1
0 100 200 300 400 500 600 700 800 900 1000 N.asteroides3 N.neocaledoniensis2 N.neocaledoniensis5 N.coubleae1 Nocardia thailandica DSM 44808T DSM N.abscessus1 N.abscessus4 N.abscessus5 N.abscessus2 N.abscessus3 N.beijingensis1 N.araoensis1 N.araoensis3 N.arthritidis3 N.araoensis4 N.araoensis5 N.arthritidis1 N.beijingensis4 N.arthritidis4 N.artthritidis--2 N.beijingensis2 N.beijingensis-3 N.beijingensis5 N.araoensis2 N.exalbida1 N.exalbida2 N.exalbida3 N.exalbida5 N.exalbida4 N.gamkensis1 N.jiangxiensis-1 N.asiatica1 N.asiatica4 N.asiatica5 N.asiatica2 N.asiatica3 N.xishanensis1 N.arthritidis5 N.harenae1 N.altamirensis-1 N.tenerifensis1 N.brasiliensis1 N.brasiliensis3 N.brasiliensis4 N.brasiliensis5 N.brasiliensis2 Nocardia brasiliensis 251 RLT Nocardia sp MB_9090_05 THL N.devorans1 N.ninae1 N.amamiensis1 N.pneumoniae1 N.ignorata1 N.asteroides1 N.asteroides5 N.neocaledoniensis4 N.neocaledoniensis1 N.neocaledoniensis3 N.asteroides2 N.asteroides4 N.novocastrense1 N.thailandica1 N.thailandica2 N.thailandica3 N.thailandica4 N.caishijiensis1 N.carnea1 N.carnea-2 N.carnea2 N.flavorosea1 N.jinanensis1 Nocardia carnea B334 UFL N.carnea4 N.rhamnosphilis1 N.rhamnosphilis2 N.sienate1 N.sienate2 N.testacea1 N.testacea2 N.testacea3 Nocardia sienata DSM 44766T DSM Nocardia testacea DSM 44765T DSM N.farcinica-1 N.farcinica-2 N.farcinica3 N.farcinica-5 N.farcinica4 N.puris1 N.puris2 N.puris-3 N.puris4 N.puris-5 N.shimofusensis1 N.shimofusensis2 N.shimofusensis3 N.speluncae1 N.takedensis1 N.takedensis2 N.takedensis3 N.lijiangensis1 N.polyresistens1 N.higoensis1 Nocardia higoensis DSM 44732T DSM N.salmonicide1 N.anaemiae1 Nocardia anaemiae DSM 44821T DSM N.pseudovaccinii1 N.vinacea-1 N.vinacea-2 N.vinacea-5 N.vinacea3 N.vinacea4 Nocardia farcinica DSM 43665T DSM Nocardia paucivorans DSM 44386T DSM N.cyriacigeorgica1 N.cyriacigeorgica4 N.cyriacigeorgica3 N.cyriacigeorgica2 N.cyriacigeorgica5 Nocardia cyriacigeorgica DSM 44484T DSM Nocardia sp N1064 IBS Nocardia sp N394 IBS N.fluminea-1 N.fluminea2 N.pseudobrasiliensis1 