちpL蔓19×8L,

Y◎u擁 慧,1勢2).pLn8EHLorpL119XSuL,ca獄no竃growabove25°q

L撒 ¢1徽b転 φ慧1e。 ◎飢a蓋簸sapairofhydr◎phob!ca且 嶺h¢cultureturbid圭tydecreasedsigni舳nUya衰era

囎 盤m¢ 搬br撒e-sp躁 題鳶gd◎ 醗 轟ぬsof畿b◎ 磁20residues給mpe縦ureshiftupfrom25to37°C(Fig.6A)。The

s彫a婁 就 ¢dbγ&hig睡yc蝕 ㌶ 竃c(iseq鷲e鷺ce,albeit(1i銑re斌decrease◎fthecellularturbiditycausedbypL119×8L

語 餓s¢ 璽灘caT薮cs籔c亀 窺rals謡1捷 劔be鵬en虚e◎cc膿edat90mina良erthetempera毛urcshi負up.

p◎総蹴 重a玉駐d無s疲 ◎鵬thepわagesφ 暮蓋e,mv重(for我pL118EHLandpL119XSuLalsoinducedturbidity

pad》erse¢Y◎ 鷺費&1~ 》~》2),a登dφad蝕 く1-ienricheta1。,19~ 》5)decre3sea負erapProximately240mina童37°C、a董though

ispre$c醜di登F重9。4A;農seque㈱c◎ 脚 榔 雌 ・fh・tins毛heμocesswasslowandincomple重ewhencompared

Page 5: functions of Bacteriophage Ogle - COnnecting REpositories · 2017. 4. 23. · 2.3.Ex躍 謡徽 ガψ91898麟 鍛駐coli E.coliXL璽 一b1鵬carryi薮gareco曲i難 煎 幽smld, whlc熱c

(A)

ogle

飼v正

φadh

Cp-1

λ

Chaiaropsis

聾ム〔≧?L-SS〔 工S三墾

蟹でx-一 一一一了¥GY

擁写馨7至ENRAYG㌢

擁Vl《一一一1く翼ξ}蓑.F㌢

鰻㌢E至r:.し

TYQGF一

D

O

D

O

D

D

!S琶 汽ト 響SLτVAS潮 《〔妻LK

¥蔦 サY慶一PIき1、蔦A¥鍵i{一 一盈

YSSF饗 一饗A採vTEY-一 了蟹籍

vss}至 聾一svflIT〔 ≡1yea}i一

擁L燕轡SE6TB興 琶龍鱗{7慶 国H

茎SSY§ 一癖3¥苺F毒G践ys一 点

S

ε

ε

rU6

ES〔玉〔葦ぜILRTGYG

点SP-A正VIくLT-一

爲麗F-VLVi《VS--

TINT-IIRIS-一

ソD--V王V--G《 書

ARF-y王 葦}くAT-一

ε

ε

E

F細hし

F勧

4RKa

6一鴨

GL-D

STT-

LFTB

6TS一

Y

Y

V-Y

¥

Y

HIDAV

YtiRRG

R舗P匿A

LNRCL

SD擁P澱

TNPSF

①)

昂 建 C 0

φ護1e

鴎Y(

夢&dh

φLc3

Cp-1

Cnnsen5us

DAEEYT--7蛍S6S¥轟 燕燕yQA轡 践SE}組 一一K-Lぞ 蕊KP至VLYSY窪SFY困L-YI-°RSSTG-¥-0酎(轡!燕 践Y量KS稗P森PYOYE踵 癬Q麗E騨A}{YFLSLK{IATDASKI

B馨E直 ¢S窟賛ぜサ?631{SSN?AAIL8F}総 森黙{真Aq翼 建警G-L¥S醒AS-L哲 段丁幽玉DTf(〔ユVY1(}{YGTCI.曾VASYP?一 稀一AムーVST-一 一一AOF6YF珪q翼 丁6SPS{ヌSLP

DY蔦 醸葺Sε国鷺γ鷺G[IREANT'『 携亙LAFし 夢τIVSAGYKPL-L¥S{≡A-Yし 讐1くNKINTSR韮L基Kど2DCL翼V鳶 轟YPL-一 一一G層¥SA艮 一一VP国FεYFPSκD6¥AI曾qFT

D¥E電 〔レ ー一一露S〔}閑}ζ難A阿丁至)践ヱL¥6拷 盆驚VK直 羅∋¥磨P舗Y-¥S¥KP-¥↑tA蓋{V欝YlζQ王1κEFP誕SL対Isays奨 一¥EVTPVP国YSFFPS醒DεiSYFgFT

DYE豆)D-一 一 PS〔≡DAgANTNACLRFP{QMIADA(≡YKF》!Y-¥SY匿P-ET雛}聾V9㌢q麟{LAqFP卜[SL算IA〔 葦ソ〔≡し♂一一一一ND&T-一 一一AトlFEfFPS同Dε1駐 智冨qys

