BIOPAC PROJEKTET – Translationel forskning med henblik på nye biomarkører ved pancreas cancer

Julia S. Johansen Onkologisk afd. og Medicinsk afd.

Herlev Hospital

From Jemal, A. et al. CA Cancer J Clin 2009;59:225-249.

Ten Leading Cancer Types for Estimated New Cancer Cases and Deaths, by Sex, United States, 2009

From Jemal, A. et al. CA Cancer J Clin 2009;59:225-249.

Five-year Relative Survival Rates Among Patients Diagnosed with Selected Cancers by Race and Stage at Diagnosis, United States, 1996-2004

Median overlevelse6 måneder

From Jemal, A. et al. CA Cancer J Clin 2009;59:225-249.

Distribution of Selected Cancers by Race and Stage at Diagnosis, United States, 1996-2004

Kun få procent diagnosticeres såtidligt, at de kan opereres

BIOPAC PROJEKTET – STATUS 5. november 2009

BIOmarkører ved mistanke om og ved Pancreas Cancer (BIOPAC) – giver de ny information om

sygdommen og forbedret monitorering og prognosticering af patienterne ?

Protokollen skrevet 2006 Projektet startede juli 2008 af Nicolai A. Schultz

BIOPAC

STUDY

BIOPAC PROJEKTET

Formål:Vi ønsker hos patienter med pancreas cancer at identificere forhold i arvemassen (SNP, gen- og microRNA array profiler), der i kombination med protein profiler og billeddiagnostik (CT-, PET, MR- og UL-skanning) vil kunne:

• identificere patienter med pancreas cancer på et tidligt tidspunkt, således at helbredende operation er mulig.

• finde de patienter der vil udvikle den mest alvorlige og aggressive sygdom, således at deres kemobehandling evt. kan kombineres med biologisk behandling eller anden behandling.

• forudsige hvilke patienter, der vil have gavn af forskellige behandlingsformer.

Vi forventer, at projektet vil kunne være til stor gavn for fremtidige patienter, der vil kunne tilbydes en bedre og mere individuel behandling ud fra kendskabet til deres gen- og microRNA array profiler, samt protein profiler.

Nye biomarkører hos patienter med pancreas cancer

Forskellige typer biomarkører

Genetiske markører

MicroRNA markører

Cancer protein markører

???????

???

Vækst markører

Fibrose markører

Inflammatoriske markører

Biomarkører

Definitionen på en "Biomarkør": En karakteregenskab, der kan måles objektivt og evalueres som en indikator for en normal biologisk proces, en sygdoms proces, eller et respons til en behandling

En god biomarkør skal bidrage til en ændret klinisk beslutning, der medfører et mere gunstigt klinisk forløb for patienten som

• nedsættelse af tid til sygdomsforværring eller tid til død• bedre livskvalitet• reduktion i sundhedsudgifter

BIOPAC PROJEKTET

Indsamling af korresponderende blod- og vævsprøver samt kliniske data fra patienter med pancreas cancer mhp. aktuelle og fremtidige projekter til gavn for danske pancreas cancer patienter.

Materiale:Blodprøver tages ved diagnose, før og efter operation, samt før og under adjuverende eller palliativ onkologisk behandling.

Blodprøverne sendes frosne til onkologisk afd., Herlev Hospital, hvor de opbevares i aflåst – 80oC fryser tilsluttet en temperatur alarm.

Vævsprøver fra pancreas cancer bliver taget ved operation eller i forbindelse med biopsi i henhold til instruks fra den Danske Cancer Biobank. Vævet vil blive kodet som relateret til BIOPAC. Vævsprøverne opbevares på patologisk afd. på lokalt sygehus.

Database:Kliniske og patologiske oplysninger.