N.pseudobrasiliensis2 N.pseudobrasiliensis3 N.pseudobrasiliensis5 N.pseudobrasiliensis4 N.acidivorans N.uniformis1 N.concava-1 N.concava-4 N.concava-5 N.concava-2 N.concava-3 N.tsunamiensis-1 N.niigatensis1 N.niigatensis3 N.niigatensis4 N.niigatensis2 N.niigatensis5 N.seriolae-1 N.inohanensis1 N.inohanensis2 N.yamanashiensis-2 N.yamanashiensis1 Nocardia concava DSM 44804T DSM Nocardia yamanashiensis DSM 44669T DSM Nocardia niigatensis DSM 44670T DSM Nocardia sp N133 IBS N.italica1 N.otitidiscaviarum-1 N.otitidiscaviarum-2 N.otitidiscaviarum3 N.otitidiscaviarum4 N.otitidiscaviarum5 Nocardia otitidiscaviarum VA_01844_09 ERL Nocardia otitidiscaviarum DSM 43242T DSM Nocardia seriolae DSM 44129T DSM N.africana1 N.veterana3 N.veterana5 N.veterana4 N.africana2 N.aobensis1 N.aobensis2 N.aobensis3 N.cerradoensis1 N.aobensis4 N.kruczakiae1 N.nova2.13.06.19 N.aobensis5 N.elegans1 N.elegans3 N.elegans5 N.elegans2 N.elegans4 N.nova1.13.06.19 N.nova3.13.06.19 N.nova4.13.06.19 N.nova5.13.06.19 N.pseudosporangifera1 Nocardia nova 10_368938 MVO N.africana3 N.veterana1 N.veterana2 N.africana4 N.violaceofusca1 Nocardia veterana RVA1_03 SLT Nocardia africana DSM 44491T DSM Nocardia elegans DSM 44890T DSM Nocardia nova DSM 44481T DSM Nocardia aobensis DSM 44805T DSM Nocardia kruczakiae DSM 44877T DSM N.brericatena1 N.brericatena2 N.paucivorans1 N.blacklokiae1 N.blacklokiae2 N.transvalensis3 N.wallacei1 N.wallacei3 N.wallacei5 N.wallacei2 N.wallacei4 N.transvalensis4 N.transvalensis5 N.transvalensis-2 Nocardia transvalensis DSM 43405T DSM N.mexicana-1 N.transvalensis-1 N.vermiculate1 Nocardia vermiculata DSM 44807T DSM N.diaphanozonaria1 N.diaphanozonaria-1 N.terpenica1 N.terpenica5 N.terpenica-2 N.terpenica3 N.terpenica4 Nocardia abscessus DSM 44432T DSM Nocardia asiatica DSM 44668T DSM Nocardia araoensis DSM 44729T DSM Nocardia pneumoniae DSM 44730T DSM Nocardia exalbida DSM 44883T DSM Nocardia arthritidis DSM 44731T DSM Nocardia ignorata DSM 44496T DSM Nocardia salmonicida DSM 40472T DSM MSP Dendrogram Distance Level