O蒼G舞 オ 湾 ノ 鎧8ぎ ゴ》rsノ 醒AダYFS8

(の

夢6呈e アτLP幽 一霧7γ¥民 噛一。質}QAJ星 一{≧(}{}¥建握冒慶舞P鍵 響獣≡HCYL義?(ヨPS--Sl{TLEYVETSASHAY YTVVSG【)S翼 冒匿iAQENGLSMYTLASQt駁 葺KSI¥S了IYPG捜 蓋{LII K

φLc3 ?T-PAKS ぜiΨ鑑§〔3DTI.S〔ヨ1・1$LS錦 夢韓護ΣkS{違yIsし 了G(き纏s6轟 丁轟錠丁 YTY●S〔3QNLSSIA健 建LGでTVQSLVS凋 旧6正SNPNLI¥A6α τ£閥Y

ε'8碧5ε露5び5 77財馨36拶翌£謝IA 6v孟 財厚説 ∫c●L鮮 7ア断κ5θρ7五謬IA svL鰯 五 fGQ五v

F培3.伽 郷 … 撫 φ菖豊・ 騨wl帥 ・・・…P毛 長・・ 麟 鋤 油 …e…d・dby・th・ ・ph・g…D・ ・h・・ 圭・dl・at・p・ ・iti・n・軸c°nsc「vat've

灘 膿ins.(A}ThelV-ternnrichetat,1995}膿耀1識 鵬 搬 鐸 膿 需 翻:t跳bulgat'icusphagemvl{Baizetetal.,199°andtheE,cotiphagelambda(Sanger}し鋭1乞 鍔 「iphage,andthe

m。 濾 謹。、,。f惣 。、Cha卿 頭F…h・a癩H・ ・h,1蝸.丁 為・ ・・ … 養d…c・ 鵬vedセh…gh・h・ly・i・ ・a・eb・x・d:(露)T為 ・midd1…gi°ns°f

翻 卿 、。fth,画g・ ・φ9重・,鰍 φ・臨Cp4,・ ・d孟 編 ∫・ph・g・ φLC3(騰 ・k・瞬 韮994)・Th・a・ ・eq…ce・n⑩ ・t・籔・A・B,C・andDa「e症 磁

慧,蟹i、h硫 。1.(1曾%).C。 。、e。,。、i紬 ・離・蜘 ・・鵬 ・・d・a… 羅鵬 ・・P翻 ・賃・・・・・・・・・…v・dth…ghth・ly・ln・ ・(C)C-te・mi・i・f翻y・i・ ・°f

t簸,晦$、,φ91。 謡 φLC3.D・ub亙ec・1螂 ・e鐸 ・・蘭d醸 玉ca韮・・ …id・ …C・ ・s・・…sh・w・c…e・v・d…e・id…(Birkeland,1494)・ 急c

h・m・1・ 騨sa・se卿 …esb・ 竜w¢e・φ霧1e舗 φLC3〈81翻 鋤d,・}w・ ・eb・xed・

wlt簸pLヱ';。 蓬》鴛1勧 し麺aryNo藍hemb翌 醜exp¢n搬e籔 重s

薮農ves難 ◎購 童顯 惚 鋤sc鍾P竈s◎fhol麟/or細 ◎f重hese

鷺c(》搬b誕 鋤 宅Plas鵬 量d§acc雛 騰u1磁 ¢(量a重37°C,b磁 蕪o重at

25°C;th総tra〕 ほscrip奪重◎】陰 乏醜37°Csee婁 γ匿stobedue童o轟 ・

1ea鑑1鰯S◎flac豆 ・c◎薮翻 徽 ψrahi帥C・py難 曲er◎f

重hesec◎ 職b童na競P置a.S殿 重d,sug9¢s亀 癒 霧 業}1at嶽e(玉 ¢G罫e農se

・fcdi漁r糠r圃tyc・ 翻 灘sw¢11wi甑hem裟NA1。ve璽

◎fhola燈d/orlys《 《蓑鎌 箆 簸◎匙曲 ◎轡n)。T}圭isi簸 驚re簸c¢ 齢農s

be¢簸f穏 婬ぬers腿PP◎rtedbyi取viv◎ ¢xp¢f量me星鳶s"s量 離9

rifa搬pid黙 醗dc麺 嚢・`i◎1,曲 《躍 重盤9h飢bo出 雛麟 一

sc罫ipt量《鴻 鍛(葦 彼鍛s1畿 雛◎魏a.t37℃ 厳ere(蓋 騒iredfor縫 蓋e

dec鵬s¢ ◎fce1璽ul鍵turb繊y(d徽 顛 蜘 瞬 ・

Wh鐙 短d"cedby謄TG飢37°C(Fl9.6A),e麟 ◎f

慮e鐙c◎ 燃擁 獺 蹴 §pLユ'i;`:'s(hotalys),pL1童 攣XS慧L緯oど),

and裏}L璽18E翌L(な5)璽ed垂()a熱s芝er(》 登se重Gf雛rbi(葦ity

(董ec野ea.Sε出a葺 出 齪with.◎ 鷺d欝TG;撫 ¢ra.重eoft熱edeαe蕊se

轡 海o♂一加 重s雛 ◎re職pi(墨 重ha勲 ξ}職by海o♂or『y3,醗d虚e

s書a寵 ◎f,..by勧 『ise鍵1ier挫 臓n出 飢bylys,

s曜 ¢s雛 薯 伽 撫 ◎ii蕪ca鷺f6撒 丑醜 簸si黙 出ecellm鐡 一

br羅e,鍵(葦c鍛prom◎ 重e玉γs癒 一雌edi就 ¢dGe簸1アsis,我s

s篠spoctedi麓ofherぬ01i難 一lysinsystemsofφLC3

(Birkela薮d,1994)andφadh(Henricheta1.,1995)as

wellaslambda{Young,1992}.