Afdeling ONKOLOGISK/ KIRURGISK

BESØG

O P Q R A B1E1 E2 E3 E4 E5

Operatio n

Diagnose

1 måned efter

operation

Før stråle-

behandli ng

14 dage efter

strålerBaseline Før

2. serie1.

scanning2.

scanning3.

scanning4.

scanning5.

scanning

Blodprøve taget Dato

3 X 6 ml Rød/sort TørglasSERUMGreiner rør 5 stk. RØD

3 X 6 ml Lilla/sort EDTA-glasEDTA plasmaGreiner rør 5 stk. BLÅ

3 X 3,5 ml Lyseblå/sort Citrat- glasCITRAT plasmaGreiner rør 5 stk. HVID

3 X 4 ml Grøn/sort Heparin-glasHEPARIN plasmaGreiner rør 3 stk. GRØN

Buffycoat fra 3 EDTA glas Greiner rør 3 stk. GUL

2 Paxgene RNA-rør

Signatur

BIOPAC X Flowdiagram for blodprøver

Afdeling KIRURGISK / ONKOLOGISK

BESØG X

Blodprøve taget Dato

3 X 6 ml Rød/sort TørglasSERUMGreiner rør 5 stk. RØD

3 X 6 ml Lilla/sort EDTA-glasEDTA plasmaGreiner rør 5 stk. BLÅ

3 X 3,5 ml Lyseblå/sort Citrat-glasCITRAT PLASMAGreiner rør 5 stk. HVID

3 X 4 ml Grøn/sort Heparin-glasHEPARIN plasmaGreiner rør 3 stk. GRØN

Buffycoat fra 3 EDTA glas Greiner rør 3 stk. GUL

2 Paxgene RNA-rør

Signatur

BIOPAC blodprøve håndtering

OPSAMLINGALLE BESØG

3 X 6 ml RØDT TØRGLAS

3 X 6 ml LILLA EDTA GLAS

3 X 3,5 ml BLÅT CITRAT GLAS

3 X 4 ml GRØNT HEPARIN GLAS

3 rør med Buffy coat 2 X PAXGEN RNA-rør

PREPARERING Henstår mindst 30 min.

Centrifugere s ved 2330g 10 min 4° C

Serum overføres til 5 x cryorør med rødt lågminimum 500 µl

Henstår mindst 30 min.

Centrifugeres ved 2330g 10 min 4° C

Plasma overføres til 5 x cryorør med blåt lågminimum 500 µl

Henstår mindst 30 min.

Centrifugeres ved 2330g 10 min 4° C

Plasma overføres til 5 x cryorør med hvidt lågminimum 500 µl

Henstår mindst 30 min.

Centrifugeres ved 2330g 10 min 4° C

Plasma overføres til 3 x cryorør med grønt lågminimum 500 µl

Brug glasset fra EDTA- plasmaen

Fjern plasma til ca. 5 mm over cellelag.

Tag alle de hvide blodlegemer fra 1 glas og kom dem i 1 cryorør med gult låg

1 glas = 1 cryorørSå man i alt har 3 cryorør.

Skal vendes forsigtigt 8-10 gange, STRAKS efter blodprøvetagning!

Henstår i 2 - 48 timer ved stuetemperatur.

Vendes godt inden røret fryses.

OPBEVARING -80° C fryser

-80° C fryser -80° C fryser -80° C fryser -80° C fryser Fryses ved -20° C i 24-72 timer.Derefter flyttes glasset over til -80° C.

BIOPAC PROJEKTET

Udgifter:

• Nogle afdelinger vil have udgifter til Klinisk Biokemisk Afd. til blodprøve indsamling. Såfremt afdelingerne ikke har økonomiske midler til dette, vil jeg sørge for betaling.

• Indlevering af væv fra BIOPAC patienter til Den Danske Cancerbiobank er gratis.

• Finansiering af analyser til forskeres forskellige projekter, er man selv ansvarlige for. Vi er feks. i gang med ansøgninger til EU og NIH.

BIOPAC PROJEKTET

Anvendelse:• Blod- og vævsprøverne samt kliniske data vil være gratis

tilgængelige for andre forskere i Danmark og udlandet med interesse for pancreas cancer og biomarkører.

• Anvendelse kan kun ske efter godkendelse fra ”BIOPAC Styregruppen”.

• Hvis prøvematerialet skal anvendes til andet end det i Projektprotokollen specificeret, skal der skrives en tillægsprotokol, som skal godkendes separat af Den Videnskabsetiske Komité.

• Gældende lovgivning for udlevering af biologisk materiale og data følges.

