Atelier Pubmed Décembre 2012

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Medline via l’interface Pubmed

Perrine Helly - Service Commun de Documentation - UBO

BU Santé

DécembreDécembre 2012 2012

Décembre 2012

Objectifs de la séance

Connaître les principes de constitution de la base Medline

Se repérer dans Pubmed

Savoir effectuer une requête pertinente dans la base

Savoir mettre en place des alertes sur un thème

Medline, quelques principes

Spots – Loop_oh Flickr CC-BY-SA

Ne pas confondre

Medline ≠ Pubmed

Le contenu(la base de données)

L'interface d'interrogation

Bases de données Un éditeur privé ou un

organisme institutionnel

Un référencement humain

Un thésaurus organisé

Une interface d'interrogation

Medline

Qui?

Quoi?

Thésaurus MESH

Interface PUBMED (il en existe d'autres)

National Library of Medicine Etats-Unis)

20 M de références d'articles biomédicaux,

issues de 5200 périodiques depuis 1948

Pubmed, quelques repères (interface web)

Compass Study – Calsidyrose – Flickr CC-BY

Vos premiers pas dans Pubmed

Recherche libre sur la grippe H1N1 chez les femmes enceintes

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

Présentation de la liste des résultats

Quelques filtres

Triez vos résultats pour n'afficher que les articles écrits en anglais ou en français

Précisez votre recherche en ne sélectionnant que les revues de la littérature

Types d'articles : rappel Case report / étude de cas Clinical Trial / essai clinique Randomized Controlled Trial / essai clinique

en aveugle avec groupe contrôle Practice guideline / recommandation de

bonne pratique Review / revue de la littérature Systematic Review / revue systématique Meta-analysis / méta-analyse (Cochrane)

Pour des recherches fines : le Mesh

Needle and Thread – Incurable Hippie – Flickr CC-BY-NC

S'il te plaît, dessine-moi...

...un thésaurus

Vocabulaire normalisé

Descripteurs

Hiérarchie

Plusieurs synonymes, un seul descripteur officiel

Syndrome, Down

Down's Syndrome

Downs Syndrome

Syndrome, Down's

Mongolism

Trisomy 21

Trisomy 21, Meiotic Nondisjunction

Trisomy 21, Mitotic Nondisjunction

Down Syndrome, Partial Trisomy 21

Partial Trisomy 21 Down Syndrome

Down Syndrome

Le thésaurus de Medline : le MeSH

Medical Subject Headings

Mots-clefs uniquement en anglais

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mesh

Le MESH

Descripteurs (>25 000)

Qualificatifs (83)

« L'affiliation Descripteur / Qualificatif est la clé de l'interrogation de Medline »*

*(citation de Philippe Eveillard dans « Comment faire ses premiers pas sur Pubmed » La Revue du praticien. Médecine générale A. 2007, n° 766-67, pp. 411-412)

Les opérateurs booléens.

Recherche libre vs. Équation de recherche

Les facteurs environnementaux de la sclérose en plaques

multiple sclerosis

environmental factors

1213 résultats – pas tous pertinents

Multiple Sclerosis/etiology"[Mesh]

AND environment[Mesh]

378 résultats pertinents

Un exemple de recherche

Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné

publiés les 10 dernières années

Un exemple de recherche

Articles en français et en anglais sur le toucher dans la relation soignant-soigné publiés les 10 dernières années

"Touch"[Mesh] AND "Professional-Patient Relations"[Mesh]

+ Filters : English, French, published in the

last 10 years

Correspondances Mesh français – Mesh anglais

=> « Mesh bilingue  de l’INSERM » :http://mesh.inserm.fr/mesh/

ou

=> « Portail terminologique de santé » (CISMEF)

http://pts.chu-rouen.fr/

Bref

« Une recherche bibliographique ne se fait pas dans les couloirs de

l’hôpital ou entre 2 stations de métro avec son

smartphone ou sa tablette. »

Philippe Eveillard

Love & Mathematics – Lost Archetype – CC BY-NC-SA sur Flickr

Exercices1- Rechercher les affiliations

descripteurs/qualificatifs correspondant :

à la chirurgie de l’ostéochondritede hanche à l’épidémiologie de la maladiede Crohn

Réponses1- Rechercher les affiliationsdescripteurs/qualificatifs correspondant :

à la chirurgie de l’ostéochondrite de hanche"Legg-Calve-Perthes Disease/surgery"[Mesh]

à l’épidémiologie de la maladie de Crohn"Crohn Disease/epidemiology"[Mesh]

1)À partir d'un mots-clef MESH ( boîte d'équation de recherche et rebond)

3 façons d'entrer une requête dans Pubmed

2) À partir du moteur de recherche avancée (« Advanced »)

3 façons d'entrer une requête dans Pubmed

3 façons d'entrer une requête dans Pubmed

3) Directement dans la barre de recherche simple

La veille dans Pubmed : services personnalisés

Low-flying harrier – Wolfpix – CC-BY-SA flickr

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Anglais Français Texte intégral gratuit BU Santé Brest

Filtre « BU Santé Brest »

Icône UBO pour l'accès direct au texte intégral

Exercice

2 - Saignement de nez et hypertension

Recherche de références à partir des mots MESH etsauvegarder des références dans MY NCBI

Exercice

3 - Les traitements du syndrome coronarien aigu.Exclure les traitements médicamenteux et lachirurgie.

Limiter aux recommandations de bonne pratique publiées ces deux dernières années

Exercice3 - ("Acute Coronary Syndrome/therapy"[Mesh])

NOT

( "AcuteCoronary Syndrome/drug therapy"[Mesh] OR "AcuteCoronary Syndrome/surgery"[Mesh] )

Du problème de la veille

équation de recherche ≠ équation de veille

Des mots MESH ?.

Ne contient pas de mots MESH

Contient des mots MESH

Exercice

4 - Trouvez les articles les plus récents sur le diagnostic de la mucoviscidose(sans utiliser les mots Mesh)

Solution : le champ Title/abstract ou [tiab]

« cystic fibrosis/diagnosis »[Mesh]

Équation de recherche (pour des résultats les plus

pertinents possibles)

(« cystic fibrosis »[tiab] OR « mucoviscidosis »[tiab]OR

« fibrocystic disease »[tiab]) AND diagnos*[tiab]

Équation de veille (pour des articles récents / pas

forcément aussi pertinents)

Créer une alerte dans MyNCBI

Retrouvez le support en ligne sur

http://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine

Ateliers BU Santé 2013

autres ressources en Santé (parce qu'il n'y a pas que Pubmed dans la vie...) mercredi 16 et 23 janvier 2013

Sudoc Cochrane Library Pascal BDSP Cismef EM-Premium

Zotero les mercredi 30 janvier, 13 et 20 février 2013

Inscription libre surhttp://formation.scd.univ-brest.fr/internes_medecine