Inadditian,severalrecombinantsco且tain重ngψ91e海o!

aid/orlys,whicharefreefrompiacontrol,werecon-

s重ructedlTablelan(iFig.1):pLU9PPR(con面niむg

Roヴ50-Roが11&hol-lys);pL18DPR(Roげ50-Ro7プ118。

海o『);pL蓋8DP獄(1e1(hoり;pL18EPR(Roぴ50-Rorf118);

pL118£HiL(Roげ94),pL18DPRdelwasderivedfrom

pL18DPR,and豊smissinga36-bp班 ηcll致agment

ext瓠di簸 薯frorri3'-termi蕪usofRoヴ50to5'-terminusof

R・ ヅ11&XL1-blueha£b・ringeach・ftheserecombi鋤ants

蓼奮ewstablyat30°C,butnotat37°C(Fig.6B).Tぬus,

p瓦1珍P昼 》Rexhibitedanonsetof加rbidi£ydecreasea毛

90minaf£eratemperatureshiftfじom30°to37°C

pL璽8DPR{nducedthe(ieGreaseafterapproxima宅ely

18◎r糠inat37°C,alb¢itincompletewheRcomparedwith

・... .On出eotherhand,pL韮8DPRdeldid鍍ot

reducetheeeilularturbidityafterthetemperatureshift

登P,b鷺tinhibitedthecellgrowthsignifica搬ly・Aφ91e

Page 6: functions of Bacteriophage Ogle - COnnecting REpositories · 2017. 4. 23. · 2.3.Ex躍 謡徽 ガψ91898麟 鍛駐coli E.coliXL璽 一b1鵬carryi薮gareco曲i難 煎 幽smld, whlc熱c

(A}

φ麟e

一 一 寺奇 亭 斎 壷一P昏 脅博 昏 壱 縣 用 一 拳

再駐i夏TS蕩き涯」轟曾醸 置翫為L三SF窒ヱ{≡翠夏~F島点雛《RTC韮cv薔ζ醤ヤ¥五P碧IS種繕蓬{躍L為餐Lム轟サy好緊奎ζ駐7翼¥L麗{}A竪鳥≦}LI¥G轟貞iSGLYD{≡LSV67S轟V賢 為区A7蚕ζ聾A轟藍tiAAIYQAVLNSINii区SSQYTBサ 醸 了S暦7泡6εS?S£望趣藪

ttt ttt質t

酬 韮

一 斎 ウ を 一 季 杢 一 斎 一 一 一 壱 昏 ト 春 を 壱 寺 壱 季昏

鍾Sむ冒替籍監麗乱亙サみ璽窪丁三蕊L汽㌢冨義SLYLE¥買 饗翼互琶}マ韮{7義義9琴く㌢響種Ψ蔓{}民鎌¥羅 真冒醤E轟霧團SDL鷺幽軽qSS潤隠P9翼S工L閣!{S閣義区ELP轟L?S襲 建理{筆腱野民PL6Rア97Sτ 胃6膣4SPQRARTRFLR夏 喉騒?長

鈴a融

塾咽 妾 寺 一寺 昏 壱 鴨 十 一 季甲 ÷季 一 鼎岬 昏 襯十 壱w罹 寺 一4$曽

響駐慧}難軽.f智轟五竪サL蓋」撃禽暮弩爲冒為¥SL鍵艮〔≧翼L翼蟹瓢為も7麗夢翼L蔦民夢L建窒爵ε毛縁.為L民轟了五¥癩轟SL!}狸1【E餐S9≡CL¥駐轟?D亙サ響マ〔≧L駐医五Y蓬}糧LPI匡}民V7Ψ9騎1サ"野ε7E区Lサム5S鹿奪(EA

t號

(B)

自㈱OCl跳

φ葱1¢

φ璽.C1

閣難 奮鶴 翼臨 騨 顯 盟L習 鞭 艶… サ騨 麟 照置箆L謄s器L胃 ㌢s鷲 鴨轟正L奪離 離s路 麗SSL醒 購 冒・盛繍LA6・ 鳥磁 ・・Y・GL聡●F… 穿聡 … 照 ・・kY6・貼 駐π09■o■7甲 昌「,P● ■.唖r艦 曽,.暫サ ロ ロ コ サ リ ロ ウ サヒ ロ つ リ ロ ロ コ コ リ の ロ サ ヒ