01002003004005006007008009001000 N.asteroides3 N.neocaledoniensis2 N.neocaledoniensis5 N.coubleae1 Nocardia thailandica DSM 44808T DSM N.abscessus1 N.abscessus4

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Page 1: 01002003004005006007008009001000 N.asteroides3 N.neocaledoniensis2 N.neocaledoniensis5 N.coubleae1 Nocardia thailandica DSM 44808T DSM N.abscessus1 N.abscessus4

01002003004005006007008009001000

N.asteroides3N.neocaledoniensis2N.neocaledoniensis5N.coubleae1Nocardia thailandica DSM 44808T DSMN.abscessus1N.abscessus4N.abscessus5N.abscessus2N.abscessus3N.beijingensis1N.araoensis1N.araoensis3N.arthritidis3N.araoensis4N.araoensis5N.arthritidis1N.beijingensis4N.arthritidis4N.artthritidis--2N.beijingensis2N.beijingensis-3N.beijingensis5N.araoensis2N.exalbida1N.exalbida2N.exalbida3N.exalbida5N.exalbida4N.gamkensis1N.jiangxiensis-1N.asiatica1N.asiatica4N.asiatica5N.asiatica2N.asiatica3N.xishanensis1N.arthritidis5N.harenae1N.altamirensis-1N.tenerifensis1N.brasiliensis1N.brasiliensis3N.brasiliensis4N.brasiliensis5N.brasiliensis2Nocardia brasiliensis 251 RLTNocardia sp MB_9090_05 THLN.devorans1N.ninae1N.amamiensis1N.pneumoniae1N.ignorata1N.asteroides1N.asteroides5N.neocaledoniensis4N.neocaledoniensis1N.neocaledoniensis3N.asteroides2N.asteroides4N.novocastrense1N.thailandica1N.thailandica2N.thailandica3N.thailandica4N.caishijiensis1N.carnea1N.carnea-2N.carnea2N.flavorosea1N.jinanensis1Nocardia carnea B334 UFLN.carnea4N.rhamnosphilis1N.rhamnosphilis2N.sienate1N.sienate2N.testacea1N.testacea2N.testacea3Nocardia sienata DSM 44766T DSMNocardia testacea DSM 44765T DSMN.farcinica-1N.farcinica-2N.farcinica3N.farcinica-5N.farcinica4N.puris1N.puris2N.puris-3N.puris4N.puris-5N.shimofusensis1N.shimofusensis2N.shimofusensis3N.speluncae1N.takedensis1N.takedensis2N.takedensis3N.lijiangensis1N.polyresistens1N.higoensis1Nocardia higoensis DSM 44732T DSMN.salmonicide1N.anaemiae1Nocardia anaemiae DSM 44821T DSMN.pseudovaccinii1N.vinacea-1N.vinacea-2N.vinacea-5N.vinacea3N.vinacea4Nocardia farcinica DSM 43665T DSMNocardia paucivorans DSM 44386T DSMN.cyriacigeorgica1N.cyriacigeorgica4N.cyriacigeorgica3N.cyriacigeorgica2N.cyriacigeorgica5Nocardia cyriacigeorgica DSM 44484T DSMNocardia sp N1064 IBSNocardia sp N394 IBSN.fluminea-1N.fluminea2N.pseudobrasiliensis1N.pseudobrasiliensis2N.pseudobrasiliensis3N.pseudobrasiliensis5N.pseudobrasiliensis4N.acidivoransN.uniformis1N.concava-1N.concava-4N.concava-5N.concava-2N.concava-3N.tsunamiensis-1N.niigatensis1N.niigatensis3N.niigatensis4N.niigatensis2N.niigatensis5N.seriolae-1N.inohanensis1N.inohanensis2N.yamanashiensis-2N.yamanashiensis1Nocardia concava DSM 44804T DSMNocardia yamanashiensis DSM 44669T DSMNocardia niigatensis DSM 44670T DSMNocardia sp N133 IBSN.italica1N.otitidiscaviarum-1N.otitidiscaviarum-2N.otitidiscaviarum3N.otitidiscaviarum4N.otitidiscaviarum5Nocardia otitidiscaviarum VA_01844_09 ERLNocardia otitidiscaviarum DSM 43242T DSMNocardia seriolae DSM 44129T DSMN.africana1N.veterana3N.veterana5N.veterana4N.africana2N.aobensis1N.aobensis2N.aobensis3N.cerradoensis1N.aobensis4N.kruczakiae1N.nova2.13.06.19N.aobensis5N.elegans1N.elegans3N.elegans5N.elegans2N.elegans4N.nova1.13.06.19N.nova3.13.06.19N.nova4.13.06.19N.nova5.13.06.19N.pseudosporangifera1Nocardia nova 10_368938 MVON.africana3N.veterana1N.veterana2N.africana4N.violaceofusca1Nocardia veterana RVA1_03 SLTNocardia africana DSM 44491T DSMNocardia elegans DSM 44890T DSMNocardia nova DSM 44481T DSMNocardia aobensis DSM 44805T DSMNocardia kruczakiae DSM 44877T DSMN.brericatena1N.brericatena2N.paucivorans1N.blacklokiae1N.blacklokiae2N.transvalensis3N.wallacei1N.wallacei3N.wallacei5N.wallacei2N.wallacei4N.transvalensis4N.transvalensis5N.transvalensis-2Nocardia transvalensis DSM 43405T DSMN.mexicana-1N.transvalensis-1N.vermiculate1Nocardia vermiculata DSM 44807T DSMN.diaphanozonaria1N.diaphanozonaria-1N.terpenica1N.terpenica5N.terpenica-2N.terpenica3N.terpenica4Nocardia abscessus DSM 44432T DSMNocardia asiatica DSM 44668T DSMNocardia araoensis DSM 44729T DSMNocardia pneumoniae DSM 44730T DSMNocardia exalbida DSM 44883T DSMNocardia arthritidis DSM 44731T DSMNocardia ignorata DSM 44496T DSMNocardia salmonicida DSM 40472T DSM

MSP Dendrogram

Distance Level