• Kliniske data og resultaterne fra biomarkørerne opbevares aflåst.

Juli 2009 BIOPAC Projektet

Kære Alle. Siden sidste nyhedsbrev er inklusionen af patienter til BIOPAC begyndt på de onkologiske afdelinger på Odense Universitetshospital og Nordsjællands Hospital Hillerød. Der arbejdes fortsat på at alle danske onkologiske og kirurgiske afdelinger, som behandler patienter med pancreas cancer skal deltage i projektet. I maj måned rundede vi de første 100 patienter inkluderet i BIOPAC og BIOPAC X. Medio juni 2009 er der inkluderet 115 patienter i BIOPAC og BIOPAC X. Hvis patienter fortsat kan inkluderes i samme tempo vil de første analyser kunne udføres om cirka et år.

Vedr. patienter der deltager i ”firmaprojekter”: Disse patienter skal også tilbydes inklusion i BIOPAC projektet, evt. i BIOPAC X, med et enkelt sæt blodprøver.

Inklusion efter påbegyndt behandling: Patienter som ikke er blevet inkluderet i BIOPAC inden de begyndte kirurgisk eller onkologisk behandling kan under behandlingsforløbet stadig inkluderes i BIOPAC eller BIOPAC X.

EU ansøgning: På årets ASCO kongres understregede flere af foredragsholderne behovet for store prospektive studier af screeningsmarkører, prognostiske og prædiktive markører, samt flere tilhørende vævsbanker. Vi har etableret kontakt til svenske og norske kolleger med henblik på et Skandinavisk samarbejde med udgangspunkt i BIOPAC-protokollen. Deltagende centre vil have mulighed for at få testet eller valideret fremtidige biomarkører på det indsamlede materiale. Der vil være mulighed for at søge EU om penge til at realisere dette samarbejde.

YKL-40 legat: Der vil i juli måned blive uddelt tre YKL-40 rekreationslegater til udvalgte patienter med pancreas cancer.

Odense Projekt: Ansvarlig for inklusion af BIOPAC patienter i Odense er Jon Kroll Bjerregaard, som skriver ph.d. om prædiktive og prognostiske markører ved downstageing af pancreas cancer med radiokemoterapi. Som delprojekt undersøges om en eventuel ændring i sukkerstofskiftet, målt med FDG-PET/CT, under behandlingen kan forudsige en behandlingseffekt.

Mange venlige hilsnerNina, Beata, Benny, Morten, Julia og NicolaiHerlev Hospital, Telefon 44884488 lokal 82412

BIOPAC PROJEKTET

Status mht. inklusion af patienter:• 142 fra Herlev Hospital • 15 fra Hillerød Hospital • 14 fra Odense Universitets Hospital• Næstved forventer snart at starte med inklusion

• Vi håber, at Rigshospitalet, Roskilde, Ålborg og Århus også snart vil kunne starte

Mål:700 patienter inkluderet i 2012Analyse vil starte i en test kohorte på 250 patienter i 2010

Biotek firmaer

Medicinal Industrien

CT/PET/MR/UL

RegeringenEU og NIH

Private fonde

ASCO og ESMO

Patient foreninger

Diagnostisk og translationel forskning

Præklinisk forskning

Undervisning

Samarbejde

Kommunikation

LægerForskere

SygeplejerskerBioanalytikere

Molekylærbiologer

Hvordan lykkes det – samarbejde !

Mange tak til !

Nicolai A. SchultzBenny V. JensenMorten WøjdemannEstrid HøgdallThomas HornAnne RoslindFlemming Burcharth

Per Pfeiffer, Jon K. Bjerregaard, Michael Bau Mortensen, Svend Erik Nielsen, Michael Holmsgaard Kristensen, Niels Henrik Holländer

Alle andre læger på Onkologisk afd. Herlev Hospital og Hillerød Hospital der har inkluderet patienter

Alle sygeplejerskerne i øvre GI team på Kirurgisk afd., Herlev HospitalAlle sygeplejerskerne i onkologisk amb., GI team, Herlev Hospital

Bioanalytikerne på Herlev Hospital: Beata, Dorthe, Charlotte, Christina, Nina, Tonni, Ulla

Patienterne