蹴頚三・愛SL腿L・A響趨S置L爲L亙S雪F夏鰭y更y疑藷亙渕《7駐民響麗麗了YL㌘百薫S蟹葺1餐ΣL真6・L菖轟ぜマサ穿民1}マ慕望L騰呂轟冒A6L五76・轟轟一 ・YSGLT【}6LSY6TSkYTYkKk?区 ゆ晶Kτ鳶画IT騒轟撃L超SI幾了TXSSDT7駐 響A藩?S田TE6窪S了SE7q更5弔,窟o,9,・ 曹.御7曹 甲 ■P辱 ・ 幽サn"阜 圓F隙,璽 ・77● 曜,,,鴫.ゆ ロ リ ロ つ ワ つ セ   コほ ロ の ヒ   ロ     ヤの に じ ヒ   ロ サ ロ つ ワ ロサ ロ ロ ロ ロ コ ワ コ ロ

賃瞬1醐 翫 既 薮s甑 臨LL賄L翠 監L玉膿義憩 離 器y貫 … ㈱ 騨 ・・… 夏姻 §磁 納YY… ・・猷 為撚LL轟 ・・IY6YYA6PTTSGLGDSDRYLNK唇 一民sε ε盟瓢

F量9.4.C()瓢 峯)a謡so難oftheφ 暮蓋e海`タ!茎}r◎童e墨nwlt鉦pr¢s聴mp匙 重ve}}Oii鍛se厳cQdedbyotherphages.十,bas量caa;一,acidicaa・(A)Physicalsimila∫ity

be亀we¢ 鍛 癒eho董 滋s費f篭hcphageφg蓋e(thiss雛dy),ゐ.わ 解ざg躍1α擢 帥agemvl(80izete窒al.,1990),and」 しg礎 ∫sεrψha琶eφadh(}{enrichetaLj995).

Posslbl¢ 鍵a鵬m¢ 鵬b蹴 難ed◎ 鵜ainsa賂 始d三catedbyso無dbars,翻dpatentia呈beta-turnreg{onsaxeshownby韮owercaseでs(Young,1992).

働S騨e鍼c曲 ・脚1螂 わe宣we鋤theh。lips・fthe夢ha暮eφ91e麟isstu嚇L,isterirz脚n・cin(Zinketaい995),andtheLξ ・・tisphage¢LC3

(13irkeland,1994),baublecolonsrepresenttheidenticalasresidues.Dashesindicatepositionswithconservativesubstitutions.

¢ 撃~ 璽 《339灘 》

騒 闇 呈 く言9Sa融)

麗輩4 .;

麟畿媛懸 《3管'aa}

融嘗 呈饒 《題器aa)

1f_.._ .{ 韓2噛aa)

臨 ⑪《慧腿 夏鯉一

m

一義 騒c耳 〉 麗奮踊

Fl9。5.愉d・1・s・fthemur翻dascs¢ 鵬 ・dedicyphages.Thestructu・ ・s・ 糠 ・p漁 重孟ve隻y・玉・S・ffhephageogle(th{sw・rkいh・ ノ・一惣 ・・繍

phε堪¢ 憩v1{騒 ◎izete電a1.,1~}~ 》◎)a賎dr鷺v辱 くDuJ}()ntc室a塁.,皇 ~》~}3),宅heL.gas.seriphage¢adh〈Henr藍cheta藍 り1995),theL.lactisphageφLC3

(雛 勲el鍛 δ,1994),鍛d癌e∫.pneumv鷹 岬h縦geCp-UG綾rci&e重al.,1990)arec膿pared.「Threem◎dulesDE,ABCD,a顯dMEMareshownin

Pig.3.Th・ ・量… 曲 ・・e・sh。w晒d・1・DE卿LC31y・1郎h・ 之w・ ・・・…v・d…id…A・p・ ・dG1・w・ ・e・・tfo・ndi・ 孟t・N-t・翻 ・…Th・h・t・h・d

b㈱ …p・ … 燵 麟 ・蓋・A轟CD伽mH・ 癩 ・h・t・}。1995).Th・ ・1・th漁 …w・i・Cp-1(G・ 蜘eta1。1990)・ ・dth・tw・th重 ・k・ …w・1・ φLC3

(雛Rela賦19鱗)indicaterepeatedseq鵬 簸¢es.Thearr・wi醜 φ91es盤 ・wsaregi・nsimilart・that・fφLC3(seeFig・3>・

DNAre蓼i◎ 豊》pr¢c¢(量沁 慧 翫)『礁1ayco簸 之a嘉箕atranscript豊o銭a葺

pro買 夏o綴s)f縫 顧i◎ 籠i聡 豊簸E.ω どゑ

c◎ 買玉P凱 ・,鰍 裏yslsde糠edseve業alpr◎ 鱗 ㈱r一

薮keseq鷺 ¢鶴¢¢s{-35a.聡d4◎se璽 鷲e熟c¢s)wi銭 董量簸Roげy4

a簸齢oど 岬h蚤 磁 購 §童m鰻ar童dheμes疑 搬ptivepromoters

拓 購di簸 五雄 伽C∫ 伽 ∫({brarev玉ewseeP◎uwelsa撮

Leer,1993}andE.enli(HarleyandReynolds,1987).

