PUBMED 29 novembre 2012. PUBMED Piattaforma di accesso alla principale banca dati bibliografica...

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PUBMED

29 novembre 2012

PUBMEDPiattaforma di accesso alla principalebanca dati bibliografica biomedica, Medline:

• prodotta dalla U.S. National Library of Medicine (NLM)

• sviluppata dal National Center for Biotechnology Information (NCBI)

• accessibile gratuitamente via Web

PUBMEDSi occupa di:

–medicina –infermieristica e discipline collaterali–odontoiatria –medicina veterinaria –scienze pre-cliniche

DATI• Indicizza oltre 5500 periodici (quasi la metà

di provenienza USA)

• La copertura è prevalentemente anglosassone (91% dei lavori in inglese: circa 800 periodici in altre lingue)

• Il taglio è clinico

DATI

• Inviati in maniera automatica dagli editori [PubMed - as supplied by publisher]. Sono compresi gli [Epub ahead of print]

• Presi in carico, ma non ancora indicizzati [PubMed - in process]

• La citazione completata con i MeSH, le eventuali correzioni etc etc [PubMed - indexed for MEDLINE]

DATI

Il valore aggiunto di PubMed (e delle

banche dati in generale) è dato dal lavoro

umano di indicizzazione e normalizzazioneDATI

RISULTATI

PubMed fornisce il record bibliografico

e, quando disponibili, l’abstract e il

full-text dell’articolo recuperato.

COME ACCEDERE

PUBMED: HOME PAGE

RICERCA LIBERA 1.

• Dopo aver inserito il termine di ricerca, il sistema suggerisce una lista di termini a partire da quello inserito

• Non è una lista esaustiva• E’ diverso cercare un singolo termine o più termini

RICERCA LIBERA 2.

• Le singole parole vengono cercate, oltre che nel thesaurus (quando ci sono) usando il campo All Fields HYPERTENSION

ALL FIELDS

• Il campo “All Fields” comprende tutti i campi di ricerca meno i campi “Place of Publication” e “Transliterated Title”

• I termini fra virgolette e quelli troncati sono cercati in questo campo

RICERCA LIBERA 3.• Quando digitiamo più termini nella stringa di

ricerca, PubMed attiva l’Automatic Term Mapping

• Tabelle di conversione– Mesh– Titolo della rivista– Autore/Collaboratore

RICERCA LIBERA. 4• Quando i termini sono trovati all’interno di una

delle tabelle, la ricerca si ferma

• Se i termini non vengono trovati in una tabella, vengono ricercati in AND allargando molto

la ricerca (v. Search details)

ESEMPIO

Knee surgery

FRASE ESATTA• Usare le virgolette per trovare una frase “così come

è scritta” (es. “knee surgery”, “molecular biology” o “metabolite reproduction”)

• Usare il troncamento (es. knee surger*)

TRONCAMENTO • L’asterisco * sostituisce zero o più caratteri

• Alla fine della parola: trova i termini con la stessa radice

• Esclude l’Automatic Term Mapping quindi non vengono ricercati nei Mesh

• Non si applica alle stopword– Parole che non vengono cercate

• a, an, are, be, for...

FRASE ESATTA: ESEMPIO

STRUMENTI PER LA RICERCA:

Il thesaurus - MESH

• Vocabolario controllato dei descrittori (sinonimi, acronimi e varianti di lingua vengono normalizzati con un unico termine)

• Strutturato ad albero

STRUMENTI PER LA RICERCA:

Il thesaurus - MESH

La strategia di ricerca può avvantaggiarsi delle

seguenti opzioni:

• Major topic (termine principale)

• Esplosione o NON esplosione del termine

• Uso dei Sotto descrittori

STRUMENTI PER LA RICERCA:

Il thesaurus - MESH

• Vantaggi:

– I sinonimi sono inclusi nella ricerca

– Gli articoli trovati sono pertinenti

I SOTTODESCRITTORI: Mesh subheadings

• Ad ogni termine del thesaurus corrispondono solo i subheadings che lo riguardano

• Riducono il numero di record recuperati secondo l’intenzione di chi ricerca

STRUMENTI PER LA RICERCA:

Il thesaurus

• Quando ricercare nel thesaurus:– Argomento consolidato (v. tempi di attribuzione dei

descrittori) – I sinonimi sono inclusi nella ricerca – Gli articoli trovati sono pertinenti

• E’ sempre consigliato fare anche la ricerca libera

RICERCA PER DESCRITTORI 1:

Mesh database

RICERCA PER DESCRITTORI 2:

Mesh database

RICERCA PER

DESCRITTORI 3.

RICERCA PER DESCRITTORI 4.

– Subheadings

– Major topic

– Explosion

– Entry terms (sinonimi)

– Ricercare tramite Search builder

PAUSA

CONSIGLIO

• Cercare un termine alla volta

• Unire i termini tra loro con gli operatori booleani

OPERATORI BOOLEANI

• AND

• OR

• NOT

ESECUZIONE DEI BOOLEANI 1.

• Il primo operatore da sinistra è eseguito per primo

– influenza AND vaccine OR vaccination

• articoli che contengono sia "influenza" sia "vaccine"

• articoli con "vaccination"

ESECUZIONE DEI BOOLEANI 2.

• Le parentesi modificano l’ordine di ricerca: i termini fra parentesi sono eseguiti per primi e poi combinati con gli altri

– influenza AND (vaccine OR vaccination)

• “influenza” e “vaccine”

• “influenza” e “vaccination”

COMBINARE I PASSI DELLA RICERCA

AMPLIARE LA RICERCA:

Related citations

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LIMITARE LA RICERCA:

Clinical Queries

LIMITARE LA RICERCA:

Clinical Queries

VISUALIZZARE I RISULTATI

FORMATO ABSTRACT con link al full text e a

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temporaneamente collocare i miei risultati

• Elimina automaticamente i duplicati

• Nella clipboard posso fare le stesse operazioni consentite nella Main Search Page

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• Contiene fino a un massimo di 500 record

• Dal momento in cui smetto di lavorare, resta disponibile per 8 ore

CITATION SENSOR• Cerca le citazioni bibliografiche a partire dai termini inseriti in libera • Gli articoli trovati dal Citation sensor sono evidenziati

in testa alla lista dei risultati– Smith 2009

GENE SENSOR • Gene Sensor riconosce i circa 5mln di geni del database Gene; se ne

individua uno nella stringa di ricerca, offre, in un riquadro primo fra i risultati, link a informazioni specifiche in Gene database– a2m liver

SINGLE CITATION MATCHER

• Per completare citazioni parziali

• Si può compilare anche un solo campo

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