A皇ternatively,9PRoげ50and/orgPRoが118mayaccele卜

atetheturbiditydecreaseincomhinationwithholin

and/orlysin,asinthecoliphageI'2(ZiermanneEal.,

Page 7: functions of Bacteriophage Ogle - COnnecting REpositories · 2017. 4. 23. · 2.3.Ex躍 謡徽 ガψ91898麟 鍛駐coli E.coliXL璽 一b1鵬carryi薮gareco曲i難 煎 幽smld, whlc熱c

TA蓉 乱£ 亙

P董as蓋γ}k至s

Plasrnid genotypeorconstruct Sourceorreference

F',1#

p JC11$

ρuα19

蕃》翫1蓋9P駐L

pL夏19X欝L

pL118露 蚤{L

pL璽13XSuL

pl.1室8X亙)L

pLl豊8髭DE

茎}L118氾 蚤{{L

鋒Lll~}P婆}R

2Ll8DP鼠

P瓦 豊、客蓋)PRde皇

pL茎 躍PR

A〆,P如`薦cz'

Anr,P緬 、緬cz'酸.豆30rigin

遼〆,P繭 鐙『㏄Z1擁 蚕30rigin

護)UC箋19::2,938-bpPs21-BarnHIfragment倉o賀 玉φ$1e

《Roヴ50,Royヅ118,ゐoまa!}《i砂5un(ierPr冒c》

pUC重 裏隻:2,338-b罫)ぎ ゐ磁 窄βα海麗 耳翫agme窺 疲◎mpL119PPR

(hOt段 鷺dか3underP汝)

妻)UC薫1S:;L760-bpEcoltlっ 酵加d夏疑fragmentfro鶏pL119PPR

(1}'Su鷲d¢rP緬 ζ>

pUC豊 鰺::53◎-byXbai-Sau3A互 貨a暮meptfrompL1量9PP藪

(holun(圭erP置 σ∂

pLJClf8::732-bpXbalsDralfragmentfrompL119PPR

緯o'農 簸d淫 砂s-∠1!αcz'underPm`}

茎)U「C豊18::5◎2-bpEco蔓 ζ夏一bra亙fragmentfromP瓦 遥18XDL

(∠ぎlys一溢鍛cz'underP1β`)

茎){JC1豆8::569-bpjEヨcoR互 一費 ∫麓c夏Ifrag夏】ユeヨ窪塗fro鵬 φ暮1e

(Rorf94"脆derPぬc)

pUC119::2,963-bpF'stlfragmentfromogle

pUC笠8::1,332-bpPstl-Dra亘fragmentfゴo類PLU9PPR

plJC18::1,2%一 ⑳P舘L蜜)ral(436-bp}海cll)f餓gmentfご ◎mpLH8DPR

pUα8::83⑪ 一bpPst夏 認`o則 無 餉 ¢劔frompL119PP毅

VieiraandMessing,1987

VieiraandMessing,1987

VieiraandMessing,197

Thiswork

Thrswork

Thiswork

Thiswork

Thiswork

Thiswork

Thiswork

Thiswork

Thiswork

Thiswork

TITISWOFIC

◎$

OO

警・0

o-i

A

'

'

'

ヲ'

饗ノ

'

'

層一'一'

κ''

X'1

\\

、∴

・、

、、

/ダ轟ヂ

掬熟、

會Ψ

\\\ ・\ @ip

●・ 、

\ く凱 ㍉o ,_

\ ㌣、

σ〆1

Bる 篭 彗㌦=ラ 鞭==

xゲ

!▽'

声 ノo一 ロ ー 一一羅 一,,口 囁

濁'

'夏

「ム「,舳

㌔、、

、輪'

、o

'弁

o

匙、

,働

島藩

-

ー壱

瑠'

鵯O

伽O恥鴨

~hO"噂

'

'

'

x

ノ'

'

Cロ む ザ

コズ リ コ

d,壽 曹'艦 一急 一 一%幽 一ノノ

金ら

,'

云o'o、o\「'0

'o、 ヤ

ノ'、o転

ノ!1ム 、 、鳳o姑

繁\/\ 啓 \

!\ £\.

〆 \ ・こ4,●一'

'

0 4 8 0 4 a 0 4 B 12

了1輪 碧 ㈲

Fig、6.ExpressionGf癒eφ 答1elysis悪e簸es孟 薮E,coli.{A)E.ご 薇XL1-bbecarryingtheplasmldpL119XSuL(○,劇,pLH8EHL(△,禽),pLll9XBL

(▽,闇)◎ftheve¢t◎r幽sm羅 費むα 童80r119〔x),照sgr◎w職a毛25℃i且LBmed沁mco勲fininga胆piciiliロ(60Fg/蕉nD.WhGn山eA6600ft難e

c醸 擬ehadreached◎3,重hegr◎w出tempera鐙re~vassh遺edt◎37℃with(()pe農sy膿hots)orwi施ou重(飢edsymbols)concomitantadd董YIOqof

iPTG(痂alconce飢ra重io離 夏鱗醸).Gガow出 ◎f重hecdlswas搬o簸 五童◎redbymeasuring幽 ¢ch鋤gel蝕/歪660.(B)E.ω 海XLレbbecarryingthep韮asmid

pLi拶PPR(○),痺 認 更>PR(△),pU$DPR畿1(O),1;:(▽)◎rth¢vec給rpl誠s翻dpUC18GI1亘4(X),wasgr(》wn乱t25℃inLBmcdiu鱗

co慮am鋤 塞a即 溝 撤(6躰9/雛1)。Whe償hoA660◎ftheculturehackreachedO.3,臨cgrow翫 胎mperaturewasslftedto37℃,and重hecellgrow出

聡smo歳orcdas孟 鍛dlca匙¢d溢{A)。(C)E.co!ゴXL1。bluecarrying出 ¢pPasmidpL烈8XDL(○,轡),pL董18EDL(△,禽)orthevectorpjasrnld

t'.(X),聡 隠ro轍a宅25℃i鷺 鰺 鵬edi瞭c・ 賊al駐 重員ga即lc難n(60μ9加1)。Whe殿the潅6ω ◎ftheculturehadrcachedO3,1hegrow出

tempe撒 臆cwassぬ 縦 ¢d沁37cC縣t垣 ◎pe簸sy鵬bols)orwi鐵o猛t(践11¢dsymb◎is)concoml重antadd虻ionofIPTG{且nalconcentration1π1M),and

孟hecel丑browま 轟 職s恥 ◎nit◎reぬsl麟 ㈱tedin(A>.

琵》9諺)。On康 ¢◎重鼓¢rhind,XL1ま 》嚢聡eh負rbori鷺gpL隻8E劉 裟

orpL葺 璽8EH量L蓼 罫e響 薮◎罫灘 該11y,s鷺 菖gest癬 菖 撫 戯 ¢ach◎f

gpRoφo,菖 ρRoヴ1ヱ8講 蹴dgpR〈)拶4Ga箆 登◎£(至is重雛ガb出e

celle簸vdOP¢i醜erityfor◎ 簸¢self.

Tworec◎mbi蔽a飢p雲asmidspL118XDLand

pL1ユ8箆DLhaveafUsedgene(underPlaccon重rd),

搬medDE/a,whichiscomposedof78-aaN-ter組i熱"s

oHysi盤and91-aaC-terminusoflac.'a-fragment

Page 8: functions of Bacteriophage Ogle - COnnecting REpositories · 2017. 4. 23. · 2.3.Ex躍 謡徽 ガψ91898麟 鍛駐coli E.coliXL璽 一b1鵬carryi薮gareco曲i難 煎 幽smld, whlc熱c

《Tab豊ela簸(1Fig.2).Up◎ 登 竃e登珪}er滋 購res}}i實upfro灘

3◎°重◎37℃ 勧 癒 ¢畿bse鵬eoぎX憂}TG,pL118XDLcarry●

i薮gb◎ 簸玉 ◎fhola墾d五)薦 γ(Y.ma鷺 童fξ}s重ed隻heturbid箆y

dec鵬se譲er2轟O醗i雛IF恵6C),a璽 撫o鷲gh癒 ¢ra重ewa8

s◎艶 騨 撫 茎◎w曲 瓠co脚aredw量 嶽pL119.X翫 伽1-lys)

(Fl96A),w恥 雛easpL118覧DLt◎ 罫i薮蓼 かE/a(簸d雛 ◎t

red"ce撫ece掘ar濾b嫌y(F逡.6C).W五e益1難d建c¢dby

亙PTGa萄37°C,b◎ 費10f費 隻e罵c◎ 蜜簸b玉薮a窪賞ssfa

即 玉do登se重 ◎fturbiditydecr¢ 蹴:毒oゆ 卿 偽within

60min;D鎗/偽w轍 簸12◎ 艶i態 丁蝕es¢re§誠ssugges賃ha婁

癒e搬 く>du蓋¢D氾 ◎fφ悪1elysi錘 蚕()c畿蕪zed玉 難 疑sN峨er瓢i腔"s

〈Fib。3A我 麺dF量9.5)(x)ntai鷲san農 ¢tivece纂t¢ τ(s}釜◎∫ 亘亀s

璽y重icac縫v重匙y.

T◎esti鵬 ㈱ 馳e癒er患  ,:s三 酎 アs雄sys隻em¢a簸

m誰 ¢a豊 ¢si◎薮《s)iむE。colice難 聡 盟(◎r  ne灘b雛e),

rel¢as¢o縁cyt◎ 幽s難ice額zymeβ 一g癩ct◎sidasewas

難easuredat37℃a董o鍛 菖w童磁 出e重 慣bidi鯉dr◎P◎f£,c罐

CK茎 蓋1髭κZ+c齪ryi簸gpL11~ 》PP鼠{Roφ0-Roヴ118-hol●

lys),wh沁 難 読re疲eef冥 ◎鵬tagl4c◎ntr◎LAsprese簸 象edi鷺

F量9。7,β 一9ぬ 伽sldasc我ct重vi重ywas藪 糠dぬ 出e蹟ediu蹟

α20凱 諭 雄er童h¢to卿era童 鵬shi恥3撮i宅sre玉ease

fr◎mthecyt◎pla灘C鰹 ¢媛edwdlwithhe獄 竃e◎f

雛b磁yreducti◎n.

8ゆΩ

O

雫,o

of

〆 ム  ムー/島

/

ヘゾ \:。

'

'

,

'

,

'

,

'

'

'

[

'

o

'

/

{

/

 亀

8

6

4

2

0

0 2 4

γ1蹴 ¢(h)

6 8

§

O

Fig.7.iteleaseofβ 一9麓呈馳C宝oS量(ias¢by重heφ91¢ 茎ys孟ssyste斑.1配.CO彦

CK1三1ca町ing重heplasmid夢L茎9P聖R(O)or重heVECt◎ ゆlas搬ld

pUC隻 今 〈△)WdSgr◎ 騨鶏 爲t25°C量 簸L琶mediumc◎n奄a量 鷺玉ngarnp重C1豊凝鷺

(6◎オ゜a/r登1).Whe貸the・46600負heculture難a《 董r¢ac}亙e(豊0.3,癌 ¢grOW癌

temper脚re職ssh漁ed童 ◎37℃,endthecellgr◎w廠was撫oni嫉ed

as重ndicatedi簸Fig.6.A亀 重nterva豊s,盆po雛 ◎離 ◎郵t藪¢culturewas

rem◎ved,a鞭dtreec¢ 墨董一敷eesupernatantfluidw践sob職 呈nedby

centrifugation.β 一G&1哉c匙os量d隷s¢activityofthesu婁)ernafanfoft襲 ¢ce難s

腰bo蜘 帥L轡PP翼(劇 ◎rtheveet。rptJC19>wasmo醸orcd説

夷20asδesαlbed蓋nSect重o鷲2.

TheseobservationsinE'.cotisuggestedthatthetwo

φ墓1ep鵬tiveproteins,holinandlysin,can沁troducea

玉esio簸(s)i聡theE、,co蔀cel1envelope,andthehol董!1-lysin

systerraisessentiallyinvolvedintheeytolyticprocess.As

in豊a鎮bda(Young,1992)andP2(zierman麺e隻aL,雲994),

匙heφ9ヱ ¢脚es翻and卵mightbeunderacomp重icated

c◎n£r◎LF顧hers加dieso登structure,expressio孤,fu鍛c-

tion,a照e難zymaticpropertiesoftheφ91elysisge勲es

;'.瀞 磯 難e㈱ 鵬

We重h撒kDr.S.Nakamura(Toyama,Japan),鋤d

Drs。Y.Mas鹿 瓢une,andR.Hosono(Kanazawa,Japa難)

forencouragementandsupport.

驚e蝕r繍c総

Arendt,E.K.,Daly,C.,Fitzgerald,G.F.andvandeGuchte,M.(1994}

MolecularcharacterizationofLactococcalbacteriaphagcTuc2(?09

andidentificationandanalysisofgenesencodingLysin,aputative

Holm,andtwostructuralproteins.Apps.Environ.Microbiol.60,

1875-.王883.

Birkeiand,N.-K.{1394)Cloning,molecularcharacterization,and

expressionofthegenesencodingthelytiefunctionsoflactacaccal

bacteriaphageφLC3:adualiysissystemofmoduiazdesign.Can,

∫.Microbi41.40,658-665.

Baizet,B.,Lahbib-Mansais,Y.,Dupont,L.,Ritzenthaler,P.and

IVIata,Iv1.(1990}Cloning,expressionandsequenceanalysisofan

endatysin-encodinggeneofLactobacillusbulgarieusbacteriophage

mv1.Gene94,61--b7.

turd,C.G.endDreyfuss,Ci.{199}Conservedstructuresanddie-ersity

offu難cξ めnsofRNA-bi積d重ngprote三ns.Science265,615-621,

Campbell,A,(1994)Co鵬parativemolecularbiologyoflamboid

phages.Annu.Rev.IVIicrabzal.48,193-222.

T3avidson,B.E.,Powell,1.B.andHillier,A.3.(1990)Temperate

bacteriophagesandlysogenyinlacticacidbacteria.FEMS

MIcrobio孟.R¢v.87,79-9Q.

Dupont,L,,Vasata,A.,Mikkoncn,M,B◎izet-Bo鍍h◎ure,B.,

Alatossava,T.andRitzenthaler,P.(1993}UenBankaccession

No.226590.

Fouche,F.B.antiHash,J.1-1.(1978}TheN,O-diacetylmuramidaseof

Chctltarapsi,sspecies.Identificationofaspartyiandglutamylresidues

intheactivesite.J.Biol.Chem.233,6787-6793.

Garcia,4'.,Garcia,J.L.,Garcia,E.,Sanchez-Pueltes,J.M.andLopez,R.

(1990}ModularorganizationofthelyticenzymesofStreptococcus

pneumoniaeandllsbacteriophages.Gene86,8レ88.

}{a.rley,C8.andRey鷺o董ds,RJ》 。(1987)Ana韮ysisofE.colipromoter

sequences.NucleicAcidsILes.15,2343-2361.

Honrich,B.,Bi龍isho魚r,B.a簸dBlas孟,U.(1995)Prixロarystructureand

functionalanalysisoftheIysisgenesofI,actobucillusgasseri

bacteriophageφadh.J.Bacterioi.177,723-732.

Kakikawa,M.,Oki,M,Tadokoro,1.L,Nakamura,S.,Taketo,A.and

Koda三ra,K.-1.(19%)Cl◎ 面 琶andnuc璽eotideseguenceo舳emajor

capsidμGteinofLactabucillusbatter量o凶a怒 巳 φg王e.Genc(inpress).

Kodaira,K-L,Nakano,K,,Okada,S.a捻dTaket◎,A.〈1992)

Nucleot三(葦eseguenee◎fthegenomeofthebacte罫 重ophageα3:

interreiatiortshipofthegenamestructureantithegeneproducts

wi癒th◎seof亡hephages,φX174,G4,andφKBIochim.810phys.

Acta1130,277-288.

Kodaira,K.一 要,,Okl,M.,Taketo,A,,Yasukawa,H.andMasa!none,Y.

Page 9: functions of Bacteriophage Ogle - COnnecting REpositories · 2017. 4. 23. · 2.3.Ex躍 謡徽 ガψ91898麟 鍛駐coli E.coliXL璽 一b1鵬carryi薮gareco曲i難 煎 幽smld, whlc熱c

(1タ鱗a)鯵e匙e懸i醸 雲。魏 ◎fぬesi簸9董estranded◎ruinofShagetla

SOt2TICTP翌as鵬i(至 茎)KY騒 ・B重◎c}}i鵬・Bi◎P為ys.Ac筆a墨26G,茎83-19◎.

Kod&1餓 諏.一 互.,God鵬,GN翻dT舞ke重o,A.(1タ 食4b)c◎ 脚 段藤 三ve

s魔diesoぎ 宅he艶i煕s磁 夢烈 殖晦 鍵s。fEscher醜 αcolispわ εrical

single-str雛d磁D婦Aph聡es3i◎chim.13至O飾ys.Ac臓126◎,玉91-199,

Lu翻g,w.,s¢e細 磁,£.,K至 鞠e罫 一顕1z,瓦,Sch雌 驚r,K}{.,

鍛agm磁,L.,脚(>es¢,Cjま,,.F◎x,G.】E3.a贅dS重ackebra黙d亀,]E.(1≦)85)

Thephyt◎ge韻 蜘 憾1◎n◎fSire脚co鐡 εa麟 君耀roωcc擁&∫.G肌

Fier◎b量o蔓 、茎31,・543-551、

Po騰wols,P.鷺.andLee,R.J.(1993>G¢neties◎fla¢ 沁b農c重lli:plasmid

andg㍑e雛essi◎n.A餓 ◎難{。vanl,ec;uwenh◎ek64,85-107.

Sabi,S.貧ndLOr寝 経,S.{jL9~ 婁5)T量ie豆ysins◎fb舞Gte!駈io茎)}}ag¢sinfecting

lact至cac至db&《)士er亀 。App)董.MiGrobi◎ 萱.]巳i◎総(⊃h.43,呈 一6、

Sambr◎ ◎k,∫。,Fr量ts¢h,£.F.a鶏(套 銭慶窺簸ia銭5,「r.(1≦)8タ〉ム贋◎1cc慧嚢ardo簸i難9:

農 蓋ab◎rat◎rymenus},2簸(蚤ed.Co童(墨S茎)ri貧9賢a罫borL翫b(》story,

CddS婁 》nngHarbor,層Y.

Sang¢ 罫,F,Nlckien,S.顕dCou量s◎n,A,R.(1餌7)DNAsequ¢ 難ci鶏g

w呈窃c難ai簸 一terminatinginhibitors.Proc.N譲1.Acad.Sc重.USA7彊,

54b3-54b7.

San墓er,E,C◎ 戯son,AR.,Hilt,D.F.andPctersen,G.B.(1982)

nucleotidesequenceoぎbacteriophageλDNA.J.Mol.B{of.

162,729-773.

Schauler,C.,Ehrlich,S.D.andChapin,Tvl.-C.(1994)Sequenceand

organizationofthelactococcalprolate-headedblLb7phagegenome_

Microbiology140,3461-3069.

Taketo,A.{1988)DNAtransfectionofEscherichiucolibye}ectropora-

tio縫.B重ochim.8iophys.Acta949,318-324.

Terzaghi,B.E.andSardine,W.E.(1975)Improvedmediumforlacti,;

Streptacacciandtheirbacteriophages.Appf.Microbioi.29,807-813.

Vieira,」 。andMesslng,J.(1987)MethodsEnzymol.153,3--11.

Young,R.(1992)BacteriophageIysis:mechanismandregulation.

Microbiot.Itev.56,430-481.

Ziermann,R.,Bartlett,B.,Calendar,R.andChristie,G.E.{199}

FunctionsinvolvedinbacteriaphageP2-inductedhostcelllysinand

ident{盒cat垂 〔)競ofanewta謡gene.∫.BacterioL176,4974-4984

Zink,P..,L,oessner,iVI.3.antiScherer,S.(1995)Characterizationof

crypticpraphages(monoeins)inListeriaandsequenceanalysisofa

hoiin/endolysingene.Microbiol.141,2577--2584.